More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_5317 on replicon NC_009621
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009621  Smed_5317  inner-membrane translocator  100 
 
 		 313 aa  606  9.999999999999999e-173  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.566323  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4646  inner-membrane translocator  86.17 
 
 		 316 aa  527  1e-149  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5735  inner-membrane translocator  86.93 
 
 		 316 aa  525  1e-148  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0600842  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3912  inner-membrane translocator  70.82 
 
 		 315 aa  448  1e-125  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.246881  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1533  inner-membrane translocator  52.32 
 
 		 332 aa  280  2e-74  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.691946  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5160  inner-membrane translocator  50.33 
 
 		 328 aa  231  2e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.201222  normal  0.841137 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2783  inner-membrane translocator  46.05 
 
 		 312 aa  218  1e-55  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.140737  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4053  inner-membrane translocator  46.01 
 
 		 301 aa  206  5e-52  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.732892 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2414  ribose ABC transporter (permease)  37.5 
 
 		 337 aa  152  5.9999999999999996e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1072  inner-membrane translocator  36.45 
 
 		 317 aa  151  2e-35  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0954589  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1196  inner-membrane translocator  37.46 
 
 		 328 aa  137  2e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.352827 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3940  inner-membrane translocator  33.59 
 
 		 364 aa  115  6.9999999999999995e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00743156  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2283  monosaccharide-transporting ATPase  29.7 
 
 		 345 aa  104  2e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.303171  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0263  inner-membrane translocator  31.64 
 
 		 330 aa  104  2e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3880  sugar transport system permease  30.11 
 
 		 334 aa  103  3e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0490565 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0965  monosaccharide-transporting ATPase  30.11 
 
 		 342 aa  103  6e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0911  ribose ABC transporter, permease protein  30.11 
 
 		 342 aa  102  7e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2746  inner-membrane translocator  32.84 
 
 		 317 aa  102  8e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.470444  normal  0.775986 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0591  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  30.86 
 
 		 347 aa  102  9e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0343543  normal  0.480724 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4115  monosaccharide-transporting ATPase  29.43 
 
 		 318 aa  101  1e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12300  monosaccharide ABC transporter membrane protein  30.5 
 
 		 309 aa  100  3e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  decreased coverage  0.00275786  normal  0.739873 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0395  inner-membrane translocator  35.19 
 
 		 315 aa  99.8  5e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.853202  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1631  ribose ABC transporter, permease protein  30.96 
 
 		 334 aa  99.4  7e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1575  ribose ABC transporter, permease protein  30.96 
 
 		 334 aa  99.4  7e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.136542  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1398  inner-membrane translocator  31.9 
 
 		 334 aa  99.4  8e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00127371  normal  0.617276 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4066  monosaccharide-transporting ATPase  31.67 
 
 		 334 aa  99  9e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0158179  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1138  inner-membrane translocator  33.33 
 
 		 328 aa  98.6  1e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1987  monosaccharide-transporting ATPase  30.8 
 
 		 312 aa  97.8  2e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.589517  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2642  inner-membrane translocator  36.95 
 
 		 348 aa  98.2  2e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.769134  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2400  Monosaccharide-transporting ATPase  31.73 
 
 		 334 aa  96.7  4e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1759  ribose ABC transporter permease  29.62 
 
 		 330 aa  96.7  5e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.32812  hitchhiker  0.000062023 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1509  ribose ABC transporter, permease protein  29.62 
 
 		 330 aa  96.7  5e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.424015  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1613  monosaccharide-transporting ATPase  29.62 
 
 		 330 aa  96.7  5e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0502  monosaccharide-transporting ATPase  34.15 
 
 		 333 aa  95.9  7e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00475125 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5465  monosaccharide-transporting ATPase  30.55 
 
 		 337 aa  95.1  1e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.050328 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0886  ABC sugar transporter, inner-membrane subunit  30.55 
 
 		 337 aa  95.1  1e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0350071  normal  0.652921 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3549  inner-membrane translocator  30.55 
 
 		 337 aa  95.1  1e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4818  inner-membrane translocator  30.55 
 
 		 337 aa  95.1  1e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.414014  normal  0.232318 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3785  monosaccharide-transporting ATPase  30.91 
 
 		 337 aa  95.5  1e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0107495 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3234  Monosaccharide-transporting ATPase  33.04 
 
 		 335 aa  94.4  2e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.197254  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10510  monosaccharide ABC transporter membrane protein  33.68 
 
 		 380 aa  94.7  2e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2592  monosaccharide-transporting ATPase  31.41 
 
 		 316 aa  94.7  2e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2914  monosaccharide-transporting ATPase  32.93 
 
 		 346 aa  94  3e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.366692  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0712  inner-membrane translocator  32.83 
 
 		 310 aa  94  3e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0709957  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1962  monosaccharide-transporting ATPase  32.52 
 
 		 353 aa  93.2  4e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0698409  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4199  inner-membrane translocator  30.18 
 
 		 337 aa  93.6  4e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1852  ribose ABC transporter, permease protein  32.52 
 
 		 353 aa  93.2  4e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4722  monosaccharide-transporting ATPase  29.82 
 
 		 335 aa  93.2  5e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.278194 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5320  inner-membrane translocator  33.19 
 
 		 350 aa  93.2  5e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.306475  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2981  inner-membrane translocator  29.96 
 
 		 328 aa  93.2  5e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0921483  normal  0.0941351 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0456  ribose/xylose/arabinose/galactoside ABC-type transporter permease  30.48 
 
 		 310 aa  93.2  5e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1642  Monosaccharide-transporting ATPase  32.16 
 
 		 317 aa  93.2  6e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000000622557  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5341  ABC transporter membrane spanning protein (ribose)  31.72 
 
 		 348 aa  92.8  6e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0361  carbohydrate ABC transporter permease  30.48 
 
 		 310 aa  93.2  6e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0859  ribose ABC transporter, permease protein  32.34 
 
 		 346 aa  92.4  8e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.479908  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6089  inner-membrane translocator  33.93 
 
 		 334 aa  92.4  8e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.761591  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0780  inner-membrane translocator  29.86 
 
 		 328 aa  92.4  9e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.219344  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3488  sugar ABC transporter, permease protein  30.77 
 
 		 341 aa  91.7  1e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.294731  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0406  inner-membrane translocator  30.36 
 
 		 361 aa  92  1e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0563  monosaccharide-transporting ATPase  30.04 
 
 		 311 aa  91.3  2e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000352632  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0907  methylthioribose transport system permease protein  28.86 
 
 		 329 aa  90.9  2e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1400  D-ribose transport system permease protein  31.25 
 
 		 327 aa  91.3  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.151364 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6207  inner-membrane translocator  29.06 
 
 		 341 aa  90.5  3e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.729739 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2853  inner-membrane translocator  31.75 
 
 		 317 aa  90.1  4e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.654587 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1965  inner-membrane translocator  29.06 
 
 		 341 aa  90.5  4e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.389843  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2189  Monosaccharide-transporting ATPase  33.33 
 
 		 325 aa  89.7  5e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4601  Monosaccharide-transporting ATPase  29.06 
 
 		 341 aa  89.7  6e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.841849 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1792  sugar ABC transporter, permease protein  30.83 
 
 		 835 aa  89.4  8e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2433  ribose ABC transporter, permease protein  30.55 
 
 		 349 aa  89  9e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.19854  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0812  monosaccharide-transporting ATPase  31.05 
 
 		 317 aa  89  1e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.213991  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0416  Monosaccharide-transporting ATPase  27.78 
 
 		 335 aa  88.6  1e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000387261  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0835  monosaccharide-transporting ATPase  31.05 
 
 		 317 aa  89  1e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4236  ribose ABC transporter permease protein  29.02 
 
 		 322 aa  89  1e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.000913636  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2788  ABC-type transporter for ribose/xylose/arabinose/galactoside systems, permease protein  27.06 
 
 		 314 aa  88.6  1e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0544071  normal  0.614175 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3775  L-arabinose transporter permease protein  30.47 
 
 		 315 aa  88.2  1e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.629082 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1196  ribose ABC transporter, permease protein  31.74 
 
 		 334 aa  87.8  2e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.134964  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1826  inner-membrane translocator  30.19 
 
 		 336 aa  87.8  2e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0911886  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2807  inner-membrane translocator  30.66 
 
 		 338 aa  88.2  2e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1640  carbohydrate ABC transporter permease  31.74 
 
 		 334 aa  87.8  2e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.367254  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0302  carbohydrate ABC transporter permease  31.74 
 
 		 334 aa  87.8  2e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0470774  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0858  carbohydrate ABC transporter permease  31.74 
 
 		 334 aa  87.8  2e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3727  Monosaccharide-transporting ATPase  34.3 
 
 		 356 aa  87.8  2e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.587944  normal  0.0169743 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2071  ribose ABC transporter, permease protein  31.74 
 
 		 341 aa  87.4  3e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0117227  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1909  carbohydrate ABC transporter permease  31.74 
 
 		 339 aa  87.4  3e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.071894  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0285  carbohydrate ABC transporter permease  33.18 
 
 		 344 aa  87  3e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1922  carbohydrate ABC transporter permease  31.74 
 
 		 339 aa  87.4  3e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0196  carbohydrate ABC transporter permease  33.18 
 
 		 344 aa  87  3e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2756  L-arabinose transporter permease protein  30.2 
 
 		 335 aa  87  4e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.394625  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1704  inner-membrane translocator  35.41 
 
 		 330 aa  87  4e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.851457  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3092  inner-membrane translocator  33.48 
 
 		 325 aa  86.7  4e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.281303  normal  0.348975 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2214  inner-membrane translocator  32.4 
 
 		 324 aa  87  4e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.543943 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2995  L-arabinose transporter permease protein  30.86 
 
 		 335 aa  86.3  5e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.397713  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3346  monosaccharide-transporting ATPase  29.62 
 
 		 345 aa  86.7  5e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0869656  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4526  ribose ABC transporter permease protein  28.63 
 
 		 322 aa  86.7  5e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000584894  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0412  Monosaccharide-transporting ATPase  26.94 
 
 		 328 aa  86.7  5e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00266655  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2585  L-arabinose transporter permease protein  30.86 
 
 		 335 aa  86.3  6e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2641  inner-membrane translocator  33.66 
 
 		 338 aa  86.3  6e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3089  inner-membrane translocator  28.47 
 
 		 337 aa  86.3  6e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0871348  normal  0.381344 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2442  monosaccharide-transporting ATPase  35.94 
 
 		 349 aa  86.3  6e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1424  inner-membrane translocator  32.27 
 
 		 345 aa  86.3  7e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>