91 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aaci_2017 on replicon NC_013205
Organism: Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013205  Aaci_2017  ribosome biogenesis GTPase YqeH  100 
 
 
396 aa  797    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1237  GTP-binding protein YqeH  40.1 
 
 
375 aa  283  5.000000000000001e-75  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000896118  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1164  GTP-binding protein YqeH  35.17 
 
 
366 aa  266  5.999999999999999e-70  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0914946  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2459  GTP-binding protein YqeH  35.37 
 
 
370 aa  260  4e-68  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0019503  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0992  GTP-binding protein YqeH  37.23 
 
 
369 aa  257  2e-67  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4186  GTP-binding protein YqeH  35.16 
 
 
368 aa  254  2.0000000000000002e-66  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4468  GTP-binding protein YqeH  34.2 
 
 
368 aa  253  6e-66  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0923529  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4562  GTP-binding protein YqeH  34.2 
 
 
368 aa  253  6e-66  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4357  GTP-binding protein YqeH  34.2 
 
 
368 aa  253  6e-66  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.701648 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4071  GTP-binding protein YqeH  34.2 
 
 
368 aa  253  6e-66  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0184971  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4233  GTP-binding protein YqeH  34.2 
 
 
368 aa  253  6e-66  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4416  GTP-binding protein YqeH  34.2 
 
 
368 aa  253  6e-66  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4081  GTP-binding protein YqeH  34.2 
 
 
368 aa  253  6e-66  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0782  GTP-binding protein YqeH  33.94 
 
 
368 aa  252  8.000000000000001e-66  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0185086  hitchhiker  0.000205366 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4455  GTP-binding protein YqeH  33.94 
 
 
368 aa  252  1e-65  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.26216  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1585  GTP-binding protein YqeH  35.66 
 
 
372 aa  251  2e-65  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.595212  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1740  GTP-binding protein YqeH  37.57 
 
 
379 aa  246  4.9999999999999997e-64  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1664  GTP-binding protein YqeH  36.34 
 
 
372 aa  246  4.9999999999999997e-64  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00606929  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3061  GTP-binding protein YqeH  33.16 
 
 
368 aa  245  9.999999999999999e-64  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.844402  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1404  GTP-binding protein YqeH  34.63 
 
 
369 aa  244  1.9999999999999999e-63  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000143151  hitchhiker  2.51031e-26 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0226  GTP-binding protein YqeH  33.75 
 
 
401 aa  241  2e-62  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1689  GTP-binding protein YqeH  34.95 
 
 
366 aa  239  4e-62  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1654  GTP-binding protein YqeH  34.95 
 
 
366 aa  239  4e-62  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0906  GTP-binding protein YqeH  33.54 
 
 
385 aa  213  3.9999999999999995e-54  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.346468  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0079  GTP-binding protein HSR1-related  31.74 
 
 
363 aa  196  4.0000000000000005e-49  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00226262  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0079  GTP-binding protein, HSR1-related  32.3 
 
 
363 aa  192  1e-47  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000212587  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0841  hypothetical protein  27.94 
 
 
365 aa  176  9e-43  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1822  GTP-binding protein HSR1-related protein  27.09 
 
 
379 aa  166  4e-40  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_40200  predicted protein  30.41 
 
 
710 aa  167  4e-40  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00209699  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0797  GTP-binding protein, HSR1-related  27.66 
 
 
357 aa  161  2e-38  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0424  hypothetical protein  24.53 
 
 
367 aa  157  4e-37  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  decreased coverage  0.00290695  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1198  GTP-binding protein HSR1-related  25.13 
 
 
376 aa  145  1e-33  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0436  GTP-binding protein HSR1-related protein  27.79 
 
 
391 aa  144  3e-33  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0525  ribosome biogenesis GTPase YqeH  25.13 
 
 
361 aa  138  2e-31  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.642642  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl351  GTPase  24.06 
 
 
365 aa  127  3e-28  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  4.213e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_37471  predicted protein  30.79 
 
 
401 aa  119  9.999999999999999e-26  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0357188  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_49745  predicted protein  30.72 
 
 
604 aa  115  1.0000000000000001e-24  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.814694  normal  0.848329 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1095  ribosomal biogenesis GTPase  25.46 
 
 
283 aa  54.7  0.000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00065113  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28889  predicted protein  23.04 
 
 
521 aa  54.3  0.000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.691875  normal  0.346364 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_2182  predicted protein  26.57 
 
 
360 aa  53.5  0.000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4128  ribosomal biogenesis GTPase  28.57 
 
 
281 aa  52  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2103  GTP-binding protein EngA  38.69 
 
 
441 aa  50.8  0.00004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1301  GTP-binding protein HSR1-related  26.32 
 
 
299 aa  51.2  0.00004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000833299 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2924  HSR1-related GTP-binding protein  25.73 
 
 
299 aa  50.4  0.00005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1604  GTP-binding protein, HSR1-related  25.43 
 
 
277 aa  50.1  0.00007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000452633  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0824  GTP-binding protein, HSR1-related  37.12 
 
 
261 aa  50.1  0.00008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01215  Myosin-related protein homolog MlpA Fragment [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9UVC7]  22 
 
 
544 aa  48.9  0.0001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.00107626  normal  0.249209 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28031  predicted protein  27.48 
 
 
676 aa  48.5  0.0002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0763  GTP-binding protein YlqF  28.05 
 
 
291 aa  48.9  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000221052  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0059  GTP-binding protein HSR1-related  28.48 
 
 
260 aa  48.5  0.0002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.800533  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3374  ribosomal biogenesis GTPase  26.67 
 
 
285 aa  48.1  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07360  GTP-binding protein HSR1-related  30.86 
 
 
282 aa  48.1  0.0003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000017476  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4089  ribosomal biogenesis GTPase  28.57 
 
 
281 aa  48.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2453  ribosomal biogenesis GTPase  22.35 
 
 
312 aa  47.8  0.0003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.643671  normal  0.265294 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0018  tRNA modification GTPase TrmE  27.08 
 
 
438 aa  48.1  0.0003  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10530  small GTP-binding protein  31.28 
 
 
438 aa  47.8  0.0004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02701  ribosomal biogenesis GTPase  26.01 
 
 
287 aa  47.4  0.0004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0776649  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1449  GTPase YjeQ  26.32 
 
 
315 aa  47.8  0.0004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2377  ribosomal biogenesis GTPase  24.01 
 
 
307 aa  47.4  0.0004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2892  GTPase family protein  31.41 
 
 
463 aa  47.4  0.0005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1785  GTP-binding  36.51 
 
 
307 aa  46.6  0.0008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.417498 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0750  GTP-binding protein EngA  30.94 
 
 
451 aa  46.6  0.0008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.524371  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1561  ribosomal biogenesis GTPase  25.43 
 
 
287 aa  46.6  0.0008  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0630  GTPase EngC  26.72 
 
 
340 aa  46.2  0.001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000140785  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0250  small GTP-binding protein  45.45 
 
 
370 aa  45.8  0.001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.829825  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3634  ribosomal biogenesis GTPase  24.71 
 
 
334 aa  45.1  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.909228  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1775  GTP-binding protein EngA  29.14 
 
 
465 aa  45.4  0.002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0773  GTPases  27.68 
 
 
280 aa  45.4  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.79834e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1586  ribosomal biogenesis GTPase  25.99 
 
 
281 aa  45.1  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0128264 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2742  ribosome-associated GTPase  28.06 
 
 
353 aa  45.4  0.002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000201123  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1711  GTP-binding protein EngA  28.49 
 
 
465 aa  45.1  0.002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.625328  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1708  ribosome-associated GTPase  24.38 
 
 
287 aa  44.3  0.003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_25133  predicted protein  26.04 
 
 
562 aa  44.3  0.004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1227  GTP-binding protein HSR1-related  25.29 
 
 
279 aa  43.9  0.004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.240539  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1624  GTP-binding protein EngA  33.55 
 
 
437 aa  44.3  0.004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.565401  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6542  small GTP-binding protein  30.09 
 
 
441 aa  44.3  0.004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0776  GTP-binding protein YlqF  31.16 
 
 
290 aa  44.3  0.004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.119569  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3226  GTP-binding protein HSR1-related  34.48 
 
 
473 aa  43.9  0.005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1203  GTP-binding protein HSR1-related  26.47 
 
 
283 aa  43.9  0.005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000139155  normal  0.179888 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1409  tRNA modification GTPase TrmE  41.98 
 
 
452 aa  43.9  0.005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0483  GTP-binding protein, HSR1-related  28.57 
 
 
258 aa  43.5  0.006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1707  GTP-binding protein, HSR1-related  26.04 
 
 
277 aa  43.9  0.006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.12169  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1990  ribosome-associated GTPase  23.88 
 
 
287 aa  43.5  0.007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0160  GTP-binding protein, HSR1-related  31.4 
 
 
262 aa  43.1  0.008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.210718  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1983  GTP-binding protein EngA  29.38 
 
 
439 aa  43.1  0.008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1409  ribosome biogenesis GTP-binding protein YlqF  26.45 
 
 
271 aa  43.1  0.008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.421311  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0158  GTP-binding protein HSR1-related  31.4 
 
 
262 aa  43.1  0.008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.844156  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0381  ribosome-associated GTPase  29.92 
 
 
370 aa  43.1  0.009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1589  ribosomal biogenesis GTPase  22.09 
 
 
313 aa  43.1  0.009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.246818 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_30716  nuclear/nucleolar GTP-binding protein 2  22.01 
 
 
534 aa  43.1  0.009  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0409155  normal  0.593065 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3235  GTP-binding protein Era  34.88 
 
 
489 aa  42.7  0.01  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00276402  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>