More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU1380 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU1380  ferrous iron transport protein B  100 
 
 		 663 aa  1325    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1951  ferrous iron transport protein B  65.73 
 
 		 654 aa  857    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2444  ferrous iron transport protein B  84.77 
 
 		 663 aa  1111    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000158903  normal  0.791554 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2625  ferrous iron transport protein B  76.17 
 
 		 663 aa  1011    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1588  ferrous iron transport protein B  76.32 
 
 		 663 aa  1009    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0516402  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3001  ferrous iron transport protein B  78.58 
 
 		 662 aa  1059    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000135253  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2467  ferrous iron transport protein B  72.31 
 
 		 657 aa  932    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000331593  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3681  ferrous iron transport protein B  56.85 
 
 		 664 aa  734    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.10548  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0773  ferrous iron transport protein B  74.15 
 
 		 665 aa  964    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.332967  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1565  small GTP-binding protein domain-containing protein  44.81 
 
 		 688 aa  522  1e-147  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0658423  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2299  small GTP-binding protein  44.66 
 
 		 688 aa  520  1e-146  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  unclonable  0.00736056  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2387  small GTP-binding protein  44.51 
 
 		 688 aa  518  1.0000000000000001e-145  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.723257  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2250  small GTP-binding protein  41.64 
 
 		 689 aa  516  1.0000000000000001e-145  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.633777 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1068  small GTP-binding protein domain-containing protein  43.88 
 
 		 649 aa  488  1e-136  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.857406  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1076  ferrous iron transport B-like  48.44 
 
 		 487 aa  463  1e-129  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.652309 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13350  ferrous iron transport protein FeoB  40.41 
 
 		 616 aa  444  1e-123  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00495766  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0661  small GTP-binding protein  40.42 
 
 		 661 aa  434  1e-120  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.252074  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3531  small GTP-binding protein  42.28 
 
 		 654 aa  430  1e-119  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  unclonable  0.000000246563  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1800  Ferrous iron transport B domain protein  48.34 
 
 		 488 aa  432  1e-119  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1550  small GTP-binding protein  40.32 
 
 		 663 aa  426  1e-118  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000411502  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1828  nucleoside recognition domain protein  48.13 
 
 		 488 aa  427  1e-118  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.561638  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05920  Ferrous iron transport protein FeoB  44.3 
 
 		 480 aa  427  1e-118  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000073202  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1997  small GTP-binding protein  38.18 
 
 		 607 aa  426  1e-118  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0191527  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0648  small GTP-binding protein  39.6 
 
 		 650 aa  413  1e-114  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000421975  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1182  small GTP-binding protein domain-containing protein  39.43 
 
 		 614 aa  406  1.0000000000000001e-112  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0979811  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1563  small GTP-binding protein  37.46 
 
 		 607 aa  404  1e-111  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.657781  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1654  small GTP-binding protein  38.97 
 
 		 659 aa  404  1e-111  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000471814  hitchhiker  0.0000209414 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1460  small GTP-binding protein  36.92 
 
 		 634 aa  362  1e-98  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1872  ferrous iron transport protein B  34.11 
 
 		 658 aa  315  1.9999999999999998e-84  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0703  small GTP-binding protein  31.84 
 
 		 572 aa  301  2e-80  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.313338  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0467  ferrous iron transport protein B  32.96 
 
 		 623 aa  297  4e-79  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.630353 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0188  ferrous iron transport protein B  29.71 
 
 		 657 aa  293  5e-78  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000355145  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05070  Ferrous iron transporter protein FeoB  30.37 
 
 		 607 aa  285  2.0000000000000002e-75  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000363083  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0589  ferrous iron transport protein B  33.13 
 
 		 637 aa  284  3.0000000000000004e-75  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1668  ferrous iron transport protein B  31.53 
 
 		 662 aa  281  4e-74  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0114  GTP-binding protein HSR1-related  32.41 
 
 		 619 aa  276  6e-73  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2779  small GTP-binding protein  30.76 
 
 		 620 aa  272  1e-71  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1784  GTP-binding protein, HSR1-related  32.7 
 
 		 616 aa  273  1e-71  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0970  ferrous iron transport protein B  32.24 
 
 		 669 aa  272  2e-71  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.245644  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1140  ferrous iron transport protein B  30.35 
 
 		 680 aa  271  4e-71  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000225033  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1125  ferrous iron transport protein B  29.73 
 
 		 669 aa  270  5.9999999999999995e-71  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00490528  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0385  hypothetical protein  31.11 
 
 		 624 aa  270  8e-71  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0434  ferrous iron transport protein B  30.65 
 
 		 665 aa  270  8.999999999999999e-71  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1194  GTP-binding protein HSR1-related  29.65 
 
 		 606 aa  269  1e-70  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0970  ferrous iron transport protein B  30.78 
 
 		 666 aa  268  2e-70  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0839864 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3765  ferrous iron transport protein B  31.97 
 
 		 743 aa  266  8e-70  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1277  Fe2+ transport system protein B  30.21 
 
 		 576 aa  266  1e-69  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000691258  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1503  ferrous iron transport protein B, putative  30.55 
 
 		 576 aa  261  2e-68  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.111914  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4965  ferrous iron transport protein B  29.71 
 
 		 662 aa  261  3e-68  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3293  ferrous iron transport protein B  33.72 
 
 		 741 aa  261  3e-68  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.608312  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4542  ferrous iron transport protein B  29.71 
 
 		 662 aa  261  4e-68  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0779  ferrous iron transport protein B  30.92 
 
 		 688 aa  261  4e-68  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.328587  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4703  ferrous iron transport protein B  29.71 
 
 		 662 aa  260  5.0000000000000005e-68  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.580342  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5064  ferrous iron transport protein B  29.71 
 
 		 662 aa  260  5.0000000000000005e-68  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.939249  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1569  ferrous iron transport protein B  29.84 
 
 		 646 aa  260  6e-68  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0260  ferrous iron transport protein B  29.95 
 
 		 647 aa  259  8e-68  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1293  small GTP-binding protein  30.18 
 
 		 576 aa  259  9e-68  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0042575  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2325  ferrous iron transport protein B  30.72 
 
 		 666 aa  259  1e-67  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.907395  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3855  hypothetical protein  33.1 
 
 		 776 aa  259  1e-67  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.107886  normal  0.584174 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4928  ferrous iron transport protein B  29.71 
 
 		 662 aa  259  1e-67  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4947  ferrous iron transport protein B  29.56 
 
 		 662 aa  259  1e-67  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3658  ferrous iron transport protein B  30.73 
 
 		 741 aa  258  2e-67  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4560  ferrous iron transport protein B  29.41 
 
 		 662 aa  256  8e-67  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.185124  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1088  ferrous iron transport protein B  31.23 
 
 		 753 aa  256  8e-67  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.0000362942  hitchhiker  0.0000000000000163165 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1653  ferrous iron transport protein B  30.06 
 
 		 647 aa  256  1.0000000000000001e-66  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.888316 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3268  ferrous iron transport protein B  31.4 
 
 		 747 aa  254  3e-66  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.309598  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0307  ferrous iron transport protein B  29 
 
 		 662 aa  254  4.0000000000000004e-66  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4932  ferrous iron transport protein B  28.55 
 
 		 662 aa  254  5.000000000000001e-66  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0193  Fe2+ transport system protein B  29.88 
 
 		 691 aa  254  5.000000000000001e-66  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0635  ferrous iron transport protein B  30.86 
 
 		 676 aa  254  5.000000000000001e-66  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.0000306814  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3412  ferrous iron transport protein B  34.35 
 
 		 740 aa  253  6e-66  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0882  ferrous iron transport protein B  31.85 
 
 		 720 aa  253  7e-66  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000109469  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1294  ferrous iron transport protein B  33.04 
 
 		 844 aa  253  1e-65  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1951  ferrous iron transport protein B  30.33 
 
 		 680 aa  253  1e-65  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0016959  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4105  ferrous iron transport protein B  31.17 
 
 		 738 aa  252  2e-65  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.281443  normal  0.296674 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2470  ferrous iron transport protein B  32.89 
 
 		 786 aa  252  2e-65  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3474  ferrous iron transport protein B  29.5 
 
 		 662 aa  251  2e-65  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1785  ferrous iron transport protein B  30.94 
 
 		 713 aa  251  3e-65  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.84236  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2464  ferrous iron transport protein B  32.12 
 
 		 712 aa  251  4e-65  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.967572  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0719  ferrous iron transport protein B  30.88 
 
 		 829 aa  250  5e-65  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0311256  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4642  ferrous iron transport protein B  28.55 
 
 		 662 aa  250  7e-65  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0095  ferrous iron transport protein B  30.82 
 
 		 676 aa  249  1e-64  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0975  ferrous iron transport protein B  29.13 
 
 		 647 aa  248  3e-64  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0316  ferrous iron transport protein B  31.53 
 
 		 725 aa  248  3e-64  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000000873753  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0107  ferrous iron transport protein B  31.76 
 
 		 778 aa  248  4e-64  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.803376  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0856  hypothetical protein  32.64 
 
 		 649 aa  246  9e-64  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.935712  normal  0.465758 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2843  ferrous iron transport protein B  31.23 
 
 		 712 aa  245  1.9999999999999999e-63  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3368  ferrous iron transport protein B  33.76 
 
 		 740 aa  245  1.9999999999999999e-63  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2157  small GTP-binding protein domain-containing protein  29.49 
 
 		 571 aa  245  1.9999999999999999e-63  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2658  ferrous iron transport protein B  28.38 
 
 		 664 aa  243  9e-63  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0793  ferrous iron transport protein B  30.97 
 
 		 728 aa  243  1e-62  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.585929  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3524  ferrous iron transport protein B  32.87 
 
 		 697 aa  242  2e-62  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000134401  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0198  ferrous iron transport protein B  28.24 
 
 		 645 aa  241  2.9999999999999997e-62  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0654  Fe2+ transport system protein B  29.23 
 
 		 712 aa  241  2.9999999999999997e-62  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2414  ferrous iron transport protein B  31.19 
 
 		 772 aa  241  4e-62  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.331306  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0675  ferrous iron transport protein B  34.39 
 
 		 732 aa  241  4e-62  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.183925  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1458  ferrous iron transport protein B  31.15 
 
 		 716 aa  241  4e-62  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.137578  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1139  small GTP-binding protein  30.94 
 
 		 610 aa  240  5e-62  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1713  ferrous iron transport protein B  28.64 
 
 		 645 aa  240  5e-62  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.340113  normal  0.969498 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1452  ferrous iron transport protein B  28.46 
 
 		 665 aa  240  5.999999999999999e-62  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.789379  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>