More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_2414 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_2414  ribose ABC transporter (permease)  100 
 
 		 337 aa  615  1e-175  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1196  inner-membrane translocator  84.84 
 
 		 328 aa  424  1e-117  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.352827 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4646  inner-membrane translocator  38.89 
 
 		 316 aa  181  2e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3912  inner-membrane translocator  39.09 
 
 		 315 aa  180  2.9999999999999997e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.246881  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1533  inner-membrane translocator  44.77 
 
 		 332 aa  178  1e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.691946  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5317  inner-membrane translocator  37.74 
 
 		 313 aa  177  3e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.566323  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5735  inner-membrane translocator  38.59 
 
 		 316 aa  176  7e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0600842  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4053  inner-membrane translocator  41.39 
 
 		 301 aa  166  5.9999999999999996e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.732892 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2783  inner-membrane translocator  41.37 
 
 		 312 aa  157  2e-37  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.140737  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5160  inner-membrane translocator  42.57 
 
 		 328 aa  149  6e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.201222  normal  0.841137 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1072  inner-membrane translocator  36.91 
 
 		 317 aa  142  9e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0954589  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0591  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  37.59 
 
 		 347 aa  116  5e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0343543  normal  0.480724 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0361  carbohydrate ABC transporter permease  39.18 
 
 		 310 aa  109  7.000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0456  ribose/xylose/arabinose/galactoside ABC-type transporter permease  39.18 
 
 		 310 aa  108  1e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1792  sugar ABC transporter, permease protein  39.69 
 
 		 835 aa  106  7e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1458  Monosaccharide-transporting ATPase  37.34 
 
 		 333 aa  102  7e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0717887 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11050  monosaccharide ABC transporter membrane protein  31.91 
 
 		 358 aa  100  3e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.543201 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1921  inner-membrane translocator  32.23 
 
 		 354 aa  100  5e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.748893  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0736  ribose ABC transporter, permease protein  34.16 
 
 		 311 aa  97.8  2e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0579  ribose ABC transporter, permease  34.16 
 
 		 311 aa  98.2  2e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0578  ribose ABC transporter, permease  34.16 
 
 		 311 aa  97.8  2e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0535816  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0797  ribose ABC transporter, permease protein  34.16 
 
 		 311 aa  98.2  2e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000530424  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0563  monosaccharide-transporting ATPase  35.22 
 
 		 311 aa  97.8  2e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000352632  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4638  ribose ABC transporter, permease protein  34.16 
 
 		 311 aa  97.8  3e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0801722  unclonable  4.6789e-26 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0700  ribose ABC transporter, permease protein  34.16 
 
 		 311 aa  97.8  3e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0973921  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1987  monosaccharide-transporting ATPase  30.71 
 
 		 312 aa  97.1  4e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.589517  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1398  inner-membrane translocator  34.65 
 
 		 334 aa  96.7  5e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00127371  normal  0.617276 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0725  ribose ABC transporter, permease protein  33.74 
 
 		 311 aa  96.7  5e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.35469e-35 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0582  monosaccharide-transporting ATPase  35.63 
 
 		 311 aa  96.7  6e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3346  monosaccharide-transporting ATPase  37.12 
 
 		 345 aa  96.3  7e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0869656  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0635  ribose ABC transporter permease  33.33 
 
 		 311 aa  95.9  1e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0668  ribose ABC transporter permease  33.33 
 
 		 311 aa  95.9  1e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2809  inner-membrane translocator  34 
 
 		 342 aa  95.1  1e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0829098  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2782  inner-membrane translocator  34 
 
 		 342 aa  95.1  1e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2826  inner-membrane translocator  34 
 
 		 342 aa  95.1  1e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.700859  normal  0.0291669 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0263  inner-membrane translocator  29.96 
 
 		 330 aa  92.8  7e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0859  ribose ABC transporter, permease protein  33.45 
 
 		 346 aa  91.3  2e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.479908  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2853  inner-membrane translocator  33.18 
 
 		 317 aa  91.3  2e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.654587 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5134  ABC transporter membrane spanning protein (ribose)  34.72 
 
 		 349 aa  91.7  2e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.180892  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1509  ribose ABC transporter, permease protein  30.92 
 
 		 330 aa  91.7  2e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.424015  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4366  Monosaccharide-transporting ATPase  35.42 
 
 		 323 aa  91.7  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.168159  normal  0.0421878 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1613  monosaccharide-transporting ATPase  30.92 
 
 		 330 aa  91.7  2e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1826  inner-membrane translocator  30.8 
 
 		 336 aa  91.7  2e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0911886  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2914  monosaccharide-transporting ATPase  33.45 
 
 		 346 aa  91.7  2e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.366692  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1759  ribose ABC transporter permease  30.92 
 
 		 330 aa  91.7  2e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.32812  hitchhiker  0.000062023 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10510  monosaccharide ABC transporter membrane protein  34.14 
 
 		 380 aa  90.5  4e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1631  ribose ABC transporter, permease protein  32.41 
 
 		 334 aa  89.7  6e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1575  ribose ABC transporter, permease protein  32.41 
 
 		 334 aa  89.7  6e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.136542  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22090  inner-membrane translocator  36.99 
 
 		 308 aa  89.7  7e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5320  inner-membrane translocator  32.08 
 
 		 350 aa  88.6  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.306475  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4738  monosaccharide-transporting ATPase  32.74 
 
 		 334 aa  89  1e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.419907  hitchhiker  0.00245002 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4066  monosaccharide-transporting ATPase  32.41 
 
 		 334 aa  88.6  2e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0158179  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3217  ribose transport system permease protein RbsC  31.27 
 
 		 334 aa  88.2  2e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.961558  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3940  inner-membrane translocator  35.77 
 
 		 364 aa  88.2  2e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00743156  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5341  ABC transporter membrane spanning protein (ribose)  33.45 
 
 		 348 aa  88.6  2e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1962  monosaccharide-transporting ATPase  32.99 
 
 		 353 aa  87.4  3e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0698409  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1852  ribose ABC transporter, permease protein  32.99 
 
 		 353 aa  87.4  3e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0362  inner-membrane translocator  30.82 
 
 		 383 aa  87  4e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2570  inner-membrane translocator  36.02 
 
 		 325 aa  85.5  0.000000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1858  monosaccharide-transporting ATPase  30.14 
 
 		 324 aa  85.5  0.000000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.413944  hitchhiker  0.0026052 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2883  inner-membrane translocator  32.2 
 
 		 348 aa  84.7  0.000000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.797919 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3234  Monosaccharide-transporting ATPase  32.58 
 
 		 335 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.197254  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2840  monosaccharide-transporting ATPase  33.59 
 
 		 332 aa  84.7  0.000000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6344  monosaccharide-transporting ATPase  33.82 
 
 		 343 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0383311  normal  0.17282 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3353  inner-membrane translocator  34.06 
 
 		 319 aa  84.3  0.000000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01060  monosaccharide ABC transporter membrane protein  35.14 
 
 		 336 aa  84  0.000000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0342  inner-membrane translocator  33.73 
 
 		 326 aa  84.3  0.000000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.770654  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0502  monosaccharide-transporting ATPase  34.63 
 
 		 333 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00475125 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4115  monosaccharide-transporting ATPase  28.37 
 
 		 318 aa  84  0.000000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0712  inner-membrane translocator  29.08 
 
 		 310 aa  84  0.000000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0709957  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2121  Monosaccharide-transporting ATPase  33.59 
 
 		 350 aa  83.2  0.000000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.83989 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6097  ABC transporter membrane spanning protein (sugar)  30.96 
 
 		 335 aa  83.2  0.000000000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2807  inner-membrane translocator  33.05 
 
 		 338 aa  83.2  0.000000000000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0922  monosaccharide-transporting ATPase  28.91 
 
 		 309 aa  83.2  0.000000000000007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2432  putative binding-protein-dependent transport system permease  31.07 
 
 		 327 aa  82.8  0.000000000000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4219  L-arabinose transporter permease protein  31.37 
 
 		 338 aa  82.8  0.000000000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.645331 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0886  ABC sugar transporter, inner-membrane subunit  33.6 
 
 		 337 aa  82.4  0.000000000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0350071  normal  0.652921 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3549  inner-membrane translocator  33.6 
 
 		 337 aa  82.4  0.000000000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4818  inner-membrane translocator  33.6 
 
 		 337 aa  82.4  0.000000000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.414014  normal  0.232318 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5465  monosaccharide-transporting ATPase  33.6 
 
 		 337 aa  82.4  0.000000000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.050328 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1138  inner-membrane translocator  31.18 
 
 		 328 aa  82  0.00000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0148  Monosaccharide-transporting ATPase  32.16 
 
 		 332 aa  82  0.00000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1402  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  31.5 
 
 		 348 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0354839  normal  0.170843 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2804  inner-membrane translocator  30.37 
 
 		 324 aa  82  0.00000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.500539  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2400  Monosaccharide-transporting ATPase  32.97 
 
 		 334 aa  82.4  0.00000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5745  monosaccharide-transporting ATPase  34.72 
 
 		 318 aa  82  0.00000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1352  Monosaccharide-transporting ATPase  32.66 
 
 		 345 aa  81.6  0.00000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.884414  normal  0.25944 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0248  inner-membrane translocator  30.94 
 
 		 338 aa  81.6  0.00000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0614  inner-membrane translocator  31.97 
 
 		 331 aa  81.3  0.00000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3785  monosaccharide-transporting ATPase  32.67 
 
 		 337 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0107495 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3727  Monosaccharide-transporting ATPase  31.88 
 
 		 356 aa  81.3  0.00000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.587944  normal  0.0169743 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4199  inner-membrane translocator  33.2 
 
 		 337 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4722  monosaccharide-transporting ATPase  33.2 
 
 		 335 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.278194 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3568  monosaccharide-transporting ATPase  32.6 
 
 		 332 aa  81.3  0.00000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0115  ribose ABC transporter, permease protein  30.83 
 
 		 310 aa  81.3  0.00000000000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2714  sugar ABC transporter, permease  29.46 
 
 		 338 aa  80.9  0.00000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.953176  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2694  sugar ABC transporter, permease  29.46 
 
 		 338 aa  80.9  0.00000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.273875  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1271  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  31.66 
 
 		 342 aa  80.9  0.00000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.123363 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2108  inner-membrane translocator  31.35 
 
 		 354 aa  80.9  0.00000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000443727  normal  0.121569 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0077  inner-membrane translocator  31.72 
 
 		 331 aa  80.9  0.00000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>