More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_3056 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_3056  monosaccharide-transporting ATPase  100 
 
 		 322 aa  615  1e-175  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000872387  hitchhiker  0.00658118 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2668  monosaccharide-transporting ATPase  87.58 
 
 		 322 aa  507  9.999999999999999e-143  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.86374  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0396  inner-membrane translocator  49.84 
 
 		 329 aa  226  5.0000000000000005e-58  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.883346  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0264  inner-membrane translocator  36.22 
 
 		 328 aa  169  6e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4114  monosaccharide-transporting ATPase  37.94 
 
 		 330 aa  168  1e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1139  monosaccharide-transporting ATPase  40.14 
 
 		 334 aa  165  1.0000000000000001e-39  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2448  inner-membrane translocator  35.51 
 
 		 327 aa  154  2e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0992718  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2745  inner-membrane translocator  39.32 
 
 		 335 aa  152  8e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.80645 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1613  monosaccharide-transporting ATPase  33.96 
 
 		 330 aa  149  5e-35  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1509  ribose ABC transporter, permease protein  33.96 
 
 		 330 aa  149  5e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.424015  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1759  ribose ABC transporter permease  33.96 
 
 		 330 aa  149  5e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.32812  hitchhiker  0.000062023 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2593  inner-membrane translocator  37.45 
 
 		 332 aa  147  3e-34  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4066  monosaccharide-transporting ATPase  35.13 
 
 		 334 aa  140  3.9999999999999997e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0158179  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1631  ribose ABC transporter, permease protein  34.64 
 
 		 334 aa  137  2e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1575  ribose ABC transporter, permease protein  34.64 
 
 		 334 aa  137  2e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.136542  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1642  Monosaccharide-transporting ATPase  35.06 
 
 		 317 aa  137  2e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000000622557  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1987  monosaccharide-transporting ATPase  32.48 
 
 		 312 aa  136  6.0000000000000005e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.589517  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0563  monosaccharide-transporting ATPase  34.41 
 
 		 311 aa  135  7.000000000000001e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000352632  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0614  inner-membrane translocator  31.97 
 
 		 331 aa  135  8e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7366  ABC transporter membrane spanning protein (ribose)  37.84 
 
 		 325 aa  135  9.999999999999999e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2883  inner-membrane translocator  37.98 
 
 		 348 aa  134  3e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.797919 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1881  ribose ABC transporter, permease protein  29.06 
 
 		 311 aa  134  3e-30  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0277317  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0592  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  32.43 
 
 		 336 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.242667  normal  0.208776 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0582  monosaccharide-transporting ATPase  34.08 
 
 		 311 aa  133  3.9999999999999996e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4638  ribose ABC transporter, permease protein  34.08 
 
 		 311 aa  132  9e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0801722  unclonable  4.6789e-26 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0700  ribose ABC transporter, permease protein  34.08 
 
 		 311 aa  132  9e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0973921  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2804  inner-membrane translocator  33.86 
 
 		 324 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.500539  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0994  ribose ABC transporter, permease protein  35.86 
 
 		 319 aa  131  2.0000000000000002e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2278  inner-membrane translocator  35.93 
 
 		 309 aa  131  2.0000000000000002e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.568654  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0725  ribose ABC transporter, permease protein  34.08 
 
 		 311 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.35469e-35 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0736  ribose ABC transporter, permease protein  34.08 
 
 		 311 aa  130  3e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0578  ribose ABC transporter, permease  34.08 
 
 		 311 aa  130  3e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0535816  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0797  ribose ABC transporter, permease protein  34.08 
 
 		 311 aa  130  3e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000530424  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0115  ribose ABC transporter, permease protein  34.73 
 
 		 310 aa  130  4.0000000000000003e-29  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0579  ribose ABC transporter, permease  33.76 
 
 		 311 aa  129  5.0000000000000004e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0635  ribose ABC transporter permease  33.76 
 
 		 311 aa  129  6e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0668  ribose ABC transporter permease  33.76 
 
 		 311 aa  129  6e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3234  Monosaccharide-transporting ATPase  34.36 
 
 		 335 aa  129  9.000000000000001e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.197254  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1370  ribose ABC transporter permease protein  32.07 
 
 		 323 aa  129  9.000000000000001e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.512196  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1398  inner-membrane translocator  35.32 
 
 		 334 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00127371  normal  0.617276 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0710  inner-membrane translocator  32.09 
 
 		 337 aa  128  1.0000000000000001e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0123  inner-membrane translocator  31.31 
 
 		 343 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0263  inner-membrane translocator  35.22 
 
 		 330 aa  128  1.0000000000000001e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0516  ribose ABC transporter permease protein  34.37 
 
 		 324 aa  127  3e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2942  Monosaccharide-transporting ATPase  35.53 
 
 		 332 aa  127  3e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.868986 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0712  inner-membrane translocator  37.46 
 
 		 310 aa  127  3e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0709957  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0456  ribose/xylose/arabinose/galactoside ABC-type transporter permease  33.02 
 
 		 310 aa  126  6e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0361  carbohydrate ABC transporter permease  32.7 
 
 		 310 aa  125  8.000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0911  ribose ABC transporter, permease protein  32.84 
 
 		 342 aa  125  1e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0886  ABC sugar transporter, inner-membrane subunit  35.14 
 
 		 337 aa  125  1e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0350071  normal  0.652921 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0248  inner-membrane translocator  32.17 
 
 		 338 aa  125  1e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3336  inner-membrane translocator  36.16 
 
 		 346 aa  125  1e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5465  monosaccharide-transporting ATPase  35.14 
 
 		 337 aa  125  1e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.050328 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3549  inner-membrane translocator  35.14 
 
 		 337 aa  125  1e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3880  sugar transport system permease  32.84 
 
 		 334 aa  125  1e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0490565 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4818  inner-membrane translocator  35.14 
 
 		 337 aa  125  1e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.414014  normal  0.232318 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0965  monosaccharide-transporting ATPase  32.84 
 
 		 342 aa  124  1e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2914  monosaccharide-transporting ATPase  35 
 
 		 346 aa  124  2e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.366692  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2442  ABC transporter permease  31.53 
 
 		 348 aa  123  3e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.986757  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11050  monosaccharide ABC transporter membrane protein  35.56 
 
 		 358 aa  124  3e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.543201 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0492  Monosaccharide-transporting ATPase  33.67 
 
 		 317 aa  124  3e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.302976  normal  0.146165 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6382  inner-membrane translocator  34.94 
 
 		 320 aa  123  5e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.079038 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2121  Monosaccharide-transporting ATPase  33.22 
 
 		 350 aa  123  5e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.83989 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0835  monosaccharide-transporting ATPase  33.23 
 
 		 317 aa  123  5e-27  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3785  monosaccharide-transporting ATPase  33.87 
 
 		 337 aa  123  5e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0107495 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0812  monosaccharide-transporting ATPase  33.23 
 
 		 317 aa  123  5e-27  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.213991  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1465  inner-membrane translocator  36.22 
 
 		 311 aa  122  6e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.168191  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4722  monosaccharide-transporting ATPase  35.16 
 
 		 335 aa  122  6e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.278194 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0342  ribose ABC transporter permease protein  33.76 
 
 		 324 aa  122  6e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4928  monosaccharide-transporting ATPase  30.77 
 
 		 332 aa  122  6e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.611047  normal  0.698391 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2981  inner-membrane translocator  33.8 
 
 		 328 aa  122  7e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0921483  normal  0.0941351 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3765  inner-membrane translocator  31.21 
 
 		 306 aa  122  9e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00344833  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01060  monosaccharide ABC transporter membrane protein  32.49 
 
 		 336 aa  122  9.999999999999999e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0859  ribose ABC transporter, permease protein  35 
 
 		 346 aa  122  9.999999999999999e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.479908  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4626  Monosaccharide-transporting ATPase  33.54 
 
 		 348 aa  121  9.999999999999999e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.530699 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0149  Monosaccharide-transporting ATPase  31.4 
 
 		 324 aa  121  9.999999999999999e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.259249  normal  0.0554207 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2782  inner-membrane translocator  34.73 
 
 		 342 aa  122  9.999999999999999e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0502  monosaccharide-transporting ATPase  33.76 
 
 		 333 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00475125 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2826  inner-membrane translocator  34.73 
 
 		 342 aa  122  9.999999999999999e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.700859  normal  0.0291669 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1676  inner-membrane translocator  34.57 
 
 		 849 aa  122  9.999999999999999e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.586191 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2809  inner-membrane translocator  34.73 
 
 		 342 aa  122  9.999999999999999e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0829098  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0362  inner-membrane translocator  32.01 
 
 		 383 aa  120  1.9999999999999998e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3461  monosaccharide-transporting ATPase  30.15 
 
 		 342 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.488861 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1400  D-ribose transport system permease protein  35.77 
 
 		 327 aa  121  1.9999999999999998e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.151364 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0052  ABC transporter, permease, sugar transport  31.88 
 
 		 332 aa  120  3e-26  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0182601  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4199  inner-membrane translocator  34.82 
 
 		 337 aa  120  3e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1792  sugar ABC transporter, permease protein  32.7 
 
 		 835 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1458  Monosaccharide-transporting ATPase  31.83 
 
 		 333 aa  120  4.9999999999999996e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0717887 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4135  inner-membrane translocator  34.42 
 
 		 321 aa  119  6e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4173  ribose ABC transporter permease protein  31.25 
 
 		 322 aa  119  6e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00211847  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2523  inner-membrane translocator  33.44 
 
 		 313 aa  119  6e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4115  monosaccharide-transporting ATPase  32.14 
 
 		 318 aa  119  7e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0009  ribose ABC transporter permease protein  31.75 
 
 		 322 aa  119  7e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0774  inner-membrane translocator  32.05 
 
 		 339 aa  119  7.999999999999999e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0308372 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2045  inner-membrane translocator  34.14 
 
 		 342 aa  119  9e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.459231 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000340  ribose ABC transport system permease protein RbsC  31.43 
 
 		 327 aa  118  9.999999999999999e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06144  ribose ABC transporter permease protein  31.75 
 
 		 327 aa  119  9.999999999999999e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1460  inner-membrane translocator  32.48 
 
 		 373 aa  118  9.999999999999999e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.3149 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2716  high-affinity D-ribose ABC transporter membrane protein  34.1 
 
 		 365 aa  118  9.999999999999999e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.139094  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0922  monosaccharide-transporting ATPase  29.47 
 
 		 309 aa  118  9.999999999999999e-26  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>