More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_1138 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009484  Acry_1138  inner-membrane translocator  100 
 
 		 328 aa  626  1e-178  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4115  monosaccharide-transporting ATPase  40.13 
 
 		 318 aa  173  3.9999999999999995e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2592  monosaccharide-transporting ATPase  38.49 
 
 		 316 aa  163  4.0000000000000004e-39  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0263  inner-membrane translocator  37.91 
 
 		 330 aa  153  4e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2746  inner-membrane translocator  37.54 
 
 		 317 aa  137  2e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.470444  normal  0.775986 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1881  ribose ABC transporter, permease protein  33.8 
 
 		 311 aa  135  8e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0277317  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0591  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  30.93 
 
 		 347 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0343543  normal  0.480724 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0935  inner-membrane translocator:glucose/ribitol dehydrogenase  34.15 
 
 		 317 aa  131  2.0000000000000002e-29  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.840539  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0993  ribose ABC transporter, permease protein  34.15 
 
 		 317 aa  131  2.0000000000000002e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0580  inner-membrane translocator  40.57 
 
 		 329 aa  123  5e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.00103432  normal  0.838313 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1466  inner-membrane translocator  35.5 
 
 		 342 aa  120  1.9999999999999998e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.613245  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0395  inner-membrane translocator  38.01 
 
 		 315 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.853202  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1398  inner-membrane translocator  35.86 
 
 		 334 aa  120  3e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00127371  normal  0.617276 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2981  inner-membrane translocator  32.71 
 
 		 328 aa  120  3.9999999999999996e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0921483  normal  0.0941351 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0456  ribose/xylose/arabinose/galactoside ABC-type transporter permease  32.04 
 
 		 310 aa  117  3e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2641  inner-membrane translocator  35.31 
 
 		 338 aa  117  3.9999999999999997e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0361  carbohydrate ABC transporter permease  31.69 
 
 		 310 aa  116  6e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6381  inner-membrane translocator  35.67 
 
 		 313 aa  115  6.9999999999999995e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.736605  normal  0.121067 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0563  monosaccharide-transporting ATPase  32.77 
 
 		 311 aa  114  3e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000352632  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0151  inner membrane ABC transporter permease protein YjfF  31.58 
 
 		 330 aa  114  3e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.302956  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4065  inner membrane ABC transporter permease protein YjfF  31.58 
 
 		 330 aa  114  3e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.937045  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0479  inner membrane ABC transporter permease protein YjfF  31.58 
 
 		 330 aa  114  3e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0714563 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0342  inner-membrane translocator  33.45 
 
 		 326 aa  112  6e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.770654  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0582  monosaccharide-transporting ATPase  32.77 
 
 		 311 aa  112  9e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2852  inner-membrane translocator  35.03 
 
 		 317 aa  112  1.0000000000000001e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.387266  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0886  ABC sugar transporter, inner-membrane subunit  33.54 
 
 		 337 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0350071  normal  0.652921 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3549  inner-membrane translocator  33.54 
 
 		 337 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5465  monosaccharide-transporting ATPase  33.54 
 
 		 337 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.050328 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4818  inner-membrane translocator  33.54 
 
 		 337 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.414014  normal  0.232318 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0635  ribose ABC transporter permease  32.75 
 
 		 311 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0700  ribose ABC transporter, permease protein  32.43 
 
 		 311 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0973921  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0668  ribose ABC transporter permease  32.75 
 
 		 311 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4638  ribose ABC transporter, permease protein  32.43 
 
 		 311 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0801722  unclonable  4.6789e-26 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0614  inner-membrane translocator  34.3 
 
 		 331 aa  110  3e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12300  monosaccharide ABC transporter membrane protein  32.37 
 
 		 309 aa  110  3e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  decreased coverage  0.00275786  normal  0.739873 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0736  ribose ABC transporter, permease protein  32.75 
 
 		 311 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0578  ribose ABC transporter, permease  32.75 
 
 		 311 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0535816  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3912  inner-membrane translocator  32.97 
 
 		 315 aa  109  5e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.246881  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0579  ribose ABC transporter, permease  32.75 
 
 		 311 aa  109  5e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3785  monosaccharide-transporting ATPase  33.88 
 
 		 337 aa  110  5e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0107495 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2914  monosaccharide-transporting ATPase  32.02 
 
 		 346 aa  109  7.000000000000001e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.366692  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4066  monosaccharide-transporting ATPase  33.33 
 
 		 334 aa  109  8.000000000000001e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0158179  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1792  sugar ABC transporter, permease protein  31.69 
 
 		 835 aa  108  9.000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09560  Monosaccharide-transporting ATPase  32.39 
 
 		 322 aa  108  9.000000000000001e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.785729  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01060  monosaccharide ABC transporter membrane protein  33.77 
 
 		 336 aa  108  1e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0115  ribose ABC transporter, permease protein  34.03 
 
 		 310 aa  108  1e-22  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0725  ribose ABC transporter, permease protein  32.4 
 
 		 311 aa  108  1e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.35469e-35 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0797  ribose ABC transporter, permease protein  32.4 
 
 		 311 aa  108  1e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000530424  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1072  inner-membrane translocator  31.95 
 
 		 317 aa  108  1e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0954589  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1631  ribose ABC transporter, permease protein  32.92 
 
 		 334 aa  107  2e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1575  ribose ABC transporter, permease protein  32.92 
 
 		 334 aa  107  2e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.136542  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4199  inner-membrane translocator  32.92 
 
 		 337 aa  107  3e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4722  monosaccharide-transporting ATPase  33.22 
 
 		 335 aa  107  3e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.278194 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0835  monosaccharide-transporting ATPase  35.09 
 
 		 317 aa  107  4e-22  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0812  monosaccharide-transporting ATPase  35.09 
 
 		 317 aa  107  4e-22  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.213991  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0911  ribose ABC transporter, permease protein  28.36 
 
 		 342 aa  104  2e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3880  sugar transport system permease  28.83 
 
 		 334 aa  104  2e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0490565 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0965  monosaccharide-transporting ATPase  28.83 
 
 		 342 aa  103  3e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0859  ribose ABC transporter, permease protein  34.66 
 
 		 346 aa  103  4e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.479908  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0502  monosaccharide-transporting ATPase  32.57 
 
 		 333 aa  103  4e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00475125 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3234  Monosaccharide-transporting ATPase  32.04 
 
 		 335 aa  103  5e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.197254  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2804  inner-membrane translocator  33.33 
 
 		 324 aa  102  6e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.500539  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1826  inner-membrane translocator  34.24 
 
 		 336 aa  103  6e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0911886  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11050  monosaccharide ABC transporter membrane protein  31.6 
 
 		 358 aa  103  6e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.543201 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2278  inner-membrane translocator  32.71 
 
 		 309 aa  102  6e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.568654  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3336  inner-membrane translocator  31.46 
 
 		 346 aa  102  7e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1454  Monosaccharide-transporting ATPase  28.4 
 
 		 345 aa  102  8e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.760781 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3976  ribose ABC transporter permease protein  30.38 
 
 		 322 aa  102  9e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.144441  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5320  inner-membrane translocator  32.89 
 
 		 350 aa  102  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.306475  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5735  inner-membrane translocator  32.27 
 
 		 316 aa  100  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0600842  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1400  D-ribose transport system permease protein  34.44 
 
 		 327 aa  101  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.151364 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0690  Monosaccharide-transporting ATPase  31.4 
 
 		 348 aa  101  2e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0715844 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5317  inner-membrane translocator  32.97 
 
 		 313 aa  101  2e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.566323  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3329  inner-membrane translocator  31.5 
 
 		 314 aa  100  3e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0362  inner-membrane translocator  32.26 
 
 		 383 aa  100  3e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3229  monosaccharide-transporting ATPase  30.91 
 
 		 324 aa  100  3e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3637  inner-membrane translocator  30.1 
 
 		 355 aa  100  4e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2883  inner-membrane translocator  31.73 
 
 		 348 aa  99.8  5e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.797919 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7831  sugar ABC transporter membrane protein  31.94 
 
 		 330 aa  99.8  5e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4590  L-arabinose transporter permease protein  29.29 
 
 		 337 aa  100  5e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00280966 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5220  L-arabinose transporter permease protein  29.29 
 
 		 341 aa  100  5e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5639  L-arabinose transporter permease protein  29.29 
 
 		 341 aa  100  5e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.356357  normal  0.0453459 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1063  monosaccharide-transporting ATPase  33.55 
 
 		 365 aa  99.8  5e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2031  L-arabinose transporter permease protein  31.48 
 
 		 328 aa  99.8  6e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.192716  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1626  L-arabinose transporter permease protein  29.01 
 
 		 339 aa  99.8  6e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1852  ribose ABC transporter, permease protein  31.87 
 
 		 353 aa  99.8  6e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5745  monosaccharide-transporting ATPase  35.79 
 
 		 318 aa  99.4  7e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1962  monosaccharide-transporting ATPase  31.87 
 
 		 353 aa  99.4  7e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0698409  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1397  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  32.92 
 
 		 333 aa  99  9e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0163625  normal  0.0606309 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1613  monosaccharide-transporting ATPase  32.04 
 
 		 330 aa  98.6  1e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1460  inner-membrane translocator  30.7 
 
 		 373 aa  98.6  1e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.3149 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1370  ribose ABC transporter permease protein  29.27 
 
 		 323 aa  98.6  1e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.512196  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1337  amino acid or sugar ABC transport system, permease protein  29.68 
 
 		 333 aa  98.6  1e-19  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.485159 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1759  ribose ABC transporter permease  32.04 
 
 		 330 aa  98.6  1e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.32812  hitchhiker  0.000062023 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2962  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  30.6 
 
 		 349 aa  98.6  1e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.510501  normal  0.588326 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3055  inner-membrane translocator  34.56 
 
 		 320 aa  99  1e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000100154  hitchhiker  0.00643024 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5198  Monosaccharide-transporting ATPase  33.33 
 
 		 333 aa  98.6  1e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1509  ribose ABC transporter, permease protein  32.04 
 
 		 330 aa  98.6  1e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.424015  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4366  Monosaccharide-transporting ATPase  33.22 
 
 		 323 aa  98.6  1e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.168159  normal  0.0421878 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4646  inner-membrane translocator  33.1 
 
 		 316 aa  98.6  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>