More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_3001 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002939  GSU1380  ferrous iron transport protein B  78.58 
 
 
663 aa  1059    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1951  ferrous iron transport protein B  64.07 
 
 
654 aa  848    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2444  ferrous iron transport protein B  79.7 
 
 
663 aa  1071    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000158903  normal  0.791554 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2467  ferrous iron transport protein B  72.52 
 
 
657 aa  948    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000331593  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2625  ferrous iron transport protein B  75.57 
 
 
663 aa  1018    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3001  ferrous iron transport protein B  100 
 
 
662 aa  1328    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000135253  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3681  ferrous iron transport protein B  55.14 
 
 
664 aa  752    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.10548  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0773  ferrous iron transport protein B  73.91 
 
 
665 aa  988    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.332967  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1588  ferrous iron transport protein B  76.32 
 
 
663 aa  1026    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0516402  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2299  small GTP-binding protein  44.51 
 
 
688 aa  525  1e-147  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  unclonable  0.00736056  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2387  small GTP-binding protein  44.36 
 
 
688 aa  523  1e-147  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.723257  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1565  small GTP-binding protein domain-containing protein  44.23 
 
 
688 aa  519  1e-146  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0658423  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2250  small GTP-binding protein  42.07 
 
 
689 aa  511  1e-143  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.633777 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1068  small GTP-binding protein domain-containing protein  43.43 
 
 
649 aa  491  1e-137  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.857406  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1076  ferrous iron transport B-like  50.67 
 
 
487 aa  475  1e-132  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.652309 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1800  Ferrous iron transport B domain protein  48.74 
 
 
488 aa  441  9.999999999999999e-123  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0661  small GTP-binding protein  38.9 
 
 
661 aa  441  9.999999999999999e-123  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.252074  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13350  ferrous iron transport protein FeoB  40.53 
 
 
616 aa  438  1e-121  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00495766  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1997  small GTP-binding protein  38.91 
 
 
607 aa  436  1e-121  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0191527  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3531  small GTP-binding protein  42.57 
 
 
654 aa  436  1e-121  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  unclonable  0.000000246563  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1828  nucleoside recognition domain protein  48.54 
 
 
488 aa  437  1e-121  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.561638  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05920  Ferrous iron transport protein FeoB  46.3 
 
 
480 aa  434  1e-120  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000073202  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0648  small GTP-binding protein  40.12 
 
 
650 aa  424  1e-117  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000421975  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1550  small GTP-binding protein  40.03 
 
 
663 aa  421  1e-116  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000411502  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1563  small GTP-binding protein  38.36 
 
 
607 aa  414  1e-114  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.657781  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1182  small GTP-binding protein domain-containing protein  38.53 
 
 
614 aa  407  1.0000000000000001e-112  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0979811  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1654  small GTP-binding protein  37.27 
 
 
659 aa  402  9.999999999999999e-111  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000471814  hitchhiker  0.0000209414 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1460  small GTP-binding protein  35.7 
 
 
634 aa  360  5e-98  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1872  ferrous iron transport protein B  34.33 
 
 
658 aa  322  1.9999999999999998e-86  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1139  small GTP-binding protein  33.7 
 
 
610 aa  291  2e-77  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1277  Fe2+ transport system protein B  31.91 
 
 
576 aa  287  4e-76  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000691258  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0114  GTP-binding protein HSR1-related  33.85 
 
 
619 aa  286  7e-76  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0188  ferrous iron transport protein B  30.16 
 
 
657 aa  284  3.0000000000000004e-75  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000355145  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1194  GTP-binding protein HSR1-related  30.55 
 
 
606 aa  278  2e-73  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0467  ferrous iron transport protein B  31.07 
 
 
623 aa  278  3e-73  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.630353 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1668  ferrous iron transport protein B  30.91 
 
 
662 aa  278  3e-73  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1784  GTP-binding protein, HSR1-related  32.82 
 
 
616 aa  277  6e-73  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1140  ferrous iron transport protein B  32.02 
 
 
680 aa  276  1.0000000000000001e-72  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000225033  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0385  hypothetical protein  32.27 
 
 
624 aa  274  3e-72  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3293  ferrous iron transport protein B  33.5 
 
 
741 aa  273  7e-72  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.608312  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1293  small GTP-binding protein  30.64 
 
 
576 aa  273  9e-72  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0042575  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3765  ferrous iron transport protein B  33.27 
 
 
743 aa  273  9e-72  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0589  ferrous iron transport protein B  32.93 
 
 
637 aa  271  4e-71  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2779  small GTP-binding protein  30.78 
 
 
620 aa  270  7e-71  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1503  ferrous iron transport protein B, putative  30.49 
 
 
576 aa  270  8.999999999999999e-71  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.111914  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3268  ferrous iron transport protein B  29.75 
 
 
747 aa  267  5e-70  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.309598  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0434  ferrous iron transport protein B  31.09 
 
 
665 aa  263  4.999999999999999e-69  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1785  ferrous iron transport protein B  30.1 
 
 
713 aa  263  4.999999999999999e-69  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.84236  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3658  ferrous iron transport protein B  30.58 
 
 
741 aa  263  6e-69  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3412  ferrous iron transport protein B  32.89 
 
 
740 aa  263  6.999999999999999e-69  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0970  ferrous iron transport protein B  31.63 
 
 
669 aa  263  1e-68  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.245644  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1125  ferrous iron transport protein B  31.44 
 
 
669 aa  259  9e-68  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00490528  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4105  ferrous iron transport protein B  31.61 
 
 
738 aa  259  1e-67  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.281443  normal  0.296674 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0970  ferrous iron transport protein B  29.85 
 
 
666 aa  258  2e-67  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0839864 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3368  ferrous iron transport protein B  32.28 
 
 
740 aa  258  2e-67  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05070  Ferrous iron transporter protein FeoB  28.73 
 
 
607 aa  256  6e-67  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000363083  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0793  ferrous iron transport protein B  30.61 
 
 
728 aa  255  2.0000000000000002e-66  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.585929  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3855  hypothetical protein  31.86 
 
 
776 aa  254  3e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.107886  normal  0.584174 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2464  ferrous iron transport protein B  32.07 
 
 
712 aa  254  3e-66  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.967572  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1073  small GTP-binding protein  28.71 
 
 
650 aa  250  5e-65  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2157  small GTP-binding protein domain-containing protein  28.64 
 
 
571 aa  250  5e-65  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2325  ferrous iron transport protein B  30.32 
 
 
666 aa  250  6e-65  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.907395  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0779  ferrous iron transport protein B  29.62 
 
 
688 aa  250  7e-65  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.328587  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2470  ferrous iron transport protein B  31.57 
 
 
786 aa  249  2e-64  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1043  ferrous iron transport protein B  32.63 
 
 
725 aa  248  3e-64  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00262992 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4965  ferrous iron transport protein B  28.55 
 
 
662 aa  246  8e-64  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1508  ferrous iron transport protein B  27.11 
 
 
665 aa  246  9e-64  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.225021  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1933  ferrous iron transport protein B  33.08 
 
 
774 aa  245  1.9999999999999999e-63  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.651093  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1569  ferrous iron transport protein B  30 
 
 
646 aa  244  3e-63  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0107  ferrous iron transport protein B  31.86 
 
 
778 aa  244  3e-63  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.803376  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3474  ferrous iron transport protein B  28.46 
 
 
662 aa  244  3e-63  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2071  ferrous iron transport protein B  32.57 
 
 
774 aa  244  3e-63  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0703  small GTP-binding protein  30.21 
 
 
572 aa  244  3.9999999999999997e-63  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.313338  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2658  ferrous iron transport protein B  27.38 
 
 
664 aa  244  5e-63  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0882  ferrous iron transport protein B  31.79 
 
 
720 aa  243  7e-63  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000109469  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4947  ferrous iron transport protein B  28.24 
 
 
662 aa  243  7.999999999999999e-63  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1088  ferrous iron transport protein B  29.65 
 
 
753 aa  243  7.999999999999999e-63  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.0000362942  hitchhiker  0.0000000000000163165 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4703  ferrous iron transport protein B  28.24 
 
 
662 aa  243  1e-62  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.580342  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4542  ferrous iron transport protein B  28.24 
 
 
662 aa  243  1e-62  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5064  ferrous iron transport protein B  28.24 
 
 
662 aa  243  1e-62  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.939249  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1458  ferrous iron transport protein B  31.89 
 
 
716 aa  242  1e-62  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.137578  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4560  ferrous iron transport protein B  28.24 
 
 
662 aa  241  2e-62  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.185124  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0307  ferrous iron transport protein B  27.76 
 
 
662 aa  242  2e-62  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0719  ferrous iron transport protein B  30.47 
 
 
829 aa  242  2e-62  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0311256  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0635  ferrous iron transport protein B  29.59 
 
 
676 aa  241  2.9999999999999997e-62  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.0000306814  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1194  ferrous iron transport protein B  28.97 
 
 
714 aa  241  2.9999999999999997e-62  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0095  ferrous iron transport protein B  30.42 
 
 
676 aa  241  4e-62  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4928  ferrous iron transport protein B  28.09 
 
 
662 aa  241  4e-62  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4932  ferrous iron transport protein B  27.76 
 
 
662 aa  241  4e-62  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4642  ferrous iron transport protein B  27.76 
 
 
662 aa  240  6.999999999999999e-62  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1951  ferrous iron transport protein B  30.93 
 
 
680 aa  239  1e-61  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0016959  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2572  ferrous iron transport protein B  28.88 
 
 
664 aa  239  1e-61  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2626  ferrous iron transport protein B  28.88 
 
 
664 aa  239  1e-61  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.51649  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0260  ferrous iron transport protein B  30.17 
 
 
647 aa  239  1e-61  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2690  ferrous iron transport protein B  29.21 
 
 
764 aa  238  2e-61  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.878145  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1729  ferrous iron transport protein B  31.72 
 
 
717 aa  239  2e-61  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000105992  normal  0.0580785 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0623  ferrous iron transport protein B  29.06 
 
 
783 aa  238  2e-61  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.626283  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1294  ferrous iron transport protein B  29.88 
 
 
844 aa  238  3e-61  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2843  ferrous iron transport protein B  27.39 
 
 
712 aa  237  5.0000000000000005e-61  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2074  ferrous iron transport protein B  29.43 
 
 
712 aa  236  7e-61  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>