More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_4053 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_4053  inner-membrane translocator  100 
 
 		 301 aa  568  1e-161  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.732892 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3912  inner-membrane translocator  48.84 
 
 		 315 aa  251  1e-65  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.246881  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5317  inner-membrane translocator  47 
 
 		 313 aa  242  7e-63  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.566323  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4646  inner-membrane translocator  49.44 
 
 		 316 aa  241  9e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5735  inner-membrane translocator  48.69 
 
 		 316 aa  238  9e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0600842  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1533  inner-membrane translocator  47.7 
 
 		 332 aa  229  4e-59  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.691946  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2783  inner-membrane translocator  46.46 
 
 		 312 aa  190  2e-47  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.140737  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5160  inner-membrane translocator  46.27 
 
 		 328 aa  166  5e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.201222  normal  0.841137 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2414  ribose ABC transporter (permease)  41.03 
 
 		 337 aa  161  1e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1196  inner-membrane translocator  40.34 
 
 		 328 aa  136  5e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.352827 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4115  monosaccharide-transporting ATPase  30.94 
 
 		 318 aa  128  2.0000000000000002e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1072  inner-membrane translocator  37.31 
 
 		 317 aa  124  1e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0954589  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0263  inner-membrane translocator  31.72 
 
 		 330 aa  122  8e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0591  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  32.58 
 
 		 347 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0343543  normal  0.480724 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2853  inner-membrane translocator  35.12 
 
 		 317 aa  112  9e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.654587 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3130  inner-membrane translocator  32.77 
 
 		 333 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0780017  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1458  Monosaccharide-transporting ATPase  32.58 
 
 		 333 aa  107  2e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0717887 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1400  D-ribose transport system permease protein  35.46 
 
 		 327 aa  104  2e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.151364 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0412  Monosaccharide-transporting ATPase  31.08 
 
 		 328 aa  104  2e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00266655  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2592  monosaccharide-transporting ATPase  33.21 
 
 		 316 aa  104  2e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3940  inner-membrane translocator  32.43 
 
 		 364 aa  103  3e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00743156  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01060  monosaccharide ABC transporter membrane protein  34.31 
 
 		 336 aa  103  4e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2981  inner-membrane translocator  31.15 
 
 		 328 aa  102  6e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0921483  normal  0.0941351 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2782  inner-membrane translocator  31.84 
 
 		 342 aa  102  6e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2826  inner-membrane translocator  31.84 
 
 		 342 aa  102  6e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.700859  normal  0.0291669 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2809  inner-membrane translocator  31.84 
 
 		 342 aa  102  6e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0829098  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0342  inner-membrane translocator  34.8 
 
 		 326 aa  102  7e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.770654  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1987  monosaccharide-transporting ATPase  31.84 
 
 		 312 aa  102  1e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.589517  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3600  monosaccharide-transporting ATPase  31.27 
 
 		 345 aa  101  2e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0147335  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4171  Monosaccharide-transporting ATPase  29.88 
 
 		 341 aa  99.8  4e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00275528 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3217  ribose transport system permease protein RbsC  30.48 
 
 		 334 aa  99.8  5e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.961558  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3329  inner-membrane translocator  29.72 
 
 		 345 aa  99.8  5e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5038  inner-membrane translocator  29.72 
 
 		 345 aa  99.8  5e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.893051 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4966  monosaccharide-transporting ATPase  29.72 
 
 		 347 aa  99.4  6e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5246  monosaccharide-transporting ATPase  29.72 
 
 		 345 aa  99.8  6e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.971428 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0582  monosaccharide-transporting ATPase  29.88 
 
 		 338 aa  99.4  7e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000210774  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4446  inner-membrane translocator  29.72 
 
 		 345 aa  99.4  7e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000908606 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1826  inner-membrane translocator  31.09 
 
 		 336 aa  99  8e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0911886  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1613  monosaccharide-transporting ATPase  33.05 
 
 		 330 aa  98.6  1e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1759  ribose ABC transporter permease  33.05 
 
 		 330 aa  98.6  1e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.32812  hitchhiker  0.000062023 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1509  ribose ABC transporter, permease protein  33.05 
 
 		 330 aa  98.6  1e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.424015  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0395  inner-membrane translocator  39.64 
 
 		 315 aa  98.6  1e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.853202  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4722  monosaccharide-transporting ATPase  34.8 
 
 		 335 aa  99  1e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.278194 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1087  inner-membrane translocator  31.25 
 
 		 339 aa  98.6  1e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.10708 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3880  sugar transport system permease  29.57 
 
 		 334 aa  98.2  2e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0490565 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3346  monosaccharide-transporting ATPase  30.85 
 
 		 345 aa  97.8  2e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0869656  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0965  monosaccharide-transporting ATPase  29.57 
 
 		 342 aa  97.8  2e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0886  ABC sugar transporter, inner-membrane subunit  34.8 
 
 		 337 aa  97.8  2e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0350071  normal  0.652921 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5465  monosaccharide-transporting ATPase  34.8 
 
 		 337 aa  97.8  2e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.050328 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3549  inner-membrane translocator  34.8 
 
 		 337 aa  97.8  2e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4818  inner-membrane translocator  34.8 
 
 		 337 aa  97.8  2e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.414014  normal  0.232318 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1337  amino acid or sugar ABC transport system, permease protein  31.27 
 
 		 333 aa  97.8  2e-19  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.485159 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0911  ribose ABC transporter, permease protein  29.57 
 
 		 342 aa  97.8  2e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2299  inner-membrane translocator  32.06 
 
 		 335 aa  97.4  3e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0163581  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4199  inner-membrane translocator  34.4 
 
 		 337 aa  97.1  3e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0690  Monosaccharide-transporting ATPase  33.85 
 
 		 348 aa  96.7  4e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0715844 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3785  monosaccharide-transporting ATPase  34 
 
 		 337 aa  96.3  5e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0107495 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0625  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  30.19 
 
 		 345 aa  96.3  5e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.983884  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3267  inner-membrane translocator  32.17 
 
 		 317 aa  96.3  5e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.322146  normal  0.753894 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12300  monosaccharide ABC transporter membrane protein  31.09 
 
 		 309 aa  95.9  7e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  decreased coverage  0.00275786  normal  0.739873 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0184  inner-membrane translocator  34.36 
 
 		 326 aa  95.1  1e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3234  Monosaccharide-transporting ATPase  34.29 
 
 		 335 aa  95.1  1e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.197254  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1138  inner-membrane translocator  34.73 
 
 		 328 aa  95.1  1e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2214  inner-membrane translocator  33.73 
 
 		 324 aa  94.7  2e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.543943 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2739  inner-membrane translocator  31.72 
 
 		 339 aa  94.4  2e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.86731 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1133  monosaccharide-transporting ATPase  29.71 
 
 		 359 aa  94  3e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000291616  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0712  inner-membrane translocator  30.25 
 
 		 310 aa  93.2  5e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0709957  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3329  inner-membrane translocator  31.73 
 
 		 314 aa  93.2  5e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0539  inner-membrane translocator  32.43 
 
 		 322 aa  92.4  7e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2283  monosaccharide-transporting ATPase  29.96 
 
 		 345 aa  92.8  7e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.303171  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3645  inner-membrane translocator  32.8 
 
 		 327 aa  92.4  8e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0115  ribose ABC transporter, permease protein  30.61 
 
 		 310 aa  92  1e-17  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7025  monosaccharide-transporting ATPase  31.97 
 
 		 335 aa  92  1e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.560665  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0502  monosaccharide-transporting ATPase  33.6 
 
 		 333 aa  91.7  1e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00475125 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0718  inner-membrane translocator  33.08 
 
 		 341 aa  92  1e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.303584  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2116  monosaccharide-transporting ATPase  30.27 
 
 		 340 aa  92  1e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.326273  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0993  ribose ABC transporter, permease protein  33.33 
 
 		 317 aa  91.3  2e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2714  sugar ABC transporter, permease  30.86 
 
 		 338 aa  91.3  2e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.953176  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0935  inner-membrane translocator:glucose/ribitol dehydrogenase  33.33 
 
 		 317 aa  91.3  2e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.840539  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5745  monosaccharide-transporting ATPase  33.46 
 
 		 318 aa  90.9  2e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0361  carbohydrate ABC transporter permease  31.2 
 
 		 310 aa  90.9  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5134  ABC transporter membrane spanning protein (ribose)  33.45 
 
 		 349 aa  91.3  2e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.180892  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2442  ABC transporter permease  29.74 
 
 		 348 aa  91.3  2e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.986757  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3449  inner-membrane translocator  27.92 
 
 		 314 aa  90.9  2e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0456  ribose/xylose/arabinose/galactoside ABC-type transporter permease  31.2 
 
 		 310 aa  90.9  2e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2222  monosaccharide-transporting ATPase  29.29 
 
 		 319 aa  90.9  3e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.294 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2278  inner-membrane translocator  28.67 
 
 		 309 aa  90.5  3e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.568654  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2977  putative ribose ABC transporter, permease protein  30.47 
 
 		 329 aa  90.5  3e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0563  monosaccharide-transporting ATPase  30.59 
 
 		 311 aa  90.5  3e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000352632  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10510  monosaccharide ABC transporter membrane protein  34.65 
 
 		 380 aa  90.9  3e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1652  inner-membrane translocator  35 
 
 		 340 aa  90.1  4e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0718181  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2840  monosaccharide-transporting ATPase  30.42 
 
 		 332 aa  90.1  4e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0736  ribose ABC transporter, permease protein  30.68 
 
 		 311 aa  89.7  5e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0578  ribose ABC transporter, permease  30.68 
 
 		 311 aa  89.7  5e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0535816  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2764  ribose ABC transporter permease  30.47 
 
 		 338 aa  89.4  6e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.340533  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2976  ribose ABC transporter permease  30.47 
 
 		 329 aa  89.7  6e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.355889  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0700  ribose ABC transporter, permease protein  30.68 
 
 		 311 aa  89.7  6e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0973921  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1424  inner-membrane translocator  35.41 
 
 		 345 aa  89.7  6e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4638  ribose ABC transporter, permease protein  30.68 
 
 		 311 aa  89.7  6e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0801722  unclonable  4.6789e-26 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3219  monosaccharide-transporting ATPase  31.4 
 
 		 331 aa  89.4  6e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0102816 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>