More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_2783 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009484  Acry_2783  inner-membrane translocator  100 
 
 		 312 aa  586  1e-166  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.140737  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5317  inner-membrane translocator  46.05 
 
 		 313 aa  253  2.0000000000000002e-66  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.566323  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4646  inner-membrane translocator  47.7 
 
 		 316 aa  248  1e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5735  inner-membrane translocator  47.37 
 
 		 316 aa  246  3e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0600842  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3912  inner-membrane translocator  46.69 
 
 		 315 aa  244  1.9999999999999999e-63  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.246881  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1533  inner-membrane translocator  47.14 
 
 		 332 aa  213  2.9999999999999995e-54  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.691946  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4053  inner-membrane translocator  46.46 
 
 		 301 aa  182  5.0000000000000004e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.732892 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5160  inner-membrane translocator  47 
 
 		 328 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.201222  normal  0.841137 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2414  ribose ABC transporter (permease)  41.4 
 
 		 337 aa  163  3e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1072  inner-membrane translocator  40.14 
 
 		 317 aa  153  4e-36  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0954589  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1196  inner-membrane translocator  41.75 
 
 		 328 aa  144  2e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.352827 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2981  inner-membrane translocator  35.36 
 
 		 328 aa  113  5e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0921483  normal  0.0941351 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4115  monosaccharide-transporting ATPase  35.37 
 
 		 318 aa  107  3e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0591  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  34.94 
 
 		 347 aa  107  3e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0343543  normal  0.480724 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2592  monosaccharide-transporting ATPase  36.4 
 
 		 316 aa  100  4e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3645  inner-membrane translocator  35.39 
 
 		 327 aa  94.4  2e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1509  ribose ABC transporter, permease protein  35.68 
 
 		 330 aa  94  3e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.424015  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0886  ABC sugar transporter, inner-membrane subunit  34.19 
 
 		 337 aa  94  3e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0350071  normal  0.652921 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3549  inner-membrane translocator  34.19 
 
 		 337 aa  94  3e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4818  inner-membrane translocator  34.19 
 
 		 337 aa  94  3e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.414014  normal  0.232318 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5465  monosaccharide-transporting ATPase  34.19 
 
 		 337 aa  94  3e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.050328 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1613  monosaccharide-transporting ATPase  35.68 
 
 		 330 aa  94  3e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1759  ribose ABC transporter permease  35.68 
 
 		 330 aa  94  3e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.32812  hitchhiker  0.000062023 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4199  inner-membrane translocator  33.82 
 
 		 337 aa  93.6  4e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1987  monosaccharide-transporting ATPase  34.3 
 
 		 312 aa  93.2  6e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.589517  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0263  inner-membrane translocator  33.61 
 
 		 330 aa  92.8  6e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1138  inner-membrane translocator  31.95 
 
 		 328 aa  92.4  9e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3234  Monosaccharide-transporting ATPase  38.5 
 
 		 335 aa  91.3  2e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.197254  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6207  inner-membrane translocator  33.08 
 
 		 341 aa  90.5  3e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.729739 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1965  inner-membrane translocator  33.08 
 
 		 341 aa  90.5  3e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.389843  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4722  monosaccharide-transporting ATPase  37 
 
 		 335 aa  90.5  3e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.278194 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4601  Monosaccharide-transporting ATPase  33.46 
 
 		 341 aa  90.1  4e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.841849 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2788  ABC-type transporter for ribose/xylose/arabinose/galactoside systems, permease protein  29.55 
 
 		 314 aa  89.7  5e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0544071  normal  0.614175 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0412  Monosaccharide-transporting ATPase  28.92 
 
 		 328 aa  89.7  6e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00266655  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2840  monosaccharide-transporting ATPase  34.43 
 
 		 332 aa  89.7  6e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3785  monosaccharide-transporting ATPase  32.83 
 
 		 337 aa  89.4  8e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0107495 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2597  inner-membrane translocator  33.47 
 
 		 330 aa  88.2  1e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.443228  normal  0.425979 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1398  inner-membrane translocator  32.93 
 
 		 334 aa  87.8  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00127371  normal  0.617276 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0395  inner-membrane translocator  35.9 
 
 		 315 aa  87.8  2e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.853202  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2189  Monosaccharide-transporting ATPase  37.55 
 
 		 325 aa  87  4e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0563  monosaccharide-transporting ATPase  32.52 
 
 		 311 aa  86.7  4e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000352632  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3735  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  35.21 
 
 		 336 aa  86.7  4e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.282869  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3468  inner-membrane translocator  35.21 
 
 		 336 aa  86.7  4e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0342  inner-membrane translocator  39.7 
 
 		 326 aa  86.7  5e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.770654  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1458  Monosaccharide-transporting ATPase  34.44 
 
 		 333 aa  86.7  5e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0717887 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0718  inner-membrane translocator  33.09 
 
 		 341 aa  85.9  7e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.303584  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2302  inner-membrane translocator  32.44 
 
 		 327 aa  85.9  8e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0887388 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0725  ribose ABC transporter, permease protein  32.17 
 
 		 311 aa  85.1  0.000000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.35469e-35 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0582  monosaccharide-transporting ATPase  32.17 
 
 		 311 aa  85.5  0.000000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2077  inner-membrane translocator  34.25 
 
 		 333 aa  85.1  0.000000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00110578 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0736  ribose ABC transporter, permease protein  32.17 
 
 		 311 aa  84.3  0.000000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0635  ribose ABC transporter permease  32.17 
 
 		 311 aa  84.7  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0578  ribose ABC transporter, permease  32.17 
 
 		 311 aa  84.3  0.000000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0535816  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1652  inner-membrane translocator  33.94 
 
 		 340 aa  84.3  0.000000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0718181  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0700  ribose ABC transporter, permease protein  32.17 
 
 		 311 aa  84.3  0.000000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0973921  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0668  ribose ABC transporter permease  32.17 
 
 		 311 aa  84.7  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2278  inner-membrane translocator  32.14 
 
 		 309 aa  84.3  0.000000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.568654  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4638  ribose ABC transporter, permease protein  32.17 
 
 		 311 aa  84.3  0.000000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0801722  unclonable  4.6789e-26 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0580  inner-membrane translocator  32.34 
 
 		 329 aa  84.3  0.000000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.00103432  normal  0.838313 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3352  hypothetical protein  34.86 
 
 		 336 aa  84.7  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.913341  normal  0.18018 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0579  ribose ABC transporter, permease  31.82 
 
 		 311 aa  84  0.000000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0502  monosaccharide-transporting ATPase  34.17 
 
 		 333 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00475125 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2642  inner-membrane translocator  33.08 
 
 		 348 aa  84.3  0.000000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.769134  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2982  monosaccharide-transporting ATPase  37.2 
 
 		 323 aa  84  0.000000000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.018273  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2641  inner-membrane translocator  32.82 
 
 		 338 aa  83.6  0.000000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2605  Monosaccharide-transporting ATPase  31.98 
 
 		 336 aa  83.6  0.000000000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.467417  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0709  inner-membrane translocator  33.2 
 
 		 314 aa  83.6  0.000000000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.999308  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2116  monosaccharide-transporting ATPase  32.17 
 
 		 340 aa  83.6  0.000000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.326273  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0797  ribose ABC transporter, permease protein  31.82 
 
 		 311 aa  83.2  0.000000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000530424  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0456  ribose/xylose/arabinose/galactoside ABC-type transporter permease  33.68 
 
 		 310 aa  83.2  0.000000000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0361  carbohydrate ABC transporter permease  33.68 
 
 		 310 aa  83.2  0.000000000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2714  sugar ABC transporter, permease  30.1 
 
 		 338 aa  82.8  0.000000000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.953176  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1400  D-ribose transport system permease protein  34.05 
 
 		 327 aa  83.2  0.000000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.151364 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2853  inner-membrane translocator  33.72 
 
 		 317 aa  82.8  0.000000000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.654587 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2299  inner-membrane translocator  34.74 
 
 		 335 aa  82.8  0.000000000000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0163581  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0690  Monosaccharide-transporting ATPase  33.09 
 
 		 348 aa  82.8  0.000000000000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0715844 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1466  inner-membrane translocator  35.32 
 
 		 342 aa  82  0.00000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.613245  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1738  inner-membrane translocator  26.74 
 
 		 337 aa  82  0.00000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3217  ribose transport system permease protein RbsC  31.76 
 
 		 334 aa  81.3  0.00000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.961558  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1914  inner-membrane translocator  33.22 
 
 		 328 aa  81.6  0.00000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2424  ribose ABC transporter, permease protein  33.33 
 
 		 331 aa  80.9  0.00000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3078  ribose ABC transporter permease  33.33 
 
 		 331 aa  80.9  0.00000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1048  inner-membrane translocator  29.84 
 
 		 328 aa  80.9  0.00000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2521  monosaccharide-transporting ATPase  33.33 
 
 		 331 aa  80.9  0.00000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0115  ribose ABC transporter, permease protein  30.13 
 
 		 310 aa  80.5  0.00000000000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2764  ribose ABC transporter permease  30.1 
 
 		 338 aa  80.9  0.00000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.340533  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4135  inner-membrane translocator  31.85 
 
 		 321 aa  80.5  0.00000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2431  (monosaccharide) transport system permease protein  32.65 
 
 		 328 aa  80.9  0.00000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.790241  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1921  inner-membrane translocator  29.09 
 
 		 354 aa  80.9  0.00000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.748893  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0922  monosaccharide-transporting ATPase  30.15 
 
 		 309 aa  80.5  0.00000000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1881  ribose ABC transporter, permease protein  30.99 
 
 		 311 aa  80.5  0.00000000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0277317  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2998  inner-membrane translocator  32.2 
 
 		 343 aa  79.7  0.00000000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1339  inner-membrane translocator  32.2 
 
 		 343 aa  79.7  0.00000000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.698639  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3336  inner-membrane translocator  33.21 
 
 		 346 aa  79.7  0.00000000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2448  inner-membrane translocator  28.91 
 
 		 327 aa  79.7  0.00000000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0992718  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0369  inner-membrane translocator  29.15 
 
 		 354 aa  79.3  0.00000000000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.823115  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2739  inner-membrane translocator  32.03 
 
 		 339 aa  79.3  0.00000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.86731 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2694  sugar ABC transporter, permease  29.76 
 
 		 338 aa  79.3  0.00000000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.273875  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3822  monosaccharide-transporting ATPase  30.48 
 
 		 328 aa  79.3  0.00000000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.479121  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2432  putative binding-protein-dependent transport system permease  31.42 
 
 		 327 aa  79  0.00000000000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>