More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_2489 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007796  Mhun_2157  small GTP-binding protein domain-containing protein  61.75 
 
 		 571 aa  736    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2489  small GTP-binding protein  100 
 
 		 571 aa  1124    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1139  small GTP-binding protein  55.26 
 
 		 610 aa  623  1e-177  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05070  Ferrous iron transporter protein FeoB  53.36 
 
 		 607 aa  614  9.999999999999999e-175  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000363083  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1503  ferrous iron transport protein B, putative  52.25 
 
 		 576 aa  596  1e-169  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.111914  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1293  small GTP-binding protein  52.08 
 
 		 576 aa  595  1e-169  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0042575  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1277  Fe2+ transport system protein B  51.73 
 
 		 576 aa  588  1e-166  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000691258  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0703  small GTP-binding protein  50.96 
 
 		 572 aa  558  1e-158  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.313338  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0529  small GTP-binding protein  51.49 
 
 		 587 aa  526  1e-148  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1073  small GTP-binding protein  36.96 
 
 		 650 aa  395  1e-108  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13350  ferrous iron transport protein FeoB  34.2 
 
 		 616 aa  342  1e-92  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00495766  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1194  GTP-binding protein HSR1-related  33.55 
 
 		 606 aa  330  3e-89  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1997  small GTP-binding protein  31.22 
 
 		 607 aa  330  5.0000000000000004e-89  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0191527  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0661  small GTP-binding protein  33.22 
 
 		 661 aa  328  2.0000000000000001e-88  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.252074  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1182  small GTP-binding protein domain-containing protein  35.26 
 
 		 614 aa  328  2.0000000000000001e-88  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0979811  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1550  small GTP-binding protein  34.88 
 
 		 663 aa  326  7e-88  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000411502  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1872  ferrous iron transport protein B  32.77 
 
 		 658 aa  319  1e-85  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2779  small GTP-binding protein  33.39 
 
 		 620 aa  305  2.0000000000000002e-81  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0648  small GTP-binding protein  32.48 
 
 		 650 aa  299  7e-80  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000421975  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1668  ferrous iron transport protein B  30.84 
 
 		 662 aa  298  1e-79  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3681  ferrous iron transport protein B  32.72 
 
 		 664 aa  296  9e-79  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.10548  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1460  small GTP-binding protein  34.38 
 
 		 634 aa  295  2e-78  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1654  small GTP-binding protein  32.56 
 
 		 659 aa  294  4e-78  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000471814  hitchhiker  0.0000209414 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0467  ferrous iron transport protein B  34.26 
 
 		 623 aa  290  6e-77  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.630353 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1951  ferrous iron transport protein B  33.08 
 
 		 654 aa  289  1e-76  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2467  ferrous iron transport protein B  32.97 
 
 		 657 aa  287  4e-76  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000331593  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1563  small GTP-binding protein  30.1 
 
 		 607 aa  277  4e-73  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.657781  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0385  hypothetical protein  32.1 
 
 		 624 aa  274  4.0000000000000004e-72  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1784  GTP-binding protein, HSR1-related  32.01 
 
 		 616 aa  273  8.000000000000001e-72  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1380  ferrous iron transport protein B  33.6 
 
 		 663 aa  272  9e-72  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0114  GTP-binding protein HSR1-related  32.59 
 
 		 619 aa  271  2e-71  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1068  small GTP-binding protein domain-containing protein  30.8 
 
 		 649 aa  269  1e-70  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.857406  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2299  small GTP-binding protein  32.07 
 
 		 688 aa  262  1e-68  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  unclonable  0.00736056  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2387  small GTP-binding protein  32.07 
 
 		 688 aa  261  2e-68  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.723257  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2250  small GTP-binding protein  30.42 
 
 		 689 aa  250  6e-65  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.633777 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0661  Fe2+ transport system protein B-like protein  29.35 
 
 		 601 aa  244  3e-63  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0589  ferrous iron transport protein B  30.35 
 
 		 637 aa  240  5e-62  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0188  ferrous iron transport protein B  28.26 
 
 		 657 aa  229  1e-58  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000355145  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3765  ferrous iron transport protein B  30.39 
 
 		 743 aa  223  7e-57  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4965  ferrous iron transport protein B  28.07 
 
 		 662 aa  222  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4932  ferrous iron transport protein B  28.02 
 
 		 662 aa  220  3.9999999999999997e-56  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3474  ferrous iron transport protein B  29.13 
 
 		 662 aa  219  1e-55  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0307  ferrous iron transport protein B  28.07 
 
 		 662 aa  219  1e-55  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1631  ferrous iron transport protein B  27.41 
 
 		 587 aa  218  2e-55  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000000698683  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0465  ferrous iron transport protein B  30.86 
 
 		 770 aa  218  2.9999999999999998e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0434  ferrous iron transport protein B  29.84 
 
 		 665 aa  217  5e-55  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1913  ferrous iron transport protein B  27.95 
 
 		 587 aa  216  8e-55  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000339722  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1508  ferrous iron transport protein B  28.39 
 
 		 665 aa  212  1e-53  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.225021  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3001  ferrous iron transport protein B  33.33 
 
 		 662 aa  211  2e-53  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000135253  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1657  ferrous iron transport protein B  29.28 
 
 		 631 aa  211  4e-53  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000909964  hitchhiker  0.000224716 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2658  ferrous iron transport protein B  28.81 
 
 		 664 aa  210  6e-53  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3855  hypothetical protein  33.08 
 
 		 776 aa  209  9e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.107886  normal  0.584174 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1588  ferrous iron transport protein B  34.79 
 
 		 663 aa  209  1e-52  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0516402  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2444  ferrous iron transport protein B  34.48 
 
 		 663 aa  208  2e-52  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000158903  normal  0.791554 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2723  ferrous iron transport protein B  28.64 
 
 		 631 aa  207  6e-52  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000251574  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2625  ferrous iron transport protein B  33.85 
 
 		 663 aa  206  9e-52  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1818  Fe2+ transport system protein B  30.69 
 
 		 770 aa  206  1e-51  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.375819  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0623  ferrous iron transport protein B  29.16 
 
 		 783 aa  203  6e-51  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.626283  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2325  ferrous iron transport protein B  30.78 
 
 		 666 aa  203  6e-51  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.907395  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0107  ferrous iron transport protein B  30.84 
 
 		 778 aa  202  1.9999999999999998e-50  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.803376  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1653  ferrous iron transport protein B  27.8 
 
 		 647 aa  202  1.9999999999999998e-50  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.888316 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0856  hypothetical protein  31.22 
 
 		 649 aa  202  1.9999999999999998e-50  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.935712  normal  0.465758 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2809  ferrous iron transport protein B  29.09 
 
 		 597 aa  201  3e-50  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.123024 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0260  ferrous iron transport protein B  27.97 
 
 		 647 aa  200  5e-50  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0095  ferrous iron transport protein B  29.77 
 
 		 676 aa  200  7e-50  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1343  ferrous iron transport protein B  30.14 
 
 		 662 aa  199  7.999999999999999e-50  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.547756  normal  0.129294 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0168  ferrous iron transport protein B  29.54 
 
 		 771 aa  199  1.0000000000000001e-49  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.426324  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4560  ferrous iron transport protein B  27.85 
 
 		 662 aa  199  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.185124  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3746  ferrous iron transport protein B  29.54 
 
 		 771 aa  199  1.0000000000000001e-49  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4629  ferrous iron transport protein B  29.44 
 
 		 771 aa  199  1.0000000000000001e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2572  ferrous iron transport protein B  25.69 
 
 		 664 aa  198  2.0000000000000003e-49  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3985  ferrous iron transport protein B  29.26 
 
 		 771 aa  198  2.0000000000000003e-49  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2626  ferrous iron transport protein B  25.69 
 
 		 664 aa  198  2.0000000000000003e-49  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.51649  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1713  ferrous iron transport protein B  25.79 
 
 		 645 aa  196  9e-49  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.340113  normal  0.969498 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1569  ferrous iron transport protein B  26.73 
 
 		 646 aa  196  1e-48  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0773  ferrous iron transport protein B  35.01 
 
 		 665 aa  196  1e-48  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.332967  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1729  ferrous iron transport protein B  29.53 
 
 		 717 aa  195  2e-48  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000105992  normal  0.0580785 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4642  ferrous iron transport protein B  26.97 
 
 		 662 aa  195  2e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1565  small GTP-binding protein domain-containing protein  31.66 
 
 		 688 aa  193  6e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0658423  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0970  ferrous iron transport protein B  28.85 
 
 		 669 aa  193  8e-48  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.245644  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0882  ferrous iron transport protein B  29.22 
 
 		 720 aa  192  1e-47  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000109469  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2878  ferrous iron transport protein B  27.26 
 
 		 606 aa  192  1e-47  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0506695 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0110  ferrous iron transport protein B  28.87 
 
 		 668 aa  192  2e-47  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0260348  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1125  ferrous iron transport protein B  28.32 
 
 		 669 aa  192  2e-47  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00490528  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0735  ferrous iron transport protein B  28.41 
 
 		 648 aa  190  5e-47  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.56734  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1076  ferrous iron transport B-like  32.31 
 
 		 487 aa  190  7e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.652309 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0543  ferrous iron transport protein B  29.29 
 
 		 669 aa  190  8e-47  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00422143  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3875  ferrous iron transport protein B  30.66 
 
 		 772 aa  189  1e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.551384  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3779  ferrous iron transport protein B  30.72 
 
 		 772 aa  188  2e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3813  ferrous iron transport protein B  30.72 
 
 		 772 aa  188  2e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3707  ferrous iron transport protein B  30.72 
 
 		 772 aa  188  2e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0198  ferrous iron transport protein B  26.73 
 
 		 645 aa  189  2e-46  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1097  ferrous iron transport protein B  28.09 
 
 		 595 aa  187  3e-46  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3704  ferrous iron transport protein B  30.72 
 
 		 772 aa  187  5e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1597  GTP-binding protein HSR1-related  29.71 
 
 		 617 aa  186  7e-46  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0316  ferrous iron transport protein B  29.33 
 
 		 725 aa  186  8e-46  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000000873753  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0676  ferrous iron transport protein B  28.55 
 
 		 636 aa  186  1.0000000000000001e-45  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2849  ferrous iron transport protein B  33.33 
 
 		 618 aa  186  1.0000000000000001e-45  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1553  small GTP-binding protein  27.19 
 
 		 822 aa  186  1.0000000000000001e-45  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00130117  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00098  ferrous iron transport protein B  30.86 
 
 		 621 aa  185  2.0000000000000003e-45  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.069629  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>