More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_4645 on replicon NC_012848
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012848  Rleg_4645  inner-membrane translocator  100 
 
 		 315 aa  598  1e-170  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5736  inner-membrane translocator  95.56 
 
 		 315 aa  541  1e-153  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.104967  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5318  inner-membrane translocator  86.67 
 
 		 315 aa  483  1e-135  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.305006  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3911  inner-membrane translocator  80.77 
 
 		 313 aa  461  1e-129  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.219967  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5159  inner-membrane translocator  59.6 
 
 		 316 aa  310  2e-83  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.482978  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4052  inner-membrane translocator  56.14 
 
 		 319 aa  295  5e-79  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.744052 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1534  inner-membrane translocator  58.57 
 
 		 338 aa  290  2e-77  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.601041  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2782  inner-membrane translocator  49.83 
 
 		 313 aa  254  9e-67  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.163094  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1195  inner-membrane translocator  44.09 
 
 		 319 aa  216  4e-55  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.438418 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2415  inner-membrane translocator  41.75 
 
 		 319 aa  201  9.999999999999999e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.945279  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1071  inner-membrane translocator  40.96 
 
 		 818 aa  161  1e-38  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.121101  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1139  monosaccharide-transporting ATPase  35.16 
 
 		 334 aa  111  2.0000000000000002e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0264  inner-membrane translocator  31.06 
 
 		 328 aa  105  1e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3056  monosaccharide-transporting ATPase  32.88 
 
 		 322 aa  95.1  1e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000872387  hitchhiker  0.00658118 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6382  inner-membrane translocator  33.8 
 
 		 320 aa  94  3e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.079038 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2593  inner-membrane translocator  31.65 
 
 		 332 aa  92.8  6e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5745  monosaccharide-transporting ATPase  31.92 
 
 		 318 aa  90.9  2e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0412  Monosaccharide-transporting ATPase  32.02 
 
 		 328 aa  90.5  3e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00266655  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0592  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  33.08 
 
 		 336 aa  89.4  7e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.242667  normal  0.208776 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1465  inner-membrane translocator  33.45 
 
 		 311 aa  88.6  1e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.168191  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0994  ribose ABC transporter, permease protein  31.03 
 
 		 319 aa  88.2  2e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4114  monosaccharide-transporting ATPase  28.47 
 
 		 330 aa  87  4e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2668  monosaccharide-transporting ATPase  29.39 
 
 		 322 aa  86.3  6e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.86374  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1400  D-ribose transport system permease protein  29.6 
 
 		 327 aa  85.9  8e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.151364 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1852  ribose ABC transporter, permease protein  28.4 
 
 		 353 aa  83.6  0.000000000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3568  monosaccharide-transporting ATPase  30.45 
 
 		 332 aa  83.2  0.000000000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2745  inner-membrane translocator  28.33 
 
 		 335 aa  82.4  0.000000000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.80645 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1962  monosaccharide-transporting ATPase  28.4 
 
 		 353 aa  82  0.00000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0698409  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0582  monosaccharide-transporting ATPase  27.46 
 
 		 338 aa  82  0.00000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000210774  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0416  Monosaccharide-transporting ATPase  25.41 
 
 		 335 aa  82  0.00000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000387261  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4115  monosaccharide-transporting ATPase  32.26 
 
 		 318 aa  79.7  0.00000000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01060  monosaccharide ABC transporter membrane protein  27.87 
 
 		 336 aa  79  0.00000000000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2914  monosaccharide-transporting ATPase  24.53 
 
 		 346 aa  79  0.0000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.366692  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0859  ribose ABC transporter, permease protein  24.77 
 
 		 346 aa  78.2  0.0000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.479908  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1273  inner-membrane translocator  29.79 
 
 		 308 aa  78.2  0.0000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.485087  normal  0.949472 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0922  monosaccharide-transporting ATPase  28.15 
 
 		 309 aa  78.2  0.0000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2804  inner-membrane translocator  25.95 
 
 		 324 aa  77.8  0.0000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.500539  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5320  inner-membrane translocator  23.1 
 
 		 350 aa  77.4  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.306475  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2716  high-affinity D-ribose ABC transporter membrane protein  25.66 
 
 		 365 aa  77.4  0.0000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.139094  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2121  Monosaccharide-transporting ATPase  27.92 
 
 		 350 aa  77.4  0.0000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.83989 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0165  monosaccharide-transporting ATPase  27.99 
 
 		 318 aa  77  0.0000000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1423  inner-membrane translocator  29.9 
 
 		 320 aa  76.3  0.0000000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.231921  normal  0.914235 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2432  putative binding-protein-dependent transport system permease  27.7 
 
 		 327 aa  76.3  0.0000000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2442  monosaccharide-transporting ATPase  32.62 
 
 		 349 aa  76.3  0.0000000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0263  inner-membrane translocator  32.11 
 
 		 330 aa  75.1  0.000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0579  inner-membrane translocator  31.95 
 
 		 334 aa  75.5  0.000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0563858  normal  0.638168 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4171  Monosaccharide-transporting ATPase  27.68 
 
 		 341 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00275528 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4227  monosaccharide-transporting ATPase  28.13 
 
 		 326 aa  75.1  0.000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3707  inner-membrane translocator  30.39 
 
 		 335 aa  74.3  0.000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.480101  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0362  inner-membrane translocator  29.41 
 
 		 383 aa  74.3  0.000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2158  inner-membrane translocator  26.69 
 
 		 325 aa  73.9  0.000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0784619  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1030  monosaccharide-transporting ATPase  31.06 
 
 		 341 aa  73.2  0.000000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.608545 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1337  amino acid or sugar ABC transport system, permease protein  26.14 
 
 		 333 aa  72.8  0.000000000007  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.485159 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0288  inner-membrane translocator  26.54 
 
 		 331 aa  72.8  0.000000000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.247958 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2433  ribose ABC transporter, permease protein  29.86 
 
 		 349 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.19854  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0614  inner-membrane translocator  25.61 
 
 		 331 aa  71.6  0.00000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1466  inner-membrane translocator  27.68 
 
 		 342 aa  71.2  0.00000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.613245  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0947  inner-membrane translocator  29.86 
 
 		 319 aa  71.2  0.00000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.383865  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0968  inner-membrane translocator  30.29 
 
 		 345 aa  71.2  0.00000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1087  inner-membrane translocator  26.91 
 
 		 339 aa  71.6  0.00000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.10708 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3976  ribose ABC transporter permease protein  26.26 
 
 		 322 aa  71.2  0.00000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.144441  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0581  monosaccharide-transporting ATPase  25.64 
 
 		 333 aa  71.6  0.00000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000000566626  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02438  predicted sugar transporter subunit: membrane component of ABC superfamily  26.53 
 
 		 332 aa  70.9  0.00000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1122  Monosaccharide-transporting ATPase  26.53 
 
 		 332 aa  70.9  0.00000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3217  ribose transport system permease protein RbsC  27.88 
 
 		 334 aa  70.5  0.00000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.961558  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2831  putative sugar ABC transporter, permease protein  26.53 
 
 		 332 aa  70.9  0.00000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02402  hypothetical protein  26.53 
 
 		 332 aa  70.9  0.00000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4097  sugar transport system permease  27.36 
 
 		 330 aa  70.1  0.00000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4029  ribose ABC transporter, permease protein  27.36 
 
 		 330 aa  70.1  0.00000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0126  monosaccharide-transporting ATPase  27.36 
 
 		 330 aa  70.1  0.00000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2699  putative sugar ABC transporter, permease protein  26.53 
 
 		 332 aa  70.1  0.00000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0456  ribose/xylose/arabinose/galactoside ABC-type transporter permease  29.84 
 
 		 310 aa  70.1  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0993  ribose ABC transporter, permease protein  29.9 
 
 		 317 aa  70.1  0.00000000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0935  inner-membrane translocator:glucose/ribitol dehydrogenase  29.9 
 
 		 317 aa  70.1  0.00000000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.840539  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2698  putative sugar ABC transporter, permease protein  26.53 
 
 		 332 aa  69.7  0.00000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3600  monosaccharide-transporting ATPase  24.29 
 
 		 345 aa  69.7  0.00000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0147335  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4526  ribose ABC transporter permease protein  27.97 
 
 		 322 aa  69.7  0.00000000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000584894  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4182  inner-membrane translocator  28.36 
 
 		 341 aa  69.7  0.00000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0361  carbohydrate ABC transporter permease  29.84 
 
 		 310 aa  69.7  0.00000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6250  inner-membrane translocator  29.79 
 
 		 335 aa  69.3  0.00000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.862039  normal  0.813312 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0965  monosaccharide-transporting ATPase  26.64 
 
 		 342 aa  69.3  0.00000000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3689  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  26.62 
 
 		 334 aa  69.3  0.00000000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.138978  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0911  ribose ABC transporter, permease protein  26.64 
 
 		 342 aa  69.3  0.00000000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3424  inner-membrane translocator  26.62 
 
 		 334 aa  69.3  0.00000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.724227  normal  0.790416 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2491  inner-membrane translocator  24.44 
 
 		 405 aa  68.6  0.0000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3880  sugar transport system permease  25.94 
 
 		 334 aa  68.6  0.0000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0490565 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1579  sugar ABC transporter permease  27.73 
 
 		 318 aa  68.9  0.0000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.827046  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1049  inner-membrane translocator  27.99 
 
 		 340 aa  68.6  0.0000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.186781  normal  0.0406542 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3854  Monosaccharide-transporting ATPase  33.12 
 
 		 341 aa  68.9  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.297382 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2807  inner-membrane translocator  28.18 
 
 		 338 aa  68.6  0.0000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3763  L-arabinose transporter permease protein  28.63 
 
 		 316 aa  68.6  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.139254  normal  0.990186 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3779  putative sugar ABC transporter, permease protein  26.19 
 
 		 332 aa  68.6  0.0000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1631  ribose ABC transporter, permease protein  28.32 
 
 		 334 aa  68.2  0.0000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3488  sugar ABC transporter, permease protein  28.32 
 
 		 341 aa  67.8  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.294731  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0477  putative sugar ABC transporter permease  31.93 
 
 		 339 aa  67.8  0.0000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.844394  normal  0.0733402 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2907  Monosaccharide-transporting ATPase  29.77 
 
 		 323 aa  68.2  0.0000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0357751 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0396  inner-membrane translocator  32.47 
 
 		 329 aa  68.6  0.0000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.883346  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4626  Monosaccharide-transporting ATPase  28.95 
 
 		 348 aa  67.8  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.530699 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4580  Monosaccharide-transporting ATPase  27.76 
 
 		 328 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000124272  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6712  inner-membrane translocator  29.9 
 
 		 333 aa  68.6  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.769833 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>