More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_1533 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_1533  inner-membrane translocator  100 
 
 		 332 aa  621  1e-177  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.691946  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5317  inner-membrane translocator  52.32 
 
 		 313 aa  303  2.0000000000000002e-81  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.566323  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5735  inner-membrane translocator  52.13 
 
 		 316 aa  293  2e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0600842  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3912  inner-membrane translocator  51.8 
 
 		 315 aa  292  5e-78  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.246881  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4646  inner-membrane translocator  51.15 
 
 		 316 aa  291  1e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5160  inner-membrane translocator  51.06 
 
 		 328 aa  219  6e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.201222  normal  0.841137 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2783  inner-membrane translocator  46 
 
 		 312 aa  204  2e-51  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.140737  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4053  inner-membrane translocator  47.7 
 
 		 301 aa  204  2e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.732892 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2414  ribose ABC transporter (permease)  43.42 
 
 		 337 aa  167  2e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1196  inner-membrane translocator  42.05 
 
 		 328 aa  157  2e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.352827 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1072  inner-membrane translocator  36.58 
 
 		 317 aa  135  9.999999999999999e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0954589  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0591  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  35.19 
 
 		 347 aa  123  4e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0343543  normal  0.480724 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3940  inner-membrane translocator  33.65 
 
 		 364 aa  115  8.999999999999998e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00743156  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0263  inner-membrane translocator  31.42 
 
 		 330 aa  106  5e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4115  monosaccharide-transporting ATPase  30.26 
 
 		 318 aa  103  6e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1509  ribose ABC transporter, permease protein  34.54 
 
 		 330 aa  99.4  8e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.424015  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1613  monosaccharide-transporting ATPase  34.54 
 
 		 330 aa  99.4  8e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1759  ribose ABC transporter permease  34.54 
 
 		 330 aa  99.4  8e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.32812  hitchhiker  0.000062023 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2592  monosaccharide-transporting ATPase  32.49 
 
 		 316 aa  96.7  4e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4366  Monosaccharide-transporting ATPase  40.17 
 
 		 323 aa  95.9  8e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.168159  normal  0.0421878 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12300  monosaccharide ABC transporter membrane protein  30.97 
 
 		 309 aa  95.9  9e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  decreased coverage  0.00275786  normal  0.739873 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4655  inner-membrane translocator  31.68 
 
 		 337 aa  94.4  2e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00409858 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1458  Monosaccharide-transporting ATPase  33.33 
 
 		 333 aa  94.7  2e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0717887 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2521  monosaccharide-transporting ATPase  33.94 
 
 		 331 aa  93.2  5e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2424  ribose ABC transporter, permease protein  33.94 
 
 		 331 aa  93.2  5e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3078  ribose ABC transporter permease  33.94 
 
 		 331 aa  93.2  5e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2809  inner-membrane translocator  34.26 
 
 		 342 aa  93.2  6e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0829098  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2442  ABC transporter permease  31.05 
 
 		 348 aa  93.2  6e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.986757  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2782  inner-membrane translocator  34.26 
 
 		 342 aa  93.2  6e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2826  inner-membrane translocator  34.26 
 
 		 342 aa  93.2  6e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.700859  normal  0.0291669 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0196  carbohydrate ABC transporter permease  36.53 
 
 		 344 aa  92  1e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0285  carbohydrate ABC transporter permease  36.53 
 
 		 344 aa  92  1e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1602  monosaccharide-transporting ATPase  31.38 
 
 		 349 aa  91.7  2e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.195048  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0210  ribose ABC transporter, permease protein  36.07 
 
 		 339 aa  91.7  2e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2432  putative binding-protein-dependent transport system permease  30.15 
 
 		 327 aa  91.3  2e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1738  inner-membrane translocator  27.14 
 
 		 337 aa  88.6  1e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2840  monosaccharide-transporting ATPase  31.09 
 
 		 332 aa  89  1e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0712  inner-membrane translocator  32.54 
 
 		 310 aa  89  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0709957  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1424  inner-membrane translocator  35.35 
 
 		 345 aa  88.6  1e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6712  inner-membrane translocator  30.26 
 
 		 333 aa  87.8  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.769833 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5307  ABC transporter membrane spanning protein (ribose)  29.45 
 
 		 334 aa  88.2  2e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.167667  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1464  monosaccharide-transporting ATPase  35.35 
 
 		 345 aa  87.8  2e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.987014  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1712  monosaccharide-transporting ATPase  34.86 
 
 		 345 aa  87.8  2e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0294222 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0342  inner-membrane translocator  32.05 
 
 		 326 aa  88.2  2e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.770654  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1987  monosaccharide-transporting ATPase  31.73 
 
 		 312 aa  88.2  2e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.589517  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1652  inner-membrane translocator  33.47 
 
 		 340 aa  87.4  3e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0718181  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3055  inner-membrane translocator  30.74 
 
 		 320 aa  87.4  3e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000100154  hitchhiker  0.00643024 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2214  inner-membrane translocator  35.69 
 
 		 324 aa  87.8  3e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.543943 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2807  inner-membrane translocator  31.07 
 
 		 338 aa  87.4  3e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2302  inner-membrane translocator  31.73 
 
 		 327 aa  87  4e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0887388 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2962  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  35.15 
 
 		 349 aa  86.7  5e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.510501  normal  0.588326 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4300  monosaccharide-transporting ATPase  34.31 
 
 		 341 aa  86.7  5e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.94979 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10510  monosaccharide ABC transporter membrane protein  33.91 
 
 		 380 aa  86.7  5e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3267  inner-membrane translocator  30.3 
 
 		 317 aa  86.7  6e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.322146  normal  0.753894 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5811  Monosaccharide-transporting ATPase  29.89 
 
 		 333 aa  86.3  7e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0999426  normal  0.0839503 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3219  monosaccharide-transporting ATPase  32.29 
 
 		 331 aa  85.9  8e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0102816 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0922  monosaccharide-transporting ATPase  30.17 
 
 		 309 aa  85.5  0.000000000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2613  L-arabinose transporter permease protein  28.11 
 
 		 338 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.727228  normal  0.716925 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0502  monosaccharide-transporting ATPase  32.28 
 
 		 333 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00475125 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0993  ribose ABC transporter, permease protein  32.17 
 
 		 317 aa  84.7  0.000000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2853  inner-membrane translocator  32.13 
 
 		 317 aa  85.1  0.000000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.654587 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1654  ABC transporter permease protein  36.53 
 
 		 344 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1265  inner-membrane translocator  35.64 
 
 		 342 aa  84.7  0.000000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00281697  decreased coverage  0.000195243 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0123  inner-membrane translocator  29.75 
 
 		 343 aa  85.1  0.000000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0907  methylthioribose transport system permease protein  28.96 
 
 		 329 aa  84.7  0.000000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1062  inner-membrane translocator  34.42 
 
 		 345 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.379015  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1542  inner-membrane translocator  34.42 
 
 		 345 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0935  inner-membrane translocator:glucose/ribitol dehydrogenase  32.17 
 
 		 317 aa  84.7  0.000000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.840539  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1858  monosaccharide-transporting ATPase  29.96 
 
 		 324 aa  84.7  0.000000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.413944  hitchhiker  0.0026052 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1852  ribose ABC transporter, permease protein  31.03 
 
 		 353 aa  84.7  0.000000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0859  ribose ABC transporter, permease protein  31.69 
 
 		 346 aa  84.3  0.000000000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.479908  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4682  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  34.42 
 
 		 345 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.377068  normal  0.145685 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1518  monosaccharide-transporting ATPase  34.42 
 
 		 345 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0853941  normal  0.0193721 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2914  monosaccharide-transporting ATPase  31.69 
 
 		 346 aa  84  0.000000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.366692  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1154  ribose/xylose/arabinose/galactoside ABC-type transporter permease  34.19 
 
 		 350 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1077  carbohydrate ABC transporter permease  34.19 
 
 		 341 aa  84  0.000000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.255506  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2371  sugar ABC transporter, permease protein  34.19 
 
 		 341 aa  84  0.000000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.474719  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1962  monosaccharide-transporting ATPase  32.27 
 
 		 353 aa  83.6  0.000000000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0698409  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1791  carbohydrate ABC transporter permease  34.19 
 
 		 350 aa  83.2  0.000000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2981  inner-membrane translocator  29.1 
 
 		 328 aa  83.2  0.000000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0921483  normal  0.0941351 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6918  Monosaccharide-transporting ATPase  34.03 
 
 		 351 aa  83.6  0.000000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0182781  normal  0.200912 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0639  sugar ABC transporter, permease protein  34.19 
 
 		 341 aa  83.2  0.000000000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2641  inner-membrane translocator  32.21 
 
 		 338 aa  83.2  0.000000000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0827  carbohydrate ABC transporter permease  34.19 
 
 		 341 aa  83.2  0.000000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4056  inner-membrane translocator  32.66 
 
 		 369 aa  82.8  0.000000000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0407655  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3446  L-arabinose transporter permease protein  27.54 
 
 		 334 aa  82.8  0.000000000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1579  sugar ABC transporter permease  28.85 
 
 		 318 aa  82.8  0.000000000000008  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.827046  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5745  monosaccharide-transporting ATPase  36.52 
 
 		 318 aa  82  0.00000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2640  L-arabinose ABC transporter, permease protein  32.85 
 
 		 329 aa  82  0.00000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0418311  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1608  sugar ABC transporter, permease protein  34.62 
 
 		 341 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0709  inner-membrane translocator  35.47 
 
 		 314 aa  82  0.00000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.999308  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2484  L-arabinose transporter permease protein  29.55 
 
 		 334 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.532923  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3482  L-arabinose transporter permease protein  29.55 
 
 		 334 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.456756  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1138  inner-membrane translocator  30.98 
 
 		 328 aa  81.6  0.00000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3484  L-arabinose transporter permease protein  29.55 
 
 		 334 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6344  monosaccharide-transporting ATPase  29.87 
 
 		 343 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0383311  normal  0.17282 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0416  Monosaccharide-transporting ATPase  31.94 
 
 		 335 aa  81.3  0.00000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000387261  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4722  monosaccharide-transporting ATPase  34.36 
 
 		 335 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.278194 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0404  L-arabinose transporter permease protein  29.55 
 
 		 334 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.15645  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3775  L-arabinose transporter permease protein  30.99 
 
 		 315 aa  81.6  0.00000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.629082 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>