More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SAG1013 on replicon NC_004116
Organism: Streptococcus agalactiae 2603V/R



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004116  SAG1013  ribosomal biogenesis GTPase  100 
 
 
283 aa  577  1e-164  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.132908  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0919  ribosomal biogenesis GTPase  87.99 
 
 
284 aa  510  1e-144  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.294572  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1416  ribosomal biogenesis GTPase  69.89 
 
 
283 aa  406  1.0000000000000001e-112  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.00443588  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1095  ribosomal biogenesis GTPase  49.65 
 
 
283 aa  291  6e-78  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00065113  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2490  ribosomal biogenesis GTPase  50.89 
 
 
287 aa  290  3e-77  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000101626  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3661  ribosomal biogenesis GTPase  48.74 
 
 
296 aa  286  2e-76  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000313796  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3880  ribosomal biogenesis GTPase  49.11 
 
 
296 aa  284  1.0000000000000001e-75  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000579568  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3689  ribosomal biogenesis GTPase  49.11 
 
 
296 aa  283  2.0000000000000002e-75  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0162209  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3579  ribosomal biogenesis GTPase  49.11 
 
 
296 aa  283  2.0000000000000002e-75  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000271121  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3597  ribosomal biogenesis GTPase  49.11 
 
 
296 aa  283  2.0000000000000002e-75  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00124948  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3976  ribosomal biogenesis GTPase  49.11 
 
 
296 aa  283  2.0000000000000002e-75  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000127206  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3851  ribosomal biogenesis GTPase  49.11 
 
 
296 aa  283  2.0000000000000002e-75  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  5.126e-62 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1307  ribosomal biogenesis GTPase  48.75 
 
 
296 aa  282  3.0000000000000004e-75  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000615833  unclonable  1.55704e-25 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3936  ribosomal biogenesis GTPase  48.75 
 
 
296 aa  282  4.0000000000000003e-75  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000467955  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3885  ribosomal biogenesis GTPase  48.75 
 
 
296 aa  282  5.000000000000001e-75  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000521697  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1988  ribosomal biogenesis GTPase  47.54 
 
 
288 aa  281  1e-74  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0776  GTP-binding protein YlqF  46.71 
 
 
290 aa  277  1e-73  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.119569  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0764  GTP-binding protein YlqF  45.09 
 
 
284 aa  268  5.9999999999999995e-71  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2048  GTP-binding protein, HSR1-related  46.93 
 
 
284 aa  266  2.9999999999999995e-70  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000391161  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0913  GTPase  43.88 
 
 
279 aa  262  6e-69  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000773459 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0763  GTP-binding protein YlqF  45.91 
 
 
291 aa  253  2.0000000000000002e-66  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000221052  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1327  ribosomal biogenesis GTPase  43.92 
 
 
294 aa  248  8e-65  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.575844  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1302  ribosomal biogenesis GTPase  43.92 
 
 
294 aa  248  8e-65  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00764479  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0811  ribosomal biogenesis GTPase  44.56 
 
 
287 aa  247  1e-64  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00749287  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1203  GTP-binding protein HSR1-related  43.32 
 
 
283 aa  238  1e-61  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000139155  normal  0.179888 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0716  GTP1/OBG protein  43.16 
 
 
292 aa  237  2e-61  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00781144  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1486  ribosomal biogenesis GTPase  42.09 
 
 
313 aa  233  3e-60  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2401  GTP-binding protein HSR1-related  42.91 
 
 
292 aa  231  9e-60  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00457359  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2306  ribosomal biogenesis GTPase  42.91 
 
 
313 aa  230  2e-59  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.575224  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06087  ribosomal biogenesis GTPase  41.26 
 
 
314 aa  229  3e-59  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3753  GTP1/OBG protein  44.53 
 
 
276 aa  229  3e-59  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000336118  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1293  GTP-binding protein HSR1-related  41.52 
 
 
280 aa  228  8e-59  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.00000000027879  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1554  GTP-binding protein  42.03 
 
 
281 aa  228  9e-59  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1589  ribosomal biogenesis GTPase  42.5 
 
 
313 aa  227  2e-58  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.246818 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2029  ribosomal biogenesis GTPase  41.79 
 
 
312 aa  226  4e-58  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.831437  normal  0.492608 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2638  ribosomal biogenesis GTPase  41.37 
 
 
312 aa  225  5.0000000000000005e-58  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00454653  normal  0.052608 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1882  ribosomal biogenesis GTPase  41.73 
 
 
313 aa  225  7e-58  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.140157  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1855  ribosomal biogenesis GTPase  41.73 
 
 
313 aa  225  7e-58  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1889  ribosomal biogenesis GTPase  41.73 
 
 
313 aa  225  7e-58  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000287  50S ribosomal subunit maturation GTPase RbgA  41.64 
 
 
314 aa  224  8e-58  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.146408  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2437  ribosomal biogenesis GTPase  41.73 
 
 
313 aa  224  9e-58  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.743849  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1961  ribosomal biogenesis GTPase  39.71 
 
 
281 aa  223  2e-57  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.648804  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0663  GTP-binding protein, HSR1-related  36.46 
 
 
284 aa  222  4.9999999999999996e-57  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.011457  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1679  ribosomal biogenesis GTPase  39.35 
 
 
281 aa  222  4.9999999999999996e-57  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.607688  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1752  ribosomal biogenesis GTPase  41.84 
 
 
313 aa  222  7e-57  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0461  ribosomal biogenesis GTPase  41.13 
 
 
314 aa  221  9e-57  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.178573  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1703  ribosomal biogenesis GTPase  41.11 
 
 
310 aa  221  9.999999999999999e-57  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.237834  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2508  ribosomal biogenesis GTPase  40.71 
 
 
312 aa  221  9.999999999999999e-57  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1982  ribosomal biogenesis GTPase  42.09 
 
 
318 aa  220  1.9999999999999999e-56  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.360178 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2283  ribosomal biogenesis GTPase  42.09 
 
 
318 aa  219  3e-56  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0251974 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0186  GTP-binding protein HSR1-related protein  39.79 
 
 
285 aa  217  2e-55  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2590  ribosomal biogenesis GTPase  41.13 
 
 
313 aa  216  2.9999999999999998e-55  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3634  ribosomal biogenesis GTPase  40.65 
 
 
334 aa  214  9.999999999999999e-55  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.909228  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2395  ribosomal biogenesis GTPase  40.07 
 
 
313 aa  213  2.9999999999999995e-54  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.806942 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2186  ribosomal biogenesis GTPase  40.07 
 
 
313 aa  213  2.9999999999999995e-54  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2263  ribosomal biogenesis GTPase  40.07 
 
 
313 aa  213  2.9999999999999995e-54  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1707  GTP-binding protein, HSR1-related  39.86 
 
 
277 aa  213  3.9999999999999995e-54  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.12169  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1054  ribosomal biogenesis GTPase  37.81 
 
 
315 aa  212  4.9999999999999996e-54  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1993  ribosomal biogenesis GTPase  40.5 
 
 
314 aa  211  7e-54  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0543739  normal  0.136959 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1409  ribosome biogenesis GTP-binding protein YlqF  40.14 
 
 
271 aa  211  9e-54  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.421311  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0669  ribosomal biogenesis GTPase  38.85 
 
 
311 aa  211  1e-53  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.378944  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2453  ribosomal biogenesis GTPase  37.99 
 
 
312 aa  206  2e-52  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.643671  normal  0.265294 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1367  ribosome biogenesis GTP-binding protein YlqF  35.89 
 
 
292 aa  207  2e-52  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1490  GTP-binding protein  39.35 
 
 
278 aa  204  1e-51  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000000659617  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1604  GTP-binding protein, HSR1-related  37.23 
 
 
277 aa  204  1e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000452633  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0169  ribosomal biogenesis GTPase  40.85 
 
 
323 aa  201  9.999999999999999e-51  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000316145  normal  0.720532 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1349  GTP-binding  36.96 
 
 
319 aa  201  9.999999999999999e-51  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00974199  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0705  GTP-binding protein HSR1-related protein  36.43 
 
 
298 aa  200  1.9999999999999998e-50  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2146  GTP-binding protein, HSR1-related  37.41 
 
 
305 aa  199  3.9999999999999996e-50  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1688  GTP-binding protein HSR1-related  39.21 
 
 
341 aa  197  2.0000000000000003e-49  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.161371  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0773  GTPases  37.23 
 
 
280 aa  196  4.0000000000000005e-49  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.79834e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0973  GTP-binding protein HSR1-related protein  38.3 
 
 
282 aa  195  7e-49  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000015477  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1018  GTPase  35.87 
 
 
282 aa  194  1e-48  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.447609  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2924  HSR1-related GTP-binding protein  38.13 
 
 
299 aa  193  2e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1301  GTP-binding protein HSR1-related  38.49 
 
 
299 aa  193  3e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000833299 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2377  ribosomal biogenesis GTPase  35.46 
 
 
307 aa  191  8e-48  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1785  GTP-binding  38.3 
 
 
307 aa  186  4e-46  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.417498 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1204  GTP-binding  37.86 
 
 
305 aa  185  6e-46  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.185511  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1682  GTP-binding protein HSR1-related  37.23 
 
 
324 aa  181  1e-44  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02636  ribosomal biogenesis GTPase  38.15 
 
 
323 aa  181  2e-44  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1350  GTP-binding protein HSR1-related  35.52 
 
 
319 aa  181  2e-44  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0587703  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2510  GTP-binding protein, HSR1-related  35.52 
 
 
319 aa  181  2e-44  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.271003  normal  0.0153931 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07360  GTP-binding protein HSR1-related  36.88 
 
 
282 aa  178  1e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000017476  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1388  GTP-binding  37.72 
 
 
316 aa  177  1e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2120  GTPase  36.4 
 
 
304 aa  176  3e-43  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2474  GTP-binding protein HSR1-related  34.95 
 
 
317 aa  176  3e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.188866  normal  0.279197 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1227  GTP-binding protein HSR1-related  36.23 
 
 
279 aa  174  9.999999999999999e-43  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.240539  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3629  GTP-binding protein HSR1-related  35.66 
 
 
320 aa  174  9.999999999999999e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2487  GTP-binding protein HSR1-related  35.46 
 
 
328 aa  172  5e-42  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000110563 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1312  GTP-binding protein, HSR1-related  37.01 
 
 
319 aa  171  2e-41  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl538  GTPase  32.29 
 
 
315 aa  169  5e-41  Mesoplasma florum L1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000607031  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3396  GTP-binding  35.79 
 
 
330 aa  169  5e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0973  GTP-binding protein YlqF  32.71 
 
 
270 aa  167  1e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000216329  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2758  GTP-binding protein, HSR1-related  35.27 
 
 
329 aa  166  2.9999999999999998e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0145905 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2270  GTP-binding protein  33.45 
 
 
322 aa  166  2.9999999999999998e-40  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00193404  hitchhiker  0.000000344964 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0843  GTP-binding protein HSR1-related  34.52 
 
 
271 aa  163  3e-39  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1586  ribosomal biogenesis GTPase  30.11 
 
 
281 aa  156  4e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0128264 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0663  ribosomal biogenesis GTPase  31.16 
 
 
279 aa  154  1e-36  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.5554  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0543  GTPase family protein  32.76 
 
 
316 aa  154  1e-36  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02121  ribosomal biogenesis GTPase  30.85 
 
 
287 aa  150  2e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>