More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_4185 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010676  Bphyt_4185  Monosaccharide-transporting ATPase  100 
 
 		 342 aa  655    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000488874 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0886  inner-membrane translocator  83.39 
 
 		 331 aa  493  9.999999999999999e-139  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.689512  normal  0.453437 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3429  inner-membrane translocator  37.68 
 
 		 343 aa  209  4e-53  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00479151  hitchhiker  0.0000975841 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0888  inner-membrane translocator  34.58 
 
 		 319 aa  162  7e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.174254  normal  0.753414 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4187  Monosaccharide-transporting ATPase  38.32 
 
 		 319 aa  152  8e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.837303  hitchhiker  0.00079828 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4849  inner-membrane translocator  37.19 
 
 		 325 aa  150  3e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.361402  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2121  Monosaccharide-transporting ATPase  32.56 
 
 		 350 aa  149  9e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.83989 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2807  inner-membrane translocator  34.32 
 
 		 338 aa  146  5e-34  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3089  inner-membrane translocator  31.55 
 
 		 337 aa  146  6e-34  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0871348  normal  0.381344 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3417  inner-membrane translocator  35.86 
 
 		 316 aa  145  9e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.254798  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2283  monosaccharide-transporting ATPase  32.95 
 
 		 345 aa  144  2e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.303171  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2214  inner-membrane translocator  34.74 
 
 		 324 aa  143  4e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.543943 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2031  L-arabinose transporter permease protein  31.89 
 
 		 328 aa  142  6e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.192716  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1642  Monosaccharide-transporting ATPase  32.37 
 
 		 317 aa  142  6e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000000622557  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2247  L-arabinose transporter permease protein  31.72 
 
 		 327 aa  142  9.999999999999999e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000358536 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1997  L-arabinose transporter permease protein  33.57 
 
 		 349 aa  142  9.999999999999999e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.254059  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2331  L-arabinose transporter permease protein  31.89 
 
 		 328 aa  142  9.999999999999999e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.266483  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1883  L-arabinose transporter permease protein  33.57 
 
 		 349 aa  142  9.999999999999999e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1652  inner-membrane translocator  35.61 
 
 		 340 aa  141  1.9999999999999998e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0718181  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2263  L-arabinose transporter permease protein  33.21 
 
 		 349 aa  141  1.9999999999999998e-32  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1424  inner-membrane translocator  33.04 
 
 		 345 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6250  inner-membrane translocator  32.56 
 
 		 335 aa  141  1.9999999999999998e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.862039  normal  0.813312 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0288  inner-membrane translocator  32.06 
 
 		 331 aa  140  3.9999999999999997e-32  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.247958 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0814  monosaccharide-transporting ATPase  30.87 
 
 		 327 aa  139  4.999999999999999e-32  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0814  sugar ABC transporter, permease protein  30.87 
 
 		 327 aa  139  4.999999999999999e-32  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1464  monosaccharide-transporting ATPase  32.75 
 
 		 345 aa  139  6e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.987014  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2302  inner-membrane translocator  32.83 
 
 		 327 aa  139  6e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0887388 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3204  inner-membrane translocator  33.82 
 
 		 348 aa  138  1e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.0000146759  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4121  inner-membrane translocator  32.63 
 
 		 328 aa  138  1e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.49492  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1921  inner-membrane translocator  34.7 
 
 		 354 aa  138  1e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.748893  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1030  monosaccharide-transporting ATPase  33.24 
 
 		 341 aa  137  2e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.608545 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1712  monosaccharide-transporting ATPase  34.01 
 
 		 345 aa  137  2e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0294222 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0290  monosaccharide-transporting ATPase  32.53 
 
 		 331 aa  137  3.0000000000000003e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4682  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  32.17 
 
 		 345 aa  136  5e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.377068  normal  0.145685 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1910  L-arabinose transporter permease protein  31.33 
 
 		 328 aa  135  9e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2804  inner-membrane translocator  30.19 
 
 		 324 aa  135  9.999999999999999e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.500539  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0700  ribose ABC transporter, permease protein  32.26 
 
 		 311 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0973921  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4638  ribose ABC transporter, permease protein  32.26 
 
 		 311 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0801722  unclonable  4.6789e-26 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0736  ribose ABC transporter, permease protein  32.26 
 
 		 311 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0578  ribose ABC transporter, permease  32.26 
 
 		 311 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0535816  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1518  monosaccharide-transporting ATPase  32.17 
 
 		 345 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0853941  normal  0.0193721 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1062  inner-membrane translocator  32.17 
 
 		 345 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.379015  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1542  inner-membrane translocator  32.17 
 
 		 345 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1049  inner-membrane translocator  33.03 
 
 		 340 aa  134  1.9999999999999998e-30  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.186781  normal  0.0406542 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0539  inner-membrane translocator  35.96 
 
 		 322 aa  134  1.9999999999999998e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0156  sugar ABC transporter permease  31.21 
 
 		 326 aa  134  1.9999999999999998e-30  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000155105 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0579  ribose ABC transporter, permease  31.94 
 
 		 311 aa  134  3e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1826  inner-membrane translocator  34.62 
 
 		 336 aa  134  3e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0911886  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0196  carbohydrate ABC transporter permease  34.71 
 
 		 344 aa  134  3e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0563  monosaccharide-transporting ATPase  31.94 
 
 		 311 aa  134  3e-30  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000352632  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0285  carbohydrate ABC transporter permease  34.71 
 
 		 344 aa  134  3e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0582  monosaccharide-transporting ATPase  31.94 
 
 		 311 aa  133  3.9999999999999996e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0725  ribose ABC transporter, permease protein  31.94 
 
 		 311 aa  133  3.9999999999999996e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.35469e-35 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2222  monosaccharide-transporting ATPase  34.36 
 
 		 319 aa  133  3.9999999999999996e-30  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.294 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0797  ribose ABC transporter, permease protein  31.94 
 
 		 311 aa  133  5e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000530424  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1400  D-ribose transport system permease protein  36.77 
 
 		 327 aa  133  5e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.151364 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1902  inner-membrane translocator  33.77 
 
 		 319 aa  133  5e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0227487  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0635  ribose ABC transporter permease  31.94 
 
 		 311 aa  132  6e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0668  ribose ABC transporter permease  31.94 
 
 		 311 aa  132  6e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4919  L-arabinose transporter permease protein  30 
 
 		 339 aa  132  6e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.259607  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2278  inner-membrane translocator  33.91 
 
 		 309 aa  132  6.999999999999999e-30  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.568654  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0614  inner-membrane translocator  31.75 
 
 		 331 aa  131  1.0000000000000001e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5474  L-arabinose transporter permease protein  30.03 
 
 		 335 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0452809 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2635  L-arabinose transporter permease protein  30.32 
 
 		 328 aa  131  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.348948  hitchhiker  0.00000000000485021 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0769  ribose transport system permease  32.7 
 
 		 342 aa  131  2.0000000000000002e-29  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00219185  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0456  ribose/xylose/arabinose/galactoside ABC-type transporter permease  34.92 
 
 		 310 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0361  carbohydrate ABC transporter permease  34.92 
 
 		 310 aa  130  3e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3976  ribose ABC transporter permease protein  31.75 
 
 		 322 aa  130  3e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.144441  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4526  ribose ABC transporter permease protein  32.59 
 
 		 322 aa  130  3e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000584894  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1023  L-arabinose transporter permease protein  30.32 
 
 		 328 aa  130  4.0000000000000003e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3880  sugar transport system permease  33.67 
 
 		 334 aa  130  4.0000000000000003e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0490565 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0965  monosaccharide-transporting ATPase  34.69 
 
 		 342 aa  130  4.0000000000000003e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3353  inner-membrane translocator  35.71 
 
 		 319 aa  130  4.0000000000000003e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0911  ribose ABC transporter, permease protein  34.69 
 
 		 342 aa  130  4.0000000000000003e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4236  ribose ABC transporter permease protein  34.01 
 
 		 322 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.000913636  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1287  L-arabinose transporter permease protein  30.32 
 
 		 328 aa  130  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00785622  hitchhiker  0.000000602764 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2130  L-arabinose transporter permease protein  30.32 
 
 		 328 aa  130  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000455443  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01867  fused L-arabinose transporter subunits of ABC superfamily: membrane components  30.32 
 
 		 329 aa  130  5.0000000000000004e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1744  Monosaccharide-transporting ATPase  30.32 
 
 		 328 aa  130  5.0000000000000004e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.629454  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01856  hypothetical protein  30.32 
 
 		 329 aa  130  5.0000000000000004e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1736  L-arabinose transporter permease protein  30.32 
 
 		 328 aa  130  5.0000000000000004e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.612736  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1995  L-arabinose transporter permease protein  30.32 
 
 		 328 aa  130  5.0000000000000004e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00340389  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3336  inner-membrane translocator  30.91 
 
 		 346 aa  129  6e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1654  ABC transporter permease protein  34.71 
 
 		 344 aa  129  7.000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0210  ribose ABC transporter, permease protein  34.32 
 
 		 339 aa  129  7.000000000000001e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5220  L-arabinose transporter permease protein  29.82 
 
 		 341 aa  129  7.000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5639  L-arabinose transporter permease protein  29.82 
 
 		 341 aa  129  7.000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.356357  normal  0.0453459 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4348  inner-membrane translocator  37.01 
 
 		 348 aa  129  8.000000000000001e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02438  predicted sugar transporter subunit: membrane component of ABC superfamily  35.46 
 
 		 332 aa  128  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1122  Monosaccharide-transporting ATPase  35.46 
 
 		 332 aa  128  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4590  L-arabinose transporter permease protein  30.5 
 
 		 337 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00280966 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3765  inner-membrane translocator  33.65 
 
 		 306 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00344833  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02402  hypothetical protein  35.46 
 
 		 332 aa  128  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2831  putative sugar ABC transporter, permease protein  35.46 
 
 		 332 aa  128  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3593  monosaccharide-transporting ATPase  36.39 
 
 		 329 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.225998  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0718  inner-membrane translocator  35.61 
 
 		 341 aa  128  1.0000000000000001e-28  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.303584  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1087  inner-membrane translocator  34 
 
 		 339 aa  128  1.0000000000000001e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.10708 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2147  L-arabinose transporter permease protein  29.87 
 
 		 328 aa  128  2.0000000000000002e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3217  ribose transport system permease protein RbsC  33.12 
 
 		 334 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.961558  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3707  inner-membrane translocator  34.5 
 
 		 335 aa  128  2.0000000000000002e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.480101  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>