More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_1466 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007802  Jann_1466  inner-membrane translocator  100 
 
 		 342 aa  656    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.613245  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0580  inner-membrane translocator  39.63 
 
 		 329 aa  173  3.9999999999999995e-42  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.00103432  normal  0.838313 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0342  ribose ABC transporter permease protein  35.93 
 
 		 324 aa  130  4.0000000000000003e-29  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1370  ribose ABC transporter permease protein  36.67 
 
 		 323 aa  127  3e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.512196  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4115  monosaccharide-transporting ATPase  31.69 
 
 		 318 aa  127  4.0000000000000003e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3055  inner-membrane translocator  35.25 
 
 		 320 aa  124  3e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000100154  hitchhiker  0.00643024 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06144  ribose ABC transporter permease protein  34.56 
 
 		 327 aa  122  6e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0935  inner-membrane translocator:glucose/ribitol dehydrogenase  36.23 
 
 		 317 aa  122  7e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.840539  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0993  ribose ABC transporter, permease protein  36.23 
 
 		 317 aa  122  7e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2592  monosaccharide-transporting ATPase  33.8 
 
 		 316 aa  122  7e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0263  inner-membrane translocator  31.88 
 
 		 330 aa  122  9.999999999999999e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000340  ribose ABC transport system permease protein RbsC  35.06 
 
 		 327 aa  121  1.9999999999999998e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0504  inner-membrane translocator  31.83 
 
 		 357 aa  119  9.999999999999999e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0009  ribose ABC transporter permease protein  35.06 
 
 		 322 aa  118  9.999999999999999e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2278  inner-membrane translocator  34.15 
 
 		 309 aa  117  1.9999999999999998e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.568654  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0395  inner-membrane translocator  37.23 
 
 		 315 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.853202  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0591  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  36.54 
 
 		 347 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0343543  normal  0.480724 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5341  ABC transporter membrane spanning protein (ribose)  32.92 
 
 		 348 aa  116  3.9999999999999997e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1138  inner-membrane translocator  36 
 
 		 328 aa  116  3.9999999999999997e-25  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4526  ribose ABC transporter permease protein  31.56 
 
 		 322 aa  116  5e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000584894  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2669  inner-membrane translocator  34.17 
 
 		 320 aa  116  6e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3707  inner-membrane translocator  33.83 
 
 		 335 aa  115  7.999999999999999e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.480101  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2302  inner-membrane translocator  32.34 
 
 		 327 aa  115  1.0000000000000001e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0887388 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4236  ribose ABC transporter permease protein  32.46 
 
 		 322 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.000913636  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0814  monosaccharide-transporting ATPase  29.23 
 
 		 327 aa  114  2.0000000000000002e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0156  sugar ABC transporter permease  29.45 
 
 		 326 aa  114  2.0000000000000002e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000155105 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0814  sugar ABC transporter, permease protein  29.23 
 
 		 327 aa  114  2.0000000000000002e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0712  inner-membrane translocator  34.78 
 
 		 310 aa  114  3e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0709957  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3130  inner-membrane translocator  31.08 
 
 		 333 aa  113  4.0000000000000004e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0780017  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2605  Monosaccharide-transporting ATPase  35.04 
 
 		 336 aa  113  5e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.467417  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7025  monosaccharide-transporting ATPase  34.23 
 
 		 335 aa  112  6e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.560665  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3204  inner-membrane translocator  32.69 
 
 		 348 aa  112  6e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.0000146759  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3976  ribose ABC transporter permease protein  32.5 
 
 		 322 aa  112  9e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.144441  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0614  inner-membrane translocator  30.75 
 
 		 331 aa  112  9e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0700  ribose ABC transporter, permease protein  35.16 
 
 		 311 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0973921  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4638  ribose ABC transporter, permease protein  35.16 
 
 		 311 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0801722  unclonable  4.6789e-26 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0725  ribose ABC transporter, permease protein  35.16 
 
 		 311 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.35469e-35 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2442  monosaccharide-transporting ATPase  35.53 
 
 		 349 aa  112  1.0000000000000001e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0389  ribose transport system permease protein rbsC  34.85 
 
 		 357 aa  112  1.0000000000000001e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.995697 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0736  ribose ABC transporter, permease protein  35.16 
 
 		 311 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0579  ribose ABC transporter, permease  35.16 
 
 		 311 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0578  ribose ABC transporter, permease  35.16 
 
 		 311 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0535816  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0797  ribose ABC transporter, permease protein  35.55 
 
 		 311 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000530424  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1374  inner-membrane translocator  33.33 
 
 		 350 aa  110  2.0000000000000002e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.161757  normal  0.147375 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4173  ribose ABC transporter permease protein  32.59 
 
 		 322 aa  111  2.0000000000000002e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00211847  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4599  inner-membrane translocator  33.09 
 
 		 340 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.033778 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4188  monosaccharide-transporting ATPase  29.55 
 
 		 360 aa  110  2.0000000000000002e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0103  monosaccharide-transporting ATPase  31.11 
 
 		 360 aa  110  2.0000000000000002e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.628662  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0635  ribose ABC transporter permease  34.77 
 
 		 311 aa  110  3e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0668  ribose ABC transporter permease  34.77 
 
 		 311 aa  110  3e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2809  monosaccharide-transporting ATPase  31.45 
 
 		 337 aa  110  4.0000000000000004e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0709  inner-membrane translocator  33.58 
 
 		 314 aa  110  5e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.999308  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3217  ribose transport system permease protein RbsC  32.45 
 
 		 334 aa  110  5e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.961558  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0582  monosaccharide-transporting ATPase  34.77 
 
 		 311 aa  110  5e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4336  Monosaccharide-transporting ATPase  32.97 
 
 		 340 aa  109  6e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.895812  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4171  Monosaccharide-transporting ATPase  32.71 
 
 		 341 aa  109  7.000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00275528 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0563  monosaccharide-transporting ATPase  34.65 
 
 		 311 aa  109  7.000000000000001e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000352632  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0539  inner-membrane translocator  34.22 
 
 		 322 aa  109  7.000000000000001e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3593  monosaccharide-transporting ATPase  32.85 
 
 		 329 aa  108  1e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.225998  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0911  ribose ABC transporter, permease protein  30.04 
 
 		 342 aa  108  1e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3880  sugar transport system permease  30.4 
 
 		 334 aa  108  1e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0490565 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5970  ABC transporter membrane spanning protein (sugar)  30.75 
 
 		 360 aa  108  1e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0370627  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0965  monosaccharide-transporting ATPase  30.04 
 
 		 342 aa  108  1e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2513  inner-membrane translocator  33.83 
 
 		 328 aa  108  2e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.587124  normal  0.279488 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6381  inner-membrane translocator  35.89 
 
 		 313 aa  108  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.736605  normal  0.121067 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2604  inner-membrane translocator  34.07 
 
 		 317 aa  107  3e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.104291  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0127  inner-membrane translocator  29.86 
 
 		 354 aa  107  3e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0342  inner-membrane translocator  32.3 
 
 		 326 aa  107  4e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.770654  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4580  Monosaccharide-transporting ATPase  31.68 
 
 		 328 aa  106  5e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000124272  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2222  monosaccharide-transporting ATPase  32.72 
 
 		 319 aa  106  6e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.294 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1881  ribose ABC transporter, permease protein  34.24 
 
 		 311 aa  106  6e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0277317  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1874  monosaccharide-transporting ATPase  31.11 
 
 		 354 aa  106  7e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.273612  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0412  Monosaccharide-transporting ATPase  31.02 
 
 		 328 aa  105  8e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00266655  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0718  inner-membrane translocator  33.73 
 
 		 341 aa  105  8e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.303584  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1902  inner-membrane translocator  33.33 
 
 		 319 aa  105  9e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0227487  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0369  inner-membrane translocator  30.15 
 
 		 354 aa  105  1e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.823115  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2448  inner-membrane translocator  31.2 
 
 		 327 aa  105  1e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0992718  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4899  ribose ABC transporter permease protein  32.21 
 
 		 321 aa  104  2e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0818131  hitchhiker  0.000000774907 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1793  monosaccharide-transporting ATPase  31.52 
 
 		 306 aa  105  2e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.115366  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2746  inner-membrane translocator  36.6 
 
 		 317 aa  104  2e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.470444  normal  0.775986 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4114  ribose ABC transporter permease protein  33.11 
 
 		 321 aa  104  2e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.32727  normal  0.0391743 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2903  inner-membrane translocator  27.22 
 
 		 329 aa  104  2e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0235  monosaccharide-transporting ATPase  33.82 
 
 		 363 aa  104  3e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.802766 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4601  Monosaccharide-transporting ATPase  31.32 
 
 		 341 aa  104  3e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.841849 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2883  inner-membrane translocator  38.64 
 
 		 348 aa  103  3e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.797919 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09560  Monosaccharide-transporting ATPase  32.92 
 
 		 322 aa  103  3e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.785729  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2116  monosaccharide-transporting ATPase  30.6 
 
 		 340 aa  104  3e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.326273  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4317  monosaccharide-transporting ATPase  34.58 
 
 		 440 aa  103  3e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.769006  normal  0.0636141 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3353  inner-membrane translocator  32.96 
 
 		 319 aa  103  3e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1642  Monosaccharide-transporting ATPase  31.07 
 
 		 317 aa  104  3e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000000622557  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0922  monosaccharide-transporting ATPase  29.3 
 
 		 309 aa  103  4e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4446  inner-membrane translocator  33.92 
 
 		 345 aa  103  4e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000908606 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4135  inner-membrane translocator  32.97 
 
 		 321 aa  103  5e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4626  Monosaccharide-transporting ATPase  33.33 
 
 		 348 aa  103  5e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.530699 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3734  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  30.1 
 
 		 325 aa  102  7e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.450327  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2121  Monosaccharide-transporting ATPase  30.72 
 
 		 350 aa  102  7e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.83989 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3467  inner-membrane translocator  30.1 
 
 		 325 aa  102  7e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1613  monosaccharide-transporting ATPase  27.88 
 
 		 330 aa  102  8e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0893  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  30.92 
 
 		 328 aa  102  8e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1759  ribose ABC transporter permease  27.88 
 
 		 330 aa  102  8e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.32812  hitchhiker  0.000062023 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>