More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_3055 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_3055  inner-membrane translocator  100 
 
 		 320 aa  604  9.999999999999999e-173  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000100154  hitchhiker  0.00643024 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2669  inner-membrane translocator  91.25 
 
 		 320 aa  487  1e-136  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0395  inner-membrane translocator  58.75 
 
 		 315 aa  263  4e-69  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.853202  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0263  inner-membrane translocator  46.43 
 
 		 330 aa  243  1.9999999999999999e-63  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4115  monosaccharide-transporting ATPase  43.45 
 
 		 318 aa  238  1e-61  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2592  monosaccharide-transporting ATPase  41.16 
 
 		 316 aa  176  6e-43  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0993  ribose ABC transporter, permease protein  38.55 
 
 		 317 aa  154  2e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0935  inner-membrane translocator:glucose/ribitol dehydrogenase  38.55 
 
 		 317 aa  154  2e-36  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.840539  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1466  inner-membrane translocator  35.25 
 
 		 342 aa  153  4e-36  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.613245  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0591  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  35.79 
 
 		 347 aa  149  6e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0343543  normal  0.480724 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2746  inner-membrane translocator  40.07 
 
 		 317 aa  146  5e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.470444  normal  0.775986 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6381  inner-membrane translocator  39.03 
 
 		 313 aa  141  9.999999999999999e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.736605  normal  0.121067 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11050  monosaccharide ABC transporter membrane protein  35.45 
 
 		 358 aa  134  1.9999999999999998e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.543201 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3217  ribose transport system permease protein RbsC  33.72 
 
 		 334 aa  132  7.999999999999999e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.961558  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2302  inner-membrane translocator  34.52 
 
 		 327 aa  132  7.999999999999999e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0887388 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2981  inner-membrane translocator  32.83 
 
 		 328 aa  131  1.0000000000000001e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0921483  normal  0.0941351 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1509  ribose ABC transporter, permease protein  32.29 
 
 		 330 aa  127  3e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.424015  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1759  ribose ABC transporter permease  32.29 
 
 		 330 aa  127  3e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.32812  hitchhiker  0.000062023 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1613  monosaccharide-transporting ATPase  32.29 
 
 		 330 aa  127  3e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3329  inner-membrane translocator  33.01 
 
 		 314 aa  126  4.0000000000000003e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4121  inner-membrane translocator  31.79 
 
 		 328 aa  125  7e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.49492  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0580  inner-membrane translocator  34.37 
 
 		 329 aa  125  1e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.00103432  normal  0.838313 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2807  inner-membrane translocator  34.43 
 
 		 338 aa  124  2e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0412  Monosaccharide-transporting ATPase  33.82 
 
 		 328 aa  124  2e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00266655  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0456  ribose/xylose/arabinose/galactoside ABC-type transporter permease  34.66 
 
 		 310 aa  124  3e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0361  carbohydrate ABC transporter permease  34.66 
 
 		 310 aa  124  3e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1642  Monosaccharide-transporting ATPase  34.84 
 
 		 317 aa  123  5e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000000622557  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1138  inner-membrane translocator  34.56 
 
 		 328 aa  122  7e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3449  inner-membrane translocator  34.02 
 
 		 314 aa  122  9e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1352  Monosaccharide-transporting ATPase  32.67 
 
 		 345 aa  121  9.999999999999999e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.884414  normal  0.25944 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10510  monosaccharide ABC transporter membrane protein  34.56 
 
 		 380 aa  121  9.999999999999999e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0690  Monosaccharide-transporting ATPase  35.26 
 
 		 348 aa  122  9.999999999999999e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0715844 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5246  monosaccharide-transporting ATPase  32.64 
 
 		 345 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.971428 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1987  monosaccharide-transporting ATPase  32.19 
 
 		 312 aa  120  1.9999999999999998e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.589517  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4135  inner-membrane translocator  33.94 
 
 		 321 aa  121  1.9999999999999998e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1874  monosaccharide-transporting ATPase  31.27 
 
 		 354 aa  121  1.9999999999999998e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.273612  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2045  inner-membrane translocator  33.09 
 
 		 342 aa  121  1.9999999999999998e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.459231 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0563  monosaccharide-transporting ATPase  34.42 
 
 		 311 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000352632  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3329  inner-membrane translocator  32.64 
 
 		 345 aa  120  3e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5038  inner-membrane translocator  32.64 
 
 		 345 aa  120  3e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.893051 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0725  ribose ABC transporter, permease protein  34.06 
 
 		 311 aa  120  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.35469e-35 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5341  ABC transporter membrane spanning protein (ribose)  31.86 
 
 		 348 aa  120  3.9999999999999996e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4626  Monosaccharide-transporting ATPase  33.23 
 
 		 348 aa  119  4.9999999999999996e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.530699 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2883  inner-membrane translocator  37.35 
 
 		 348 aa  120  4.9999999999999996e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.797919 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0736  ribose ABC transporter, permease protein  34.06 
 
 		 311 aa  119  6e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0578  ribose ABC transporter, permease  34.06 
 
 		 311 aa  119  6e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0535816  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4638  ribose ABC transporter, permease protein  34.06 
 
 		 311 aa  119  6e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0801722  unclonable  4.6789e-26 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0797  ribose ABC transporter, permease protein  34.06 
 
 		 311 aa  119  6e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000530424  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0123  inner-membrane translocator  32.52 
 
 		 343 aa  119  6e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0700  ribose ABC transporter, permease protein  34.06 
 
 		 311 aa  119  6e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0973921  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0635  ribose ABC transporter permease  33.7 
 
 		 311 aa  119  9e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0579  ribose ABC transporter, permease  34.06 
 
 		 311 aa  119  9e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0668  ribose ABC transporter permease  33.7 
 
 		 311 aa  119  9e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2442  ABC transporter permease  34.51 
 
 		 348 aa  118  9.999999999999999e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.986757  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0625  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  32.64 
 
 		 345 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.983884  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0582  monosaccharide-transporting ATPase  34.06 
 
 		 311 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2942  Monosaccharide-transporting ATPase  33.02 
 
 		 332 aa  118  9.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.868986 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2400  Monosaccharide-transporting ATPase  33.69 
 
 		 334 aa  118  9.999999999999999e-26  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3940  inner-membrane translocator  33.33 
 
 		 364 aa  117  1.9999999999999998e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00743156  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1792  sugar ABC transporter, permease protein  36.84 
 
 		 835 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3600  monosaccharide-transporting ATPase  31.93 
 
 		 345 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0147335  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4171  Monosaccharide-transporting ATPase  31.11 
 
 		 341 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00275528 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4446  inner-membrane translocator  32.12 
 
 		 345 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000908606 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1400  D-ribose transport system permease protein  35.42 
 
 		 327 aa  117  1.9999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.151364 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4966  monosaccharide-transporting ATPase  32.27 
 
 		 347 aa  117  3e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1087  inner-membrane translocator  31.96 
 
 		 339 aa  116  6e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.10708 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1652  inner-membrane translocator  32.91 
 
 		 340 aa  115  6.9999999999999995e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0718181  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0342  ribose ABC transporter permease protein  32.62 
 
 		 324 aa  115  6.9999999999999995e-25  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0288  inner-membrane translocator  30.34 
 
 		 331 aa  115  8.999999999999998e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.247958 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2264  putative ribose ABC transporter, permease protein  35.71 
 
 		 317 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0588068 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4655  inner-membrane translocator  31.69 
 
 		 337 aa  115  1.0000000000000001e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00409858 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0769  ribose transport system permease  30.16 
 
 		 342 aa  115  1.0000000000000001e-24  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00219185  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3014  ribose ABC transporter, permease protein, putative  31.67 
 
 		 317 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0563864  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1826  inner-membrane translocator  32.95 
 
 		 336 aa  114  2.0000000000000002e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0911886  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3850  inner-membrane translocator  30.52 
 
 		 388 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.530581  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2121  Monosaccharide-transporting ATPase  33.54 
 
 		 350 aa  114  2.0000000000000002e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.83989 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0115  ribose ABC transporter, permease protein  30 
 
 		 310 aa  114  3e-24  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2765  ribose ABC transporter permease  34.52 
 
 		 317 aa  113  3e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.586648  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2977  ribose ABC transporter permease  34.52 
 
 		 317 aa  113  3e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.807119  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1072  inner-membrane translocator  34.57 
 
 		 317 aa  114  3e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0954589  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0814  monosaccharide-transporting ATPase  30 
 
 		 327 aa  113  3e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0814  sugar ABC transporter, permease protein  30 
 
 		 327 aa  113  3e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2715  sugar ABC transporter, permease  34.52 
 
 		 317 aa  113  4.0000000000000004e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2973  putative ribose ABC transporter, permease protein  34.52 
 
 		 317 aa  113  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000373309 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0911  ribose ABC transporter, permease protein  31.02 
 
 		 342 aa  113  5e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01060  monosaccharide ABC transporter membrane protein  32.71 
 
 		 336 aa  113  5e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3880  sugar transport system permease  31.8 
 
 		 334 aa  113  5e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0490565 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1579  sugar ABC transporter permease  33.45 
 
 		 318 aa  113  5e-24  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.827046  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0965  monosaccharide-transporting ATPase  30.82 
 
 		 342 aa  113  5e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0156  sugar ABC transporter permease  30.74 
 
 		 326 aa  113  5e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000155105 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2695  sugar ABC transporter, permease  34.13 
 
 		 317 aa  112  6e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1030  monosaccharide-transporting ATPase  31.49 
 
 		 341 aa  112  6e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.608545 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3016  putative ribose ABC transporter, permease protein  33.47 
 
 		 317 aa  112  6e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0070  monosaccharide-transporting ATPase  36.07 
 
 		 364 aa  112  6e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0675215  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3727  Monosaccharide-transporting ATPase  32.16 
 
 		 356 aa  112  7.000000000000001e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.587944  normal  0.0169743 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1398  inner-membrane translocator  32.77 
 
 		 334 aa  112  7.000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00127371  normal  0.617276 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2771  monosaccharide-transporting ATPase  34.52 
 
 		 322 aa  112  8.000000000000001e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.285266  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0502  monosaccharide-transporting ATPase  33.23 
 
 		 333 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00475125 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4702  Monosaccharide-transporting ATPase  34.08 
 
 		 339 aa  112  1.0000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.6318  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1602  monosaccharide-transporting ATPase  34.93 
 
 		 315 aa  111  1.0000000000000001e-23  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>