More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_0059 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_0059  GTP-binding protein HSR1-related  100 
 
 		 260 aa  509  1e-143  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.800533  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1339  GTP-binding protein HSR1-related  40.78 
 
 		 374 aa  169  3e-41  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0259  GTP-binding protein YlqF  40.78 
 
 		 384 aa  167  1e-40  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0579  GTP-binding protein HSR1-related  39.61 
 
 		 388 aa  166  5e-40  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.133242 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2161  GTP-binding protein, HSR1-related  38.87 
 
 		 268 aa  165  5.9999999999999996e-40  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0021  GTP-binding protein, HSR1-related  37.69 
 
 		 261 aa  160  1e-38  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0017  GTP-binding protein HSR1-related  37.65 
 
 		 259 aa  158  6e-38  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.437741 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0645  GTP-binding protein HSR1-related  39.13 
 
 		 374 aa  155  6e-37  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.112449  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0396  GTP-binding protein YlqF  40.65 
 
 		 254 aa  155  6e-37  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.243282  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3055  GTP-binding protein  39.84 
 
 		 258 aa  151  8e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.464248 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1049  small GTP-binding protein  36.84 
 
 		 256 aa  150  2e-35  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0648076 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01666  nucleolar GTPase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G08930)  35.74 
 
 		 560 aa  141  9.999999999999999e-33  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.772298  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1194  GTP-binding protein HSR1-related  37.45 
 
 		 379 aa  138  1e-31  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42327  predicted protein  36.25 
 
 		 443 aa  136  4e-31  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.812568  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0824  GTP-binding protein, HSR1-related  35.96 
 
 		 261 aa  134  9.999999999999999e-31  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND05640  conserved hypothetical protein  37.11 
 
 		 717 aa  133  3.9999999999999996e-30  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1293  GTP-binding protein HSR1-related  33.87 
 
 		 280 aa  126  4.0000000000000003e-28  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.00000000027879  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1931  GTP-binding protein YlqF  36.51 
 
 		 265 aa  124  2e-27  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_30716  nuclear/nucleolar GTP-binding protein 2  32.69 
 
 		 534 aa  124  2e-27  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0409155  normal  0.593065 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_2182  predicted protein  30.74 
 
 		 360 aa  123  3e-27  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2401  GTP-binding protein HSR1-related  33.84 
 
 		 292 aa  120  3e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00457359  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2029  ribosomal biogenesis GTPase  35.32 
 
 		 312 aa  120  3e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.831437  normal  0.492608 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2638  ribosomal biogenesis GTPase  34.92 
 
 		 312 aa  119  7e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00454653  normal  0.052608 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1988  ribosomal biogenesis GTPase  30.12 
 
 		 288 aa  117  9.999999999999999e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2508  ribosomal biogenesis GTPase  33.73 
 
 		 312 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2490  ribosomal biogenesis GTPase  31.18 
 
 		 287 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000101626  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1095  ribosomal biogenesis GTPase  30.49 
 
 		 283 aa  115  5e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00065113  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0716  GTP1/OBG protein  32.55 
 
 		 292 aa  116  5e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00781144  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2306  ribosomal biogenesis GTPase  33.73 
 
 		 313 aa  115  6.9999999999999995e-25  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.575224  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3880  ribosomal biogenesis GTPase  30.8 
 
 		 296 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000579568  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3689  ribosomal biogenesis GTPase  30.04 
 
 		 296 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0162209  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3976  ribosomal biogenesis GTPase  30.04 
 
 		 296 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000127206  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1645  GTP-binding protein HSR1-related protein  35.48 
 
 		 267 aa  114  2.0000000000000002e-24  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0965414  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3661  ribosomal biogenesis GTPase  30.42 
 
 		 296 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000313796  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1589  ribosomal biogenesis GTPase  33.47 
 
 		 313 aa  113  3e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.246818 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3597  ribosomal biogenesis GTPase  30.04 
 
 		 296 aa  112  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00124948  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3851  ribosomal biogenesis GTPase  30.04 
 
 		 296 aa  112  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  5.126e-62 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3936  ribosomal biogenesis GTPase  30.04 
 
 		 296 aa  112  5e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000467955  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1307  ribosomal biogenesis GTPase  30.04 
 
 		 296 aa  112  5e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000615833  unclonable  1.55704e-25 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3579  ribosomal biogenesis GTPase  30.04 
 
 		 296 aa  112  6e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000271121  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3885  ribosomal biogenesis GTPase  30.04 
 
 		 296 aa  112  6e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000521697  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2146  GTP-binding protein, HSR1-related  30.98 
 
 		 305 aa  111  9e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0811  ribosomal biogenesis GTPase  30.04 
 
 		 287 aa  109  6e-23  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00749287  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0169  ribosomal biogenesis GTPase  30.98 
 
 		 323 aa  108  7.000000000000001e-23  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000316145  normal  0.720532 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000287  50S ribosomal subunit maturation GTPase RbgA  31.35 
 
 		 314 aa  107  1e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.146408  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0763  GTP-binding protein YlqF  31.11 
 
 		 291 aa  108  1e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000221052  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0669  ribosomal biogenesis GTPase  31.13 
 
 		 311 aa  108  1e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.378944  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06087  ribosomal biogenesis GTPase  28.94 
 
 		 314 aa  107  3e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_25133  predicted protein  33.85 
 
 		 562 aa  106  3e-22  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1982  ribosomal biogenesis GTPase  31.75 
 
 		 318 aa  106  3e-22  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.360178 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1203  GTP-binding protein HSR1-related  30.27 
 
 		 283 aa  106  3e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000139155  normal  0.179888 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0663  GTP-binding protein, HSR1-related  29.1 
 
 		 284 aa  106  4e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.011457  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2283  ribosomal biogenesis GTPase  31.75 
 
 		 318 aa  106  4e-22  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0251974 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1961  ribosomal biogenesis GTPase  31.73 
 
 		 281 aa  106  4e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.648804  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1679  ribosomal biogenesis GTPase  31.73 
 
 		 281 aa  106  4e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.607688  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1327  ribosomal biogenesis GTPase  30.04 
 
 		 294 aa  105  5e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.575844  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1882  ribosomal biogenesis GTPase  32.54 
 
 		 313 aa  106  5e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.140157  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1889  ribosomal biogenesis GTPase  32.54 
 
 		 313 aa  106  5e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1302  ribosomal biogenesis GTPase  30.04 
 
 		 294 aa  105  5e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00764479  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2437  ribosomal biogenesis GTPase  32.54 
 
 		 313 aa  105  5e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.743849  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1855  ribosomal biogenesis GTPase  32.54 
 
 		 313 aa  106  5e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1752  ribosomal biogenesis GTPase  32.54 
 
 		 313 aa  105  1e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1409  ribosome biogenesis GTP-binding protein YlqF  29.77 
 
 		 271 aa  104  2e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.421311  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1301  GTP-binding protein HSR1-related  33.6 
 
 		 299 aa  103  3e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000833299 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2395  ribosomal biogenesis GTPase  32.54 
 
 		 313 aa  103  4e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.806942 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1490  GTP-binding protein  31.23 
 
 		 278 aa  103  4e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000000659617  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2924  HSR1-related GTP-binding protein  33.2 
 
 		 299 aa  102  6e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2186  ribosomal biogenesis GTPase  32.14 
 
 		 313 aa  101  9e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2263  ribosomal biogenesis GTPase  32.14 
 
 		 313 aa  101  9e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1486  ribosomal biogenesis GTPase  30.16 
 
 		 313 aa  101  1e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1703  ribosomal biogenesis GTPase  31.25 
 
 		 310 aa  100  2e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.237834  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07360  GTP-binding protein HSR1-related  28.9 
 
 		 282 aa  100  2e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000017476  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2590  ribosomal biogenesis GTPase  32.14 
 
 		 313 aa  99.8  4e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2048  GTP-binding protein, HSR1-related  28.68 
 
 		 284 aa  99  7e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000391161  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1993  ribosomal biogenesis GTPase  31.78 
 
 		 314 aa  98.6  8e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0543739  normal  0.136959 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0663  ribosomal biogenesis GTPase  34.96 
 
 		 279 aa  98.6  9e-20  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.5554  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1367  ribosome biogenesis GTP-binding protein YlqF  27.37 
 
 		 292 aa  98.6  9e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0461  ribosomal biogenesis GTPase  28.8 
 
 		 314 aa  98.2  1e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.178573  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3753  GTP1/OBG protein  27.65 
 
 		 276 aa  98.2  1e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000336118  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2377  ribosomal biogenesis GTPase  30.16 
 
 		 307 aa  96.7  3e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2758  GTP-binding protein, HSR1-related  27.38 
 
 		 329 aa  95.1  9e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0145905 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2474  GTP-binding protein HSR1-related  28.96 
 
 		 317 aa  95.1  9e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.188866  normal  0.279197 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2487  GTP-binding protein HSR1-related  29.73 
 
 		 328 aa  94.7  1e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000110563 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2453  ribosomal biogenesis GTPase  30.16 
 
 		 312 aa  94.7  1e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.643671  normal  0.265294 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1604  GTP-binding protein, HSR1-related  31.71 
 
 		 277 aa  95.1  1e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000452633  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_34264  predicted protein  32.96 
 
 		 597 aa  94.4  2e-18  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.159227  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0776  GTP-binding protein YlqF  29.08 
 
 		 290 aa  94  2e-18  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.119569  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0705  GTP-binding protein HSR1-related protein  30.3 
 
 		 298 aa  93.6  3e-18  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1682  GTP-binding protein HSR1-related  27.63 
 
 		 324 aa  93.2  4e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28889  predicted protein  28.82 
 
 		 521 aa  93.2  4e-18  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.691875  normal  0.346364 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0973  GTP-binding protein HSR1-related protein  33.73 
 
 		 282 aa  92.8  5e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000015477  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0773  GTPases  30.95 
 
 		 280 aa  92  9e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.79834e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl538  GTPase  29.88 
 
 		 315 aa  91.7  1e-17  Mesoplasma florum L1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000607031  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3634  ribosomal biogenesis GTPase  28.17 
 
 		 334 aa  91.3  1e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.909228  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0913  GTPase  32.05 
 
 		 279 aa  91.7  1e-17  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000773459 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01215  Myosin-related protein homolog MlpA Fragment [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9UVC7]  36.07 
 
 		 544 aa  90.9  2e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.00107626  normal  0.249209 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0973  GTP-binding protein YlqF  26.15 
 
 		 270 aa  90.9  2e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000216329  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1054  ribosomal biogenesis GTPase  28.98 
 
 		 315 aa  89.7  4e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC01210  conserved hypothetical protein  25.82 
 
 		 669 aa  88.2  1e-16  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02636  ribosomal biogenesis GTPase  30.43 
 
 		 323 aa  88.2  1e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>