More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_0559 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_0559  type II secretion system protein E  100 
 
 		 1126 aa  2244    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2033  type II secretion system protein E  69.9 
 
 		 628 aa  842    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0873  general secretory pathway protein E  42.38 
 
 		 871 aa  324  7e-87  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1107  type II secretion system protein E  43.09 
 
 		 787 aa  307  7e-82  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1504  type II secretion system protein E  35.75 
 
 		 558 aa  305  3.0000000000000004e-81  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4828  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  34.7 
 
 		 563 aa  304  6.000000000000001e-81  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.436741 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2414  type II secretion system protein E  41.81 
 
 		 564 aa  300  1e-79  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1684  type II secretory pathway, ATPase PulE/Tfp pilus assembly pathway, ATPase PilB  42.52 
 
 		 577 aa  295  3e-78  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0417932  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0328  general secretion pathway protein E  40.6 
 
 		 514 aa  295  4e-78  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1924  type II secretion system protein E  39.96 
 
 		 576 aa  294  7e-78  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1042  general secretory pathway protein E  37.33 
 
 		 570 aa  294  7e-78  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.90473  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1392  type II secretion system protein E  34.17 
 
 		 571 aa  293  1e-77  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.025124 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3365  type II secretion system protein E  40.82 
 
 		 520 aa  292  3e-77  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.219755  normal  0.0138681 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3555  type II secretion system protein E  44.5 
 
 		 573 aa  291  5.0000000000000004e-77  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.422315  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0408  type II secretion system protein E  41.4 
 
 		 570 aa  290  1e-76  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1783  type IV pilus biogenesis protein PilB, putative  40.36 
 
 		 574 aa  289  2e-76  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.989309  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1864  type II secretion system protein E  39.56 
 
 		 573 aa  289  2e-76  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.468476 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0117  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  42.53 
 
 		 571 aa  288  2.9999999999999996e-76  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00247138  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0410  type II secretion system protein E  37.6 
 
 		 565 aa  288  4e-76  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.430305  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1743  type II secretion system protein E  41.99 
 
 		 577 aa  287  5.999999999999999e-76  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17740  type II secretion system protein E (GspE)  42.71 
 
 		 557 aa  287  7e-76  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.898246 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2420  type II secretion system protein E  39.69 
 
 		 573 aa  286  1.0000000000000001e-75  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2609  general secretory pathway protein E  35.19 
 
 		 610 aa  286  2.0000000000000002e-75  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0938454  normal  0.754135 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0122  type II secretion system protein E  36.14 
 
 		 514 aa  285  2.0000000000000002e-75  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.766789  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1168  type II secretion system protein E  42 
 
 		 561 aa  285  3.0000000000000004e-75  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05970  Tfp pilus assembly protein PilB  34.23 
 
 		 558 aa  284  5.000000000000001e-75  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1823  type II secretion system protein E  42.04 
 
 		 571 aa  284  7.000000000000001e-75  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.158798 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0426  type II secretion system protein E  41.65 
 
 		 577 aa  283  1e-74  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0285266  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3393  type II secretion system protein E  36.62 
 
 		 513 aa  282  2e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.118784  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2744  type II secretion system protein E  42.71 
 
 		 527 aa  283  2e-74  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.804654  normal  0.322952 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0656  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  33.17 
 
 		 568 aa  282  3e-74  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3004  type II secretion system protein E  39.91 
 
 		 573 aa  282  3e-74  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000330393 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1884  type II secretion system protein E  39.95 
 
 		 570 aa  282  3e-74  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000626903  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1128  type II secretion system protein E  39.7 
 
 		 563 aa  281  4e-74  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1451  type II secretion system protein E  38.8 
 
 		 574 aa  281  4e-74  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1103  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  42.18 
 
 		 571 aa  281  4e-74  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.202418  decreased coverage  0.00743342 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0656  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  41.96 
 
 		 568 aa  281  4e-74  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0622  type II secretion system protein E  33 
 
 		 568 aa  281  5e-74  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1347  type II secretion system protein E  41.73 
 
 		 556 aa  281  7e-74  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0888  type II secretion system protein E  44.33 
 
 		 553 aa  280  9e-74  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0968  type II secretion system protein E  41.19 
 
 		 561 aa  280  1e-73  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.197479  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2096  type IV pilus assembly protein PilB  43.42 
 
 		 571 aa  280  1e-73  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0246  type II secretion system protein E  39.86 
 
 		 560 aa  280  1e-73  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00126346  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2562  type II secretion system protein E  43.45 
 
 		 555 aa  280  1e-73  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0131  type II secretory pathway and PulE/Tfp pilus assembly pathway ATPase PilB  42.16 
 
 		 578 aa  280  1e-73  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1156  type II secretion system protein E  41.63 
 
 		 591 aa  280  1e-73  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0676561 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1279  type II secretion system protein E  40.09 
 
 		 573 aa  279  2e-73  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0682  general secretory pathway protein E  38.31 
 
 		 520 aa  279  2e-73  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.980899  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2570  secretion system protein E  39.63 
 
 		 562 aa  280  2e-73  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3137  pili biogenesis ATPase  41.08 
 
 		 474 aa  278  3e-73  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.629616  hitchhiker  0.0029573 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0051  general secretory pathway protein E  37.14 
 
 		 499 aa  279  3e-73  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.582006  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3618  general secretory pathway protein E  40.2 
 
 		 523 aa  278  4e-73  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.394925  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3243  type II secretion system protein E  36.72 
 
 		 499 aa  278  4e-73  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.286765 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3428  general secretory pathway protein E  40.69 
 
 		 471 aa  278  4e-73  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00010017 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0167  general secretion pathway protein E  40.39 
 
 		 521 aa  278  5e-73  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2785  general secretion pathway protein E  37.66 
 
 		 497 aa  278  5e-73  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.254947  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3517  general secretion pathway protein E  37.66 
 
 		 497 aa  278  5e-73  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.385541  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0221  general secretory pathway protein E  37.66 
 
 		 497 aa  278  5e-73  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1889  general secretion pathway protein E  37.66 
 
 		 497 aa  278  5e-73  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.902732  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0008  general secretory pathway protein E  37.66 
 
 		 497 aa  278  5e-73  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2663  general secretion pathway protein E  37.66 
 
 		 497 aa  278  5e-73  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0008  general secretory pathway protein E  37.66 
 
 		 497 aa  278  5e-73  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0106  general secretory pathway protein E  40.63 
 
 		 514 aa  278  5e-73  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0608  general secretory pathway protein E  41.41 
 
 		 520 aa  278  5e-73  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000611826 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0376  type II secretion system protein E  37.04 
 
 		 670 aa  277  6e-73  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0594  general secretory pathway protein E  41.41 
 
 		 520 aa  277  6e-73  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1822  type II secretion system protein E  41.28 
 
 		 557 aa  277  9e-73  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0186286  normal  0.89431 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0667  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  33.78 
 
 		 568 aa  277  9e-73  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0453527  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1631  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  39.04 
 
 		 568 aa  276  1.0000000000000001e-72  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0145  general secretory pathway protein E  39.9 
 
 		 523 aa  277  1.0000000000000001e-72  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0991  type II secretion system protein E  41.01 
 
 		 564 aa  275  2.0000000000000002e-72  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3071  general secretory pathway protein E  37.83 
 
 		 515 aa  276  2.0000000000000002e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000785682 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0009  Type II secretion system gspE  37.83 
 
 		 499 aa  276  2.0000000000000002e-72  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0061  general secretory pathway protein E  37.83 
 
 		 499 aa  276  2.0000000000000002e-72  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.212522  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0080  general secretory pathway protein E  36.72 
 
 		 499 aa  276  2.0000000000000002e-72  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0170  general secretion pathway protein E  39.76 
 
 		 520 aa  275  3e-72  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0904  type II secretion system protein E  34.72 
 
 		 595 aa  275  3e-72  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0729  general secretory pathway protein E  33.96 
 
 		 603 aa  275  3e-72  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.26973  normal  0.525639 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0157  type II secretion system protein E (GspE)  39.9 
 
 		 521 aa  275  3e-72  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0152  type II secretion system protein E (GspE)  39.9 
 
 		 521 aa  275  3e-72  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1653  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  32.32 
 
 		 568 aa  275  3e-72  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0949  type II secretion system protein E  40.88 
 
 		 885 aa  275  4.0000000000000004e-72  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.14742  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1055  type II secretion system protein E  37.16 
 
 		 559 aa  275  4.0000000000000004e-72  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0268645  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2895  type II secretion system protein E  39.24 
 
 		 580 aa  275  5.000000000000001e-72  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.847539  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2272  secretion system protein E  38.84 
 
 		 563 aa  275  5.000000000000001e-72  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0061  general secretory pathway protein E  36.72 
 
 		 499 aa  274  6e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0152  type II secretion system protein E (GspE)  39.9 
 
 		 521 aa  274  6e-72  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.203719  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0150  general secretory pathway protein E  40.39 
 
 		 521 aa  274  8.000000000000001e-72  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0154  general secretory pathway protein E  40.39 
 
 		 521 aa  274  8.000000000000001e-72  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.11492 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0154  general secretory pathway protein E  40.39 
 
 		 521 aa  274  8.000000000000001e-72  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4205  general secretory pathway protein E  40.39 
 
 		 521 aa  274  8.000000000000001e-72  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.381078  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0755  general secretory pathway protein E  38.14 
 
 		 469 aa  274  9e-72  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.179891 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1322  type II secretion system protein E  42.61 
 
 		 553 aa  273  9e-72  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0787535 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1114  general secretion pathway protein E  38.53 
 
 		 585 aa  273  1e-71  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1341  type II secretion system protein E  34.25 
 
 		 570 aa  273  1e-71  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3426  general secretory pathway protein E  39.95 
 
 		 497 aa  273  1e-71  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2184  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  44.13 
 
 		 572 aa  273  1e-71  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.48405  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0062  general secretory pathway protein E  37.17 
 
 		 498 aa  273  1e-71  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3230  type II secretion system protein E (GspE)  38.67 
 
 		 491 aa  273  2e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0114833  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1725  general secretory pathway protein E  40.09 
 
 		 553 aa  273  2e-71  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>