More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_5735 on replicon NC_011366
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011366  Rleg2_5735  inner-membrane translocator  100 
 
 		 316 aa  606  9.999999999999999e-173  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0600842  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4646  inner-membrane translocator  94.94 
 
 		 316 aa  582  1.0000000000000001e-165  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5317  inner-membrane translocator  86.93 
 
 		 313 aa  525  1e-148  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.566323  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3912  inner-membrane translocator  74.92 
 
 		 315 aa  463  1e-129  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.246881  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1533  inner-membrane translocator  52.13 
 
 		 332 aa  272  5.000000000000001e-72  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.691946  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5160  inner-membrane translocator  50.97 
 
 		 328 aa  230  2e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.201222  normal  0.841137 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2783  inner-membrane translocator  47.37 
 
 		 312 aa  212  5.999999999999999e-54  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.140737  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4053  inner-membrane translocator  47.62 
 
 		 301 aa  204  2e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.732892 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2414  ribose ABC transporter (permease)  38.16 
 
 		 337 aa  154  2e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1072  inner-membrane translocator  36.54 
 
 		 317 aa  141  1.9999999999999998e-32  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0954589  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1196  inner-membrane translocator  37.25 
 
 		 328 aa  135  6.0000000000000005e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.352827 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3940  inner-membrane translocator  36.29 
 
 		 364 aa  120  3.9999999999999996e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00743156  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0263  inner-membrane translocator  34.17 
 
 		 330 aa  114  2.0000000000000002e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4115  monosaccharide-transporting ATPase  29.56 
 
 		 318 aa  111  1.0000000000000001e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2283  monosaccharide-transporting ATPase  31.02 
 
 		 345 aa  107  3e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.303171  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3880  sugar transport system permease  31.65 
 
 		 334 aa  105  9e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0490565 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0965  monosaccharide-transporting ATPase  31.65 
 
 		 342 aa  104  2e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0911  ribose ABC transporter, permease protein  31.65 
 
 		 342 aa  104  2e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2642  inner-membrane translocator  35.59 
 
 		 348 aa  104  2e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.769134  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1613  monosaccharide-transporting ATPase  33.6 
 
 		 330 aa  104  3e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1509  ribose ABC transporter, permease protein  33.6 
 
 		 330 aa  104  3e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.424015  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1759  ribose ABC transporter permease  33.6 
 
 		 330 aa  104  3e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.32812  hitchhiker  0.000062023 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0591  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  32.36 
 
 		 347 aa  103  4e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0343543  normal  0.480724 
 
 
-
 
NC_004310  BR1631  ribose ABC transporter, permease protein  33.69 
 
 		 334 aa  100  3e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1400  D-ribose transport system permease protein  33.46 
 
 		 327 aa  100  3e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.151364 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1575  ribose ABC transporter, permease protein  33.69 
 
 		 334 aa  100  3e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.136542  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0395  inner-membrane translocator  39.19 
 
 		 315 aa  99.4  8e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.853202  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1987  monosaccharide-transporting ATPase  34.13 
 
 		 312 aa  98.2  2e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.589517  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2746  inner-membrane translocator  32.85 
 
 		 317 aa  97.8  2e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.470444  normal  0.775986 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4066  monosaccharide-transporting ATPase  33.21 
 
 		 334 aa  97.4  3e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0158179  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1138  inner-membrane translocator  32.27 
 
 		 328 aa  97.1  4e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1398  inner-membrane translocator  31.91 
 
 		 334 aa  95.9  8e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00127371  normal  0.617276 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5341  ABC transporter membrane spanning protein (ribose)  32.59 
 
 		 348 aa  95.5  1e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0712  inner-membrane translocator  33.33 
 
 		 310 aa  95.1  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0709957  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12300  monosaccharide ABC transporter membrane protein  30.34 
 
 		 309 aa  94.4  2e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  decreased coverage  0.00275786  normal  0.739873 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0907  methylthioribose transport system permease protein  30.61 
 
 		 329 aa  94.7  2e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1962  monosaccharide-transporting ATPase  33.56 
 
 		 353 aa  94  3e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0698409  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1852  ribose ABC transporter, permease protein  33.56 
 
 		 353 aa  94  3e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0456  ribose/xylose/arabinose/galactoside ABC-type transporter permease  32.34 
 
 		 310 aa  93.2  5e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0361  carbohydrate ABC transporter permease  32.34 
 
 		 310 aa  92.8  6e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2914  monosaccharide-transporting ATPase  32.95 
 
 		 346 aa  92.8  7e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.366692  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2853  inner-membrane translocator  33.45 
 
 		 317 aa  92.8  7e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.654587 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2981  inner-membrane translocator  29.67 
 
 		 328 aa  92.8  7e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0921483  normal  0.0941351 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2400  Monosaccharide-transporting ATPase  32.25 
 
 		 334 aa  92.8  7e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0859  ribose ABC transporter, permease protein  32.95 
 
 		 346 aa  92  1e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.479908  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0412  Monosaccharide-transporting ATPase  29.63 
 
 		 328 aa  92  1e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00266655  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0780  inner-membrane translocator  28.57 
 
 		 328 aa  91.7  2e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.219344  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2592  monosaccharide-transporting ATPase  30.91 
 
 		 316 aa  91.3  2e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2807  inner-membrane translocator  31.88 
 
 		 338 aa  91.3  2e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5320  inner-membrane translocator  30.85 
 
 		 350 aa  90.9  3e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.306475  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1704  inner-membrane translocator  34.76 
 
 		 330 aa  90.1  5e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.851457  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5246  monosaccharide-transporting ATPase  30.86 
 
 		 345 aa  90.1  5e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.971428 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3329  inner-membrane translocator  30.86 
 
 		 345 aa  89.7  5e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5038  inner-membrane translocator  30.86 
 
 		 345 aa  89.7  5e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.893051 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3775  L-arabinose transporter permease protein  29.62 
 
 		 315 aa  89.7  6e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.629082 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3488  sugar ABC transporter, permease protein  31.62 
 
 		 341 aa  89.4  7e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.294731  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2585  L-arabinose transporter permease protein  29.88 
 
 		 335 aa  89.4  7e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0285  carbohydrate ABC transporter permease  31.88 
 
 		 344 aa  89.4  7e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0196  carbohydrate ABC transporter permease  31.88 
 
 		 344 aa  89.4  7e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3234  Monosaccharide-transporting ATPase  31.73 
 
 		 335 aa  89.4  7e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.197254  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4236  ribose ABC transporter permease protein  28.93 
 
 		 322 aa  89.4  8e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.000913636  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1881  ribose ABC transporter, permease protein  28.66 
 
 		 311 aa  89.4  8e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0277317  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2995  L-arabinose transporter permease protein  29.88 
 
 		 335 aa  89.4  8e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.397713  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0625  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  30.86 
 
 		 345 aa  88.6  1e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.983884  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3055  inner-membrane translocator  31.58 
 
 		 320 aa  88.6  1e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000100154  hitchhiker  0.00643024 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3278  monosaccharide-transporting ATPase  31.96 
 
 		 334 aa  88.6  1e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.990654  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0406  inner-membrane translocator  31.07 
 
 		 361 aa  88.6  1e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1458  Monosaccharide-transporting ATPase  31.14 
 
 		 333 aa  89  1e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0717887 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2756  L-arabinose transporter permease protein  31.4 
 
 		 335 aa  87.8  2e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.394625  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2442  ABC transporter permease  28.36 
 
 		 348 aa  87.8  2e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.986757  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4135  inner-membrane translocator  31.71 
 
 		 321 aa  87.8  2e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0502  monosaccharide-transporting ATPase  31.89 
 
 		 333 aa  88.2  2e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00475125 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3130  inner-membrane translocator  29.3 
 
 		 333 aa  87.8  2e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0780017  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3449  inner-membrane translocator  29.46 
 
 		 314 aa  87.8  2e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0416  Monosaccharide-transporting ATPase  31.23 
 
 		 335 aa  88.2  2e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000387261  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2788  ABC-type transporter for ribose/xylose/arabinose/galactoside systems, permease protein  28.14 
 
 		 314 aa  88.2  2e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0544071  normal  0.614175 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3976  ribose ABC transporter permease protein  27.92 
 
 		 322 aa  87.8  2e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.144441  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2121  Monosaccharide-transporting ATPase  34.26 
 
 		 350 aa  87.8  2e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.83989 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4966  monosaccharide-transporting ATPase  31.3 
 
 		 347 aa  88.2  2e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2641  inner-membrane translocator  34.47 
 
 		 338 aa  87.4  3e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2189  Monosaccharide-transporting ATPase  33.09 
 
 		 325 aa  87.4  3e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4526  ribose ABC transporter permease protein  27.45 
 
 		 322 aa  87.4  3e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000584894  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0210  ribose ABC transporter, permease protein  31.37 
 
 		 339 aa  87.4  3e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2804  inner-membrane translocator  28.57 
 
 		 324 aa  87  3e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.500539  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4446  inner-membrane translocator  30.86 
 
 		 345 aa  87.4  3e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000908606 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3217  ribose transport system permease protein RbsC  30 
 
 		 334 aa  87  4e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.961558  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2424  ribose ABC transporter, permease protein  34.68 
 
 		 331 aa  87  4e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3078  ribose ABC transporter permease  34.68 
 
 		 331 aa  87  4e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2521  monosaccharide-transporting ATPase  34.68 
 
 		 331 aa  87  4e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1087  inner-membrane translocator  31.3 
 
 		 339 aa  86.7  4e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.10708 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1792  sugar ABC transporter, permease protein  32.58 
 
 		 835 aa  86.7  5e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0563  monosaccharide-transporting ATPase  29.26 
 
 		 311 aa  86.3  6e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000352632  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1921  inner-membrane translocator  30.63 
 
 		 354 aa  86.3  6e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.748893  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0922  monosaccharide-transporting ATPase  30.53 
 
 		 309 aa  85.9  8e-16  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1852  monosaccharide-transporting ATPase  30.34 
 
 		 330 aa  85.9  8e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5811  Monosaccharide-transporting ATPase  31.16 
 
 		 333 aa  85.9  9e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0999426  normal  0.0839503 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4118  ribose ABC transporter permease protein  27.22 
 
 		 321 aa  85.5  0.000000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.129793 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3966  ribose ABC transporter permease protein  27.22 
 
 		 321 aa  85.5  0.000000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.878402  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4266  ribose ABC transporter permease protein  27.22 
 
 		 321 aa  85.5  0.000000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00636427  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1965  inner-membrane translocator  27.92 
 
 		 341 aa  85.5  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.389843  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>