208 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9515_02231 on replicon NC_008817
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9515



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008817  P9515_02231  ribosomal biogenesis GTPase  100 
 
 		 288 aa  583  1.0000000000000001e-165  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0196  ribosomal biogenesis GTPase  82.93 
 
 		 290 aa  488  1e-137  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.122374  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02121  ribosomal biogenesis GTPase  82.58 
 
 		 290 aa  488  1e-137  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.269316  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02141  ribosomal biogenesis GTPase  82.23 
 
 		 290 aa  486  1e-136  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.909722  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02121  ribosomal biogenesis GTPase  57.54 
 
 		 287 aa  339  2.9999999999999998e-92  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27991  ribosomal biogenesis GTPase  54.7 
 
 		 289 aa  327  1.0000000000000001e-88  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2142  ribosomal biogenesis GTPase  55.05 
 
 		 292 aa  323  3e-87  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1561  ribosomal biogenesis GTPase  53.66 
 
 		 287 aa  321  8e-87  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2458  ribosomal biogenesis GTPase  54.36 
 
 		 288 aa  320  1.9999999999999998e-86  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02701  ribosomal biogenesis GTPase  52.96 
 
 		 287 aa  317  1e-85  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0776649  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0838  ribosome biogenesis GTP-binding protein YlqF  47.87 
 
 		 293 aa  280  3e-74  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4128  ribosomal biogenesis GTPase  47.02 
 
 		 281 aa  275  7e-73  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3374  ribosomal biogenesis GTPase  45.94 
 
 		 285 aa  274  1.0000000000000001e-72  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1114  ribosomal biogenesis GTPase  47.04 
 
 		 287 aa  266  2.9999999999999995e-70  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.44359  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1586  ribosomal biogenesis GTPase  45.58 
 
 		 281 aa  262  4e-69  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0128264 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4089  ribosomal biogenesis GTPase  47.02 
 
 		 281 aa  260  1e-68  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4647  ribosomal biogenesis GTPase  46.32 
 
 		 293 aa  256  4e-67  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.365042 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2557  ribosomal biogenesis GTPase  45.24 
 
 		 327 aa  246  3e-64  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_33865  predicted protein  39.93 
 
 		 369 aa  220  1.9999999999999999e-56  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.837548 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0811  ribosomal biogenesis GTPase  33.69 
 
 		 287 aa  173  3.9999999999999995e-42  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00749287  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1095  ribosomal biogenesis GTPase  34 
 
 		 283 aa  172  7.999999999999999e-42  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00065113  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1327  ribosomal biogenesis GTPase  35.51 
 
 		 294 aa  163  3e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.575844  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1302  ribosomal biogenesis GTPase  35.51 
 
 		 294 aa  163  3e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00764479  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07360  GTP-binding protein HSR1-related  31.14 
 
 		 282 aa  162  6e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000017476  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0763  GTP-binding protein YlqF  33.22 
 
 		 291 aa  162  7e-39  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000221052  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3880  ribosomal biogenesis GTPase  31.85 
 
 		 296 aa  162  8.000000000000001e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000579568  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1988  ribosomal biogenesis GTPase  31 
 
 		 288 aa  161  1e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2490  ribosomal biogenesis GTPase  31.51 
 
 		 287 aa  161  2e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000101626  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3885  ribosomal biogenesis GTPase  31.51 
 
 		 296 aa  160  2e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000521697  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2401  GTP-binding protein HSR1-related  30.93 
 
 		 292 aa  160  3e-38  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00457359  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1307  ribosomal biogenesis GTPase  32.64 
 
 		 296 aa  159  5e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000615833  unclonable  1.55704e-25 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3936  ribosomal biogenesis GTPase  32.64 
 
 		 296 aa  159  5e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000467955  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3579  ribosomal biogenesis GTPase  31.16 
 
 		 296 aa  159  6e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000271121  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3597  ribosomal biogenesis GTPase  31.16 
 
 		 296 aa  159  7e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00124948  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3851  ribosomal biogenesis GTPase  31.16 
 
 		 296 aa  159  7e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  5.126e-62 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3661  ribosomal biogenesis GTPase  31.51 
 
 		 296 aa  158  8e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000313796  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3689  ribosomal biogenesis GTPase  31.16 
 
 		 296 aa  158  1e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0162209  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3976  ribosomal biogenesis GTPase  31.16 
 
 		 296 aa  158  1e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000127206  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0716  GTP1/OBG protein  31.25 
 
 		 292 aa  158  1e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00781144  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2048  GTP-binding protein, HSR1-related  30.07 
 
 		 284 aa  156  4e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000391161  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1490  GTP-binding protein  32.4 
 
 		 278 aa  156  5.0000000000000005e-37  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000000659617  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1367  ribosome biogenesis GTP-binding protein YlqF  28.9 
 
 		 292 aa  153  2.9999999999999998e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1707  GTP-binding protein, HSR1-related  32.53 
 
 		 277 aa  148  1.0000000000000001e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.12169  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0186  GTP-binding protein HSR1-related protein  30.93 
 
 		 285 aa  148  1.0000000000000001e-34  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1961  ribosomal biogenesis GTPase  32.18 
 
 		 281 aa  148  1.0000000000000001e-34  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.648804  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0776  GTP-binding protein YlqF  30.9 
 
 		 290 aa  147  2.0000000000000003e-34  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.119569  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1679  ribosomal biogenesis GTPase  31.83 
 
 		 281 aa  147  3e-34  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.607688  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1054  ribosomal biogenesis GTPase  30.77 
 
 		 315 aa  145  1e-33  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0764  GTP-binding protein YlqF  29.62 
 
 		 284 aa  141  9.999999999999999e-33  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1416  ribosomal biogenesis GTPase  34.7 
 
 		 283 aa  140  1.9999999999999998e-32  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.00443588  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0919  ribosomal biogenesis GTPase  28.77 
 
 		 284 aa  140  1.9999999999999998e-32  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.294572  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0913  GTPase  28.57 
 
 		 279 aa  140  3e-32  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000773459 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0773  GTPases  31.21 
 
 		 280 aa  139  6e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.79834e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1203  GTP-binding protein HSR1-related  28.77 
 
 		 283 aa  139  7e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000139155  normal  0.179888 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2453  ribosomal biogenesis GTPase  31.31 
 
 		 312 aa  137  2e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.643671  normal  0.265294 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1349  GTP-binding  30.79 
 
 		 319 aa  136  4e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00974199  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2508  ribosomal biogenesis GTPase  30.87 
 
 		 312 aa  135  7.000000000000001e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2029  ribosomal biogenesis GTPase  31.31 
 
 		 312 aa  134  9.999999999999999e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.831437  normal  0.492608 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1409  ribosome biogenesis GTP-binding protein YlqF  27.87 
 
 		 271 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.421311  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0663  GTP-binding protein, HSR1-related  30.27 
 
 		 284 aa  134  1.9999999999999998e-30  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.011457  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2758  GTP-binding protein, HSR1-related  31.99 
 
 		 329 aa  133  3e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0145905 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2638  ribosomal biogenesis GTPase  30.98 
 
 		 312 aa  133  3e-30  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00454653  normal  0.052608 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1589  ribosomal biogenesis GTPase  31.21 
 
 		 313 aa  134  3e-30  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.246818 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1013  ribosomal biogenesis GTPase  30.77 
 
 		 283 aa  130  2.0000000000000002e-29  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.132908  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1293  GTP-binding protein HSR1-related  29.58 
 
 		 280 aa  130  2.0000000000000002e-29  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.00000000027879  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2437  ribosomal biogenesis GTPase  30.87 
 
 		 313 aa  130  3e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.743849  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1882  ribosomal biogenesis GTPase  30.87 
 
 		 313 aa  130  3e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.140157  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0705  GTP-binding protein HSR1-related protein  28.14 
 
 		 298 aa  130  3e-29  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1889  ribosomal biogenesis GTPase  30.87 
 
 		 313 aa  130  3e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1855  ribosomal biogenesis GTPase  30.87 
 
 		 313 aa  130  3e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06087  ribosomal biogenesis GTPase  29.01 
 
 		 314 aa  130  4.0000000000000003e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2306  ribosomal biogenesis GTPase  30.85 
 
 		 313 aa  129  4.0000000000000003e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.575224  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1486  ribosomal biogenesis GTPase  29.57 
 
 		 313 aa  129  5.0000000000000004e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1752  ribosomal biogenesis GTPase  30.54 
 
 		 313 aa  129  6e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl538  GTPase  33.49 
 
 		 315 aa  128  9.000000000000001e-29  Mesoplasma florum L1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000607031  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0169  ribosomal biogenesis GTPase  29.39 
 
 		 323 aa  128  1.0000000000000001e-28  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000316145  normal  0.720532 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2283  ribosomal biogenesis GTPase  29.01 
 
 		 318 aa  128  1.0000000000000001e-28  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0251974 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1604  GTP-binding protein, HSR1-related  31.33 
 
 		 277 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000452633  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1982  ribosomal biogenesis GTPase  29.01 
 
 		 318 aa  127  2.0000000000000002e-28  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.360178 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0461  ribosomal biogenesis GTPase  29.69 
 
 		 314 aa  127  2.0000000000000002e-28  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.178573  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1350  GTP-binding protein HSR1-related  30.48 
 
 		 319 aa  126  3e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0587703  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1301  GTP-binding protein HSR1-related  32.07 
 
 		 299 aa  126  4.0000000000000003e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000833299 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2510  GTP-binding protein, HSR1-related  30.48 
 
 		 319 aa  126  4.0000000000000003e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.271003  normal  0.0153931 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1682  GTP-binding protein HSR1-related  30.2 
 
 		 324 aa  126  5e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000287  50S ribosomal subunit maturation GTPase RbgA  30.07 
 
 		 314 aa  125  8.000000000000001e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.146408  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2395  ribosomal biogenesis GTPase  29.19 
 
 		 313 aa  125  9e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.806942 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2590  ribosomal biogenesis GTPase  29.19 
 
 		 313 aa  125  1e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2924  HSR1-related GTP-binding protein  32.07 
 
 		 299 aa  123  3e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2186  ribosomal biogenesis GTPase  28.86 
 
 		 313 aa  124  3e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2263  ribosomal biogenesis GTPase  28.86 
 
 		 313 aa  124  3e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0669  ribosomal biogenesis GTPase  30.64 
 
 		 311 aa  124  3e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.378944  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1388  GTP-binding  29.63 
 
 		 316 aa  122  9e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2474  GTP-binding protein HSR1-related  30.03 
 
 		 317 aa  122  9e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.188866  normal  0.279197 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1785  GTP-binding  29.66 
 
 		 307 aa  121  9.999999999999999e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.417498 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0973  GTP-binding protein YlqF  30.07 
 
 		 270 aa  121  9.999999999999999e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000216329  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2270  GTP-binding protein  30.61 
 
 		 322 aa  121  9.999999999999999e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00193404  hitchhiker  0.000000344964 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1204  GTP-binding  28.37 
 
 		 305 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.185511  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1993  ribosomal biogenesis GTPase  30 
 
 		 314 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0543739  normal  0.136959 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3753  GTP1/OBG protein  27.68 
 
 		 276 aa  120  3e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000336118  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2146  GTP-binding protein, HSR1-related  30.51 
 
 		 305 aa  120  3e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>