More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_4646 on replicon NC_012848
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012848  Rleg_4646  inner-membrane translocator  100 
 
 		 316 aa  607  1e-173  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5735  inner-membrane translocator  94.94 
 
 		 316 aa  582  1.0000000000000001e-165  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0600842  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5317  inner-membrane translocator  86.17 
 
 		 313 aa  527  1e-149  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.566323  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3912  inner-membrane translocator  73.8 
 
 		 315 aa  465  9.999999999999999e-131  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.246881  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1533  inner-membrane translocator  51.15 
 
 		 332 aa  270  2e-71  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.691946  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5160  inner-membrane translocator  50.97 
 
 		 328 aa  233  3e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.201222  normal  0.841137 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2783  inner-membrane translocator  47.7 
 
 		 312 aa  213  1.9999999999999998e-54  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.140737  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4053  inner-membrane translocator  48.41 
 
 		 301 aa  205  9e-52  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.732892 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2414  ribose ABC transporter (permease)  38.38 
 
 		 337 aa  153  2.9999999999999998e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1072  inner-membrane translocator  35.41 
 
 		 317 aa  143  5e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0954589  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1196  inner-membrane translocator  37.25 
 
 		 328 aa  138  1e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.352827 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3940  inner-membrane translocator  34.77 
 
 		 364 aa  122  9.999999999999999e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00743156  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0263  inner-membrane translocator  34.17 
 
 		 330 aa  114  2.0000000000000002e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4115  monosaccharide-transporting ATPase  29.52 
 
 		 318 aa  113  4.0000000000000004e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2283  monosaccharide-transporting ATPase  31.75 
 
 		 345 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.303171  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3880  sugar transport system permease  32.37 
 
 		 334 aa  109  8.000000000000001e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0490565 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0911  ribose ABC transporter, permease protein  31.29 
 
 		 342 aa  108  2e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0965  monosaccharide-transporting ATPase  31.29 
 
 		 342 aa  108  2e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2642  inner-membrane translocator  35.94 
 
 		 348 aa  105  7e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.769134  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1631  ribose ABC transporter, permease protein  33.69 
 
 		 334 aa  102  6e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1575  ribose ABC transporter, permease protein  33.69 
 
 		 334 aa  102  6e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.136542  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0395  inner-membrane translocator  39.19 
 
 		 315 aa  101  2e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.853202  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1509  ribose ABC transporter, permease protein  32 
 
 		 330 aa  100  4e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.424015  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1613  monosaccharide-transporting ATPase  32 
 
 		 330 aa  100  4e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1759  ribose ABC transporter permease  32 
 
 		 330 aa  100  4e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.32812  hitchhiker  0.000062023 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4066  monosaccharide-transporting ATPase  33.21 
 
 		 334 aa  99.8  6e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0158179  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0591  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  30.48 
 
 		 347 aa  99.4  7e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0343543  normal  0.480724 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2746  inner-membrane translocator  32.34 
 
 		 317 aa  99.4  8e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.470444  normal  0.775986 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1400  D-ribose transport system permease protein  32.35 
 
 		 327 aa  97.8  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.151364 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2400  Monosaccharide-transporting ATPase  33.33 
 
 		 334 aa  97.1  3e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0712  inner-membrane translocator  32.71 
 
 		 310 aa  97.1  4e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0709957  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1987  monosaccharide-transporting ATPase  31.56 
 
 		 312 aa  96.3  7e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.589517  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1398  inner-membrane translocator  32.27 
 
 		 334 aa  96.3  7e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00127371  normal  0.617276 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5341  ABC transporter membrane spanning protein (ribose)  32.59 
 
 		 348 aa  95.9  8e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1138  inner-membrane translocator  33.1 
 
 		 328 aa  94  3e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12300  monosaccharide ABC transporter membrane protein  30.34 
 
 		 309 aa  93.6  4e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  decreased coverage  0.00275786  normal  0.739873 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2807  inner-membrane translocator  31.52 
 
 		 338 aa  93.6  4e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2592  monosaccharide-transporting ATPase  31.27 
 
 		 316 aa  93.2  6e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0907  methylthioribose transport system permease protein  31.92 
 
 		 329 aa  92.8  7e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3449  inner-membrane translocator  29.84 
 
 		 314 aa  91.7  1e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2853  inner-membrane translocator  32.81 
 
 		 317 aa  92  1e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.654587 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1962  monosaccharide-transporting ATPase  33.56 
 
 		 353 aa  90.9  2e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0698409  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3217  ribose transport system permease protein RbsC  31.42 
 
 		 334 aa  91.3  2e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.961558  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1852  ribose ABC transporter, permease protein  33.56 
 
 		 353 aa  91.3  2e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3130  inner-membrane translocator  30.62 
 
 		 333 aa  91.7  2e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0780017  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3329  inner-membrane translocator  29.69 
 
 		 345 aa  91.7  2e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5038  inner-membrane translocator  29.69 
 
 		 345 aa  91.7  2e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.893051 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0412  Monosaccharide-transporting ATPase  28.89 
 
 		 328 aa  91.3  2e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00266655  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1087  inner-membrane translocator  32.12 
 
 		 339 aa  91.3  2e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.10708 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0456  ribose/xylose/arabinose/galactoside ABC-type transporter permease  31.84 
 
 		 310 aa  90.9  2e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0361  carbohydrate ABC transporter permease  31.84 
 
 		 310 aa  91.3  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5246  monosaccharide-transporting ATPase  29.69 
 
 		 345 aa  91.7  2e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.971428 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2914  monosaccharide-transporting ATPase  33.19 
 
 		 346 aa  90.9  3e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.366692  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3055  inner-membrane translocator  30.08 
 
 		 320 aa  90.5  3e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000100154  hitchhiker  0.00643024 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0625  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  29.69 
 
 		 345 aa  90.1  4e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.983884  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0859  ribose ABC transporter, permease protein  33.19 
 
 		 346 aa  89.7  5e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.479908  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2189  Monosaccharide-transporting ATPase  31.93 
 
 		 325 aa  89.7  5e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5320  inner-membrane translocator  31.21 
 
 		 350 aa  90.1  5e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.306475  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4236  ribose ABC transporter permease protein  28.2 
 
 		 322 aa  89.7  6e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.000913636  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1881  ribose ABC transporter, permease protein  30 
 
 		 311 aa  89.7  6e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0277317  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4966  monosaccharide-transporting ATPase  30.08 
 
 		 347 aa  89.7  6e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1458  Monosaccharide-transporting ATPase  29.97 
 
 		 333 aa  89.4  7e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0717887 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4446  inner-membrane translocator  29.69 
 
 		 345 aa  89.4  7e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000908606 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7475  monosaccharide-transporting ATPase  34.65 
 
 		 363 aa  88.6  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0406  inner-membrane translocator  30 
 
 		 361 aa  89  1e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1642  Monosaccharide-transporting ATPase  30.86 
 
 		 317 aa  89  1e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000000622557  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2981  inner-membrane translocator  29.3 
 
 		 328 aa  88.2  2e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0921483  normal  0.0941351 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2756  L-arabinose transporter permease protein  31.4 
 
 		 335 aa  87.8  2e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.394625  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2995  L-arabinose transporter permease protein  28.96 
 
 		 335 aa  87.8  2e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.397713  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0210  ribose ABC transporter, permease protein  31 
 
 		 339 aa  88.2  2e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3089  inner-membrane translocator  29.2 
 
 		 337 aa  88.2  2e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0871348  normal  0.381344 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2585  L-arabinose transporter permease protein  28.96 
 
 		 335 aa  88.2  2e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2804  inner-membrane translocator  29.79 
 
 		 324 aa  88.2  2e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.500539  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2788  ABC-type transporter for ribose/xylose/arabinose/galactoside systems, permease protein  27.8 
 
 		 314 aa  88.2  2e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0544071  normal  0.614175 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3727  Monosaccharide-transporting ATPase  35.36 
 
 		 356 aa  88.2  2e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.587944  normal  0.0169743 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3234  Monosaccharide-transporting ATPase  29.93 
 
 		 335 aa  87.8  2e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.197254  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4526  ribose ABC transporter permease protein  27.82 
 
 		 322 aa  87.4  3e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000584894  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0502  monosaccharide-transporting ATPase  31.49 
 
 		 333 aa  87.4  3e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00475125 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4171  Monosaccharide-transporting ATPase  29.14 
 
 		 341 aa  87.4  3e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00275528 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2121  Monosaccharide-transporting ATPase  33.79 
 
 		 350 aa  87.4  3e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.83989 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1704  inner-membrane translocator  34.45 
 
 		 330 aa  87.4  3e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.851457  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0780  inner-membrane translocator  28.21 
 
 		 328 aa  87  4e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.219344  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3600  monosaccharide-transporting ATPase  29.01 
 
 		 345 aa  87  4e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0147335  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0285  carbohydrate ABC transporter permease  30.8 
 
 		 344 aa  87  4e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0196  carbohydrate ABC transporter permease  30.8 
 
 		 344 aa  87  4e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2669  inner-membrane translocator  30.57 
 
 		 320 aa  86.7  5e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3976  ribose ABC transporter permease protein  27.27 
 
 		 322 aa  86.7  5e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.144441  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0416  Monosaccharide-transporting ATPase  30.86 
 
 		 335 aa  86.7  5e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000387261  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0922  monosaccharide-transporting ATPase  30.97 
 
 		 309 aa  86.3  6e-16  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2739  inner-membrane translocator  31 
 
 		 339 aa  86.3  6e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.86731 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3775  L-arabinose transporter permease protein  30.82 
 
 		 315 aa  86.3  7e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.629082 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2641  inner-membrane translocator  34.47 
 
 		 338 aa  85.9  8e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2883  inner-membrane translocator  32.22 
 
 		 348 aa  85.9  8e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.797919 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3488  sugar ABC transporter, permease protein  30.15 
 
 		 341 aa  85.9  9e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.294731  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4114  ribose ABC transporter permease protein  27.3 
 
 		 321 aa  85.9  9e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.32727  normal  0.0391743 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4135  inner-membrane translocator  29.84 
 
 		 321 aa  85.5  0.000000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2782  inner-membrane translocator  28.37 
 
 		 342 aa  85.5  0.000000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3966  ribose ABC transporter permease protein  27.91 
 
 		 321 aa  85.1  0.000000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.878402  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4173  ribose ABC transporter permease protein  28.3 
 
 		 322 aa  85.1  0.000000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00211847  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2809  inner-membrane translocator  28.37 
 
 		 342 aa  85.5  0.000000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0829098  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>