More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_1423 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_1423  inner-membrane translocator  100 
 
 		 320 aa  613  1e-175  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.231921  normal  0.914235 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0264  inner-membrane translocator  31.49 
 
 		 328 aa  117  3e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4114  monosaccharide-transporting ATPase  34.48 
 
 		 330 aa  117  3.9999999999999997e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0563  monosaccharide-transporting ATPase  30.77 
 
 		 311 aa  106  5e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000352632  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1195  inner-membrane translocator  33.82 
 
 		 319 aa  105  9e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.438418 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0582  monosaccharide-transporting ATPase  30.38 
 
 		 311 aa  104  2e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0725  ribose ABC transporter, permease protein  30.38 
 
 		 311 aa  103  3e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.35469e-35 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0736  ribose ABC transporter, permease protein  30 
 
 		 311 aa  102  8e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0635  ribose ABC transporter permease  30 
 
 		 311 aa  102  8e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0578  ribose ABC transporter, permease  30 
 
 		 311 aa  102  8e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0535816  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0668  ribose ABC transporter permease  30 
 
 		 311 aa  102  8e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0700  ribose ABC transporter, permease protein  30 
 
 		 311 aa  102  8e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0973921  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4638  ribose ABC transporter, permease protein  30 
 
 		 311 aa  102  8e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0801722  unclonable  4.6789e-26 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0579  ribose ABC transporter, permease  30 
 
 		 311 aa  102  1e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0797  ribose ABC transporter, permease protein  29.62 
 
 		 311 aa  100  2e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000530424  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1139  monosaccharide-transporting ATPase  34.8 
 
 		 334 aa  100  3e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2278  inner-membrane translocator  31.01 
 
 		 309 aa  100  4e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.568654  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0115  ribose ABC transporter, permease protein  29.7 
 
 		 310 aa  96.7  5e-19  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1400  D-ribose transport system permease protein  32.42 
 
 		 327 aa  95.9  8e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.151364 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0592  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  34.12 
 
 		 336 aa  94.7  2e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.242667  normal  0.208776 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2593  inner-membrane translocator  31.25 
 
 		 332 aa  94.4  2e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1987  monosaccharide-transporting ATPase  28.19 
 
 		 312 aa  94  3e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.589517  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0148  Monosaccharide-transporting ATPase  30.03 
 
 		 332 aa  93.2  5e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0275  inner-membrane translocator  29.89 
 
 		 323 aa  92.8  8e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0456  ribose/xylose/arabinose/galactoside ABC-type transporter permease  27.91 
 
 		 310 aa  92.4  8e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2442  ABC transporter permease  30.5 
 
 		 348 aa  92.8  8e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.986757  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1398  inner-membrane translocator  29.73 
 
 		 334 aa  91.7  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00127371  normal  0.617276 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3785  monosaccharide-transporting ATPase  32.86 
 
 		 337 aa  92  1e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0107495 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0361  carbohydrate ABC transporter permease  27.91 
 
 		 310 aa  92  1e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0994  ribose ABC transporter, permease protein  32.7 
 
 		 319 aa  90.9  2e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2414  monosaccharide-transporting ATPase  30.48 
 
 		 360 aa  91.3  2e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.346544  normal  0.517943 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0886  ABC sugar transporter, inner-membrane subunit  32.86 
 
 		 337 aa  91.7  2e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0350071  normal  0.652921 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3549  inner-membrane translocator  32.86 
 
 		 337 aa  91.7  2e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2745  inner-membrane translocator  34.65 
 
 		 335 aa  91.7  2e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.80645 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4199  inner-membrane translocator  32.38 
 
 		 337 aa  90.9  2e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4818  inner-membrane translocator  32.86 
 
 		 337 aa  91.7  2e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.414014  normal  0.232318 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5465  monosaccharide-transporting ATPase  32.86 
 
 		 337 aa  91.7  2e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.050328 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0502  monosaccharide-transporting ATPase  36.54 
 
 		 333 aa  91.3  2e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00475125 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3329  inner-membrane translocator  30.65 
 
 		 314 aa  90.9  3e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4722  monosaccharide-transporting ATPase  31.9 
 
 		 335 aa  90.9  3e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.278194 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1759  ribose ABC transporter permease  29.73 
 
 		 330 aa  90.5  4e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.32812  hitchhiker  0.000062023 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1613  monosaccharide-transporting ATPase  29.73 
 
 		 330 aa  90.5  4e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1509  ribose ABC transporter, permease protein  29.73 
 
 		 330 aa  90.5  4e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.424015  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0835  monosaccharide-transporting ATPase  30.8 
 
 		 317 aa  89.7  5e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0812  monosaccharide-transporting ATPase  30.8 
 
 		 317 aa  89.7  5e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.213991  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0625  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  28.17 
 
 		 345 aa  89.4  7e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.983884  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0712  inner-membrane translocator  30.15 
 
 		 310 aa  89.4  8e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0709957  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4115  monosaccharide-transporting ATPase  31.41 
 
 		 318 aa  89  9e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2668  monosaccharide-transporting ATPase  30.47 
 
 		 322 aa  89  9e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.86374  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3056  monosaccharide-transporting ATPase  33.05 
 
 		 322 aa  89  9e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000872387  hitchhiker  0.00658118 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3880  sugar transport system permease  27.34 
 
 		 334 aa  89  1e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0490565 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0911  ribose ABC transporter, permease protein  27.34 
 
 		 342 aa  88.6  1e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0614  inner-membrane translocator  28.06 
 
 		 331 aa  88.6  1e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01060  monosaccharide ABC transporter membrane protein  27.59 
 
 		 336 aa  88.6  1e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0396  inner-membrane translocator  32.97 
 
 		 329 aa  89  1e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.883346  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7025  monosaccharide-transporting ATPase  27.3 
 
 		 335 aa  88.6  1e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.560665  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2415  inner-membrane translocator  31.25 
 
 		 319 aa  89  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.945279  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0965  monosaccharide-transporting ATPase  27.34 
 
 		 342 aa  88.2  1e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6250  inner-membrane translocator  28.61 
 
 		 335 aa  87.8  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.862039  normal  0.813312 
 
 
-
 
NC_004310  BR1631  ribose ABC transporter, permease protein  27.86 
 
 		 334 aa  88.2  2e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3234  Monosaccharide-transporting ATPase  31.31 
 
 		 335 aa  88.2  2e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.197254  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7366  ABC transporter membrane spanning protein (ribose)  30.38 
 
 		 325 aa  87.8  2e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1575  ribose ABC transporter, permease protein  27.86 
 
 		 334 aa  88.2  2e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.136542  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0780  inner-membrane translocator  26.41 
 
 		 328 aa  87.4  3e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.219344  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2433  ribose ABC transporter, permease protein  35.71 
 
 		 349 aa  87  3e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.19854  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3938  ABC transporter related protein  32.7 
 
 		 839 aa  87  3e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.649029  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0263  inner-membrane translocator  32.5 
 
 		 330 aa  87.4  3e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2914  monosaccharide-transporting ATPase  28.1 
 
 		 346 aa  87.4  3e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.366692  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2523  inner-membrane translocator  28.52 
 
 		 313 aa  87  3e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1370  ribose ABC transporter permease protein  30.09 
 
 		 323 aa  87  4e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.512196  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0859  ribose ABC transporter, permease protein  28.47 
 
 		 346 aa  87  4e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.479908  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4066  monosaccharide-transporting ATPase  28.52 
 
 		 334 aa  87  4e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0158179  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2265  putative ribose ABC transporter, permease protein  30.92 
 
 		 329 aa  87  4e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0836743 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5246  monosaccharide-transporting ATPase  29.21 
 
 		 345 aa  86.3  6e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.971428 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3329  inner-membrane translocator  29.21 
 
 		 345 aa  86.3  7e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5038  inner-membrane translocator  29.21 
 
 		 345 aa  86.3  7e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.893051 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0579  inner-membrane translocator  29.69 
 
 		 334 aa  86.3  7e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0563858  normal  0.638168 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1196  ribose ABC transporter, permease protein  35.71 
 
 		 334 aa  85.9  8e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.134964  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2071  ribose ABC transporter, permease protein  35.71 
 
 		 341 aa  85.9  8e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0117227  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1640  carbohydrate ABC transporter permease  35.71 
 
 		 334 aa  85.9  8e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.367254  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0302  carbohydrate ABC transporter permease  35.71 
 
 		 334 aa  85.9  8e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0470774  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0858  carbohydrate ABC transporter permease  35.71 
 
 		 334 aa  85.9  8e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1909  carbohydrate ABC transporter permease  35.71 
 
 		 339 aa  85.9  9e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.071894  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1922  carbohydrate ABC transporter permease  35.71 
 
 		 339 aa  85.9  9e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3600  monosaccharide-transporting ATPase  27.33 
 
 		 345 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0147335  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4052  inner-membrane translocator  34.38 
 
 		 319 aa  85.1  0.000000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.744052 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2714  sugar ABC transporter, permease  29.72 
 
 		 338 aa  84.3  0.000000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.953176  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1792  sugar ABC transporter, permease protein  28.12 
 
 		 835 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3346  monosaccharide-transporting ATPase  25.51 
 
 		 345 aa  84.7  0.000000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0869656  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3130  inner-membrane translocator  29.23 
 
 		 333 aa  84.3  0.000000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0780017  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4446  inner-membrane translocator  28.84 
 
 		 345 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000908606 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4262  monosaccharide-transporting ATPase  29.33 
 
 		 336 aa  84  0.000000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0638371  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4645  inner-membrane translocator  30.58 
 
 		 315 aa  84  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5320  inner-membrane translocator  27.91 
 
 		 350 aa  84  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.306475  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1063  monosaccharide-transporting ATPase  31.14 
 
 		 365 aa  84.3  0.000000000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2694  sugar ABC transporter, permease  29.72 
 
 		 338 aa  83.6  0.000000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.273875  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2977  putative ribose ABC transporter, permease protein  29.88 
 
 		 329 aa  83.6  0.000000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0033  sugar ABC transporter, permease  28.8 
 
 		 316 aa  83.6  0.000000000000004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.696552  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4171  Monosaccharide-transporting ATPase  30.71 
 
 		 341 aa  83.2  0.000000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00275528 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6382  inner-membrane translocator  32.65 
 
 		 320 aa  83.2  0.000000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.079038 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>