206 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SAG1664 on replicon NC_004116
Organism: Streptococcus agalactiae 2603V/R



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004116  SAG1664  GTP-binding protein YqeH  100 
 
 		 372 aa  766    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00606929  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1585  GTP-binding protein YqeH  84.14 
 
 		 372 aa  662    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.595212  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1237  GTP-binding protein YqeH  63.61 
 
 		 375 aa  506  9.999999999999999e-143  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000896118  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0226  GTP-binding protein YqeH  62.5 
 
 		 401 aa  503  1e-141  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1740  GTP-binding protein YqeH  58.33 
 
 		 379 aa  452  1.0000000000000001e-126  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4455  GTP-binding protein YqeH  56.84 
 
 		 368 aa  438  9.999999999999999e-123  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.26216  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0782  GTP-binding protein YqeH  56.84 
 
 		 368 aa  438  9.999999999999999e-123  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0185086  hitchhiker  0.000205366 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2459  GTP-binding protein YqeH  56.18 
 
 		 370 aa  440  9.999999999999999e-123  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0019503  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4186  GTP-binding protein YqeH  56.57 
 
 		 368 aa  438  9.999999999999999e-123  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4416  GTP-binding protein YqeH  56.57 
 
 		 368 aa  435  1e-121  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4233  GTP-binding protein YqeH  56.57 
 
 		 368 aa  435  1e-121  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4071  GTP-binding protein YqeH  56.57 
 
 		 368 aa  435  1e-121  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0184971  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4081  GTP-binding protein YqeH  56.57 
 
 		 368 aa  435  1e-121  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4357  GTP-binding protein YqeH  56.57 
 
 		 368 aa  435  1e-121  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.701648 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4562  GTP-binding protein YqeH  56.57 
 
 		 368 aa  435  1e-121  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4468  GTP-binding protein YqeH  56.57 
 
 		 368 aa  435  1e-121  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0923529  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3061  GTP-binding protein YqeH  55.35 
 
 		 368 aa  431  1e-120  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.844402  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0992  GTP-binding protein YqeH  54.18 
 
 		 369 aa  414  1e-114  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1404  GTP-binding protein YqeH  47.99 
 
 		 369 aa  363  3e-99  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000143151  hitchhiker  2.51031e-26 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1164  GTP-binding protein YqeH  46.38 
 
 		 366 aa  345  5e-94  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0914946  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1654  GTP-binding protein YqeH  46.9 
 
 		 366 aa  326  5e-88  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1689  GTP-binding protein YqeH  46.9 
 
 		 366 aa  326  5e-88  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0906  GTP-binding protein YqeH  43.68 
 
 		 385 aa  322  6e-87  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.346468  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2017  ribosome biogenesis GTPase YqeH  36.34 
 
 		 396 aa  246  4.9999999999999997e-64  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0079  GTP-binding protein, HSR1-related  34.5 
 
 		 363 aa  206  7e-52  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000212587  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0079  GTP-binding protein HSR1-related  34.23 
 
 		 363 aa  205  1e-51  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00226262  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0424  hypothetical protein  33.51 
 
 		 367 aa  197  4.0000000000000005e-49  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  decreased coverage  0.00290695  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1822  GTP-binding protein HSR1-related protein  28.84 
 
 		 379 aa  188  2e-46  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1198  GTP-binding protein HSR1-related  30.65 
 
 		 376 aa  179  7e-44  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_40200  predicted protein  30.51 
 
 		 710 aa  177  2e-43  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00209699  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl351  GTPase  30.69 
 
 		 365 aa  168  1e-40  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  4.213e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0841  hypothetical protein  30.79 
 
 		 365 aa  160  2e-38  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0797  GTP-binding protein, HSR1-related  29.65 
 
 		 357 aa  157  3e-37  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_49745  predicted protein  30.97 
 
 		 604 aa  153  5e-36  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.814694  normal  0.848329 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0525  ribosome biogenesis GTPase YqeH  26.68 
 
 		 361 aa  133  6e-30  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.642642  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0436  GTP-binding protein HSR1-related protein  27.44 
 
 		 391 aa  132  1.0000000000000001e-29  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_37471  predicted protein  26.83 
 
 		 401 aa  118  1.9999999999999998e-25  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0357188  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2453  ribosomal biogenesis GTPase  27.11 
 
 		 312 aa  60.8  0.00000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.643671  normal  0.265294 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0059  GTP-binding protein HSR1-related  28.21 
 
 		 260 aa  57.8  0.0000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.800533  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02636  ribosomal biogenesis GTPase  27.81 
 
 		 323 aa  56.6  0.0000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000287  50S ribosomal subunit maturation GTPase RbgA  27.1 
 
 		 314 aa  56.2  0.0000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.146408  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3634  ribosomal biogenesis GTPase  28.25 
 
 		 334 aa  55.1  0.000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.909228  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2377  ribosomal biogenesis GTPase  28.75 
 
 		 307 aa  54.7  0.000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0461  ribosomal biogenesis GTPase  26.45 
 
 		 314 aa  55.1  0.000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.178573  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1388  GTP-binding  28.57 
 
 		 316 aa  53.5  0.000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3396  GTP-binding  27.68 
 
 		 330 aa  53.5  0.000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1312  GTP-binding protein, HSR1-related  25.86 
 
 		 319 aa  53.1  0.000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06087  ribosomal biogenesis GTPase  25.81 
 
 		 314 aa  52.4  0.00001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2587  tRNA modification GTPase TrmE  42.03 
 
 		 448 aa  52.4  0.00001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.147171 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_2182  predicted protein  29.44 
 
 		 360 aa  51.6  0.00002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3629  GTP-binding protein HSR1-related  28.57 
 
 		 320 aa  51.6  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1486  ribosomal biogenesis GTPase  27.74 
 
 		 313 aa  52  0.00002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1029  tRNA modification GTPase TrmE  42.03 
 
 		 434 aa  50.8  0.00003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.111023  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5023  tRNA modification GTPase TrmE  41.18 
 
 		 447 aa  51.2  0.00003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0584026  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0429  tRNA modification GTPase TrmE  46.38 
 
 		 462 aa  51.2  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0669  ribosomal biogenesis GTPase  27.11 
 
 		 311 aa  51.2  0.00003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.378944  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2029  ribosomal biogenesis GTPase  27.11 
 
 		 312 aa  50.4  0.00004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.831437  normal  0.492608 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4081  tRNA modification GTPase TrmE  44.93 
 
 		 441 aa  50.8  0.00004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0162579 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2638  ribosomal biogenesis GTPase  27.11 
 
 		 312 aa  50.4  0.00005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00454653  normal  0.052608 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0392  tRNA modification GTPase TrmE  46.38 
 
 		 460 aa  50.1  0.00006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.379406 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2510  GTP-binding protein, HSR1-related  26.62 
 
 		 319 aa  50.1  0.00007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.271003  normal  0.0153931 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0750  GTP-binding protein EngA  30.06 
 
 		 451 aa  49.7  0.00008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.524371  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1301  GTP-binding protein HSR1-related  31.25 
 
 		 299 aa  49.7  0.00009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000833299 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3624  tRNA modification GTPase TrmE  42.03 
 
 		 455 aa  49.7  0.00009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.473452  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1350  GTP-binding protein HSR1-related  26.62 
 
 		 319 aa  48.9  0.0001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0587703  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2437  ribosomal biogenesis GTPase  26.45 
 
 		 313 aa  48.9  0.0001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.743849  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1230  tRNA modification GTPase TrmE  43.48 
 
 		 428 aa  49.3  0.0001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1889  ribosomal biogenesis GTPase  26.45 
 
 		 313 aa  48.9  0.0001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1993  ribosomal biogenesis GTPase  26.75 
 
 		 314 aa  48.9  0.0001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0543739  normal  0.136959 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2891  tRNA modification GTPase TrmE  43.48 
 
 		 428 aa  49.3  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1855  ribosomal biogenesis GTPase  26.45 
 
 		 313 aa  48.9  0.0001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1882  ribosomal biogenesis GTPase  26.45 
 
 		 313 aa  48.9  0.0001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.140157  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1589  ribosomal biogenesis GTPase  25.3 
 
 		 313 aa  48.9  0.0001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.246818 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1752  ribosomal biogenesis GTPase  26.45 
 
 		 313 aa  48.9  0.0001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1204  GTP-binding protein EngA  34.68 
 
 		 442 aa  49.3  0.0001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.109244  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3454  tRNA modification GTPase TrmE  37.35 
 
 		 429 aa  48.5  0.0002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0483  GTP-binding protein, HSR1-related  29.7 
 
 		 258 aa  48.9  0.0002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2508  ribosomal biogenesis GTPase  26.51 
 
 		 312 aa  48.1  0.0002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3656  tRNA modification GTPase TrmE  37.25 
 
 		 460 aa  48.1  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2864  tRNA modification GTPase TrmE  37.8 
 
 		 428 aa  48.5  0.0002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.234827 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2924  HSR1-related GTP-binding protein  30.47 
 
 		 299 aa  48.5  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2758  GTP-binding protein, HSR1-related  28.66 
 
 		 329 aa  48.5  0.0002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0145905 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02701  ribosomal biogenesis GTPase  27.27 
 
 		 287 aa  48.1  0.0002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0776649  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1609  GTP-binding protein EngA  29.38 
 
 		 449 aa  48.1  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0528486 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1937  GTP-binding protein EngA  29.38 
 
 		 449 aa  48.1  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_33876  predicted protein  36.78 
 
 		 489 aa  48.5  0.0002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.242987 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2667  tRNA modification GTPase TrmE  36.99 
 
 		 428 aa  48.5  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0398705  normal  0.380735 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2407  tRNA modification GTPase TrmE  40.58 
 
 		 433 aa  48.9  0.0002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0297  tRNA modification GTPase TrmE  46.38 
 
 		 441 aa  47.8  0.0003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2590  ribosomal biogenesis GTPase  26.45 
 
 		 313 aa  47.8  0.0003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3472  tRNA modification GTPase TrmE  42.03 
 
 		 442 aa  48.1  0.0003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4089  ribosomal biogenesis GTPase  23.46 
 
 		 281 aa  47.8  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1054  ribosomal biogenesis GTPase  25.42 
 
 		 315 aa  47.4  0.0004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0717  tRNA modification GTPase TrmE  43.48 
 
 		 550 aa  47.4  0.0004  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2395  ribosomal biogenesis GTPase  25.81 
 
 		 313 aa  47.4  0.0004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.806942 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1580  tRNA modification GTPase TrmE  34.44 
 
 		 444 aa  47.4  0.0004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.183316 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0643  tRNA modification GTPase TrmE  38.27 
 
 		 452 aa  47.4  0.0004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.461676 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1561  ribosomal biogenesis GTPase  27.27 
 
 		 287 aa  47.4  0.0005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2186  ribosomal biogenesis GTPase  24.68 
 
 		 313 aa  46.6  0.0006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2263  ribosomal biogenesis GTPase  24.68 
 
 		 313 aa  46.6  0.0006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>