More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B0592 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007952  Bxe_B0592  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  100 
 
 		 336 aa  647    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.242667  normal  0.208776 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2593  inner-membrane translocator  40.07 
 
 		 332 aa  157  3e-37  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0456  ribose/xylose/arabinose/galactoside ABC-type transporter permease  36.45 
 
 		 310 aa  142  7e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0361  carbohydrate ABC transporter permease  36.45 
 
 		 310 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0736  ribose ABC transporter, permease protein  35.49 
 
 		 311 aa  140  3.9999999999999997e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0578  ribose ABC transporter, permease  35.49 
 
 		 311 aa  140  3.9999999999999997e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0535816  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0579  ribose ABC transporter, permease  35.49 
 
 		 311 aa  139  4.999999999999999e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0725  ribose ABC transporter, permease protein  35.15 
 
 		 311 aa  139  7.999999999999999e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.35469e-35 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0797  ribose ABC transporter, permease protein  35.15 
 
 		 311 aa  139  8.999999999999999e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000530424  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4638  ribose ABC transporter, permease protein  35.15 
 
 		 311 aa  139  1e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0801722  unclonable  4.6789e-26 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0700  ribose ABC transporter, permease protein  35.15 
 
 		 311 aa  139  1e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0973921  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0582  monosaccharide-transporting ATPase  35.15 
 
 		 311 aa  137  2e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0635  ribose ABC transporter permease  34.81 
 
 		 311 aa  137  2e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0668  ribose ABC transporter permease  34.81 
 
 		 311 aa  137  2e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1792  sugar ABC transporter, permease protein  36.3 
 
 		 835 aa  136  5e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0396  inner-membrane translocator  40.29 
 
 		 329 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.883346  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1478  inner-membrane translocator  34.63 
 
 		 322 aa  134  1.9999999999999998e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0563  monosaccharide-transporting ATPase  34.92 
 
 		 311 aa  134  3e-30  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000352632  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2745  inner-membrane translocator  41.48 
 
 		 335 aa  133  3.9999999999999996e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.80645 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0184  inner-membrane translocator  35.89 
 
 		 326 aa  130  2.0000000000000002e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2513  inner-membrane translocator  36.99 
 
 		 328 aa  130  3e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.587124  normal  0.279488 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1826  inner-membrane translocator  34.97 
 
 		 336 aa  130  3e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0911886  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0342  ribose ABC transporter permease protein  33.43 
 
 		 324 aa  130  4.0000000000000003e-29  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4526  ribose ABC transporter permease protein  33.96 
 
 		 322 aa  129  5.0000000000000004e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000584894  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3092  inner-membrane translocator  35.31 
 
 		 325 aa  128  1.0000000000000001e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.281303  normal  0.348975 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5320  inner-membrane translocator  35.62 
 
 		 350 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.306475  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12300  monosaccharide ABC transporter membrane protein  36.97 
 
 		 309 aa  127  2.0000000000000002e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  decreased coverage  0.00275786  normal  0.739873 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0275  inner-membrane translocator  34.48 
 
 		 323 aa  127  2.0000000000000002e-28  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0362  inner-membrane translocator  34.21 
 
 		 383 aa  127  2.0000000000000002e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0115  ribose ABC transporter, permease protein  34.59 
 
 		 310 aa  127  3e-28  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4236  ribose ABC transporter permease protein  36.49 
 
 		 322 aa  127  3e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.000913636  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4348  inner-membrane translocator  36.1 
 
 		 348 aa  126  4.0000000000000003e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3329  inner-membrane translocator  34.46 
 
 		 314 aa  126  5e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3234  Monosaccharide-transporting ATPase  34.81 
 
 		 335 aa  125  8.000000000000001e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.197254  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1987  monosaccharide-transporting ATPase  33.91 
 
 		 312 aa  125  9e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.589517  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1458  Monosaccharide-transporting ATPase  35.35 
 
 		 333 aa  125  1e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0717887 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1370  ribose ABC transporter permease protein  36.53 
 
 		 323 aa  125  1e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.512196  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2278  inner-membrane translocator  37.02 
 
 		 309 aa  124  3e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.568654  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1881  ribose ABC transporter, permease protein  30.72 
 
 		 311 aa  124  3e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0277317  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2222  monosaccharide-transporting ATPase  36.08 
 
 		 319 aa  124  3e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.294 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3593  monosaccharide-transporting ATPase  34.43 
 
 		 329 aa  123  5e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.225998  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0539  inner-membrane translocator  36.81 
 
 		 322 aa  123  5e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1509  ribose ABC transporter, permease protein  30.94 
 
 		 330 aa  122  6e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.424015  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1759  ribose ABC transporter permease  30.94 
 
 		 330 aa  122  6e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.32812  hitchhiker  0.000062023 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1613  monosaccharide-transporting ATPase  30.94 
 
 		 330 aa  122  6e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0994  ribose ABC transporter, permease protein  32.57 
 
 		 319 aa  122  9e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3976  ribose ABC transporter permease protein  36.27 
 
 		 322 aa  122  9e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.144441  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6089  inner-membrane translocator  34.04 
 
 		 334 aa  121  9.999999999999999e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.761591  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0502  monosaccharide-transporting ATPase  33.56 
 
 		 333 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00475125 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3336  inner-membrane translocator  33.11 
 
 		 346 aa  121  1.9999999999999998e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2782  inner-membrane translocator  32.89 
 
 		 342 aa  120  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2826  inner-membrane translocator  32.89 
 
 		 342 aa  120  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.700859  normal  0.0291669 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2809  inner-membrane translocator  32.89 
 
 		 342 aa  120  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0829098  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1793  monosaccharide-transporting ATPase  34.24 
 
 		 306 aa  120  3e-26  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.115366  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1575  ribose ABC transporter, permease protein  31.46 
 
 		 334 aa  120  3e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.136542  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1631  ribose ABC transporter, permease protein  31.46 
 
 		 334 aa  120  3e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1139  monosaccharide-transporting ATPase  33.69 
 
 		 334 aa  120  3.9999999999999996e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2914  monosaccharide-transporting ATPase  36.76 
 
 		 346 aa  119  7e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.366692  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1852  ribose ABC transporter, permease protein  31.31 
 
 		 353 aa  117  1.9999999999999998e-25  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4216  ribose ABC transporter permease protein  36.86 
 
 		 321 aa  118  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.064291  normal  0.774246 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0859  ribose ABC transporter, permease protein  36.4 
 
 		 346 aa  117  1.9999999999999998e-25  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.479908  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4173  ribose ABC transporter permease protein  35.84 
 
 		 322 aa  117  1.9999999999999998e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00211847  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1962  monosaccharide-transporting ATPase  31.31 
 
 		 353 aa  118  1.9999999999999998e-25  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0698409  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0290  monosaccharide-transporting ATPase  33.12 
 
 		 331 aa  118  1.9999999999999998e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4275  ribose ABC transporter permease protein  36.86 
 
 		 321 aa  118  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3204  inner-membrane translocator  37.02 
 
 		 348 aa  118  1.9999999999999998e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.0000146759  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2981  inner-membrane translocator  35.94 
 
 		 328 aa  118  1.9999999999999998e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0921483  normal  0.0941351 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4066  monosaccharide-transporting ATPase  31.46 
 
 		 334 aa  118  1.9999999999999998e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0158179  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3785  monosaccharide-transporting ATPase  34.55 
 
 		 337 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0107495 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0911  ribose ABC transporter, permease protein  34.7 
 
 		 342 aa  118  1.9999999999999998e-25  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4095  ribose ABC transporter permease protein  36.86 
 
 		 321 aa  118  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0965  monosaccharide-transporting ATPase  34.7 
 
 		 342 aa  118  1.9999999999999998e-25  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3880  sugar transport system permease  34.7 
 
 		 334 aa  117  1.9999999999999998e-25  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0490565 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4166  ribose ABC transporter permease protein  36.86 
 
 		 321 aa  118  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4110  ribose ABC transporter permease protein  36.86 
 
 		 321 aa  118  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.401971  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0893  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  35.79 
 
 		 328 aa  117  3e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4607  Monosaccharide-transporting ATPase  31.66 
 
 		 348 aa  117  3.9999999999999997e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0264  inner-membrane translocator  32.53 
 
 		 328 aa  117  3.9999999999999997e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4199  inner-membrane translocator  34.22 
 
 		 337 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5465  monosaccharide-transporting ATPase  35.31 
 
 		 337 aa  116  6e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.050328 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0774  inner-membrane translocator  33.65 
 
 		 339 aa  116  6e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0308372 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0886  ABC sugar transporter, inner-membrane subunit  35.31 
 
 		 337 aa  116  6e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0350071  normal  0.652921 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3549  inner-membrane translocator  35.31 
 
 		 337 aa  116  6e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4818  inner-membrane translocator  35.31 
 
 		 337 aa  116  6e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.414014  normal  0.232318 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01060  monosaccharide ABC transporter membrane protein  34.98 
 
 		 336 aa  115  6.9999999999999995e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3424  inner-membrane translocator  30.91 
 
 		 334 aa  115  6.9999999999999995e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.724227  normal  0.790416 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3689  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  30.91 
 
 		 334 aa  115  7.999999999999999e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.138978  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4722  monosaccharide-transporting ATPase  34.98 
 
 		 335 aa  115  7.999999999999999e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.278194 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4899  ribose ABC transporter permease protein  35.31 
 
 		 321 aa  115  8.999999999999998e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0818131  hitchhiker  0.000000774907 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1030  monosaccharide-transporting ATPase  33.33 
 
 		 341 aa  115  8.999999999999998e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.608545 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3353  inner-membrane translocator  35.99 
 
 		 319 aa  115  8.999999999999998e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0263  inner-membrane translocator  34.56 
 
 		 330 aa  115  8.999999999999998e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6712  inner-membrane translocator  33.02 
 
 		 333 aa  115  8.999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.769833 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3523  inner-membrane translocator  30.82 
 
 		 355 aa  115  1.0000000000000001e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4580  Monosaccharide-transporting ATPase  35.79 
 
 		 328 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000124272  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3089  inner-membrane translocator  33.67 
 
 		 337 aa  115  1.0000000000000001e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0871348  normal  0.381344 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2668  monosaccharide-transporting ATPase  34.17 
 
 		 322 aa  115  1.0000000000000001e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.86374  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0712  inner-membrane translocator  34.5 
 
 		 310 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0709957  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0516  ribose ABC transporter permease protein  34.06 
 
 		 324 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4114  ribose ABC transporter permease protein  35.84 
 
 		 321 aa  115  2.0000000000000002e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.32727  normal  0.0391743 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>