More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_1196 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_1196  inner-membrane translocator  100 
 
 		 328 aa  601  1.0000000000000001e-171  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.352827 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2414  ribose ABC transporter (permease)  84.84 
 
 		 337 aa  421  1e-117  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3912  inner-membrane translocator  39.62 
 
 		 315 aa  179  4e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.246881  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1533  inner-membrane translocator  43.71 
 
 		 332 aa  178  1e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.691946  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4646  inner-membrane translocator  38.89 
 
 		 316 aa  175  9.999999999999999e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5735  inner-membrane translocator  39.22 
 
 		 316 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0600842  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5317  inner-membrane translocator  36.93 
 
 		 313 aa  173  2.9999999999999996e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.566323  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2783  inner-membrane translocator  41.75 
 
 		 312 aa  160  4e-38  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.140737  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4053  inner-membrane translocator  41.39 
 
 		 301 aa  155  1e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.732892 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1072  inner-membrane translocator  39.2 
 
 		 317 aa  144  2e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0954589  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5160  inner-membrane translocator  41.33 
 
 		 328 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.201222  normal  0.841137 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0361  carbohydrate ABC transporter permease  42.55 
 
 		 310 aa  120  3e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0456  ribose/xylose/arabinose/galactoside ABC-type transporter permease  42.55 
 
 		 310 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1458  Monosaccharide-transporting ATPase  39 
 
 		 333 aa  119  9e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0717887 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1792  sugar ABC transporter, permease protein  40.47 
 
 		 835 aa  117  3e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0591  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  36.74 
 
 		 347 aa  110  3e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0343543  normal  0.480724 
 
 
-
 
NC_004310  BR1631  ribose ABC transporter, permease protein  35.86 
 
 		 334 aa  109  7.000000000000001e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1575  ribose ABC transporter, permease protein  35.86 
 
 		 334 aa  109  7.000000000000001e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.136542  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2782  inner-membrane translocator  32.53 
 
 		 342 aa  107  2e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2826  inner-membrane translocator  32.53 
 
 		 342 aa  107  2e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.700859  normal  0.0291669 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2809  inner-membrane translocator  32.53 
 
 		 342 aa  107  2e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0829098  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1398  inner-membrane translocator  36.55 
 
 		 334 aa  106  5e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00127371  normal  0.617276 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4066  monosaccharide-transporting ATPase  34.66 
 
 		 334 aa  106  5e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0158179  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22090  inner-membrane translocator  39.75 
 
 		 308 aa  105  7e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1826  inner-membrane translocator  31.54 
 
 		 336 aa  105  1e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0911886  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3346  monosaccharide-transporting ATPase  36.16 
 
 		 345 aa  104  2e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0869656  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0563  monosaccharide-transporting ATPase  32.5 
 
 		 311 aa  105  2e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000352632  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2914  monosaccharide-transporting ATPase  32.75 
 
 		 346 aa  103  3e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.366692  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0582  monosaccharide-transporting ATPase  32.92 
 
 		 311 aa  103  5e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01060  monosaccharide ABC transporter membrane protein  35.18 
 
 		 336 aa  103  6e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0859  ribose ABC transporter, permease protein  32.65 
 
 		 346 aa  102  7e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.479908  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0797  ribose ABC transporter, permease protein  35.48 
 
 		 311 aa  102  9e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000530424  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0579  ribose ABC transporter, permease  32.51 
 
 		 311 aa  102  1e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0736  ribose ABC transporter, permease protein  32.51 
 
 		 311 aa  101  2e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0578  ribose ABC transporter, permease  32.51 
 
 		 311 aa  101  2e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0535816  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0700  ribose ABC transporter, permease protein  32.51 
 
 		 311 aa  101  2e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0973921  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1921  inner-membrane translocator  32.51 
 
 		 354 aa  100  2e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.748893  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4638  ribose ABC transporter, permease protein  32.51 
 
 		 311 aa  101  2e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0801722  unclonable  4.6789e-26 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0725  ribose ABC transporter, permease protein  32.1 
 
 		 311 aa  100  4e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.35469e-35 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0263  inner-membrane translocator  32.97 
 
 		 330 aa  100  4e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5320  inner-membrane translocator  30.82 
 
 		 350 aa  99.8  6e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.306475  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5134  ABC transporter membrane spanning protein (ribose)  34.07 
 
 		 349 aa  99.4  7e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.180892  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0635  ribose ABC transporter permease  31.69 
 
 		 311 aa  99  9e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0668  ribose ABC transporter permease  31.69 
 
 		 311 aa  99  9e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3593  monosaccharide-transporting ATPase  32.79 
 
 		 329 aa  97.8  2e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.225998  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1987  monosaccharide-transporting ATPase  30.16 
 
 		 312 aa  97.4  3e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.589517  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1858  monosaccharide-transporting ATPase  31.56 
 
 		 324 aa  97.4  3e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.413944  hitchhiker  0.0026052 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6344  monosaccharide-transporting ATPase  32.57 
 
 		 343 aa  97.4  3e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0383311  normal  0.17282 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3880  sugar transport system permease  32.08 
 
 		 334 aa  96.7  5e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0490565 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11050  monosaccharide ABC transporter membrane protein  32.85 
 
 		 358 aa  96.7  5e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.543201 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5745  monosaccharide-transporting ATPase  35.61 
 
 		 318 aa  96.7  5e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2513  inner-membrane translocator  33.76 
 
 		 328 aa  96.7  5e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.587124  normal  0.279488 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2570  inner-membrane translocator  36.4 
 
 		 325 aa  96.3  7e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0148  Monosaccharide-transporting ATPase  34.84 
 
 		 332 aa  95.9  8e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0965  monosaccharide-transporting ATPase  31.03 
 
 		 342 aa  95.9  8e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0911  ribose ABC transporter, permease protein  31.03 
 
 		 342 aa  95.9  8e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3329  inner-membrane translocator  31.54 
 
 		 314 aa  95.5  1e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0362  inner-membrane translocator  31.1 
 
 		 383 aa  95.1  1e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2853  inner-membrane translocator  35.07 
 
 		 317 aa  95.5  1e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.654587 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0184  inner-membrane translocator  34.63 
 
 		 326 aa  94.7  2e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3763  L-arabinose transporter permease protein  30.17 
 
 		 316 aa  94.4  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.139254  normal  0.990186 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3217  ribose transport system permease protein RbsC  33.05 
 
 		 334 aa  94  3e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.961558  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2121  Monosaccharide-transporting ATPase  34.47 
 
 		 350 aa  93.6  4e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.83989 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2756  L-arabinose transporter permease protein  31.05 
 
 		 335 aa  93.2  5e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.394625  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1337  amino acid or sugar ABC transport system, permease protein  31.66 
 
 		 333 aa  92.8  7e-18  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.485159 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4115  monosaccharide-transporting ATPase  28.81 
 
 		 318 aa  92.4  8e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3940  inner-membrane translocator  35.86 
 
 		 364 aa  92.4  8e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00743156  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3353  inner-membrane translocator  35.27 
 
 		 319 aa  92  1e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2995  L-arabinose transporter permease protein  30.07 
 
 		 335 aa  92  1e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.397713  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2585  L-arabinose transporter permease protein  30.07 
 
 		 335 aa  92  1e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4738  monosaccharide-transporting ATPase  33.1 
 
 		 334 aa  91.3  2e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.419907  hitchhiker  0.00245002 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0614  inner-membrane translocator  34.68 
 
 		 331 aa  91.3  2e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3234  Monosaccharide-transporting ATPase  33.84 
 
 		 335 aa  90.9  3e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.197254  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5220  L-arabinose transporter permease protein  32.06 
 
 		 341 aa  90.5  3e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2804  inner-membrane translocator  34.51 
 
 		 324 aa  90.9  3e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.500539  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5639  L-arabinose transporter permease protein  32.06 
 
 		 341 aa  90.5  3e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.356357  normal  0.0453459 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6314  monosaccharide-transporting ATPase  33.77 
 
 		 343 aa  90.5  4e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.359966 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2840  monosaccharide-transporting ATPase  31.64 
 
 		 332 aa  90.1  4e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1602  monosaccharide-transporting ATPase  35.34 
 
 		 349 aa  90.1  4e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.195048  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1902  inner-membrane translocator  32.18 
 
 		 319 aa  90.1  4e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0227487  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4590  L-arabinose transporter permease protein  32.06 
 
 		 337 aa  90.5  4e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00280966 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2642  inner-membrane translocator  33.8 
 
 		 348 aa  90.1  5e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.769134  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0922  monosaccharide-transporting ATPase  29.8 
 
 		 309 aa  90.1  5e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3204  inner-membrane translocator  31.86 
 
 		 348 aa  90.1  5e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.0000146759  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1962  monosaccharide-transporting ATPase  30.53 
 
 		 353 aa  90.1  5e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0698409  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1852  ribose ABC transporter, permease protein  30.53 
 
 		 353 aa  90.1  5e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0712  inner-membrane translocator  30.04 
 
 		 310 aa  89.7  6e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0709957  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3689  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  33.91 
 
 		 334 aa  89.7  7e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.138978  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3424  inner-membrane translocator  33.91 
 
 		 334 aa  89.7  7e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.724227  normal  0.790416 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0248  inner-membrane translocator  32.05 
 
 		 338 aa  89.4  8e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5307  ABC transporter membrane spanning protein (ribose)  31.52 
 
 		 334 aa  89.4  9e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.167667  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1400  D-ribose transport system permease protein  34.14 
 
 		 327 aa  89.4  9e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.151364 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4219  L-arabinose transporter permease protein  31.02 
 
 		 338 aa  89  1e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.645331 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10510  monosaccharide ABC transporter membrane protein  35.88 
 
 		 380 aa  88.6  1e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0502  monosaccharide-transporting ATPase  33.33 
 
 		 333 aa  87.8  2e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00475125 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3785  monosaccharide-transporting ATPase  30.53 
 
 		 337 aa  88.2  2e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0107495 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2189  Monosaccharide-transporting ATPase  38.72 
 
 		 325 aa  88.2  2e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0872  Monosaccharide-transporting ATPase  33.65 
 
 		 327 aa  87.8  2e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.320863  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1509  ribose ABC transporter, permease protein  30.2 
 
 		 330 aa  88.2  2e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.424015  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6473  inner-membrane translocator  33.44 
 
 		 343 aa  88.2  2e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.760723  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>