More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_1139 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009484  Acry_1139  monosaccharide-transporting ATPase  100 
 
 		 334 aa  633  1e-180  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2593  inner-membrane translocator  40.98 
 
 		 332 aa  186  5e-46  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2668  monosaccharide-transporting ATPase  42.52 
 
 		 322 aa  179  7e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.86374  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3056  monosaccharide-transporting ATPase  38.51 
 
 		 322 aa  172  5e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000872387  hitchhiker  0.00658118 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0264  inner-membrane translocator  37.1 
 
 		 328 aa  157  3e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0994  ribose ABC transporter, permease protein  41.04 
 
 		 319 aa  155  1e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6382  inner-membrane translocator  41.22 
 
 		 320 aa  154  2e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.079038 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0275  inner-membrane translocator  35.27 
 
 		 323 aa  151  2e-35  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2914  monosaccharide-transporting ATPase  32.46 
 
 		 346 aa  149  6e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.366692  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2523  inner-membrane translocator  35.1 
 
 		 313 aa  149  8e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5320  inner-membrane translocator  31.83 
 
 		 350 aa  149  9e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.306475  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4114  monosaccharide-transporting ATPase  36.89 
 
 		 330 aa  149  9e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0115  ribose ABC transporter, permease protein  34.62 
 
 		 310 aa  145  7.0000000000000006e-34  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12300  monosaccharide ABC transporter membrane protein  35.74 
 
 		 309 aa  145  7.0000000000000006e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  decreased coverage  0.00275786  normal  0.739873 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0859  ribose ABC transporter, permease protein  31.59 
 
 		 346 aa  144  1e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.479908  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2883  inner-membrane translocator  37.32 
 
 		 348 aa  144  2e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.797919 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0396  inner-membrane translocator  42.58 
 
 		 329 aa  144  3e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.883346  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1962  monosaccharide-transporting ATPase  33.73 
 
 		 353 aa  144  3e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0698409  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2278  inner-membrane translocator  37.36 
 
 		 309 aa  142  6e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.568654  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1852  ribose ABC transporter, permease protein  33.43 
 
 		 353 aa  142  7e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0362  inner-membrane translocator  31.12 
 
 		 383 aa  141  1.9999999999999998e-32  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0155  inner-membrane translocator  33.43 
 
 		 324 aa  140  3e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00293955  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0149  Monosaccharide-transporting ATPase  33.44 
 
 		 324 aa  140  3.9999999999999997e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.259249  normal  0.0554207 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2448  inner-membrane translocator  32.35 
 
 		 327 aa  140  3.9999999999999997e-32  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0992718  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1460  inner-membrane translocator  34.42 
 
 		 373 aa  137  2e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.3149 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1400  D-ribose transport system permease protein  35.25 
 
 		 327 aa  137  2e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.151364 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1642  Monosaccharide-transporting ATPase  31.8 
 
 		 317 aa  137  2e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000000622557  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0922  monosaccharide-transporting ATPase  31.87 
 
 		 309 aa  137  2e-31  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1602  monosaccharide-transporting ATPase  35.66 
 
 		 315 aa  137  3.0000000000000003e-31  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7366  ABC transporter membrane spanning protein (ribose)  34.21 
 
 		 325 aa  137  3.0000000000000003e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01060  monosaccharide ABC transporter membrane protein  34.64 
 
 		 336 aa  136  5e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0563  monosaccharide-transporting ATPase  34.1 
 
 		 311 aa  136  5e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000352632  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1793  monosaccharide-transporting ATPase  34.81 
 
 		 306 aa  135  9.999999999999999e-31  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.115366  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0736  ribose ABC transporter, permease protein  33.99 
 
 		 311 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0578  ribose ABC transporter, permease  33.99 
 
 		 311 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0535816  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0797  ribose ABC transporter, permease protein  33.99 
 
 		 311 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000530424  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2400  Monosaccharide-transporting ATPase  36.4 
 
 		 334 aa  134  1.9999999999999998e-30  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0579  ribose ABC transporter, permease  33.99 
 
 		 311 aa  134  3e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0835  monosaccharide-transporting ATPase  32.89 
 
 		 317 aa  133  3e-30  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0582  monosaccharide-transporting ATPase  33.66 
 
 		 311 aa  134  3e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1458  Monosaccharide-transporting ATPase  31.31 
 
 		 333 aa  134  3e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0717887 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0812  monosaccharide-transporting ATPase  32.89 
 
 		 317 aa  133  3e-30  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.213991  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0592  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  35.2 
 
 		 336 aa  133  5e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.242667  normal  0.208776 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0725  ribose ABC transporter, permease protein  33.66 
 
 		 311 aa  132  6e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.35469e-35 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4638  ribose ABC transporter, permease protein  33.66 
 
 		 311 aa  132  6.999999999999999e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0801722  unclonable  4.6789e-26 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0700  ribose ABC transporter, permease protein  33.66 
 
 		 311 aa  132  6.999999999999999e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0973921  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0635  ribose ABC transporter permease  33.66 
 
 		 311 aa  132  7.999999999999999e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0668  ribose ABC transporter permease  33.66 
 
 		 311 aa  132  7.999999999999999e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1881  ribose ABC transporter, permease protein  27.3 
 
 		 311 aa  132  7.999999999999999e-30  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0277317  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3976  ribose ABC transporter permease protein  30.19 
 
 		 322 aa  132  7.999999999999999e-30  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.144441  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1613  monosaccharide-transporting ATPase  33.86 
 
 		 330 aa  132  9e-30  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1759  ribose ABC transporter permease  33.86 
 
 		 330 aa  132  9e-30  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.32812  hitchhiker  0.000062023 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1509  ribose ABC transporter, permease protein  33.86 
 
 		 330 aa  132  9e-30  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.424015  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2745  inner-membrane translocator  36.2 
 
 		 335 aa  132  1.0000000000000001e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.80645 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1370  ribose ABC transporter permease protein  34.98 
 
 		 323 aa  132  1.0000000000000001e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.512196  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11050  monosaccharide ABC transporter membrane protein  33.94 
 
 		 358 aa  131  2.0000000000000002e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.543201 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4645  inner-membrane translocator  35.14 
 
 		 315 aa  130  3e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1534  inner-membrane translocator  33.33 
 
 		 338 aa  129  5.0000000000000004e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.601041  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1643  inner-membrane translocator  30.79 
 
 		 320 aa  129  5.0000000000000004e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000313624  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1874  monosaccharide-transporting ATPase  34.43 
 
 		 354 aa  129  6e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.273612  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2648  inner-membrane translocator  33.78 
 
 		 365 aa  129  8.000000000000001e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.456995  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4173  ribose ABC transporter permease protein  30.07 
 
 		 322 aa  129  8.000000000000001e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00211847  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5736  inner-membrane translocator  35.51 
 
 		 315 aa  128  2.0000000000000002e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.104967  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1987  monosaccharide-transporting ATPase  33.58 
 
 		 312 aa  127  2.0000000000000002e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.589517  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2982  inner-membrane translocator  36.06 
 
 		 353 aa  127  2.0000000000000002e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0193126  normal  0.0985551 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3250  ribose ABC transporter, permease protein  33.78 
 
 		 381 aa  127  4.0000000000000003e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0912  ribose ABC transporter permease  33.78 
 
 		 381 aa  126  4.0000000000000003e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5745  monosaccharide-transporting ATPase  34.31 
 
 		 318 aa  126  4.0000000000000003e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3384  monosaccharide-transporting ATPase  33.78 
 
 		 381 aa  126  4.0000000000000003e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1133  monosaccharide-transporting ATPase  31.67 
 
 		 359 aa  127  4.0000000000000003e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000291616  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4114  ribose ABC transporter permease protein  30.23 
 
 		 321 aa  126  6e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.32727  normal  0.0391743 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3329  inner-membrane translocator  34.6 
 
 		 314 aa  125  7e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0614  inner-membrane translocator  33.07 
 
 		 331 aa  125  8.000000000000001e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2302  inner-membrane translocator  31.8 
 
 		 327 aa  125  1e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0887388 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4275  ribose ABC transporter permease protein  30.55 
 
 		 321 aa  125  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4110  ribose ABC transporter permease protein  30.55 
 
 		 321 aa  125  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.401971  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4216  ribose ABC transporter permease protein  30.55 
 
 		 321 aa  125  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.064291  normal  0.774246 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4166  ribose ABC transporter permease protein  30.55 
 
 		 321 aa  125  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1826  inner-membrane translocator  33.97 
 
 		 336 aa  125  1e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0911886  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4095  ribose ABC transporter permease protein  30.55 
 
 		 321 aa  125  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0718  inner-membrane translocator  32.84 
 
 		 341 aa  125  1e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.303584  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2121  Monosaccharide-transporting ATPase  30.51 
 
 		 350 aa  124  2e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.83989 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3727  Monosaccharide-transporting ATPase  34.92 
 
 		 356 aa  124  2e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.587944  normal  0.0169743 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10510  monosaccharide ABC transporter membrane protein  33.7 
 
 		 380 aa  124  2e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0342  ribose ABC transporter permease protein  31.06 
 
 		 324 aa  124  2e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03636  ribose ABC transporter permease protein  31.05 
 
 		 321 aa  124  3e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0321266  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4217  Monosaccharide-transporting ATPase  31.05 
 
 		 321 aa  124  3e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4266  ribose ABC transporter permease protein  31.05 
 
 		 321 aa  124  3e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00636427  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03581  hypothetical protein  31.05 
 
 		 321 aa  124  3e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0415585  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0710  inner-membrane translocator  31.39 
 
 		 337 aa  123  3e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5186  ribose ABC transporter permease protein  31.05 
 
 		 321 aa  124  3e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0679383  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0249  inner-membrane translocator  33.23 
 
 		 320 aa  124  3e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3850  inner-membrane translocator  35.55 
 
 		 388 aa  124  3e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.530581  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09560  Monosaccharide-transporting ATPase  30.37 
 
 		 322 aa  124  3e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.785729  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4244  ribose ABC transporter permease protein  31.05 
 
 		 321 aa  124  3e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00281805 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0516  ribose ABC transporter permease protein  32.69 
 
 		 324 aa  124  3e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4118  ribose ABC transporter permease protein  31.05 
 
 		 321 aa  124  3e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.129793 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3966  ribose ABC transporter permease protein  31.05 
 
 		 321 aa  124  3e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.878402  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1337  amino acid or sugar ABC transport system, permease protein  29.73 
 
 		 333 aa  123  5e-27  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.485159 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4236  ribose ABC transporter permease protein  31.03 
 
 		 322 aa  122  6e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.000913636  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>