More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_5160 on replicon NC_010623
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010623  Bphy_5160  inner-membrane translocator  100 
 
 		 328 aa  629  1e-179  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.201222  normal  0.841137 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5317  inner-membrane translocator  50.33 
 
 		 313 aa  275  6e-73  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.566323  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4646  inner-membrane translocator  50.65 
 
 		 316 aa  272  5.000000000000001e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3912  inner-membrane translocator  51.16 
 
 		 315 aa  271  1e-71  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.246881  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5735  inner-membrane translocator  50.97 
 
 		 316 aa  269  5e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0600842  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1533  inner-membrane translocator  54.26 
 
 		 332 aa  244  1.9999999999999999e-63  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.691946  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2783  inner-membrane translocator  47 
 
 		 312 aa  187  2e-46  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.140737  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4053  inner-membrane translocator  45.2 
 
 		 301 aa  179  8e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.732892 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2414  ribose ABC transporter (permease)  44.64 
 
 		 337 aa  159  7e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1072  inner-membrane translocator  38.41 
 
 		 317 aa  153  2.9999999999999998e-36  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0954589  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1196  inner-membrane translocator  41.33 
 
 		 328 aa  141  1.9999999999999998e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.352827 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4115  monosaccharide-transporting ATPase  34.98 
 
 		 318 aa  130  3e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0591  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  33.83 
 
 		 347 aa  122  8e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0343543  normal  0.480724 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2981  inner-membrane translocator  35.8 
 
 		 328 aa  120  1.9999999999999998e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0921483  normal  0.0941351 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0263  inner-membrane translocator  34.46 
 
 		 330 aa  120  3e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2592  monosaccharide-transporting ATPase  33.57 
 
 		 316 aa  112  8.000000000000001e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1138  inner-membrane translocator  34.88 
 
 		 328 aa  110  4.0000000000000004e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5307  ABC transporter membrane spanning protein (ribose)  30.45 
 
 		 334 aa  108  1e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.167667  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2739  inner-membrane translocator  31.89 
 
 		 339 aa  108  2e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.86731 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5745  monosaccharide-transporting ATPase  37.11 
 
 		 318 aa  107  2e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2714  sugar ABC transporter, permease  32.11 
 
 		 338 aa  107  3e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.953176  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2265  putative ribose ABC transporter, permease protein  32.11 
 
 		 329 aa  107  3e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0836743 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2585  L-arabinose transporter permease protein  35.27 
 
 		 335 aa  106  4e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2995  L-arabinose transporter permease protein  35.27 
 
 		 335 aa  106  5e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.397713  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2694  sugar ABC transporter, permease  32.11 
 
 		 338 aa  106  6e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.273875  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2764  ribose ABC transporter permease  32.11 
 
 		 338 aa  105  1e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.340533  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2976  ribose ABC transporter permease  32.11 
 
 		 329 aa  105  1e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.355889  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2400  Monosaccharide-transporting ATPase  37.74 
 
 		 334 aa  105  1e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2756  L-arabinose transporter permease protein  36.51 
 
 		 335 aa  104  2e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.394625  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3940  inner-membrane translocator  33.46 
 
 		 364 aa  104  2e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00743156  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3602  L-arabinose transporter permease protein  35.8 
 
 		 317 aa  104  2e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2883  inner-membrane translocator  35.39 
 
 		 348 aa  104  2e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.797919 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4135  inner-membrane translocator  33.98 
 
 		 321 aa  103  3e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2977  putative ribose ABC transporter, permease protein  31.3 
 
 		 329 aa  103  4e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4601  Monosaccharide-transporting ATPase  33.22 
 
 		 341 aa  103  4e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.841849 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1965  inner-membrane translocator  33.22 
 
 		 341 aa  103  5e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.389843  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6207  inner-membrane translocator  33.22 
 
 		 341 aa  103  6e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.729739 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1458  Monosaccharide-transporting ATPase  34.63 
 
 		 333 aa  102  7e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0717887 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0922  monosaccharide-transporting ATPase  31.37 
 
 		 309 aa  102  7e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2189  Monosaccharide-transporting ATPase  37.04 
 
 		 325 aa  102  1e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3763  L-arabinose transporter permease protein  34.57 
 
 		 316 aa  101  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.139254  normal  0.990186 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11050  monosaccharide ABC transporter membrane protein  36.19 
 
 		 358 aa  101  2e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.543201 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2982  monosaccharide-transporting ATPase  37.74 
 
 		 323 aa  101  2e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.018273  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3880  sugar transport system permease  29.41 
 
 		 334 aa  100  2e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0490565 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1265  inner-membrane translocator  36.28 
 
 		 342 aa  100  3e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00281697  decreased coverage  0.000195243 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2640  L-arabinose ABC transporter, permease protein  34.15 
 
 		 329 aa  100  3e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0418311  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0911  ribose ABC transporter, permease protein  29.02 
 
 		 342 aa  100  4e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1400  D-ribose transport system permease protein  35.83 
 
 		 327 aa  100  4e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.151364 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0965  monosaccharide-transporting ATPase  29.02 
 
 		 342 aa  100  4e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2373  L-arabinose transporter permease protein  33.33 
 
 		 329 aa  99.8  5e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00546665  normal  0.130195 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2782  inner-membrane translocator  32.06 
 
 		 342 aa  99.8  5e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2826  inner-membrane translocator  32.06 
 
 		 342 aa  99.8  5e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.700859  normal  0.0291669 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2809  inner-membrane translocator  32.06 
 
 		 342 aa  99.8  5e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0829098  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1858  monosaccharide-transporting ATPase  31.13 
 
 		 324 aa  99.4  8e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.413944  hitchhiker  0.0026052 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3727  Monosaccharide-transporting ATPase  37.87 
 
 		 356 aa  99  9e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.587944  normal  0.0169743 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3775  L-arabinose transporter permease protein  34.02 
 
 		 315 aa  99  9e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.629082 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1759  ribose ABC transporter permease  34.58 
 
 		 330 aa  99  1e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.32812  hitchhiker  0.000062023 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1509  ribose ABC transporter, permease protein  34.58 
 
 		 330 aa  99  1e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.424015  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2521  monosaccharide-transporting ATPase  36.04 
 
 		 331 aa  98.6  1e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2853  inner-membrane translocator  32.56 
 
 		 317 aa  99  1e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.654587 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2424  ribose ABC transporter, permease protein  36.04 
 
 		 331 aa  98.6  1e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3229  monosaccharide-transporting ATPase  31.97 
 
 		 324 aa  98.6  1e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1613  monosaccharide-transporting ATPase  34.58 
 
 		 330 aa  99  1e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3078  ribose ABC transporter permease  36.04 
 
 		 331 aa  98.6  1e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0736  ribose ABC transporter, permease protein  33.33 
 
 		 311 aa  97.8  2e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0578  ribose ABC transporter, permease  33.33 
 
 		 311 aa  97.8  2e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0535816  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4638  ribose ABC transporter, permease protein  33.33 
 
 		 311 aa  97.8  2e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0801722  unclonable  4.6789e-26 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0123  inner-membrane translocator  34.21 
 
 		 343 aa  97.8  2e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0700  ribose ABC transporter, permease protein  33.33 
 
 		 311 aa  97.8  2e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0973921  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0579  ribose ABC transporter, permease  33.33 
 
 		 311 aa  97.4  3e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1881  ribose ABC transporter, permease protein  29.25 
 
 		 311 aa  97.4  3e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0277317  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1602  monosaccharide-transporting ATPase  33.21 
 
 		 349 aa  97.1  4e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.195048  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0725  ribose ABC transporter, permease protein  32.95 
 
 		 311 aa  96.7  5e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.35469e-35 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2283  monosaccharide-transporting ATPase  30.52 
 
 		 345 aa  96.3  6e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.303171  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0797  ribose ABC transporter, permease protein  32.95 
 
 		 311 aa  96.3  6e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000530424  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10510  monosaccharide ABC transporter membrane protein  37.21 
 
 		 380 aa  96.3  7e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12300  monosaccharide ABC transporter membrane protein  32.81 
 
 		 309 aa  96.3  7e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  decreased coverage  0.00275786  normal  0.739873 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2432  putative binding-protein-dependent transport system permease  32.22 
 
 		 327 aa  96.3  7e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0342  inner-membrane translocator  37.56 
 
 		 326 aa  95.9  8e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.770654  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0582  monosaccharide-transporting ATPase  32.95 
 
 		 311 aa  95.9  8e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0635  ribose ABC transporter permease  32.57 
 
 		 311 aa  95.5  1e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0668  ribose ABC transporter permease  32.57 
 
 		 311 aa  95.5  1e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7831  sugar ABC transporter membrane protein  32.5 
 
 		 330 aa  95.5  1e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0563  monosaccharide-transporting ATPase  32.05 
 
 		 311 aa  94.7  2e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000352632  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3219  monosaccharide-transporting ATPase  36.04 
 
 		 331 aa  94.7  2e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0102816 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2278  inner-membrane translocator  31.25 
 
 		 309 aa  94.7  2e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.568654  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3346  monosaccharide-transporting ATPase  34.8 
 
 		 345 aa  94.4  2e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0869656  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0712  inner-membrane translocator  33.69 
 
 		 310 aa  94.4  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0709957  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2972  inner membrane ABC transporter permease protein YdeZ  32.63 
 
 		 215 aa  94.4  3e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000021735 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1398  inner-membrane translocator  28.93 
 
 		 334 aa  94  3e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00127371  normal  0.617276 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0361  carbohydrate ABC transporter permease  32.22 
 
 		 310 aa  93.6  4e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2914  monosaccharide-transporting ATPase  36.65 
 
 		 346 aa  93.6  4e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.366692  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0582  monosaccharide-transporting ATPase  27.31 
 
 		 338 aa  93.6  4e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000210774  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0774  inner-membrane translocator  36.61 
 
 		 339 aa  93.2  5e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0308372 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2299  inner-membrane translocator  31.35 
 
 		 335 aa  93.6  5e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0163581  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2613  L-arabinose transporter permease protein  31.54 
 
 		 338 aa  93.2  5e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.727228  normal  0.716925 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1352  Monosaccharide-transporting ATPase  35.45 
 
 		 345 aa  93.2  5e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.884414  normal  0.25944 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0812  monosaccharide-transporting ATPase  33.05 
 
 		 317 aa  93.2  6e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.213991  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0835  monosaccharide-transporting ATPase  33.05 
 
 		 317 aa  93.2  6e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4348  inner-membrane translocator  29.43 
 
 		 348 aa  93.2  6e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>