More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_3912 on replicon NC_009668
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009668  Oant_3912  inner-membrane translocator  100 
 
 
315 aa  611  9.999999999999999e-175  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.246881  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4646  inner-membrane translocator  73.8 
 
 
316 aa  465  9.999999999999999e-131  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5735  inner-membrane translocator  74.92 
 
 
316 aa  463  1e-129  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0600842  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5317  inner-membrane translocator  70.82 
 
 
313 aa  448  1e-125  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.566323  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1533  inner-membrane translocator  51.8 
 
 
332 aa  272  4.0000000000000004e-72  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.691946  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5160  inner-membrane translocator  51.16 
 
 
328 aa  224  2e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.201222  normal  0.841137 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4053  inner-membrane translocator  48.4 
 
 
301 aa  214  1.9999999999999998e-54  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.732892 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2783  inner-membrane translocator  46.69 
 
 
312 aa  210  2e-53  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.140737  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2414  ribose ABC transporter (permease)  38.65 
 
 
337 aa  161  1e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1072  inner-membrane translocator  36.72 
 
 
317 aa  145  7.0000000000000006e-34  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0954589  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1196  inner-membrane translocator  38.06 
 
 
328 aa  142  6e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.352827 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3940  inner-membrane translocator  32.78 
 
 
364 aa  130  3e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00743156  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4115  monosaccharide-transporting ATPase  30.39 
 
 
318 aa  121  1.9999999999999998e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0591  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  32.34 
 
 
347 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0343543  normal  0.480724 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0263  inner-membrane translocator  31.23 
 
 
330 aa  107  2e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1138  inner-membrane translocator  32.97 
 
 
328 aa  107  3e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4135  inner-membrane translocator  32.4 
 
 
321 aa  105  9e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0395  inner-membrane translocator  37.9 
 
 
315 aa  105  1e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.853202  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2592  monosaccharide-transporting ATPase  32.26 
 
 
316 aa  105  1e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10510  monosaccharide ABC transporter membrane protein  37.55 
 
 
380 aa  103  3e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2746  inner-membrane translocator  33.22 
 
 
317 aa  103  4e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.470444  normal  0.775986 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3568  monosaccharide-transporting ATPase  31.83 
 
 
332 aa  100  3e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1921  inner-membrane translocator  32.62 
 
 
354 aa  99.4  7e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.748893  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1087  inner-membrane translocator  31.4 
 
 
339 aa  99.4  7e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.10708 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1400  D-ribose transport system permease protein  34.07 
 
 
327 aa  99  9e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.151364 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2283  monosaccharide-transporting ATPase  28.47 
 
 
345 aa  99  9e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.303171  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2642  inner-membrane translocator  34.08 
 
 
348 aa  98.6  1e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.769134  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1509  ribose ABC transporter, permease protein  31.73 
 
 
330 aa  97.8  2e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.424015  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0406  inner-membrane translocator  33.1 
 
 
361 aa  98.2  2e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1613  monosaccharide-transporting ATPase  31.73 
 
 
330 aa  97.8  2e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1759  ribose ABC transporter permease  31.73 
 
 
330 aa  97.8  2e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.32812  hitchhiker  0.000062023 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1398  inner-membrane translocator  30.04 
 
 
334 aa  97.1  3e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00127371  normal  0.617276 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2853  inner-membrane translocator  33.98 
 
 
317 aa  97.4  3e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.654587 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3880  sugar transport system permease  28.67 
 
 
334 aa  96.7  5e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0490565 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0965  monosaccharide-transporting ATPase  29.75 
 
 
342 aa  96.3  6e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0911  ribose ABC transporter, permease protein  29.75 
 
 
342 aa  95.9  7e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0412  Monosaccharide-transporting ATPase  30.18 
 
 
328 aa  95.9  8e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00266655  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0416  Monosaccharide-transporting ATPase  32.72 
 
 
335 aa  95.9  9e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000387261  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0709  inner-membrane translocator  33.45 
 
 
314 aa  95.9  9e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.999308  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1631  ribose ABC transporter, permease protein  31.45 
 
 
334 aa  95.1  1e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1575  ribose ABC transporter, permease protein  31.45 
 
 
334 aa  95.1  1e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.136542  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0285  carbohydrate ABC transporter permease  32.71 
 
 
344 aa  95.1  1e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0196  carbohydrate ABC transporter permease  32.71 
 
 
344 aa  95.1  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4066  monosaccharide-transporting ATPase  30.77 
 
 
334 aa  94.4  2e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0158179  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2883  inner-membrane translocator  32.21 
 
 
348 aa  94.7  2e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.797919 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0210  ribose ABC transporter, permease protein  32.34 
 
 
339 aa  94.4  3e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2756  L-arabinose transporter permease protein  32.3 
 
 
335 aa  93.6  4e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.394625  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3234  Monosaccharide-transporting ATPase  32.09 
 
 
335 aa  93.2  5e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.197254  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3775  L-arabinose transporter permease protein  30.35 
 
 
315 aa  92.8  6e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.629082 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1987  monosaccharide-transporting ATPase  30.65 
 
 
312 aa  92.8  7e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.589517  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6269  ABC transporter membrane spanning protein  31.49 
 
 
337 aa  92.4  9e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.661725  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4171  Monosaccharide-transporting ATPase  30.12 
 
 
341 aa  92  1e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00275528 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3727  Monosaccharide-transporting ATPase  33.1 
 
 
356 aa  92  1e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.587944  normal  0.0169743 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0456  ribose/xylose/arabinose/galactoside ABC-type transporter permease  29.41 
 
 
310 aa  92  1e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0361  carbohydrate ABC transporter permease  29.41 
 
 
310 aa  92  1e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0502  monosaccharide-transporting ATPase  31.5 
 
 
333 aa  91.3  2e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00475125 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5465  monosaccharide-transporting ATPase  33.18 
 
 
337 aa  90.9  2e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.050328 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3785  monosaccharide-transporting ATPase  32.74 
 
 
337 aa  90.9  2e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0107495 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5811  Monosaccharide-transporting ATPase  29.5 
 
 
333 aa  90.9  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0999426  normal  0.0839503 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0886  ABC sugar transporter, inner-membrane subunit  33.18 
 
 
337 aa  90.9  2e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0350071  normal  0.652921 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3549  inner-membrane translocator  33.18 
 
 
337 aa  90.9  2e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4199  inner-membrane translocator  33.63 
 
 
337 aa  91.3  2e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4818  inner-membrane translocator  33.18 
 
 
337 aa  90.9  2e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.414014  normal  0.232318 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2189  Monosaccharide-transporting ATPase  32.32 
 
 
325 aa  91.3  2e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3595  inner-membrane translocator  30.43 
 
 
332 aa  91.7  2e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.79837  normal  0.221773 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0993  ribose ABC transporter, permease protein  31.58 
 
 
317 aa  90.9  3e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1062  inner-membrane translocator  31.37 
 
 
345 aa  90.5  3e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.379015  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0935  inner-membrane translocator:glucose/ribitol dehydrogenase  31.58 
 
 
317 aa  90.9  3e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.840539  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4722  monosaccharide-transporting ATPase  33.18 
 
 
335 aa  90.9  3e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.278194 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1542  inner-membrane translocator  31.37 
 
 
345 aa  90.5  3e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1518  monosaccharide-transporting ATPase  31.37 
 
 
345 aa  90.9  3e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0853941  normal  0.0193721 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1265  inner-membrane translocator  34.65 
 
 
342 aa  90.1  4e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00281697  decreased coverage  0.000195243 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6712  inner-membrane translocator  29.14 
 
 
333 aa  90.5  4e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.769833 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3130  inner-membrane translocator  30.23 
 
 
333 aa  90.1  4e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0780017  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0712  inner-membrane translocator  30.22 
 
 
310 aa  90.1  4e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0709957  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1464  monosaccharide-transporting ATPase  31 
 
 
345 aa  89.7  5e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.987014  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3488  sugar ABC transporter, permease protein  30.11 
 
 
341 aa  89.7  6e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.294731  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2278  inner-membrane translocator  30 
 
 
309 aa  89.7  6e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.568654  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1424  inner-membrane translocator  31 
 
 
345 aa  89.4  6e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0922  monosaccharide-transporting ATPase  31.3 
 
 
309 aa  89.4  7e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4682  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  31.37 
 
 
345 aa  89.4  7e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.377068  normal  0.145685 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2807  inner-membrane translocator  30.48 
 
 
338 aa  89.4  7e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3600  monosaccharide-transporting ATPase  30.12 
 
 
345 aa  89.4  8e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0147335  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1826  inner-membrane translocator  28.76 
 
 
336 aa  89.4  8e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0911886  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0563  monosaccharide-transporting ATPase  30.66 
 
 
311 aa  89  9e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000352632  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3449  inner-membrane translocator  28.57 
 
 
314 aa  89  9e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2641  inner-membrane translocator  33.17 
 
 
338 aa  89  9e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2739  inner-membrane translocator  29.59 
 
 
339 aa  88.6  1e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.86731 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0859  ribose ABC transporter, permease protein  29.52 
 
 
346 aa  88.6  1e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.479908  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12300  monosaccharide ABC transporter membrane protein  28.36 
 
 
309 aa  88.6  1e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  decreased coverage  0.00275786  normal  0.739873 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1654  ABC transporter permease protein  32.34 
 
 
344 aa  88.6  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0625  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  29.73 
 
 
345 aa  88.6  1e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.983884  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2585  L-arabinose transporter permease protein  29.84 
 
 
335 aa  88.6  1e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2914  monosaccharide-transporting ATPase  29.15 
 
 
346 aa  88.6  1e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.366692  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2995  L-arabinose transporter permease protein  29.84 
 
 
335 aa  88.6  1e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.397713  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5246  monosaccharide-transporting ATPase  29.73 
 
 
345 aa  89  1e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.971428 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3329  inner-membrane translocator  29.73 
 
 
345 aa  89  1e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4446  inner-membrane translocator  30.04 
 
 
345 aa  88.6  1e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000908606 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5038  inner-membrane translocator  29.73 
 
 
345 aa  89  1e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.893051 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1704  inner-membrane translocator  31.58 
 
 
330 aa  88.6  1e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.851457  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>