More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_0263 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008254  Meso_0263  inner-membrane translocator  100 
 
 		 330 aa  619  1e-176  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4115  monosaccharide-transporting ATPase  79.68 
 
 		 318 aa  491  9.999999999999999e-139  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3055  inner-membrane translocator  43.89 
 
 		 320 aa  214  9.999999999999999e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000100154  hitchhiker  0.00643024 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2669  inner-membrane translocator  47.14 
 
 		 320 aa  209  5e-53  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0395  inner-membrane translocator  48.29 
 
 		 315 aa  204  2e-51  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.853202  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0591  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  41.18 
 
 		 347 aa  183  3e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0343543  normal  0.480724 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2592  monosaccharide-transporting ATPase  39.93 
 
 		 316 aa  173  2.9999999999999996e-42  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2981  inner-membrane translocator  37.32 
 
 		 328 aa  164  2.0000000000000002e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0921483  normal  0.0941351 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0993  ribose ABC transporter, permease protein  41.84 
 
 		 317 aa  164  3e-39  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0935  inner-membrane translocator:glucose/ribitol dehydrogenase  41.84 
 
 		 317 aa  164  3e-39  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.840539  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4336  Monosaccharide-transporting ATPase  37.57 
 
 		 340 aa  155  6e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.895812  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4599  inner-membrane translocator  37.35 
 
 		 340 aa  155  9e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.033778 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2746  inner-membrane translocator  37.84 
 
 		 317 aa  145  9e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.470444  normal  0.775986 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1138  inner-membrane translocator  37.21 
 
 		 328 aa  144  2e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1458  Monosaccharide-transporting ATPase  36.13 
 
 		 333 aa  142  6e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0717887 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0712  inner-membrane translocator  36.88 
 
 		 310 aa  142  9e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0709957  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3336  inner-membrane translocator  34.19 
 
 		 346 aa  142  9.999999999999999e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0456  ribose/xylose/arabinose/galactoside ABC-type transporter permease  35.97 
 
 		 310 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0361  carbohydrate ABC transporter permease  35.97 
 
 		 310 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01060  monosaccharide ABC transporter membrane protein  36.71 
 
 		 336 aa  140  3e-32  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6381  inner-membrane translocator  40 
 
 		 313 aa  138  1e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.736605  normal  0.121067 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2121  Monosaccharide-transporting ATPase  34.98 
 
 		 350 aa  138  1e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.83989 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2998  inner-membrane translocator  34.82 
 
 		 343 aa  137  2e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1339  inner-membrane translocator  34.82 
 
 		 343 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.698639  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3329  inner-membrane translocator  35.41 
 
 		 314 aa  137  3.0000000000000003e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1337  amino acid or sugar ABC transport system, permease protein  32.99 
 
 		 333 aa  137  4e-31  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.485159 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2853  inner-membrane translocator  37.87 
 
 		 317 aa  136  5e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.654587 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4966  monosaccharide-transporting ATPase  33.44 
 
 		 347 aa  136  5e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4865  inner-membrane translocator  35.92 
 
 		 333 aa  136  6.0000000000000005e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4446  inner-membrane translocator  33.44 
 
 		 345 aa  135  7.000000000000001e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000908606 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2804  inner-membrane translocator  34.41 
 
 		 324 aa  135  8e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.500539  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0115  ribose ABC transporter, permease protein  35.88 
 
 		 310 aa  135  9e-31  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0563  monosaccharide-transporting ATPase  34.75 
 
 		 311 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000352632  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1792  sugar ABC transporter, permease protein  35.31 
 
 		 835 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0625  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  32.39 
 
 		 345 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.983884  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4135  inner-membrane translocator  37.63 
 
 		 321 aa  134  3e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3329  inner-membrane translocator  32.39 
 
 		 345 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5038  inner-membrane translocator  32.39 
 
 		 345 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.893051 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1962  monosaccharide-transporting ATPase  35.53 
 
 		 353 aa  133  3.9999999999999996e-30  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0698409  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0290  monosaccharide-transporting ATPase  31.83 
 
 		 331 aa  133  5e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5246  monosaccharide-transporting ATPase  32.39 
 
 		 345 aa  133  5e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.971428 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1852  ribose ABC transporter, permease protein  36.16 
 
 		 353 aa  133  5e-30  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11050  monosaccharide ABC transporter membrane protein  33.68 
 
 		 358 aa  132  6.999999999999999e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.543201 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0963  Monosaccharide-transporting ATPase  33.33 
 
 		 337 aa  132  6.999999999999999e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4849  inner-membrane translocator  32.47 
 
 		 325 aa  131  1.0000000000000001e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.361402  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2809  monosaccharide-transporting ATPase  34.51 
 
 		 337 aa  131  1.0000000000000001e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3976  ribose ABC transporter permease protein  35.37 
 
 		 322 aa  130  2.0000000000000002e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.144441  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4638  ribose ABC transporter, permease protein  33.77 
 
 		 311 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0801722  unclonable  4.6789e-26 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3674  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  33.33 
 
 		 337 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.765342  normal  0.0853749 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4171  Monosaccharide-transporting ATPase  31.56 
 
 		 341 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00275528 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4348  inner-membrane translocator  36.1 
 
 		 348 aa  130  2.0000000000000002e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0700  ribose ABC transporter, permease protein  33.77 
 
 		 311 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0973921  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0582  monosaccharide-transporting ATPase  33.77 
 
 		 311 aa  130  3e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0797  ribose ABC transporter, permease protein  33.44 
 
 		 311 aa  130  3e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000530424  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2914  monosaccharide-transporting ATPase  33.04 
 
 		 346 aa  130  3e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.366692  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2942  Monosaccharide-transporting ATPase  31.72 
 
 		 332 aa  130  3e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.868986 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0725  ribose ABC transporter, permease protein  33.44 
 
 		 311 aa  130  3e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.35469e-35 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0736  ribose ABC transporter, permease protein  33.44 
 
 		 311 aa  130  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0579  ribose ABC transporter, permease  33.44 
 
 		 311 aa  130  4.0000000000000003e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0578  ribose ABC transporter, permease  33.44 
 
 		 311 aa  130  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0535816  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2278  inner-membrane translocator  34.15 
 
 		 309 aa  130  4.0000000000000003e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.568654  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4928  monosaccharide-transporting ATPase  33.33 
 
 		 332 aa  130  4.0000000000000003e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.611047  normal  0.698391 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0859  ribose ABC transporter, permease protein  33.04 
 
 		 346 aa  130  5.0000000000000004e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.479908  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3600  monosaccharide-transporting ATPase  31.33 
 
 		 345 aa  129  6e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0147335  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3217  ribose transport system permease protein RbsC  29.65 
 
 		 334 aa  129  6e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.961558  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4526  ribose ABC transporter permease protein  33.97 
 
 		 322 aa  129  6e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000584894  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1759  ribose ABC transporter permease  33.65 
 
 		 330 aa  129  7.000000000000001e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.32812  hitchhiker  0.000062023 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1509  ribose ABC transporter, permease protein  33.65 
 
 		 330 aa  129  7.000000000000001e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.424015  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1613  monosaccharide-transporting ATPase  33.65 
 
 		 330 aa  129  7.000000000000001e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0635  ribose ABC transporter permease  33.11 
 
 		 311 aa  129  8.000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0668  ribose ABC transporter permease  33.11 
 
 		 311 aa  129  8.000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6712  inner-membrane translocator  33.02 
 
 		 333 aa  129  8.000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.769833 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1826  inner-membrane translocator  36.3 
 
 		 336 aa  129  9.000000000000001e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0911886  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5320  inner-membrane translocator  36.17 
 
 		 350 aa  129  1.0000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.306475  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1466  inner-membrane translocator  30.95 
 
 		 342 aa  128  1.0000000000000001e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.613245  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0769  ribose transport system permease  32.62 
 
 		 342 aa  128  1.0000000000000001e-28  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00219185  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1352  Monosaccharide-transporting ATPase  33.64 
 
 		 345 aa  128  1.0000000000000001e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.884414  normal  0.25944 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1488  inner-membrane translocator  31.78 
 
 		 329 aa  127  2.0000000000000002e-28  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10510  monosaccharide ABC transporter membrane protein  34.15 
 
 		 380 aa  127  2.0000000000000002e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0922  monosaccharide-transporting ATPase  31 
 
 		 309 aa  127  3e-28  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3449  inner-membrane translocator  34.9 
 
 		 314 aa  127  3e-28  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1793  monosaccharide-transporting ATPase  31.91 
 
 		 306 aa  126  4.0000000000000003e-28  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.115366  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3426  inner-membrane translocator  30.96 
 
 		 332 aa  126  5e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2243  monosaccharide-transporting ATPase  34.5 
 
 		 337 aa  126  5e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.163758  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2971  ribose ABC transporter, permease protein  35.21 
 
 		 342 aa  125  9e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3043  monosaccharide-transporting ATPase  35.21 
 
 		 342 aa  125  9e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.782139  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1872  sugar transport system permease  35.21 
 
 		 342 aa  125  9e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00854988 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3727  Monosaccharide-transporting ATPase  33.45 
 
 		 356 aa  125  9e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.587944  normal  0.0169743 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5811  Monosaccharide-transporting ATPase  32.39 
 
 		 333 aa  125  1e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0999426  normal  0.0839503 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3651  monosaccharide-transporting ATPase  36.09 
 
 		 351 aa  125  1e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.163622  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7475  monosaccharide-transporting ATPase  37.12 
 
 		 363 aa  124  2e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1370  ribose ABC transporter permease protein  33.85 
 
 		 323 aa  124  2e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.512196  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3522  autoinducer AI-2 ABC transporter, permease protein LsrC  36.09 
 
 		 351 aa  124  2e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0859  autoinducer AI-2 ABC transporter permease LsrC  35.76 
 
 		 351 aa  124  3e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1987  monosaccharide-transporting ATPase  33.01 
 
 		 312 aa  123  4e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.589517  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000340  ribose ABC transport system permease protein RbsC  34.05 
 
 		 327 aa  123  5e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3763  L-arabinose transporter permease protein  33.92 
 
 		 316 aa  122  6e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.139254  normal  0.990186 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0516  ribose ABC transporter permease protein  33.33 
 
 		 324 aa  122  6e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1400  D-ribose transport system permease protein  36.9 
 
 		 327 aa  122  8e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.151364 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1642  Monosaccharide-transporting ATPase  31.6 
 
 		 317 aa  122  8e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000000622557  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>