More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_6382 on replicon NC_012854
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012854  Rleg_6382  inner-membrane translocator  100 
 
 		 320 aa  596  1e-169  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.079038 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0994  ribose ABC transporter, permease protein  78.23 
 
 		 319 aa  449  1e-125  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1139  monosaccharide-transporting ATPase  43.48 
 
 		 334 aa  152  5e-36  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2668  monosaccharide-transporting ATPase  36.08 
 
 		 322 aa  130  3e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.86374  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1759  ribose ABC transporter permease  34.16 
 
 		 330 aa  130  4.0000000000000003e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.32812  hitchhiker  0.000062023 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1509  ribose ABC transporter, permease protein  34.16 
 
 		 330 aa  130  4.0000000000000003e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.424015  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1613  monosaccharide-transporting ATPase  34.16 
 
 		 330 aa  130  4.0000000000000003e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2593  inner-membrane translocator  37.45 
 
 		 332 aa  129  5.0000000000000004e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2914  monosaccharide-transporting ATPase  32.14 
 
 		 346 aa  124  3e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.366692  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2431  (monosaccharide) transport system permease protein  30.09 
 
 		 328 aa  122  7e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.790241  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0859  ribose ABC transporter, permease protein  31.53 
 
 		 346 aa  122  9.999999999999999e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.479908  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0592  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  33.69 
 
 		 336 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.242667  normal  0.208776 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3056  monosaccharide-transporting ATPase  34.94 
 
 		 322 aa  121  1.9999999999999998e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000872387  hitchhiker  0.00658118 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0396  inner-membrane translocator  38.8 
 
 		 329 aa  119  9e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.883346  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1987  monosaccharide-transporting ATPase  32.99 
 
 		 312 aa  118  9.999999999999999e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.589517  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3637  inner-membrane translocator  31.63 
 
 		 355 aa  119  9.999999999999999e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1195  inner-membrane translocator  34.15 
 
 		 319 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.438418 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1465  inner-membrane translocator  35.05 
 
 		 311 aa  117  1.9999999999999998e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.168191  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3523  inner-membrane translocator  31.68 
 
 		 355 aa  118  1.9999999999999998e-25  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4114  monosaccharide-transporting ATPase  33.92 
 
 		 330 aa  117  3e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5320  inner-membrane translocator  29.73 
 
 		 350 aa  117  3e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.306475  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4645  inner-membrane translocator  33.8 
 
 		 315 aa  115  7.999999999999999e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1631  ribose ABC transporter, permease protein  32.52 
 
 		 334 aa  115  1.0000000000000001e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1575  ribose ABC transporter, permease protein  32.52 
 
 		 334 aa  115  1.0000000000000001e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.136542  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2597  inner-membrane translocator  31.43 
 
 		 330 aa  115  1.0000000000000001e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.443228  normal  0.425979 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3763  L-arabinose transporter permease protein  31.29 
 
 		 316 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.139254  normal  0.990186 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2807  inner-membrane translocator  34.25 
 
 		 338 aa  114  2.0000000000000002e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1458  Monosaccharide-transporting ATPase  35.51 
 
 		 333 aa  114  2.0000000000000002e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0717887 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2415  inner-membrane translocator  33 
 
 		 319 aa  114  3e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.945279  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5736  inner-membrane translocator  33.8 
 
 		 315 aa  112  6e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.104967  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1423  inner-membrane translocator  35.32 
 
 		 320 aa  112  6e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.231921  normal  0.914235 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4066  monosaccharide-transporting ATPase  33.13 
 
 		 334 aa  112  6e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0158179  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0579  inner-membrane translocator  34.58 
 
 		 334 aa  113  6e-24  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0563858  normal  0.638168 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0492  Monosaccharide-transporting ATPase  33.33 
 
 		 317 aa  112  8.000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.302976  normal  0.146165 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0362  inner-membrane translocator  30.82 
 
 		 383 aa  112  8.000000000000001e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1962  monosaccharide-transporting ATPase  31.91 
 
 		 353 aa  111  1.0000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0698409  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7025  monosaccharide-transporting ATPase  32.76 
 
 		 335 aa  111  2.0000000000000002e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.560665  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0690  Monosaccharide-transporting ATPase  32.51 
 
 		 348 aa  110  3e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0715844 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7366  ABC transporter membrane spanning protein (ribose)  33.33 
 
 		 325 aa  110  3e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0264  inner-membrane translocator  31.63 
 
 		 328 aa  110  3e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1852  ribose ABC transporter, permease protein  32.23 
 
 		 353 aa  110  3e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6269  ABC transporter membrane spanning protein  30 
 
 		 337 aa  110  4.0000000000000004e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.661725  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0539  inner-membrane translocator  31.1 
 
 		 322 aa  109  5e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2981  inner-membrane translocator  33.95 
 
 		 328 aa  109  6e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0921483  normal  0.0941351 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1370  ribose ABC transporter permease protein  32.33 
 
 		 323 aa  109  7.000000000000001e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.512196  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6250  inner-membrane translocator  28.3 
 
 		 335 aa  109  8.000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.862039  normal  0.813312 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3707  inner-membrane translocator  34.13 
 
 		 335 aa  108  1e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.480101  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0945  beta-methylgalactoside transporter inner membrane component  30.57 
 
 		 337 aa  108  1e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3651  monosaccharide-transporting ATPase  33.68 
 
 		 351 aa  107  2e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.163622  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1652  inner-membrane translocator  33.11 
 
 		 340 aa  107  2e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0718181  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0859  autoinducer AI-2 ABC transporter permease LsrC  33.68 
 
 		 351 aa  108  2e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4767  monosaccharide-transporting ATPase  29.39 
 
 		 320 aa  107  2e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.424997 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1365  monosaccharide-transporting ATPase  31.31 
 
 		 349 aa  107  2e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0925681  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2782  inner-membrane translocator  34.42 
 
 		 342 aa  107  2e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3522  autoinducer AI-2 ABC transporter, permease protein LsrC  33.68 
 
 		 351 aa  108  2e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2826  inner-membrane translocator  34.42 
 
 		 342 aa  107  2e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.700859  normal  0.0291669 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0290  monosaccharide-transporting ATPase  30.55 
 
 		 331 aa  108  2e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4173  ribose ABC transporter permease protein  31.86 
 
 		 322 aa  107  2e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00211847  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2809  inner-membrane translocator  34.42 
 
 		 342 aa  107  2e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0829098  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2745  inner-membrane translocator  37.55 
 
 		 335 aa  107  3e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.80645 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4317  monosaccharide-transporting ATPase  35.06 
 
 		 440 aa  107  3e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.769006  normal  0.0636141 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1642  Monosaccharide-transporting ATPase  32.73 
 
 		 317 aa  107  4e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000000622557  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4052  inner-membrane translocator  36.67 
 
 		 319 aa  107  4e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.744052 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01060  monosaccharide ABC transporter membrane protein  34.48 
 
 		 336 aa  107  4e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3976  ribose ABC transporter permease protein  29.43 
 
 		 322 aa  106  5e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.144441  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4682  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  31.82 
 
 		 345 aa  106  6e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.377068  normal  0.145685 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4526  ribose ABC transporter permease protein  29.1 
 
 		 322 aa  106  6e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000584894  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5745  monosaccharide-transporting ATPase  34.75 
 
 		 318 aa  105  7e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3602  L-arabinose transporter permease protein  30.77 
 
 		 317 aa  105  7e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3593  monosaccharide-transporting ATPase  32.14 
 
 		 329 aa  106  7e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.225998  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1712  monosaccharide-transporting ATPase  32.14 
 
 		 345 aa  105  8e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0294222 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4580  Monosaccharide-transporting ATPase  31.79 
 
 		 328 aa  105  1e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000124272  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1921  inner-membrane translocator  33.21 
 
 		 354 aa  105  1e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.748893  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4849  inner-membrane translocator  29.62 
 
 		 325 aa  105  1e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.361402  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1518  monosaccharide-transporting ATPase  31.72 
 
 		 345 aa  105  1e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0853941  normal  0.0193721 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0275  inner-membrane translocator  31.94 
 
 		 323 aa  105  1e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0710  inner-membrane translocator  30.19 
 
 		 337 aa  104  2e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1965  inner-membrane translocator  34.3 
 
 		 341 aa  104  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.389843  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5159  inner-membrane translocator  32.75 
 
 		 316 aa  104  2e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.482978  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1062  inner-membrane translocator  31.72 
 
 		 345 aa  104  2e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.379015  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12300  monosaccharide ABC transporter membrane protein  33.99 
 
 		 309 aa  104  2e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  decreased coverage  0.00275786  normal  0.739873 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6207  inner-membrane translocator  34.3 
 
 		 341 aa  104  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.729739 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1131  monosaccharide-transporting ATPase  30.84 
 
 		 332 aa  105  2e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1542  inner-membrane translocator  31.72 
 
 		 345 aa  104  2e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0582  monosaccharide-transporting ATPase  31.45 
 
 		 338 aa  104  2e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000210774  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4227  monosaccharide-transporting ATPase  29.93 
 
 		 326 aa  104  2e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03636  ribose ABC transporter permease protein  30.31 
 
 		 321 aa  103  3e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0321266  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1122  Monosaccharide-transporting ATPase  30.35 
 
 		 332 aa  103  3e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4217  Monosaccharide-transporting ATPase  30.31 
 
 		 321 aa  103  3e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3475  L-arabinose transporter permease protein  30.65 
 
 		 316 aa  103  3e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4118  ribose ABC transporter permease protein  30.31 
 
 		 321 aa  103  3e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.129793 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2831  putative sugar ABC transporter, permease protein  30.35 
 
 		 332 aa  103  3e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2698  putative sugar ABC transporter, permease protein  30.99 
 
 		 332 aa  103  3e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5186  ribose ABC transporter permease protein  30.31 
 
 		 321 aa  103  3e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0679383  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0342  ribose ABC transporter permease protein  28.53 
 
 		 324 aa  104  3e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4244  ribose ABC transporter permease protein  30.31 
 
 		 321 aa  103  3e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00281805 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0712  inner-membrane translocator  32.08 
 
 		 310 aa  103  3e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0709957  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3966  ribose ABC transporter permease protein  30.31 
 
 		 321 aa  103  3e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.878402  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4266  ribose ABC transporter permease protein  30.31 
 
 		 321 aa  103  3e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00636427  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02402  hypothetical protein  30.35 
 
 		 332 aa  103  3e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>