204 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9301_02141 on replicon NC_009091
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9301



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009091  P9301_02141  ribosomal biogenesis GTPase  100 
 
 		 290 aa  588  1e-167  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.909722  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02121  ribosomal biogenesis GTPase  97.59 
 
 		 290 aa  574  1.0000000000000001e-163  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.269316  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0196  ribosomal biogenesis GTPase  96.55 
 
 		 290 aa  568  1e-161  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.122374  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02231  ribosomal biogenesis GTPase  82.23 
 
 		 288 aa  486  1e-136  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1561  ribosomal biogenesis GTPase  56.03 
 
 		 287 aa  343  2e-93  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27991  ribosomal biogenesis GTPase  55.9 
 
 		 289 aa  342  2.9999999999999997e-93  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02701  ribosomal biogenesis GTPase  56.03 
 
 		 287 aa  342  5.999999999999999e-93  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0776649  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02121  ribosomal biogenesis GTPase  55.63 
 
 		 287 aa  338  7e-92  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2142  ribosomal biogenesis GTPase  55.75 
 
 		 292 aa  332  4e-90  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2458  ribosomal biogenesis GTPase  55.05 
 
 		 288 aa  330  2e-89  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3374  ribosomal biogenesis GTPase  45.39 
 
 		 285 aa  284  1.0000000000000001e-75  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0838  ribosome biogenesis GTP-binding protein YlqF  47.52 
 
 		 293 aa  281  1e-74  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1114  ribosomal biogenesis GTPase  45.64 
 
 		 287 aa  270  1e-71  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.44359  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4128  ribosomal biogenesis GTPase  44.91 
 
 		 281 aa  270  2e-71  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1586  ribosomal biogenesis GTPase  45.26 
 
 		 281 aa  262  4.999999999999999e-69  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0128264 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4647  ribosomal biogenesis GTPase  45.04 
 
 		 293 aa  259  5.0000000000000005e-68  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.365042 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2557  ribosomal biogenesis GTPase  44.37 
 
 		 327 aa  256  4e-67  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4089  ribosomal biogenesis GTPase  44.91 
 
 		 281 aa  254  9e-67  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_33865  predicted protein  38.87 
 
 		 369 aa  208  8e-53  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.837548 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0763  GTP-binding protein YlqF  34.58 
 
 		 291 aa  174  9.999999999999999e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000221052  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1327  ribosomal biogenesis GTPase  39.02 
 
 		 294 aa  172  5e-42  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.575844  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1302  ribosomal biogenesis GTPase  39.02 
 
 		 294 aa  172  5e-42  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00764479  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1988  ribosomal biogenesis GTPase  30.82 
 
 		 288 aa  170  2e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1095  ribosomal biogenesis GTPase  32.4 
 
 		 283 aa  169  6e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00065113  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0811  ribosomal biogenesis GTPase  38.54 
 
 		 287 aa  168  8e-41  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00749287  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3880  ribosomal biogenesis GTPase  33.22 
 
 		 296 aa  168  8e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000579568  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3661  ribosomal biogenesis GTPase  32.64 
 
 		 296 aa  167  2e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000313796  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1307  ribosomal biogenesis GTPase  33.33 
 
 		 296 aa  167  2e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000615833  unclonable  1.55704e-25 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3936  ribosomal biogenesis GTPase  33.33 
 
 		 296 aa  167  2e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000467955  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3885  ribosomal biogenesis GTPase  32.87 
 
 		 296 aa  166  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000521697  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3597  ribosomal biogenesis GTPase  32.52 
 
 		 296 aa  165  8e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00124948  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3851  ribosomal biogenesis GTPase  32.52 
 
 		 296 aa  165  8e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  5.126e-62 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3579  ribosomal biogenesis GTPase  32.52 
 
 		 296 aa  165  9e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000271121  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3689  ribosomal biogenesis GTPase  32.52 
 
 		 296 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0162209  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3976  ribosomal biogenesis GTPase  32.52 
 
 		 296 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000127206  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07360  GTP-binding protein HSR1-related  32.29 
 
 		 282 aa  164  1.0000000000000001e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000017476  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2490  ribosomal biogenesis GTPase  31.82 
 
 		 287 aa  163  3e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000101626  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2048  GTP-binding protein, HSR1-related  28.87 
 
 		 284 aa  160  3e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000391161  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1707  GTP-binding protein, HSR1-related  32.52 
 
 		 277 aa  158  1e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.12169  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2401  GTP-binding protein HSR1-related  29.82 
 
 		 292 aa  155  6e-37  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00457359  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1961  ribosomal biogenesis GTPase  30.9 
 
 		 281 aa  154  1e-36  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.648804  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1679  ribosomal biogenesis GTPase  30.56 
 
 		 281 aa  154  2e-36  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.607688  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0716  GTP1/OBG protein  30.53 
 
 		 292 aa  154  2e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00781144  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1203  GTP-binding protein HSR1-related  29.17 
 
 		 283 aa  151  1e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000139155  normal  0.179888 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1367  ribosome biogenesis GTP-binding protein YlqF  28.57 
 
 		 292 aa  151  1e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1490  GTP-binding protein  30.36 
 
 		 278 aa  151  1e-35  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000000659617  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0776  GTP-binding protein YlqF  30.5 
 
 		 290 aa  150  2e-35  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.119569  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0764  GTP-binding protein YlqF  30.21 
 
 		 284 aa  150  2e-35  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0186  GTP-binding protein HSR1-related protein  32.87 
 
 		 285 aa  150  3e-35  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0919  ribosomal biogenesis GTPase  28.37 
 
 		 284 aa  145  6e-34  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.294572  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0913  GTPase  28.17 
 
 		 279 aa  143  4e-33  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000773459 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0773  GTPases  30.27 
 
 		 280 aa  142  5e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.79834e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0705  GTP-binding protein HSR1-related protein  30.8 
 
 		 298 aa  141  9.999999999999999e-33  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1054  ribosomal biogenesis GTPase  35.89 
 
 		 315 aa  140  3e-32  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1416  ribosomal biogenesis GTPase  33.17 
 
 		 283 aa  140  3.9999999999999997e-32  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.00443588  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0663  GTP-binding protein, HSR1-related  30.58 
 
 		 284 aa  139  4.999999999999999e-32  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.011457  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2508  ribosomal biogenesis GTPase  30.72 
 
 		 312 aa  139  6e-32  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1013  ribosomal biogenesis GTPase  31.65 
 
 		 283 aa  137  2e-31  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.132908  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0973  GTP-binding protein HSR1-related protein  30.77 
 
 		 282 aa  136  3.0000000000000003e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000015477  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1604  GTP-binding protein, HSR1-related  32.67 
 
 		 277 aa  136  4e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000452633  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1486  ribosomal biogenesis GTPase  30.82 
 
 		 313 aa  135  8e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2029  ribosomal biogenesis GTPase  30.03 
 
 		 312 aa  134  9.999999999999999e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.831437  normal  0.492608 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1589  ribosomal biogenesis GTPase  29.79 
 
 		 313 aa  134  9.999999999999999e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.246818 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1293  GTP-binding protein HSR1-related  29.27 
 
 		 280 aa  134  9.999999999999999e-31  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.00000000027879  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1882  ribosomal biogenesis GTPase  31.16 
 
 		 313 aa  133  3e-30  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.140157  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1752  ribosomal biogenesis GTPase  30.82 
 
 		 313 aa  133  3e-30  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1889  ribosomal biogenesis GTPase  31.16 
 
 		 313 aa  133  3e-30  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2638  ribosomal biogenesis GTPase  29.69 
 
 		 312 aa  133  3e-30  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00454653  normal  0.052608 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1855  ribosomal biogenesis GTPase  31.16 
 
 		 313 aa  133  3e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2590  ribosomal biogenesis GTPase  30.41 
 
 		 313 aa  133  3.9999999999999996e-30  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2395  ribosomal biogenesis GTPase  30.41 
 
 		 313 aa  133  3.9999999999999996e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.806942 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2186  ribosomal biogenesis GTPase  30.41 
 
 		 313 aa  132  5e-30  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2263  ribosomal biogenesis GTPase  30.41 
 
 		 313 aa  132  5e-30  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2758  GTP-binding protein, HSR1-related  29.66 
 
 		 329 aa  132  5e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0145905 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1388  GTP-binding  30.56 
 
 		 316 aa  131  1.0000000000000001e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2437  ribosomal biogenesis GTPase  30.82 
 
 		 313 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.743849  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1018  GTPase  30.77 
 
 		 282 aa  131  1.0000000000000001e-29  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.447609  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl538  GTPase  34.15 
 
 		 315 aa  130  3e-29  Mesoplasma florum L1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000607031  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3396  GTP-binding  29.63 
 
 		 330 aa  130  3e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2306  ribosomal biogenesis GTPase  29.79 
 
 		 313 aa  130  4.0000000000000003e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.575224  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1409  ribosome biogenesis GTP-binding protein YlqF  27.62 
 
 		 271 aa  129  5.0000000000000004e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.421311  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0169  ribosomal biogenesis GTPase  31.13 
 
 		 323 aa  128  1.0000000000000001e-28  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000316145  normal  0.720532 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000287  50S ribosomal subunit maturation GTPase RbgA  28.67 
 
 		 314 aa  127  2.0000000000000002e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.146408  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2474  GTP-binding protein HSR1-related  29.79 
 
 		 317 aa  127  2.0000000000000002e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.188866  normal  0.279197 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1350  GTP-binding protein HSR1-related  30.3 
 
 		 319 aa  127  3e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0587703  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2510  GTP-binding protein, HSR1-related  30.3 
 
 		 319 aa  127  3e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.271003  normal  0.0153931 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1682  GTP-binding protein HSR1-related  29.29 
 
 		 324 aa  126  3e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06087  ribosomal biogenesis GTPase  28.67 
 
 		 314 aa  126  4.0000000000000003e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1349  GTP-binding  28.9 
 
 		 319 aa  126  4.0000000000000003e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00974199  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2283  ribosomal biogenesis GTPase  29.27 
 
 		 318 aa  126  5e-28  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0251974 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3753  GTP1/OBG protein  26.83 
 
 		 276 aa  125  6e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000336118  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1982  ribosomal biogenesis GTPase  29.27 
 
 		 318 aa  125  9e-28  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.360178 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1554  GTP-binding protein  29.51 
 
 		 281 aa  125  9e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2146  GTP-binding protein, HSR1-related  30 
 
 		 305 aa  125  1e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2270  GTP-binding protein  29.11 
 
 		 322 aa  124  2e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00193404  hitchhiker  0.000000344964 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0461  ribosomal biogenesis GTPase  28.77 
 
 		 314 aa  124  3e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.178573  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0669  ribosomal biogenesis GTPase  28.67 
 
 		 311 aa  123  4e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.378944  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1301  GTP-binding protein HSR1-related  36.41 
 
 		 299 aa  122  6e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000833299 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0973  GTP-binding protein YlqF  28.26 
 
 		 270 aa  122  9e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000216329  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2924  HSR1-related GTP-binding protein  36.41 
 
 		 299 aa  121  9.999999999999999e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>