More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_2033 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_2033  type II secretion system protein E  100 
 
 		 628 aa  1278    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0559  type II secretion system protein E  69.9 
 
 		 1126 aa  841    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0873  general secretory pathway protein E  39.25 
 
 		 871 aa  325  1e-87  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17740  type II secretion system protein E (GspE)  36.71 
 
 		 557 aa  306  1.0000000000000001e-81  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.898246 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1347  type II secretion system protein E  37.9 
 
 		 556 aa  304  3.0000000000000004e-81  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4828  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  33.56 
 
 		 563 aa  301  3e-80  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.436741 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1107  type II secretion system protein E  41.83 
 
 		 787 aa  299  1e-79  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1924  type II secretion system protein E  35.75 
 
 		 576 aa  295  2e-78  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0426  type II secretion system protein E  39.54 
 
 		 577 aa  295  2e-78  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0285266  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1822  type II secretion system protein E  36.41 
 
 		 557 aa  292  1e-77  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0186286  normal  0.89431 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0410  type II secretion system protein E  41.18 
 
 		 565 aa  292  2e-77  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.430305  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0622  type II secretion system protein E  36.36 
 
 		 568 aa  292  2e-77  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1504  type II secretion system protein E  41.26 
 
 		 558 aa  290  5.0000000000000004e-77  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0328  general secretion pathway protein E  39.14 
 
 		 514 aa  288  2e-76  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1864  type II secretion system protein E  39.57 
 
 		 573 aa  288  2e-76  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.468476 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1743  type II secretion system protein E  39.09 
 
 		 577 aa  288  2.9999999999999996e-76  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0656  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  35.97 
 
 		 568 aa  287  5e-76  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0656  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  35.97 
 
 		 568 aa  286  5.999999999999999e-76  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3555  type II secretion system protein E  43.31 
 
 		 573 aa  286  7e-76  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.422315  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3365  type II secretion system protein E  40.65 
 
 		 520 aa  285  1.0000000000000001e-75  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.219755  normal  0.0138681 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1042  general secretory pathway protein E  35.12 
 
 		 570 aa  286  1.0000000000000001e-75  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.90473  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0117  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  39.24 
 
 		 571 aa  285  1.0000000000000001e-75  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00247138  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1128  type II secretion system protein E  43.11 
 
 		 563 aa  285  1.0000000000000001e-75  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2414  type II secretion system protein E  39.81 
 
 		 564 aa  285  2.0000000000000002e-75  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1725  general secretory pathway protein E  40.79 
 
 		 553 aa  284  4.0000000000000003e-75  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1392  type II secretion system protein E  39.61 
 
 		 571 aa  284  4.0000000000000003e-75  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.025124 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1684  type II secretory pathway, ATPase PulE/Tfp pilus assembly pathway, ATPase PilB  40.65 
 
 		 577 aa  283  7.000000000000001e-75  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0417932  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0246  type II secretion system protein E  38.58 
 
 		 560 aa  283  9e-75  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00126346  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1168  type II secretion system protein E  33.9 
 
 		 561 aa  282  1e-74  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2570  secretion system protein E  38.07 
 
 		 562 aa  281  2e-74  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1322  type II secretion system protein E  41.59 
 
 		 553 aa  282  2e-74  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0787535 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0667  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  35.56 
 
 		 568 aa  280  6e-74  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0453527  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2420  type II secretion system protein E  39.86 
 
 		 573 aa  280  7e-74  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1823  type II secretion system protein E  35.58 
 
 		 571 aa  280  8e-74  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.158798 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1783  type IV pilus biogenesis protein PilB, putative  38.74 
 
 		 574 aa  279  1e-73  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.989309  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1451  type II secretion system protein E  38.95 
 
 		 574 aa  279  1e-73  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1884  type II secretion system protein E  37.14 
 
 		 570 aa  278  2e-73  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000626903  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0408  type II secretion system protein E  40.54 
 
 		 570 aa  278  2e-73  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05970  Tfp pilus assembly protein PilB  40.18 
 
 		 558 aa  278  2e-73  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1341  type II secretion system protein E  34.37 
 
 		 570 aa  277  4e-73  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2609  general secretory pathway protein E  35.65 
 
 		 610 aa  277  5e-73  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0938454  normal  0.754135 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2272  secretion system protein E  39.49 
 
 		 563 aa  277  5e-73  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0263  type II secretion system protein E  40 
 
 		 891 aa  276  7e-73  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.198237  normal  0.68743 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3137  pili biogenesis ATPase  38.32 
 
 		 474 aa  276  7e-73  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.629616  hitchhiker  0.0029573 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1156  type II secretion system protein E  40.47 
 
 		 591 aa  276  8e-73  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0676561 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3004  type II secretion system protein E  36.43 
 
 		 573 aa  276  8e-73  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000330393 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1631  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  38.31 
 
 		 568 aa  276  9e-73  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2419  type II secretion system protein E  39.15 
 
 		 559 aa  276  1.0000000000000001e-72  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0729  general secretory pathway protein E  35.01 
 
 		 603 aa  275  1.0000000000000001e-72  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.26973  normal  0.525639 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1166  type II secretion system protein E  42.71 
 
 		 572 aa  275  2.0000000000000002e-72  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0991  type II secretion system protein E  40.79 
 
 		 564 aa  275  2.0000000000000002e-72  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2595  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  38.31 
 
 		 568 aa  274  3e-72  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1279  type II secretion system protein E  39.59 
 
 		 573 aa  274  3e-72  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2895  type II secretion system protein E  35.77 
 
 		 580 aa  274  3e-72  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.847539  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2071  ATPase  38.86 
 
 		 666 aa  274  4.0000000000000004e-72  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0968  type II secretion system protein E  40.98 
 
 		 561 aa  274  4.0000000000000004e-72  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.197479  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2682  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  32.15 
 
 		 568 aa  274  4.0000000000000004e-72  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1415  general secretory pathway protein E  40.05 
 
 		 490 aa  273  5.000000000000001e-72  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.437005  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3833  type II secretion system protein E  35.06 
 
 		 568 aa  272  1e-71  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.522953 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1103  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  41.23 
 
 		 571 aa  272  1e-71  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.202418  decreased coverage  0.00743342 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0376  type II secretion system protein E  37.36 
 
 		 670 aa  272  1e-71  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3910  putative phytochrome sensor protein  39.3 
 
 		 727 aa  272  2e-71  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0454039  normal  0.623088 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0594  type II secretion system protein E  41.04 
 
 		 888 aa  272  2e-71  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0229677 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1408  type II secretion system protein E  37.98 
 
 		 577 aa  272  2e-71  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.22381  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2103  type II secretion system protein E  40.4 
 
 		 571 aa  271  2.9999999999999997e-71  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1052  general secretion pathway protein E (Type II traffic warden ATPase)(cholera toxin secretion protein EpsE)  40.76 
 
 		 585 aa  271  2.9999999999999997e-71  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2744  type II secretion system protein E  41.81 
 
 		 527 aa  270  4e-71  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.804654  normal  0.322952 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1028  type II secretion system protein E  38.65 
 
 		 568 aa  270  4e-71  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.328232 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0720  general secretory pathway protein E  35.98 
 
 		 599 aa  270  4e-71  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1971  type II secretion system protein E  36.21 
 
 		 670 aa  270  5.9999999999999995e-71  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3426  general secretory pathway protein E  38.07 
 
 		 497 aa  270  5.9999999999999995e-71  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3257  type II secretion system protein E  41.46 
 
 		 561 aa  270  5.9999999999999995e-71  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0531  type II secretion system protein E  39.7 
 
 		 417 aa  270  5.9999999999999995e-71  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2174  type II secretion system protein E  40.93 
 
 		 579 aa  269  8.999999999999999e-71  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0719  general secretory pathway protein E  35.78 
 
 		 599 aa  269  1e-70  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1055  type II secretion system protein E  39.13 
 
 		 559 aa  269  1e-70  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0268645  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1964  general secretion pathway protein E  40.81 
 
 		 583 aa  269  1e-70  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1571  type II secretion system protein E  38.19 
 
 		 587 aa  269  1e-70  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00763489  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1280  general secretory pathway protein E  36.69 
 
 		 521 aa  268  2e-70  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3137  general secretory pathway protein E  41.01 
 
 		 497 aa  268  2e-70  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1393  type II secretion system protein E  37.53 
 
 		 568 aa  268  2e-70  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.733111 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0509  pilus biogenesis ATPase  36.07 
 
 		 572 aa  268  2e-70  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0385141 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0608  general secretory pathway protein E  41.75 
 
 		 520 aa  268  2e-70  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000611826 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3239  type II secretion system protein E  37.35 
 
 		 600 aa  268  2e-70  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0590846  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3246  general secretory pathway protein GspE  37.14 
 
 		 497 aa  268  2.9999999999999995e-70  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.827332 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3243  type II secretion system protein E  35.92 
 
 		 499 aa  268  2.9999999999999995e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.286765 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0594  general secretory pathway protein E  41.75 
 
 		 520 aa  268  2.9999999999999995e-70  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3428  general secretory pathway protein E  40.25 
 
 		 471 aa  267  2.9999999999999995e-70  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00010017 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0685  type II secretion system protein E  35.52 
 
 		 599 aa  268  2.9999999999999995e-70  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1231  L(+)-tartrate dehydratase subunit beta (L-TTD beta)  39.65 
 
 		 583 aa  268  2.9999999999999995e-70  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4182  type II secretion system protein E  36.64 
 
 		 676 aa  268  2.9999999999999995e-70  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.231582 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2372  type II secretion system protein E  36.64 
 
 		 595 aa  268  2.9999999999999995e-70  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1653  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  37.23 
 
 		 568 aa  268  2.9999999999999995e-70  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0949  type II secretion system protein E  39.51 
 
 		 885 aa  267  4e-70  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.14742  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4189  type II secretion system protein E  34.6 
 
 		 557 aa  267  4e-70  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3357  type II secretion system protein E  35.31 
 
 		 595 aa  267  5e-70  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.987223 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0480  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  37.37 
 
 		 562 aa  267  5e-70  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.942114  normal  0.860525 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2184  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  42.64 
 
 		 572 aa  266  5.999999999999999e-70  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.48405  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1491  type IV pilus biogenesis protein PilB  37.59 
 
 		 568 aa  267  5.999999999999999e-70  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.10563  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02787  hypothetical protein  37.91 
 
 		 497 aa  266  5.999999999999999e-70  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.0000039107  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>