More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hore_07360 on replicon NC_011899
Organism: Halothermothrix orenii H 168



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011899  Hore_07360  GTP-binding protein HSR1-related  100 
 
 
282 aa  571  1.0000000000000001e-162  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000017476  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0763  GTP-binding protein YlqF  47.14 
 
 
291 aa  266  2.9999999999999995e-70  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000221052  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1203  GTP-binding protein HSR1-related  46.59 
 
 
283 aa  260  1e-68  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000139155  normal  0.179888 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0716  GTP1/OBG protein  45.17 
 
 
292 aa  256  4e-67  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00781144  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2401  GTP-binding protein HSR1-related  44.09 
 
 
292 aa  254  1.0000000000000001e-66  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00457359  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1707  GTP-binding protein, HSR1-related  48.21 
 
 
277 aa  254  2.0000000000000002e-66  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.12169  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3579  ribosomal biogenesis GTPase  45.83 
 
 
296 aa  252  4.0000000000000004e-66  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000271121  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3597  ribosomal biogenesis GTPase  45.83 
 
 
296 aa  252  4.0000000000000004e-66  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00124948  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3851  ribosomal biogenesis GTPase  45.83 
 
 
296 aa  252  4.0000000000000004e-66  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  5.126e-62 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2490  ribosomal biogenesis GTPase  46.69 
 
 
287 aa  252  6e-66  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000101626  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3689  ribosomal biogenesis GTPase  45.83 
 
 
296 aa  251  7e-66  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0162209  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3976  ribosomal biogenesis GTPase  45.83 
 
 
296 aa  251  7e-66  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000127206  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3885  ribosomal biogenesis GTPase  45.49 
 
 
296 aa  251  9.000000000000001e-66  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000521697  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3936  ribosomal biogenesis GTPase  45.49 
 
 
296 aa  251  1e-65  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000467955  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1307  ribosomal biogenesis GTPase  45.49 
 
 
296 aa  251  1e-65  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000615833  unclonable  1.55704e-25 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3880  ribosomal biogenesis GTPase  45.49 
 
 
296 aa  250  2e-65  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000579568  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1961  ribosomal biogenesis GTPase  46.67 
 
 
281 aa  250  2e-65  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.648804  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3661  ribosomal biogenesis GTPase  45.83 
 
 
296 aa  249  3e-65  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000313796  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2048  GTP-binding protein, HSR1-related  46.29 
 
 
284 aa  249  3e-65  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000391161  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1095  ribosomal biogenesis GTPase  45.45 
 
 
283 aa  248  6e-65  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00065113  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1679  ribosomal biogenesis GTPase  46.32 
 
 
281 aa  248  6e-65  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.607688  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1409  ribosome biogenesis GTP-binding protein YlqF  46.57 
 
 
271 aa  246  4e-64  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.421311  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3753  GTP1/OBG protein  42.14 
 
 
276 aa  234  1.0000000000000001e-60  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000336118  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1988  ribosomal biogenesis GTPase  42.36 
 
 
288 aa  234  1.0000000000000001e-60  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06087  ribosomal biogenesis GTPase  42.05 
 
 
314 aa  224  9e-58  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0669  ribosomal biogenesis GTPase  42.05 
 
 
311 aa  224  1e-57  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.378944  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0663  GTP-binding protein, HSR1-related  39.86 
 
 
284 aa  223  3e-57  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.011457  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0811  ribosomal biogenesis GTPase  40.86 
 
 
287 aa  223  4e-57  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00749287  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2029  ribosomal biogenesis GTPase  40.85 
 
 
312 aa  223  4e-57  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.831437  normal  0.492608 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1490  GTP-binding protein  39.71 
 
 
278 aa  222  6e-57  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000000659617  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2638  ribosomal biogenesis GTPase  40.49 
 
 
312 aa  221  8e-57  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00454653  normal  0.052608 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000287  50S ribosomal subunit maturation GTPase RbgA  42.4 
 
 
314 aa  221  9e-57  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.146408  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1589  ribosomal biogenesis GTPase  39.65 
 
 
313 aa  221  9e-57  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.246818 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2508  ribosomal biogenesis GTPase  40.36 
 
 
312 aa  221  9.999999999999999e-57  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1293  GTP-binding protein HSR1-related  40.99 
 
 
280 aa  220  1.9999999999999999e-56  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.00000000027879  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1367  ribosome biogenesis GTP-binding protein YlqF  37.67 
 
 
292 aa  219  3e-56  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2186  ribosomal biogenesis GTPase  40.99 
 
 
313 aa  218  7.999999999999999e-56  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2263  ribosomal biogenesis GTPase  40.99 
 
 
313 aa  218  7.999999999999999e-56  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1703  ribosomal biogenesis GTPase  38.79 
 
 
310 aa  218  8.999999999999998e-56  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.237834  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0461  ribosomal biogenesis GTPase  42.05 
 
 
314 aa  217  1e-55  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.178573  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2474  GTP-binding protein HSR1-related  38.52 
 
 
317 aa  217  2e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.188866  normal  0.279197 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1982  ribosomal biogenesis GTPase  40.99 
 
 
318 aa  217  2e-55  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.360178 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1993  ribosomal biogenesis GTPase  40.07 
 
 
314 aa  217  2e-55  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0543739  normal  0.136959 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2395  ribosomal biogenesis GTPase  40.64 
 
 
313 aa  216  2.9999999999999998e-55  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.806942 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2758  GTP-binding protein, HSR1-related  38.65 
 
 
329 aa  215  7e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0145905 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2453  ribosomal biogenesis GTPase  40.28 
 
 
312 aa  215  7e-55  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.643671  normal  0.265294 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2590  ribosomal biogenesis GTPase  40.64 
 
 
313 aa  214  9.999999999999999e-55  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2283  ribosomal biogenesis GTPase  40.64 
 
 
318 aa  214  9.999999999999999e-55  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0251974 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2924  HSR1-related GTP-binding protein  38.49 
 
 
299 aa  214  1.9999999999999998e-54  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1302  ribosomal biogenesis GTPase  40.36 
 
 
294 aa  213  1.9999999999999998e-54  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00764479  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1327  ribosomal biogenesis GTPase  40.36 
 
 
294 aa  213  1.9999999999999998e-54  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.575844  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2437  ribosomal biogenesis GTPase  39.16 
 
 
313 aa  213  3.9999999999999995e-54  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.743849  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1752  ribosomal biogenesis GTPase  39.51 
 
 
313 aa  213  3.9999999999999995e-54  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2306  ribosomal biogenesis GTPase  39.44 
 
 
313 aa  212  4.9999999999999996e-54  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.575224  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2270  GTP-binding protein  37.23 
 
 
322 aa  212  5.999999999999999e-54  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00193404  hitchhiker  0.000000344964 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1855  ribosomal biogenesis GTPase  39.16 
 
 
313 aa  212  5.999999999999999e-54  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1889  ribosomal biogenesis GTPase  39.16 
 
 
313 aa  212  5.999999999999999e-54  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1882  ribosomal biogenesis GTPase  39.16 
 
 
313 aa  212  5.999999999999999e-54  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.140157  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1301  GTP-binding protein HSR1-related  38.49 
 
 
299 aa  211  1e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000833299 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3634  ribosomal biogenesis GTPase  39.22 
 
 
334 aa  210  2e-53  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.909228  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1688  GTP-binding protein HSR1-related  38.65 
 
 
341 aa  209  5e-53  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.161371  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0186  GTP-binding protein HSR1-related protein  40.07 
 
 
285 aa  209  5e-53  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1486  ribosomal biogenesis GTPase  38.38 
 
 
313 aa  209  6e-53  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1350  GTP-binding protein HSR1-related  36.88 
 
 
319 aa  207  1e-52  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0587703  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0705  GTP-binding protein HSR1-related protein  38.31 
 
 
298 aa  207  1e-52  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2510  GTP-binding protein, HSR1-related  36.88 
 
 
319 aa  207  2e-52  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.271003  normal  0.0153931 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0764  GTP-binding protein YlqF  38.93 
 
 
284 aa  205  6e-52  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2487  GTP-binding protein HSR1-related  38.35 
 
 
328 aa  205  7e-52  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000110563 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3396  GTP-binding  36.2 
 
 
330 aa  203  3e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0773  GTPases  37.5 
 
 
280 aa  201  9.999999999999999e-51  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.79834e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0973  GTP-binding protein HSR1-related protein  37.63 
 
 
282 aa  201  9.999999999999999e-51  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000015477  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1054  ribosomal biogenesis GTPase  38.81 
 
 
315 aa  200  1.9999999999999998e-50  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2146  GTP-binding protein, HSR1-related  34.17 
 
 
305 aa  198  7.999999999999999e-50  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0169  ribosomal biogenesis GTPase  38.11 
 
 
323 aa  197  1.0000000000000001e-49  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000316145  normal  0.720532 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1388  GTP-binding  35.46 
 
 
316 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1204  GTP-binding  36.65 
 
 
305 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.185511  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2120  GTPase  37.32 
 
 
304 aa  196  3e-49  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1349  GTP-binding  37.79 
 
 
319 aa  196  3e-49  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00974199  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0973  GTP-binding protein YlqF  39.25 
 
 
270 aa  196  5.000000000000001e-49  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000216329  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2377  ribosomal biogenesis GTPase  40.28 
 
 
307 aa  194  1e-48  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1312  GTP-binding protein, HSR1-related  37.28 
 
 
319 aa  194  2e-48  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3629  GTP-binding protein HSR1-related  33.68 
 
 
320 aa  192  4e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1785  GTP-binding  36.97 
 
 
307 aa  192  6e-48  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.417498 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02636  ribosomal biogenesis GTPase  38.04 
 
 
323 aa  192  6e-48  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0776  GTP-binding protein YlqF  37.5 
 
 
290 aa  191  1e-47  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.119569  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0913  GTPase  37.91 
 
 
279 aa  190  2e-47  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000773459 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1682  GTP-binding protein HSR1-related  37.32 
 
 
324 aa  190  2.9999999999999997e-47  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1604  GTP-binding protein, HSR1-related  34.64 
 
 
277 aa  190  2.9999999999999997e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000452633  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1586  ribosomal biogenesis GTPase  38.57 
 
 
281 aa  188  7e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0128264 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0919  ribosomal biogenesis GTPase  38.79 
 
 
284 aa  185  7e-46  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.294572  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1416  ribosomal biogenesis GTPase  38.25 
 
 
283 aa  182  6e-45  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.00443588  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0838  ribosome biogenesis GTP-binding protein YlqF  35.44 
 
 
293 aa  180  2.9999999999999997e-44  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1554  GTP-binding protein  35.36 
 
 
281 aa  179  5.999999999999999e-44  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1013  ribosomal biogenesis GTPase  36.88 
 
 
283 aa  178  1e-43  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.132908  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4128  ribosomal biogenesis GTPase  36.43 
 
 
281 aa  176  3e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1227  GTP-binding protein HSR1-related  35.25 
 
 
279 aa  176  4e-43  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.240539  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3374  ribosomal biogenesis GTPase  34.63 
 
 
285 aa  174  1.9999999999999998e-42  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02701  ribosomal biogenesis GTPase  35.07 
 
 
287 aa  172  3.9999999999999995e-42  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0776649  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4647  ribosomal biogenesis GTPase  36.14 
 
 
293 aa  172  5e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.365042 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4089  ribosomal biogenesis GTPase  36.43 
 
 
281 aa  171  9e-42  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>