More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_2592 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009484  Acry_2592  monosaccharide-transporting ATPase  100 
 
 		 316 aa  597  1e-170  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2746  inner-membrane translocator  40.65 
 
 		 317 aa  182  5.0000000000000004e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.470444  normal  0.775986 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0263  inner-membrane translocator  39.93 
 
 		 330 aa  173  2.9999999999999996e-42  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4115  monosaccharide-transporting ATPase  36.76 
 
 		 318 aa  169  6e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0935  inner-membrane translocator:glucose/ribitol dehydrogenase  39.86 
 
 		 317 aa  166  5.9999999999999996e-40  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.840539  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0993  ribose ABC transporter, permease protein  39.86 
 
 		 317 aa  166  5.9999999999999996e-40  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0591  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  39.41 
 
 		 347 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0343543  normal  0.480724 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0395  inner-membrane translocator  44.37 
 
 		 315 aa  158  1e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.853202  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1138  inner-membrane translocator  37.76 
 
 		 328 aa  155  9e-37  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3055  inner-membrane translocator  40.06 
 
 		 320 aa  154  2e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000100154  hitchhiker  0.00643024 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2669  inner-membrane translocator  42.6 
 
 		 320 aa  153  4e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6381  inner-membrane translocator  41.26 
 
 		 313 aa  149  7e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.736605  normal  0.121067 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1398  inner-membrane translocator  36.9 
 
 		 334 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00127371  normal  0.617276 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3449  inner-membrane translocator  34.02 
 
 		 314 aa  125  9e-28  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11050  monosaccharide ABC transporter membrane protein  33.78 
 
 		 358 aa  125  1e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.543201 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3234  Monosaccharide-transporting ATPase  36.43 
 
 		 335 aa  124  2e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.197254  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0712  inner-membrane translocator  30.32 
 
 		 310 aa  122  8e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0709957  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1466  inner-membrane translocator  33.8 
 
 		 342 aa  122  8e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.613245  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0886  ABC sugar transporter, inner-membrane subunit  35.31 
 
 		 337 aa  119  6e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0350071  normal  0.652921 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3549  inner-membrane translocator  35.31 
 
 		 337 aa  119  6e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5465  monosaccharide-transporting ATPase  35.31 
 
 		 337 aa  119  6e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.050328 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4818  inner-membrane translocator  35.31 
 
 		 337 aa  119  6e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.414014  normal  0.232318 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1352  Monosaccharide-transporting ATPase  35.56 
 
 		 345 aa  119  7e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.884414  normal  0.25944 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1339  inner-membrane translocator  33.33 
 
 		 343 aa  119  9e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.698639  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2998  inner-membrane translocator  32.66 
 
 		 343 aa  119  9e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4722  monosaccharide-transporting ATPase  36.64 
 
 		 335 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.278194 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3785  monosaccharide-transporting ATPase  36.64 
 
 		 337 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0107495 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1575  ribose ABC transporter, permease protein  35.27 
 
 		 334 aa  118  1.9999999999999998e-25  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.136542  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1631  ribose ABC transporter, permease protein  35.27 
 
 		 334 aa  118  1.9999999999999998e-25  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4066  monosaccharide-transporting ATPase  34.78 
 
 		 334 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0158179  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3568  monosaccharide-transporting ATPase  36.39 
 
 		 332 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0965  monosaccharide-transporting ATPase  33.44 
 
 		 342 aa  117  3e-25  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1400  D-ribose transport system permease protein  37.28 
 
 		 327 aa  117  3e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.151364 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0911  ribose ABC transporter, permease protein  33.44 
 
 		 342 aa  117  3e-25  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0502  monosaccharide-transporting ATPase  33.12 
 
 		 333 aa  117  3e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00475125 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3880  sugar transport system permease  33.44 
 
 		 334 aa  116  5e-25  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0490565 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0709  inner-membrane translocator  31.95 
 
 		 314 aa  116  5e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.999308  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0412  Monosaccharide-transporting ATPase  32.4 
 
 		 328 aa  116  6e-25  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00266655  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3336  inner-membrane translocator  30.98 
 
 		 346 aa  114  1.0000000000000001e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1370  ribose ABC transporter permease protein  34.27 
 
 		 323 aa  114  2.0000000000000002e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.512196  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4199  inner-membrane translocator  34.8 
 
 		 337 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3940  inner-membrane translocator  35.74 
 
 		 364 aa  114  2.0000000000000002e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00743156  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4526  ribose ABC transporter permease protein  32.2 
 
 		 322 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000584894  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2804  inner-membrane translocator  36.84 
 
 		 324 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.500539  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4236  ribose ABC transporter permease protein  33.79 
 
 		 322 aa  114  3e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.000913636  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2121  Monosaccharide-transporting ATPase  33.99 
 
 		 350 aa  114  3e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.83989 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5341  ABC transporter membrane spanning protein (ribose)  34.19 
 
 		 348 aa  114  3e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3600  monosaccharide-transporting ATPase  30.6 
 
 		 345 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0147335  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3707  inner-membrane translocator  33 
 
 		 335 aa  113  4.0000000000000004e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.480101  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1509  ribose ABC transporter, permease protein  34.54 
 
 		 330 aa  113  5e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.424015  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1613  monosaccharide-transporting ATPase  34.54 
 
 		 330 aa  113  5e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1759  ribose ABC transporter permease  34.54 
 
 		 330 aa  113  5e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.32812  hitchhiker  0.000062023 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3217  ribose transport system permease protein RbsC  31.37 
 
 		 334 aa  113  5e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.961558  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2883  inner-membrane translocator  34.72 
 
 		 348 aa  112  7.000000000000001e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.797919 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10510  monosaccharide ABC transporter membrane protein  33.68 
 
 		 380 aa  112  7.000000000000001e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0580  inner-membrane translocator  34.05 
 
 		 329 aa  112  7.000000000000001e-24  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.00103432  normal  0.838313 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1921  inner-membrane translocator  32.67 
 
 		 354 aa  112  1.0000000000000001e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.748893  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2400  Monosaccharide-transporting ATPase  34.27 
 
 		 334 aa  110  2.0000000000000002e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4300  monosaccharide-transporting ATPase  32.43 
 
 		 341 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.94979 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2433  ribose ABC transporter, permease protein  35.14 
 
 		 349 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.19854  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2962  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  32.08 
 
 		 349 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.510501  normal  0.588326 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8211  monosaccharide-transporting ATPase  32.18 
 
 		 337 aa  110  2.0000000000000002e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0342  ribose ABC transporter permease protein  33.56 
 
 		 324 aa  111  2.0000000000000002e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3417  inner-membrane translocator  33.22 
 
 		 316 aa  111  2.0000000000000002e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.254798  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0563  monosaccharide-transporting ATPase  35.64 
 
 		 311 aa  110  3e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000352632  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0038  inner-membrane translocator  35.17 
 
 		 319 aa  110  3e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4446  inner-membrane translocator  30.06 
 
 		 345 aa  110  3e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000908606 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1987  monosaccharide-transporting ATPase  31.82 
 
 		 312 aa  110  4.0000000000000004e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.589517  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0579  ribose ABC transporter, permease  34.93 
 
 		 311 aa  109  5e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000340  ribose ABC transport system permease protein RbsC  34.21 
 
 		 327 aa  109  5e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0797  ribose ABC transporter, permease protein  34.59 
 
 		 311 aa  109  6e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000530424  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0769  ribose transport system permease  32.3 
 
 		 342 aa  109  6e-23  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00219185  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1682  inner-membrane translocator  32 
 
 		 336 aa  109  7.000000000000001e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0233719  normal  0.330784 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06144  ribose ABC transporter permease protein  33.55 
 
 		 327 aa  109  7.000000000000001e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0736  ribose ABC transporter, permease protein  34.59 
 
 		 311 aa  109  8.000000000000001e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0700  ribose ABC transporter, permease protein  34.59 
 
 		 311 aa  108  8.000000000000001e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0973921  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4638  ribose ABC transporter, permease protein  34.59 
 
 		 311 aa  108  8.000000000000001e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0801722  unclonable  4.6789e-26 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0578  ribose ABC transporter, permease  34.59 
 
 		 311 aa  109  8.000000000000001e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0535816  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0425  putative sugar ABC transporter, permease protein  30.6 
 
 		 317 aa  108  8.000000000000001e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1072  inner-membrane translocator  35.5 
 
 		 317 aa  108  8.000000000000001e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0954589  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1337  amino acid or sugar ABC transport system, permease protein  31.49 
 
 		 333 aa  109  8.000000000000001e-23  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.485159 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0638  monosaccharide-transporting ATPase  31.44 
 
 		 332 aa  108  9.000000000000001e-23  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0715262  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0516  ribose ABC transporter permease protein  35.09 
 
 		 324 aa  108  1e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3130  inner-membrane translocator  30.25 
 
 		 333 aa  108  1e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0780017  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0639  sugar ABC transporter, permease protein  31.85 
 
 		 341 aa  107  2e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3912  inner-membrane translocator  31.82 
 
 		 315 aa  107  2e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.246881  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0725  ribose ABC transporter, permease protein  34.25 
 
 		 311 aa  107  2e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.35469e-35 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0827  carbohydrate ABC transporter permease  31.85 
 
 		 341 aa  107  2e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1154  ribose/xylose/arabinose/galactoside ABC-type transporter permease  31.85 
 
 		 350 aa  107  2e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1791  carbohydrate ABC transporter permease  31.85 
 
 		 350 aa  107  2e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0582  monosaccharide-transporting ATPase  34.59 
 
 		 311 aa  108  2e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2852  inner-membrane translocator  33.33 
 
 		 317 aa  107  3e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.387266  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2371  sugar ABC transporter, permease protein  31.85 
 
 		 341 aa  107  3e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.474719  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0625  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  29.43 
 
 		 345 aa  107  3e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.983884  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3431  inner-membrane translocator  31.97 
 
 		 345 aa  107  3e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00119664  hitchhiker  0.000332917 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1881  ribose ABC transporter, permease protein  33.9 
 
 		 311 aa  107  3e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0277317  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1273  inner-membrane translocator  32.87 
 
 		 308 aa  107  3e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.485087  normal  0.949472 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1077  carbohydrate ABC transporter permease  31.85 
 
 		 341 aa  107  3e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.255506  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0668  ribose ABC transporter permease  33.9 
 
 		 311 aa  106  4e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1852  monosaccharide-transporting ATPase  33 
 
 		 330 aa  106  4e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>