More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_3940 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013739  Cwoe_3940  inner-membrane translocator  100 
 
 		 364 aa  682    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00743156  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2981  inner-membrane translocator  37.36 
 
 		 328 aa  151  2e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0921483  normal  0.0941351 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3912  inner-membrane translocator  32.78 
 
 		 315 aa  139  7e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.246881  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4646  inner-membrane translocator  34.77 
 
 		 316 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11050  monosaccharide ABC transporter membrane protein  33.12 
 
 		 358 aa  136  7.000000000000001e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.543201 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5735  inner-membrane translocator  36.29 
 
 		 316 aa  134  3e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0600842  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0362  inner-membrane translocator  31.14 
 
 		 383 aa  131  2.0000000000000002e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2883  inner-membrane translocator  33.33 
 
 		 348 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.797919 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0591  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  32.62 
 
 		 347 aa  130  3e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0343543  normal  0.480724 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2782  inner-membrane translocator  36.3 
 
 		 342 aa  130  3e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2826  inner-membrane translocator  36.3 
 
 		 342 aa  130  3e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.700859  normal  0.0291669 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2809  inner-membrane translocator  36.3 
 
 		 342 aa  130  3e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0829098  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1458  Monosaccharide-transporting ATPase  36.46 
 
 		 333 aa  130  4.0000000000000003e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0717887 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2914  monosaccharide-transporting ATPase  31.39 
 
 		 346 aa  129  1.0000000000000001e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.366692  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4115  monosaccharide-transporting ATPase  33.88 
 
 		 318 aa  127  4.0000000000000003e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0859  ribose ABC transporter, permease protein  31.6 
 
 		 346 aa  126  5e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.479908  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1826  inner-membrane translocator  33.33 
 
 		 336 aa  125  8.000000000000001e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0911886  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3727  Monosaccharide-transporting ATPase  35.62 
 
 		 356 aa  125  9e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.587944  normal  0.0169743 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1962  monosaccharide-transporting ATPase  31.43 
 
 		 353 aa  125  1e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0698409  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5317  inner-membrane translocator  33.59 
 
 		 313 aa  125  1e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.566323  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0263  inner-membrane translocator  34.1 
 
 		 330 aa  124  2e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2592  monosaccharide-transporting ATPase  35.9 
 
 		 316 aa  124  2e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1852  ribose ABC transporter, permease protein  31.14 
 
 		 353 aa  124  3e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3449  inner-membrane translocator  30.23 
 
 		 314 aa  123  5e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2075  inner-membrane translocator  35.78 
 
 		 405 aa  123  5e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.716718  hitchhiker  0.0000028911 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1988  inner-membrane translocator  35.37 
 
 		 405 aa  122  9e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0171978 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5320  inner-membrane translocator  31.21 
 
 		 350 aa  122  9e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.306475  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1986  inner-membrane translocator  36.12 
 
 		 405 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.422562  hitchhiker  0.000308121 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2746  inner-membrane translocator  37.01 
 
 		 317 aa  121  1.9999999999999998e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.470444  normal  0.775986 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10510  monosaccharide ABC transporter membrane protein  33.83 
 
 		 380 aa  121  1.9999999999999998e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2057  inner-membrane translocator  34.19 
 
 		 372 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1352  Monosaccharide-transporting ATPase  32.65 
 
 		 345 aa  120  3.9999999999999996e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.884414  normal  0.25944 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0184  inner-membrane translocator  36.03 
 
 		 326 aa  119  7.999999999999999e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0288  inner-membrane translocator  31.82 
 
 		 331 aa  118  1.9999999999999998e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.247958 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2807  inner-membrane translocator  33.94 
 
 		 338 aa  117  3.9999999999999997e-25  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3329  inner-membrane translocator  32.15 
 
 		 314 aa  117  5e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3850  inner-membrane translocator  32.57 
 
 		 388 aa  116  7.999999999999999e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.530581  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0290  monosaccharide-transporting ATPase  31.72 
 
 		 331 aa  115  1.0000000000000001e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0993  ribose ABC transporter, permease protein  34.18 
 
 		 317 aa  115  2.0000000000000002e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0935  inner-membrane translocator:glucose/ribitol dehydrogenase  34.18 
 
 		 317 aa  115  2.0000000000000002e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.840539  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0052  ABC transporter, permease, sugar transport  32.47 
 
 		 332 aa  115  2.0000000000000002e-24  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0182601  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1965  inner-membrane translocator  31.68 
 
 		 341 aa  115  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.389843  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6207  inner-membrane translocator  31.68 
 
 		 341 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.729739 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4601  Monosaccharide-transporting ATPase  30.23 
 
 		 341 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.841849 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3593  monosaccharide-transporting ATPase  30.65 
 
 		 329 aa  114  3e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.225998  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2513  inner-membrane translocator  33.33 
 
 		 328 aa  114  3e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.587124  normal  0.279488 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1533  inner-membrane translocator  34.52 
 
 		 332 aa  114  3e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.691946  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1400  D-ribose transport system permease protein  35.09 
 
 		 327 aa  114  3e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.151364 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1914  inner-membrane translocator  31.56 
 
 		 328 aa  113  5e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1062  inner-membrane translocator  32.97 
 
 		 345 aa  113  6e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.379015  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1542  inner-membrane translocator  32.97 
 
 		 345 aa  113  6e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1518  monosaccharide-transporting ATPase  32.97 
 
 		 345 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0853941  normal  0.0193721 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4682  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  32.97 
 
 		 345 aa  112  8.000000000000001e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.377068  normal  0.145685 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8258  ribose ABC transporter (permease)  35.22 
 
 		 374 aa  112  8.000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.869375  decreased coverage  0.00803915 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4475  inner membrane ABC transporter permease YdeZ  32.85 
 
 		 332 aa  112  9e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4405  inner membrane ABC transporter permease protein YdeZ  32.85 
 
 		 332 aa  112  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4407  inner membrane ABC transporter permease YdeZ  32.85 
 
 		 332 aa  112  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1652  inner-membrane translocator  31.52 
 
 		 340 aa  112  1.0000000000000001e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0718181  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1792  sugar ABC transporter, permease protein  32.44 
 
 		 835 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1987  monosaccharide-transporting ATPase  30 
 
 		 312 aa  112  1.0000000000000001e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.589517  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5341  ABC transporter membrane spanning protein (ribose)  32.83 
 
 		 348 aa  112  1.0000000000000001e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4322  inner membrane ABC transporter permease protein YdeZ  32.85 
 
 		 332 aa  112  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0539  inner-membrane translocator  32.39 
 
 		 322 aa  112  1.0000000000000001e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0412  Monosaccharide-transporting ATPase  29.15 
 
 		 328 aa  111  2.0000000000000002e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00266655  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1424  inner-membrane translocator  33.33 
 
 		 345 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1464  monosaccharide-transporting ATPase  33.33 
 
 		 345 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.987014  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4292  inner membrane ABC transporter permease YdeZ  32.48 
 
 		 332 aa  111  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3707  inner-membrane translocator  30.97 
 
 		 335 aa  110  3e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.480101  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12300  monosaccharide ABC transporter membrane protein  33.58 
 
 		 309 aa  110  3e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  decreased coverage  0.00275786  normal  0.739873 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1613  monosaccharide-transporting ATPase  30.79 
 
 		 330 aa  110  4.0000000000000004e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2714  sugar ABC transporter, permease  30.91 
 
 		 338 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.953176  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1509  ribose ABC transporter, permease protein  30.79 
 
 		 330 aa  110  4.0000000000000004e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.424015  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1759  ribose ABC transporter permease  30.79 
 
 		 330 aa  110  4.0000000000000004e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.32812  hitchhiker  0.000062023 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3217  ribose transport system permease protein RbsC  29.86 
 
 		 334 aa  110  5e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.961558  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0592  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  36.21 
 
 		 336 aa  110  5e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.242667  normal  0.208776 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2764  ribose ABC transporter permease  30.91 
 
 		 338 aa  110  6e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.340533  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3092  inner-membrane translocator  33.96 
 
 		 325 aa  109  6e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.281303  normal  0.348975 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2149  Monosaccharide-transporting ATPase  33.22 
 
 		 372 aa  109  8.000000000000001e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.257212  normal  0.232458 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2400  Monosaccharide-transporting ATPase  32.51 
 
 		 334 aa  109  9.000000000000001e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2694  sugar ABC transporter, permease  30.91 
 
 		 338 aa  108  1e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.273875  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1273  inner-membrane translocator  34.36 
 
 		 308 aa  108  1e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.485087  normal  0.949472 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3765  inner-membrane translocator  34.01 
 
 		 306 aa  107  2e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00344833  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2712  inner-membrane translocator  29.54 
 
 		 362 aa  108  2e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.216754 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1642  Monosaccharide-transporting ATPase  29.63 
 
 		 317 aa  107  2e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000000622557  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2265  putative ribose ABC transporter, permease protein  30.16 
 
 		 329 aa  107  3e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0836743 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3557  inner-membrane translocator  31.56 
 
 		 329 aa  107  3e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.373061  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2976  ribose ABC transporter permease  31.17 
 
 		 329 aa  107  3e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.355889  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4580  Monosaccharide-transporting ATPase  30.62 
 
 		 328 aa  107  3e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000124272  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0893  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  30.15 
 
 		 328 aa  107  3e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2977  putative ribose ABC transporter, permease protein  31.27 
 
 		 329 aa  107  3e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4849  inner-membrane translocator  30.79 
 
 		 325 aa  107  3e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.361402  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0886  ABC sugar transporter, inner-membrane subunit  31.68 
 
 		 337 aa  107  4e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0350071  normal  0.652921 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3549  inner-membrane translocator  31.68 
 
 		 337 aa  107  4e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4818  inner-membrane translocator  31.68 
 
 		 337 aa  107  4e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.414014  normal  0.232318 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5465  monosaccharide-transporting ATPase  31.68 
 
 		 337 aa  107  4e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.050328 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1375  inner-membrane translocator  33.87 
 
 		 336 aa  106  5e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.711145 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0477  putative sugar ABC transporter permease  35.25 
 
 		 339 aa  107  5e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.844394  normal  0.0733402 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0149  putative sugar ABC transporter, permease protein  35.25 
 
 		 332 aa  106  6e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.356378  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3089  inner-membrane translocator  28.35 
 
 		 337 aa  106  6e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0871348  normal  0.381344 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4066  monosaccharide-transporting ATPase  35.25 
 
 		 332 aa  106  6e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>