213 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_28889 on replicon NC_009068
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009068  PICST_28889  predicted protein  100 
 
 		 521 aa  1056    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.691875  normal  0.346364 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01215  Myosin-related protein homolog MlpA Fragment [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9UVC7]  46.47 
 
 		 544 aa  415  1e-114  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.00107626  normal  0.249209 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_34264  predicted protein  33.33 
 
 		 597 aa  229  1e-58  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.159227  normal  1 
 
 
-
 
NC_006685  CNC01210  conserved hypothetical protein  36.55 
 
 		 669 aa  207  5e-52  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_2182  predicted protein  34.02 
 
 		 360 aa  203  5e-51  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC03480  GTP-binding protein, putative  30.48 
 
 		 642 aa  162  1e-38  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.866446  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_30716  nuclear/nucleolar GTP-binding protein 2  30.12 
 
 		 534 aa  152  1e-35  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0409155  normal  0.593065 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01666  nucleolar GTPase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G08930)  31.19 
 
 		 560 aa  147  5e-34  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.772298  normal  1 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42327  predicted protein  30.17 
 
 		 443 aa  144  5e-33  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.812568  normal  1 
 
 
-
 
NC_006686  CND05640  conserved hypothetical protein  32 
 
 		 717 aa  141  3e-32  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_25133  predicted protein  28.61 
 
 		 562 aa  139  7.999999999999999e-32  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0824  GTP-binding protein, HSR1-related  33.33 
 
 		 261 aa  124  5e-27  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1194  GTP-binding protein HSR1-related  28.9 
 
 		 379 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1645  GTP-binding protein HSR1-related protein  33.79 
 
 		 267 aa  121  3e-26  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0965414  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1931  GTP-binding protein YlqF  29.61 
 
 		 265 aa  120  4.9999999999999996e-26  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2161  GTP-binding protein, HSR1-related  31.38 
 
 		 268 aa  120  6e-26  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0017  GTP-binding protein HSR1-related  31.83 
 
 		 259 aa  116  8.999999999999998e-25  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.437741 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0021  GTP-binding protein, HSR1-related  32.43 
 
 		 261 aa  114  3e-24  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1339  GTP-binding protein HSR1-related  28.92 
 
 		 374 aa  114  4.0000000000000004e-24  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0645  GTP-binding protein HSR1-related  32.39 
 
 		 374 aa  113  6e-24  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.112449  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1049  small GTP-binding protein  31.19 
 
 		 256 aa  111  3e-23  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0648076 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0579  GTP-binding protein HSR1-related  28.22 
 
 		 388 aa  110  6e-23  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.133242 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0259  GTP-binding protein YlqF  28.57 
 
 		 384 aa  109  1e-22  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_2179  predicted protein  27.57 
 
 		 378 aa  106  1e-21  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.805213  decreased coverage  0.000732595 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07360  GTP-binding protein HSR1-related  26.64 
 
 		 282 aa  97.4  5e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000017476  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1490  GTP-binding protein  26.56 
 
 		 278 aa  94.7  4e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000000659617  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0763  GTP-binding protein YlqF  27.24 
 
 		 291 aa  93.2  9e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000221052  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0827  GTP-binding protein HSR1-related  29.71 
 
 		 266 aa  91.7  3e-17  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0811  ribosomal biogenesis GTPase  29.47 
 
 		 287 aa  91.3  4e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00749287  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_33865  predicted protein  27.55 
 
 		 369 aa  91.3  4e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.837548 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1409  ribosome biogenesis GTP-binding protein YlqF  28.91 
 
 		 271 aa  91.3  4e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.421311  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4128  ribosomal biogenesis GTPase  32.8 
 
 		 281 aa  90.5  7e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3055  GTP-binding protein  26.46 
 
 		 258 aa  90.1  1e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.464248 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1586  ribosomal biogenesis GTPase  33.53 
 
 		 281 aa  89.7  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0128264 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2048  GTP-binding protein, HSR1-related  29.68 
 
 		 284 aa  89.7  1e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000391161  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0160  GTP-binding protein, HSR1-related  27.46 
 
 		 262 aa  89  2e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.210718  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0158  GTP-binding protein HSR1-related  27.46 
 
 		 262 aa  89  2e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.844156  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0396  GTP-binding protein YlqF  25.85 
 
 		 254 aa  87.8  4e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.243282  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0059  GTP-binding protein HSR1-related  34.33 
 
 		 260 aa  87.8  5e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.800533  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4089  ribosomal biogenesis GTPase  32.8 
 
 		 281 aa  87  7e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04708  mitochondrial GTPase (YlqF), putative (AFU_orthologue; AFUA_5G08680)  31.12 
 
 		 354 aa  87  8e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.378462  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3579  ribosomal biogenesis GTPase  26.33 
 
 		 296 aa  86.3  0.000000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000271121  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1203  GTP-binding protein HSR1-related  30.53 
 
 		 283 aa  86.3  0.000000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000139155  normal  0.179888 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1367  ribosome biogenesis GTP-binding protein YlqF  26.6 
 
 		 292 aa  86.7  0.000000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3597  ribosomal biogenesis GTPase  26 
 
 		 296 aa  85.5  0.000000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00124948  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1327  ribosomal biogenesis GTPase  26.33 
 
 		 294 aa  85.5  0.000000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.575844  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1302  ribosomal biogenesis GTPase  26.33 
 
 		 294 aa  85.5  0.000000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00764479  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3851  ribosomal biogenesis GTPase  26 
 
 		 296 aa  85.5  0.000000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  5.126e-62 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3885  ribosomal biogenesis GTPase  26 
 
 		 296 aa  85.1  0.000000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000521697  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1307  ribosomal biogenesis GTPase  26 
 
 		 296 aa  84.7  0.000000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000615833  unclonable  1.55704e-25 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3689  ribosomal biogenesis GTPase  26 
 
 		 296 aa  84.3  0.000000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0162209  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3976  ribosomal biogenesis GTPase  26 
 
 		 296 aa  84.3  0.000000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000127206  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2490  ribosomal biogenesis GTPase  26.19 
 
 		 287 aa  84  0.000000000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000101626  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3661  ribosomal biogenesis GTPase  25.33 
 
 		 296 aa  84  0.000000000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000313796  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3936  ribosomal biogenesis GTPase  25.67 
 
 		 296 aa  83.6  0.000000000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000467955  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3753  GTP1/OBG protein  28.97 
 
 		 276 aa  83.6  0.000000000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000336118  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3880  ribosomal biogenesis GTPase  25.33 
 
 		 296 aa  83.2  0.00000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000579568  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1204  GTP-binding  28.67 
 
 		 305 aa  82  0.00000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.185511  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2395  ribosomal biogenesis GTPase  26.38 
 
 		 313 aa  82.8  0.00000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.806942 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2508  ribosomal biogenesis GTPase  25.34 
 
 		 312 aa  81.6  0.00000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0663  ribosomal biogenesis GTPase  27.24 
 
 		 279 aa  81.6  0.00000000000003  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.5554  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2186  ribosomal biogenesis GTPase  26.07 
 
 		 313 aa  81.3  0.00000000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2263  ribosomal biogenesis GTPase  26.07 
 
 		 313 aa  81.3  0.00000000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1293  GTP-binding protein HSR1-related  26.46 
 
 		 280 aa  81.3  0.00000000000005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.00000000027879  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2638  ribosomal biogenesis GTPase  25.39 
 
 		 312 aa  80.5  0.00000000000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00454653  normal  0.052608 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0843  GTP-binding protein HSR1-related  23.87 
 
 		 271 aa  79.7  0.0000000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0973  GTP-binding protein HSR1-related protein  28.32 
 
 		 282 aa  79.7  0.0000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000015477  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2557  ribosomal biogenesis GTPase  27.85 
 
 		 327 aa  78.6  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2401  GTP-binding protein HSR1-related  26.55 
 
 		 292 aa  78.2  0.0000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00457359  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0973  GTP-binding protein YlqF  26.76 
 
 		 270 aa  78.2  0.0000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000216329  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3374  ribosomal biogenesis GTPase  26.13 
 
 		 285 aa  78.6  0.0000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2029  ribosomal biogenesis GTPase  25.68 
 
 		 312 aa  78.2  0.0000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.831437  normal  0.492608 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4647  ribosomal biogenesis GTPase  29.56 
 
 		 293 aa  78.2  0.0000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.365042 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2306  ribosomal biogenesis GTPase  24.63 
 
 		 313 aa  77.8  0.0000000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.575224  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1349  GTP-binding  24.76 
 
 		 319 aa  77.8  0.0000000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00974199  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02121  ribosomal biogenesis GTPase  30.81 
 
 		 287 aa  77.8  0.0000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1589  ribosomal biogenesis GTPase  25 
 
 		 313 aa  77.4  0.0000000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.246818 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1752  ribosomal biogenesis GTPase  26.07 
 
 		 313 aa  77.4  0.0000000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1486  ribosomal biogenesis GTPase  24.92 
 
 		 313 aa  77.8  0.0000000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1882  ribosomal biogenesis GTPase  25.77 
 
 		 313 aa  77.4  0.0000000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.140157  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1889  ribosomal biogenesis GTPase  25.77 
 
 		 313 aa  77.4  0.0000000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2437  ribosomal biogenesis GTPase  25.77 
 
 		 313 aa  77.4  0.0000000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.743849  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1855  ribosomal biogenesis GTPase  25.77 
 
 		 313 aa  77.4  0.0000000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2590  ribosomal biogenesis GTPase  25.15 
 
 		 313 aa  77  0.0000000000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_19438  predicted protein  21.94 
 
 		 529 aa  77  0.0000000000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0420618  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1988  ribosomal biogenesis GTPase  27.76 
 
 		 288 aa  77  0.0000000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1993  ribosomal biogenesis GTPase  26.62 
 
 		 314 aa  77  0.0000000000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0543739  normal  0.136959 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0461  ribosomal biogenesis GTPase  25.78 
 
 		 314 aa  76.6  0.0000000000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.178573  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1785  GTP-binding  30.06 
 
 		 307 aa  76.3  0.000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.417498 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0663  GTP-binding protein, HSR1-related  26.53 
 
 		 284 aa  76.6  0.000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.011457  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0838  ribosome biogenesis GTP-binding protein YlqF  31.07 
 
 		 293 aa  76.3  0.000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0669  ribosomal biogenesis GTPase  27.03 
 
 		 311 aa  75.9  0.000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.378944  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000287  50S ribosomal subunit maturation GTPase RbgA  25.55 
 
 		 314 aa  75.9  0.000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.146408  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2377  ribosomal biogenesis GTPase  25.57 
 
 		 307 aa  75.9  0.000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1703  ribosomal biogenesis GTPase  26.1 
 
 		 310 aa  75.1  0.000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.237834  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0169  ribosomal biogenesis GTPase  25.61 
 
 		 323 aa  75.1  0.000000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000316145  normal  0.720532 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1688  GTP-binding protein HSR1-related  27.7 
 
 		 341 aa  74.7  0.000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.161371  normal  1 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_77411  predicted protein  22.91 
 
 		 653 aa  74.7  0.000000000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2120  GTPase  26.79 
 
 		 304 aa  74.3  0.000000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1114  ribosomal biogenesis GTPase  30.12 
 
 		 287 aa  74.3  0.000000000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.44359  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>