178 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LGAS_1404 on replicon NC_008530
Organism: Lactobacillus gasseri ATCC 33323



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008530  LGAS_1404  GTP-binding protein YqeH  100 
 
 		 369 aa  754    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000143151  hitchhiker  2.51031e-26 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1237  GTP-binding protein YqeH  52.97 
 
 		 375 aa  401  1e-111  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000896118  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1740  GTP-binding protein YqeH  50.4 
 
 		 379 aa  373  1e-102  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1585  GTP-binding protein YqeH  47.99 
 
 		 372 aa  374  1e-102  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.595212  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1664  GTP-binding protein YqeH  47.99 
 
 		 372 aa  363  3e-99  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00606929  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0226  GTP-binding protein YqeH  47.15 
 
 		 401 aa  362  5.0000000000000005e-99  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2459  GTP-binding protein YqeH  47.06 
 
 		 370 aa  340  2e-92  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0019503  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0992  GTP-binding protein YqeH  47.47 
 
 		 369 aa  337  1.9999999999999998e-91  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4186  GTP-binding protein YqeH  45.45 
 
 		 368 aa  336  3.9999999999999995e-91  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4416  GTP-binding protein YqeH  45.87 
 
 		 368 aa  335  1e-90  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4233  GTP-binding protein YqeH  45.87 
 
 		 368 aa  335  1e-90  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4071  GTP-binding protein YqeH  45.87 
 
 		 368 aa  335  1e-90  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0184971  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4081  GTP-binding protein YqeH  45.87 
 
 		 368 aa  335  1e-90  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4562  GTP-binding protein YqeH  45.87 
 
 		 368 aa  335  1e-90  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4357  GTP-binding protein YqeH  45.87 
 
 		 368 aa  335  1e-90  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.701648 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0782  GTP-binding protein YqeH  45.87 
 
 		 368 aa  335  1e-90  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0185086  hitchhiker  0.000205366 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4468  GTP-binding protein YqeH  45.87 
 
 		 368 aa  335  1e-90  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0923529  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4455  GTP-binding protein YqeH  45.6 
 
 		 368 aa  333  3e-90  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.26216  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3061  GTP-binding protein YqeH  44.8 
 
 		 368 aa  330  2e-89  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.844402  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1164  GTP-binding protein YqeH  41.13 
 
 		 366 aa  303  2.0000000000000002e-81  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0914946  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1654  GTP-binding protein YqeH  41.94 
 
 		 366 aa  288  1e-76  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1689  GTP-binding protein YqeH  41.94 
 
 		 366 aa  288  1e-76  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0906  GTP-binding protein YqeH  38.93 
 
 		 385 aa  258  9e-68  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.346468  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2017  ribosome biogenesis GTPase YqeH  34.63 
 
 		 396 aa  244  1.9999999999999999e-63  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0079  GTP-binding protein, HSR1-related  33.15 
 
 		 363 aa  197  2.0000000000000003e-49  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000212587  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0079  GTP-binding protein HSR1-related  33.24 
 
 		 363 aa  192  6e-48  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00226262  n/a   
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_40200  predicted protein  31.28 
 
 		 710 aa  174  1.9999999999999998e-42  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00209699  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0424  hypothetical protein  30.75 
 
 		 367 aa  170  4e-41  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  decreased coverage  0.00290695  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0797  GTP-binding protein, HSR1-related  31.89 
 
 		 357 aa  157  4e-37  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl351  GTPase  31.73 
 
 		 365 aa  154  2e-36  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  4.213e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1822  GTP-binding protein HSR1-related protein  27.96 
 
 		 379 aa  155  2e-36  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0841  hypothetical protein  27.2 
 
 		 365 aa  152  1e-35  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_49745  predicted protein  30.54 
 
 		 604 aa  139  1e-31  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.814694  normal  0.848329 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1198  GTP-binding protein HSR1-related  27.69 
 
 		 376 aa  138  2e-31  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0525  ribosome biogenesis GTPase YqeH  27.37 
 
 		 361 aa  134  3e-30  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.642642  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0436  GTP-binding protein HSR1-related protein  26.11 
 
 		 391 aa  122  9.999999999999999e-27  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_37471  predicted protein  29.32 
 
 		 401 aa  120  3e-26  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0357188  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1662  GTP-binding protein EngA  31.14 
 
 		 465 aa  57  0.0000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.908743  normal  0.0937106 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2029  ribosomal biogenesis GTPase  31.65 
 
 		 312 aa  55.1  0.000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.831437  normal  0.492608 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1095  ribosomal biogenesis GTPase  30.36 
 
 		 283 aa  54.7  0.000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00065113  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1589  ribosomal biogenesis GTPase  31.85 
 
 		 313 aa  54.7  0.000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.246818 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2638  ribosomal biogenesis GTPase  30.57 
 
 		 312 aa  54.3  0.000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00454653  normal  0.052608 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1752  ribosomal biogenesis GTPase  31.01 
 
 		 313 aa  52.8  0.00001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1301  GTP-binding protein HSR1-related  27.81 
 
 		 299 aa  51.6  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000833299 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2437  ribosomal biogenesis GTPase  30.38 
 
 		 313 aa  51.6  0.00002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.743849  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1889  ribosomal biogenesis GTPase  30.38 
 
 		 313 aa  51.6  0.00002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1855  ribosomal biogenesis GTPase  30.38 
 
 		 313 aa  51.6  0.00002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2508  ribosomal biogenesis GTPase  29.3 
 
 		 312 aa  51.6  0.00002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1882  ribosomal biogenesis GTPase  30.38 
 
 		 313 aa  51.6  0.00002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.140157  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1703  ribosomal biogenesis GTPase  28.9 
 
 		 310 aa  51.2  0.00003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.237834  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1486  ribosomal biogenesis GTPase  29.75 
 
 		 313 aa  51.2  0.00003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2924  HSR1-related GTP-binding protein  27.81 
 
 		 299 aa  50.8  0.00004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2395  ribosomal biogenesis GTPase  30.57 
 
 		 313 aa  50.4  0.00005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.806942 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2590  ribosomal biogenesis GTPase  30.57 
 
 		 313 aa  50.1  0.00006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2186  ribosomal biogenesis GTPase  30.57 
 
 		 313 aa  50.1  0.00006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2263  ribosomal biogenesis GTPase  30.57 
 
 		 313 aa  50.1  0.00006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0461  ribosomal biogenesis GTPase  30.57 
 
 		 314 aa  50.1  0.00006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.178573  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10530  small GTP-binding protein  35.82 
 
 		 438 aa  50.1  0.00007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0773  GTPases  30.49 
 
 		 280 aa  49.7  0.00008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.79834e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01058  GTP-binding protein EngA  29.34 
 
 		 465 aa  49.3  0.0001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.189601  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2306  ribosomal biogenesis GTPase  29.11 
 
 		 313 aa  49.3  0.0001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.575224  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06108  GTP-binding protein EngA  29.34 
 
 		 465 aa  49.3  0.0001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0692336  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1775  GTP-binding protein EngA  29.2 
 
 		 465 aa  49.3  0.0001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_10438  conserved hypothetical protein  21.74 
 
 		 634 aa  48.1  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.906693 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5023  tRNA modification GTPase TrmE  42.62 
 
 		 447 aa  48.5  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0584026  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1114  ribosomal biogenesis GTPase  24.46 
 
 		 287 aa  48.9  0.0002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.44359  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1770  GTPase EngC  27.27 
 
 		 326 aa  48.5  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.134172  normal  0.557548 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1711  GTP-binding protein EngA  29.2 
 
 		 465 aa  48.1  0.0002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.625328  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06087  ribosomal biogenesis GTPase  28.66 
 
 		 314 aa  48.1  0.0002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000287  50S ribosomal subunit maturation GTPase RbgA  29.3 
 
 		 314 aa  47.8  0.0003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.146408  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0059  GTP-binding protein HSR1-related  32.05 
 
 		 260 aa  47.4  0.0004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.800533  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0472  GTPase EngC  30.77 
 
 		 373 aa  47.4  0.0004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.613391  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1325  GTP-binding protein EngA  32.41 
 
 		 511 aa  47.4  0.0004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.359502  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2146  GTP-binding protein, HSR1-related  31.47 
 
 		 305 aa  47.4  0.0004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2840  small GTP-binding protein  31.49 
 
 		 501 aa  47  0.0005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0118235 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1609  GTP-binding protein EngA  30.23 
 
 		 449 aa  47  0.0006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0528486 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1937  GTP-binding protein EngA  30.23 
 
 		 449 aa  47  0.0006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1645  GTP-binding protein HSR1-related protein  31.02 
 
 		 267 aa  46.6  0.0007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0965414  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2487  GTP-binding protein HSR1-related  26.37 
 
 		 328 aa  46.6  0.0007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000110563 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1131  GTP-binding protein EngA  34.31 
 
 		 473 aa  46.6  0.0007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0668  GTP-binding protein EngA  29.86 
 
 		 454 aa  46.2  0.0009  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1682  GTP-binding protein HSR1-related  23.78 
 
 		 324 aa  45.8  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1485  GTP-binding protein EngA  28.02 
 
 		 462 aa  45.4  0.001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2108  GTP-binding protein EngA  36.63 
 
 		 443 aa  46.2  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000750275  normal  0.342829 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1406  GTP-binding protein EngA  26.9 
 
 		 439 aa  46.2  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0340673  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1361  GTPase EngC  24.24 
 
 		 326 aa  45.8  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1159  GTP-binding protein EngA  31.28 
 
 		 436 aa  45.8  0.001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.427593  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1379  GTPase EngC  24.24 
 
 		 326 aa  45.8  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00181  GTPase  31.47 
 
 		 305 aa  45.4  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4696  GTPase EngC  25.76 
 
 		 326 aa  45.8  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.117505 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1859  ribosome small subunit-dependent GTPase A  29.92 
 
 		 316 aa  46.2  0.001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1992  ribosome-associated GTPase  29.38 
 
 		 314 aa  46.2  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.481604  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1586  ribosomal biogenesis GTPase  25.16 
 
 		 281 aa  45.4  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0128264 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1498  GTP-binding protein EngA  33.33 
 
 		 462 aa  45.1  0.002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002251  ribosome small subunit-stimulated GTPase EngC  27.22 
 
 		 354 aa  45.1  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00154868  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0061  ribosome small subunit-dependent GTPase A  29.55 
 
 		 386 aa  45.4  0.002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2071  ribosome small subunit-dependent GTPase A  30.65 
 
 		 322 aa  45.1  0.002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0137612  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1604  GTP-binding protein, HSR1-related  26.55 
 
 		 277 aa  45.1  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000452633  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_25133  predicted protein  28.12 
 
 		 562 aa  45.4  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0776  GTP-binding protein YlqF  29.93 
 
 		 290 aa  44.7  0.002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.119569  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>