More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BRA0994 on replicon NC_004311
Organism: Brucella suis 1330



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004311  BRA0994  ribose ABC transporter, permease protein  100 
 
 		 319 aa  608  1e-173  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6382  inner-membrane translocator  78.23 
 
 		 320 aa  442  1e-123  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.079038 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1139  monosaccharide-transporting ATPase  41.67 
 
 		 334 aa  148  1.0000000000000001e-34  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2593  inner-membrane translocator  38.43 
 
 		 332 aa  142  6e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2668  monosaccharide-transporting ATPase  36.43 
 
 		 322 aa  134  1.9999999999999998e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.86374  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0396  inner-membrane translocator  39.2 
 
 		 329 aa  125  9e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.883346  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0592  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  32.88 
 
 		 336 aa  122  6e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.242667  normal  0.208776 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1987  monosaccharide-transporting ATPase  32.55 
 
 		 312 aa  122  6e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.589517  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3056  monosaccharide-transporting ATPase  35.86 
 
 		 322 aa  122  7e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000872387  hitchhiker  0.00658118 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1195  inner-membrane translocator  32.49 
 
 		 319 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.438418 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0264  inner-membrane translocator  31.43 
 
 		 328 aa  120  1.9999999999999998e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2807  inner-membrane translocator  32.44 
 
 		 338 aa  120  3e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1465  inner-membrane translocator  35.79 
 
 		 311 aa  119  9e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.168191  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2415  inner-membrane translocator  32.47 
 
 		 319 aa  114  2.0000000000000002e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.945279  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1613  monosaccharide-transporting ATPase  32.31 
 
 		 330 aa  114  2.0000000000000002e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1759  ribose ABC transporter permease  32.31 
 
 		 330 aa  114  2.0000000000000002e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.32812  hitchhiker  0.000062023 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1509  ribose ABC transporter, permease protein  32.31 
 
 		 330 aa  114  2.0000000000000002e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.424015  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2914  monosaccharide-transporting ATPase  30.34 
 
 		 346 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.366692  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1652  inner-membrane translocator  33.11 
 
 		 340 aa  113  5e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0718181  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1712  monosaccharide-transporting ATPase  29.54 
 
 		 345 aa  113  5e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0294222 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1518  monosaccharide-transporting ATPase  30.91 
 
 		 345 aa  112  6e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0853941  normal  0.0193721 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2613  L-arabinose transporter permease protein  31.23 
 
 		 338 aa  112  6e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.727228  normal  0.716925 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1062  inner-membrane translocator  30.91 
 
 		 345 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.379015  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1542  inner-membrane translocator  30.91 
 
 		 345 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4682  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  30.6 
 
 		 345 aa  112  8.000000000000001e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.377068  normal  0.145685 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0290  monosaccharide-transporting ATPase  31.13 
 
 		 331 aa  112  9e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5320  inner-membrane translocator  30.03 
 
 		 350 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.306475  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0859  ribose ABC transporter, permease protein  29.72 
 
 		 346 aa  110  2.0000000000000002e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.479908  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3689  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  32.47 
 
 		 334 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.138978  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4114  monosaccharide-transporting ATPase  33.1 
 
 		 330 aa  110  2.0000000000000002e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1826  inner-membrane translocator  30.1 
 
 		 336 aa  111  2.0000000000000002e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0911886  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4052  inner-membrane translocator  34.04 
 
 		 319 aa  111  2.0000000000000002e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.744052 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1423  inner-membrane translocator  34.38 
 
 		 320 aa  111  2.0000000000000002e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.231921  normal  0.914235 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3651  monosaccharide-transporting ATPase  30 
 
 		 351 aa  110  3e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.163622  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0196  carbohydrate ABC transporter permease  30.32 
 
 		 344 aa  110  3e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3424  inner-membrane translocator  32.47 
 
 		 334 aa  110  3e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.724227  normal  0.790416 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0285  carbohydrate ABC transporter permease  30.32 
 
 		 344 aa  110  3e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3522  autoinducer AI-2 ABC transporter, permease protein LsrC  30 
 
 		 351 aa  110  4.0000000000000004e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0859  autoinducer AI-2 ABC transporter permease LsrC  30 
 
 		 351 aa  109  5e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4121  inner-membrane translocator  31.75 
 
 		 328 aa  109  5e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.49492  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0275  inner-membrane translocator  32.42 
 
 		 323 aa  109  6e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2597  inner-membrane translocator  30.17 
 
 		 330 aa  109  7.000000000000001e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.443228  normal  0.425979 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2431  (monosaccharide) transport system permease protein  29.84 
 
 		 328 aa  108  9.000000000000001e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.790241  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0362  inner-membrane translocator  30.15 
 
 		 383 aa  108  9.000000000000001e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3976  ribose ABC transporter permease protein  29.84 
 
 		 322 aa  108  1e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.144441  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2473  monosaccharide-transporting ATPase  33.59 
 
 		 330 aa  108  2e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.270103  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3707  inner-membrane translocator  27.44 
 
 		 335 aa  107  2e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.480101  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0690  Monosaccharide-transporting ATPase  31.01 
 
 		 348 aa  107  2e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0715844 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0210  ribose ABC transporter, permease protein  30.63 
 
 		 339 aa  107  3e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7025  monosaccharide-transporting ATPase  29.93 
 
 		 335 aa  107  3e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.560665  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5159  inner-membrane translocator  34.33 
 
 		 316 aa  106  4e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.482978  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1424  inner-membrane translocator  29.65 
 
 		 345 aa  106  4e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1534  inner-membrane translocator  32.85 
 
 		 338 aa  106  4e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.601041  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1464  monosaccharide-transporting ATPase  29.65 
 
 		 345 aa  106  5e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.987014  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0638  monosaccharide-transporting ATPase  28.99 
 
 		 332 aa  106  6e-22  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0715262  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4645  inner-membrane translocator  31.25 
 
 		 315 aa  105  7e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0945  beta-methylgalactoside transporter inner membrane component  31.97 
 
 		 337 aa  105  8e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6269  ABC transporter membrane spanning protein  30.1 
 
 		 337 aa  105  9e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.661725  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2745  inner-membrane translocator  33.96 
 
 		 335 aa  105  1e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.80645 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2373  L-arabinose transporter permease protein  30.45 
 
 		 329 aa  105  1e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00546665  normal  0.130195 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0709  inner-membrane translocator  31 
 
 		 314 aa  105  1e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.999308  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7476  ABC transporter membrane spanning protein (sugar)  33.33 
 
 		 334 aa  105  1e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.202333  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4173  ribose ABC transporter permease protein  30.17 
 
 		 322 aa  104  2e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00211847  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1654  ABC transporter permease protein  30 
 
 		 344 aa  104  2e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3449  inner-membrane translocator  28.32 
 
 		 314 aa  104  2e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5736  inner-membrane translocator  31.6 
 
 		 315 aa  104  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.104967  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0516  ribose ABC transporter permease protein  30.67 
 
 		 324 aa  104  2e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0579  inner-membrane translocator  35.33 
 
 		 334 aa  104  2e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0563858  normal  0.638168 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3785  monosaccharide-transporting ATPase  32.76 
 
 		 337 aa  104  2e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0107495 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3523  inner-membrane translocator  26.63 
 
 		 355 aa  104  2e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3567  monosaccharide-transporting ATPase  32.62 
 
 		 332 aa  103  3e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0461102  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0115  ribose ABC transporter, permease protein  31.64 
 
 		 310 aa  103  4e-21  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2640  L-arabinose ABC transporter, permease protein  31.5 
 
 		 329 aa  103  4e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0418311  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3763  L-arabinose transporter permease protein  30.13 
 
 		 316 aa  103  4e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.139254  normal  0.990186 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4722  monosaccharide-transporting ATPase  31.23 
 
 		 335 aa  103  5e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.278194 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7366  ABC transporter membrane spanning protein (ribose)  31.66 
 
 		 325 aa  103  5e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0412  Monosaccharide-transporting ATPase  31.12 
 
 		 328 aa  103  5e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00266655  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2981  inner-membrane translocator  34.11 
 
 		 328 aa  102  6e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0921483  normal  0.0941351 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2853  inner-membrane translocator  30.14 
 
 		 317 aa  102  6e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.654587 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1398  inner-membrane translocator  32.82 
 
 		 334 aa  102  7e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00127371  normal  0.617276 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1370  ribose ABC transporter permease protein  31.4 
 
 		 323 aa  102  7e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.512196  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3775  L-arabinose transporter permease protein  31.02 
 
 		 315 aa  102  7e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.629082 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3336  inner-membrane translocator  33.33 
 
 		 346 aa  102  8e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4899  ribose ABC transporter permease protein  31.23 
 
 		 321 aa  102  9e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0818131  hitchhiker  0.000000774907 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4767  monosaccharide-transporting ATPase  27.72 
 
 		 320 aa  102  9e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.424997 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0052  ABC transporter, permease, sugar transport  27.34 
 
 		 332 aa  102  9e-21  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0182601  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3234  Monosaccharide-transporting ATPase  31.23 
 
 		 335 aa  102  9e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.197254  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4166  ribose ABC transporter permease protein  30.82 
 
 		 321 aa  101  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4275  ribose ABC transporter permease protein  30.82 
 
 		 321 aa  101  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4095  ribose ABC transporter permease protein  30.82 
 
 		 321 aa  101  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4216  ribose ABC transporter permease protein  30.82 
 
 		 321 aa  101  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.064291  normal  0.774246 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12300  monosaccharide ABC transporter membrane protein  31.64 
 
 		 309 aa  102  1e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  decreased coverage  0.00275786  normal  0.739873 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5318  inner-membrane translocator  33.09 
 
 		 315 aa  102  1e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.305006  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2247  L-arabinose transporter permease protein  27.73 
 
 		 327 aa  102  1e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000358536 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4110  ribose ABC transporter permease protein  30.82 
 
 		 321 aa  101  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.401971  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03636  ribose ABC transporter permease protein  30.59 
 
 		 321 aa  100  2e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0321266  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4217  Monosaccharide-transporting ATPase  30.59 
 
 		 321 aa  100  2e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4118  ribose ABC transporter permease protein  30.59 
 
 		 321 aa  100  2e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.129793 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3549  inner-membrane translocator  32.08 
 
 		 337 aa  100  2e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1575  ribose ABC transporter, permease protein  30.6 
 
 		 334 aa  100  2e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.136542  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>