246 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9902_2142 on replicon NC_007513
Organism: Synechococcus sp. CC9902



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_2142  ribosomal biogenesis GTPase  100 
 
 		 292 aa  587  1e-167  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2458  ribosomal biogenesis GTPase  86.41 
 
 		 288 aa  466  9.999999999999999e-131  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27991  ribosomal biogenesis GTPase  75.96 
 
 		 289 aa  414  9.999999999999999e-116  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1561  ribosomal biogenesis GTPase  66.2 
 
 		 287 aa  391  1e-108  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02701  ribosomal biogenesis GTPase  65.85 
 
 		 287 aa  389  1e-107  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0776649  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02121  ribosomal biogenesis GTPase  64.93 
 
 		 287 aa  381  1e-105  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02141  ribosomal biogenesis GTPase  55.75 
 
 		 290 aa  348  4e-95  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.909722  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0196  ribosomal biogenesis GTPase  55.05 
 
 		 290 aa  348  5e-95  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.122374  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02121  ribosomal biogenesis GTPase  54.7 
 
 		 290 aa  347  1e-94  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.269316  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02231  ribosomal biogenesis GTPase  55.05 
 
 		 288 aa  338  8e-92  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1114  ribosomal biogenesis GTPase  59.17 
 
 		 287 aa  309  4e-83  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.44359  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0838  ribosome biogenesis GTP-binding protein YlqF  51.06 
 
 		 293 aa  287  1e-76  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3374  ribosomal biogenesis GTPase  50 
 
 		 285 aa  285  7e-76  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1586  ribosomal biogenesis GTPase  49.82 
 
 		 281 aa  282  4.0000000000000003e-75  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0128264 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2557  ribosomal biogenesis GTPase  52.04 
 
 		 327 aa  269  5e-71  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4647  ribosomal biogenesis GTPase  50.7 
 
 		 293 aa  268  8e-71  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.365042 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4128  ribosomal biogenesis GTPase  47.4 
 
 		 281 aa  265  5e-70  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4089  ribosomal biogenesis GTPase  48.1 
 
 		 281 aa  247  2e-64  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_33865  predicted protein  45.26 
 
 		 369 aa  241  1e-62  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.837548 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1302  ribosomal biogenesis GTPase  33.8 
 
 		 294 aa  187  2e-46  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00764479  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1327  ribosomal biogenesis GTPase  33.8 
 
 		 294 aa  187  2e-46  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.575844  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0811  ribosomal biogenesis GTPase  33.1 
 
 		 287 aa  186  5e-46  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00749287  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2401  GTP-binding protein HSR1-related  31.23 
 
 		 292 aa  174  1.9999999999999998e-42  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00457359  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1707  GTP-binding protein, HSR1-related  32.87 
 
 		 277 aa  170  3e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.12169  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0716  GTP1/OBG protein  32.18 
 
 		 292 aa  169  5e-41  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00781144  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0763  GTP-binding protein YlqF  31.19 
 
 		 291 aa  169  5e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000221052  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1203  GTP-binding protein HSR1-related  33.67 
 
 		 283 aa  169  5e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000139155  normal  0.179888 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3880  ribosomal biogenesis GTPase  38.86 
 
 		 296 aa  168  7e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000579568  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1307  ribosomal biogenesis GTPase  32.76 
 
 		 296 aa  169  7e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000615833  unclonable  1.55704e-25 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3936  ribosomal biogenesis GTPase  32.76 
 
 		 296 aa  168  8e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000467955  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3885  ribosomal biogenesis GTPase  38.86 
 
 		 296 aa  168  9e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000521697  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2490  ribosomal biogenesis GTPase  37.44 
 
 		 287 aa  167  1e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000101626  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3597  ribosomal biogenesis GTPase  38.39 
 
 		 296 aa  167  2e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00124948  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3661  ribosomal biogenesis GTPase  37.91 
 
 		 296 aa  167  2e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000313796  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3851  ribosomal biogenesis GTPase  38.39 
 
 		 296 aa  167  2e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  5.126e-62 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3579  ribosomal biogenesis GTPase  37.91 
 
 		 296 aa  166  2.9999999999999998e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000271121  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3689  ribosomal biogenesis GTPase  37.91 
 
 		 296 aa  166  5e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0162209  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3976  ribosomal biogenesis GTPase  37.91 
 
 		 296 aa  166  5e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000127206  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1988  ribosomal biogenesis GTPase  32.88 
 
 		 288 aa  165  8e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1490  GTP-binding protein  32.5 
 
 		 278 aa  164  1.0000000000000001e-39  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000000659617  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07360  GTP-binding protein HSR1-related  30.58 
 
 		 282 aa  162  6e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000017476  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1095  ribosomal biogenesis GTPase  30.66 
 
 		 283 aa  158  1e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00065113  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1679  ribosomal biogenesis GTPase  29.76 
 
 		 281 aa  156  4e-37  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.607688  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1961  ribosomal biogenesis GTPase  30.45 
 
 		 281 aa  155  6e-37  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.648804  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1367  ribosome biogenesis GTP-binding protein YlqF  31.1 
 
 		 292 aa  153  2.9999999999999998e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2048  GTP-binding protein, HSR1-related  30.07 
 
 		 284 aa  153  4e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000391161  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0764  GTP-binding protein YlqF  31.14 
 
 		 284 aa  152  5.9999999999999996e-36  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0919  ribosomal biogenesis GTPase  36.32 
 
 		 284 aa  149  4e-35  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.294572  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0776  GTP-binding protein YlqF  33.33 
 
 		 290 aa  149  7e-35  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.119569  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0186  GTP-binding protein HSR1-related protein  31.31 
 
 		 285 aa  147  2.0000000000000003e-34  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1416  ribosomal biogenesis GTPase  36.84 
 
 		 283 aa  146  5e-34  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.00443588  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1293  GTP-binding protein HSR1-related  28.67 
 
 		 280 aa  144  2e-33  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.00000000027879  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0913  GTPase  27.76 
 
 		 279 aa  143  3e-33  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000773459 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0705  GTP-binding protein HSR1-related protein  26.8 
 
 		 298 aa  143  4e-33  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0973  GTP-binding protein HSR1-related protein  30.18 
 
 		 282 aa  142  8e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000015477  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1013  ribosomal biogenesis GTPase  34.55 
 
 		 283 aa  140  1.9999999999999998e-32  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.132908  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl538  GTPase  28.57 
 
 		 315 aa  140  1.9999999999999998e-32  Mesoplasma florum L1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000607031  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0663  GTP-binding protein, HSR1-related  33.33 
 
 		 284 aa  140  3e-32  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.011457  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2758  GTP-binding protein, HSR1-related  35 
 
 		 329 aa  137  2e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0145905 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1785  GTP-binding  32.54 
 
 		 307 aa  134  9.999999999999999e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.417498 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0773  GTPases  30.2 
 
 		 280 aa  132  5e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.79834e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1409  ribosome biogenesis GTP-binding protein YlqF  29.76 
 
 		 271 aa  132  6.999999999999999e-30  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.421311  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0973  GTP-binding protein YlqF  32.23 
 
 		 270 aa  129  7.000000000000001e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000216329  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1982  ribosomal biogenesis GTPase  29.66 
 
 		 318 aa  128  1.0000000000000001e-28  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.360178 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2283  ribosomal biogenesis GTPase  29.66 
 
 		 318 aa  128  1.0000000000000001e-28  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0251974 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3753  GTP1/OBG protein  28.57 
 
 		 276 aa  125  8.000000000000001e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000336118  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1682  GTP-binding protein HSR1-related  33.67 
 
 		 324 aa  124  1e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2474  GTP-binding protein HSR1-related  29.69 
 
 		 317 aa  124  2e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.188866  normal  0.279197 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1388  GTP-binding  30.69 
 
 		 316 aa  124  2e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1688  GTP-binding protein HSR1-related  29.01 
 
 		 341 aa  122  5e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.161371  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0169  ribosomal biogenesis GTPase  28.28 
 
 		 323 aa  122  7e-27  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000316145  normal  0.720532 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3396  GTP-binding  30.45 
 
 		 330 aa  122  8e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2487  GTP-binding protein HSR1-related  34.29 
 
 		 328 aa  122  9.999999999999999e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000110563 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1054  ribosomal biogenesis GTPase  25.5 
 
 		 315 aa  120  3.9999999999999996e-26  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1018  GTPase  30.69 
 
 		 282 aa  118  9.999999999999999e-26  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.447609  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3629  GTP-binding protein HSR1-related  30.1 
 
 		 320 aa  118  9.999999999999999e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2453  ribosomal biogenesis GTPase  29.05 
 
 		 312 aa  118  9.999999999999999e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.643671  normal  0.265294 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2377  ribosomal biogenesis GTPase  31.53 
 
 		 307 aa  118  9.999999999999999e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1604  GTP-binding protein, HSR1-related  31.21 
 
 		 277 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000452633  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2120  GTPase  30.61 
 
 		 304 aa  117  3e-25  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2508  ribosomal biogenesis GTPase  27.61 
 
 		 312 aa  116  3.9999999999999997e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0843  GTP-binding protein HSR1-related  31.72 
 
 		 271 aa  116  3.9999999999999997e-25  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1350  GTP-binding protein HSR1-related  31.51 
 
 		 319 aa  116  3.9999999999999997e-25  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0587703  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1204  GTP-binding  28.42 
 
 		 305 aa  116  5e-25  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.185511  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2510  GTP-binding protein, HSR1-related  31.51 
 
 		 319 aa  116  5e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.271003  normal  0.0153931 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0663  ribosomal biogenesis GTPase  25.52 
 
 		 279 aa  115  8.999999999999998e-25  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.5554  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2638  ribosomal biogenesis GTPase  27.21 
 
 		 312 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00454653  normal  0.052608 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2029  ribosomal biogenesis GTPase  27.21 
 
 		 312 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.831437  normal  0.492608 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1312  GTP-binding protein, HSR1-related  29.76 
 
 		 319 aa  114  2.0000000000000002e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2270  GTP-binding protein  28.77 
 
 		 322 aa  114  2.0000000000000002e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00193404  hitchhiker  0.000000344964 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06087  ribosomal biogenesis GTPase  25.85 
 
 		 314 aa  114  3e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3634  ribosomal biogenesis GTPase  26.71 
 
 		 334 aa  112  7.000000000000001e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.909228  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2437  ribosomal biogenesis GTPase  26.12 
 
 		 313 aa  112  8.000000000000001e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.743849  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1882  ribosomal biogenesis GTPase  26.12 
 
 		 313 aa  112  9e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.140157  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1855  ribosomal biogenesis GTPase  26.12 
 
 		 313 aa  112  9e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1486  ribosomal biogenesis GTPase  27.05 
 
 		 313 aa  112  9e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1889  ribosomal biogenesis GTPase  26.12 
 
 		 313 aa  112  9e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1227  GTP-binding protein HSR1-related  36.1 
 
 		 279 aa  111  1.0000000000000001e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.240539  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1301  GTP-binding protein HSR1-related  35 
 
 		 299 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000833299 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2590  ribosomal biogenesis GTPase  25.77 
 
 		 313 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>