More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_3431 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_3431  inner-membrane translocator  100 
 
 		 345 aa  652    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00119664  hitchhiker  0.000332917 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1062  inner-membrane translocator  33.04 
 
 		 345 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.379015  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1542  inner-membrane translocator  33.04 
 
 		 345 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2807  inner-membrane translocator  32.43 
 
 		 338 aa  121  9.999999999999999e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1518  monosaccharide-transporting ATPase  32.75 
 
 		 345 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0853941  normal  0.0193721 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1712  monosaccharide-transporting ATPase  33.91 
 
 		 345 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0294222 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4682  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  34.28 
 
 		 345 aa  119  6e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.377068  normal  0.145685 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5811  Monosaccharide-transporting ATPase  33.11 
 
 		 333 aa  118  9.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0999426  normal  0.0839503 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6712  inner-membrane translocator  33.11 
 
 		 333 aa  118  9.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.769833 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1424  inner-membrane translocator  33.96 
 
 		 345 aa  117  3e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0888  inner-membrane translocator  33.66 
 
 		 319 aa  117  3.9999999999999997e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.174254  normal  0.753414 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1464  monosaccharide-transporting ATPase  33.96 
 
 		 345 aa  116  5e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.987014  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4185  Monosaccharide-transporting ATPase  31.13 
 
 		 342 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000488874 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2491  inner-membrane translocator  29.7 
 
 		 405 aa  115  1.0000000000000001e-24  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1337  amino acid or sugar ABC transport system, permease protein  30.68 
 
 		 333 aa  114  3e-24  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.485159 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0285  carbohydrate ABC transporter permease  31.66 
 
 		 344 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0196  carbohydrate ABC transporter permease  31.66 
 
 		 344 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1792  sugar ABC transporter, permease protein  32.11 
 
 		 835 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0115  ribose ABC transporter, permease protein  33.56 
 
 		 310 aa  112  9e-24  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01060  monosaccharide ABC transporter membrane protein  33.11 
 
 		 336 aa  111  1.0000000000000001e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4659  monosaccharide-transporting ATPase  30.77 
 
 		 331 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2739  inner-membrane translocator  30.95 
 
 		 339 aa  110  3e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.86731 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0456  ribose/xylose/arabinose/galactoside ABC-type transporter permease  31.95 
 
 		 310 aa  110  3e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0361  carbohydrate ABC transporter permease  31.95 
 
 		 310 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7025  monosaccharide-transporting ATPase  31.27 
 
 		 335 aa  110  5e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.560665  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1654  ABC transporter permease protein  31.97 
 
 		 344 aa  109  7.000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0290  monosaccharide-transporting ATPase  30.23 
 
 		 331 aa  109  8.000000000000001e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1652  inner-membrane translocator  31.38 
 
 		 340 aa  108  1e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0718181  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2030  inner-membrane translocator  32.25 
 
 		 356 aa  108  1e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.9286  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1914  inner-membrane translocator  33.89 
 
 		 328 aa  108  1e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0504  inner-membrane translocator  30.33 
 
 		 357 aa  108  1e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3417  inner-membrane translocator  33.45 
 
 		 316 aa  108  1e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.254798  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2592  monosaccharide-transporting ATPase  32.53 
 
 		 316 aa  107  2e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3089  inner-membrane translocator  31.19 
 
 		 337 aa  105  1e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0871348  normal  0.381344 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1030  monosaccharide-transporting ATPase  30.98 
 
 		 341 aa  105  1e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.608545 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1642  Monosaccharide-transporting ATPase  30.85 
 
 		 317 aa  104  2e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000000622557  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0563  monosaccharide-transporting ATPase  31.39 
 
 		 311 aa  105  2e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000352632  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0210  ribose ABC transporter, permease protein  30.49 
 
 		 339 aa  103  3e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2570  inner-membrane translocator  32.2 
 
 		 325 aa  103  5e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4552  D-allose transporter subunit  29.97 
 
 		 326 aa  103  5e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0845  Monosaccharide-transporting ATPase  34.56 
 
 		 320 aa  103  6e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.102065  normal  0.0278084 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4919  L-arabinose transporter permease protein  27.98 
 
 		 339 aa  103  6e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.259607  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0718  inner-membrane translocator  32.06 
 
 		 341 aa  103  6e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.303584  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4849  inner-membrane translocator  29.67 
 
 		 325 aa  103  6e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.361402  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03958  D-allose transporter subunit  29.65 
 
 		 326 aa  102  7e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3905  Monosaccharide-transporting ATPase  29.65 
 
 		 326 aa  102  7e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3940  D-allose transporter subunit  29.65 
 
 		 326 aa  102  7e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03918  hypothetical protein  29.65 
 
 		 326 aa  102  7e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0288  inner-membrane translocator  30.84 
 
 		 331 aa  102  8e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.247958 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2942  Monosaccharide-transporting ATPase  29.81 
 
 		 332 aa  102  8e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.868986 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1987  monosaccharide-transporting ATPase  28.12 
 
 		 312 aa  102  9e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.589517  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6711  sugar ABC transporter membrane protein  33.53 
 
 		 346 aa  102  1e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.629939  normal  0.227307 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2442  ABC transporter permease  32.1 
 
 		 348 aa  102  1e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.986757  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4097  sugar transport system permease  31.78 
 
 		 330 aa  102  1e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0126  monosaccharide-transporting ATPase  31.78 
 
 		 330 aa  102  1e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4187  Monosaccharide-transporting ATPase  33.01 
 
 		 319 aa  102  1e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.837303  hitchhiker  0.00079828 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4029  ribose ABC transporter, permease protein  31.78 
 
 		 330 aa  102  1e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2523  inner-membrane translocator  32.57 
 
 		 313 aa  101  1e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3429  inner-membrane translocator  29.75 
 
 		 343 aa  101  2e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00479151  hitchhiker  0.0000975841 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4336  Monosaccharide-transporting ATPase  31.75 
 
 		 340 aa  101  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.895812  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4227  monosaccharide-transporting ATPase  30.1 
 
 		 326 aa  100  3e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1881  ribose ABC transporter, permease protein  32.43 
 
 		 311 aa  100  3e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0277317  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5474  L-arabinose transporter permease protein  28.01 
 
 		 335 aa  100  3e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0452809 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2513  inner-membrane translocator  30.52 
 
 		 328 aa  100  3e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.587124  normal  0.279488 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3061  monosaccharide-transporting ATPase  30.93 
 
 		 355 aa  100  4e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1374  inner-membrane translocator  32.15 
 
 		 350 aa  100  4e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.161757  normal  0.147375 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0945  Monosaccharide-transporting ATPase  28.48 
 
 		 335 aa  100  5e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.0035821  normal  0.067207 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0880  Monosaccharide-transporting ATPase  28.79 
 
 		 335 aa  100  5e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0333312  normal  0.303688 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2278  inner-membrane translocator  30.66 
 
 		 309 aa  100  5e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.568654  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3208  L-arabinose transporter permease protein  26.41 
 
 		 339 aa  100  5e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0500809 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0275  inner-membrane translocator  27.87 
 
 		 323 aa  100  5e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8211  monosaccharide-transporting ATPase  29.94 
 
 		 337 aa  99.4  7e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2283  monosaccharide-transporting ATPase  29.9 
 
 		 345 aa  99.4  7e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.303171  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2908  inner-membrane translocator  31.23 
 
 		 330 aa  99.8  7e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.701792  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0893  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  29.91 
 
 		 328 aa  99.4  8e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1133  monosaccharide-transporting ATPase  31.48 
 
 		 359 aa  99.4  8e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000291616  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3181  monosaccharide-transporting ATPase  31.25 
 
 		 348 aa  99.4  8e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0793432 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2456  monosaccharide-transporting ATPase  29.14 
 
 		 331 aa  99.4  9e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0582  monosaccharide-transporting ATPase  29.97 
 
 		 311 aa  99.4  9e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3234  monosaccharide-transporting ATPase  29.14 
 
 		 331 aa  99  1e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.113216  normal  0.797673 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4777  Monosaccharide-transporting ATPase  32.3 
 
 		 311 aa  98.6  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4599  inner-membrane translocator  30.51 
 
 		 340 aa  98.6  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.033778 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2809  monosaccharide-transporting ATPase  28.7 
 
 		 337 aa  99  1e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5220  L-arabinose transporter permease protein  26.79 
 
 		 341 aa  98.6  1e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4526  ribose ABC transporter permease protein  29.87 
 
 		 322 aa  99  1e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000584894  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5639  L-arabinose transporter permease protein  26.79 
 
 		 341 aa  98.6  1e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.356357  normal  0.0453459 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2431  (monosaccharide) transport system permease protein  30 
 
 		 328 aa  99  1e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.790241  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0539  inner-membrane translocator  30.28 
 
 		 322 aa  98.6  1e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2131  inner-membrane translocator  29.01 
 
 		 338 aa  99  1e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.440295 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1962  monosaccharide-transporting ATPase  27.78 
 
 		 353 aa  98.2  2e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0698409  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1852  ribose ABC transporter, permease protein  27.78 
 
 		 353 aa  97.8  2e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0389  ribose transport system permease protein rbsC  31.83 
 
 		 357 aa  98.2  2e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.995697 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3568  monosaccharide-transporting ATPase  30.24 
 
 		 332 aa  98.2  2e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1626  L-arabinose transporter permease protein  28.87 
 
 		 339 aa  98.2  2e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2404  inner-membrane translocator  32.69 
 
 		 315 aa  98.2  2e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.72307 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3130  inner-membrane translocator  29.35 
 
 		 333 aa  97.8  2e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0780017  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4638  inner-membrane translocator  31.21 
 
 		 327 aa  98.2  2e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4865  inner-membrane translocator  30.75 
 
 		 333 aa  98.2  2e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4219  L-arabinose transporter permease protein  27.43 
 
 		 338 aa  97.4  3e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.645331 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0700  ribose ABC transporter, permease protein  29.64 
 
 		 311 aa  97.4  3e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0973921  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>