More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A3360 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007347  Reut_A3360  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  100 
 
 		 303 aa  609  1e-173  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3509  LysR family transcriptional regulator  76.57 
 
 		 300 aa  471  1e-132  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.138319 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5473  LysR family transcriptional regulator  51.85 
 
 		 307 aa  276  3e-73  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0783  transcriptional regulator, LysR family  50.66 
 
 		 300 aa  273  3e-72  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.530493  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0854  LysR family transcriptional regulator  50.83 
 
 		 300 aa  272  5.000000000000001e-72  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5220  LysR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 308 aa  225  6e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.329091 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0983  LysR family transcriptional regulator  42.91 
 
 		 300 aa  225  7e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.288934  normal  0.0876373 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1019  LysR family transcriptional regulator  43.34 
 
 		 297 aa  220  1.9999999999999999e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3679  LysR family transcriptional regulator  41.31 
 
 		 310 aa  219  5e-56  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0878  LysR family transcriptional regulator  40.2 
 
 		 336 aa  197  2.0000000000000003e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.277281 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5204  transcriptional regulator, LysR family  38.87 
 
 		 309 aa  190  2e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.647866  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3347  transcriptional regulator, LysR family  39.39 
 
 		 308 aa  184  2.0000000000000003e-45  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0221177  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3949  LysR family transcriptional regulator  38.87 
 
 		 296 aa  184  2.0000000000000003e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.211824  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3997  LysR family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 308 aa  184  2.0000000000000003e-45  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.494365 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4357  LysR family transcriptional regulator  35.81 
 
 		 303 aa  181  1e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.67748 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0350  LysR family transcriptional regulator  40.2 
 
 		 298 aa  179  4e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1824  LysR family transcriptional regulator  40.2 
 
 		 298 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.381841  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1113  LysR family transcriptional regulator  40.2 
 
 		 298 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.379059  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2086  LysR family transcriptional regulator  40.2 
 
 		 298 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0822  LysR family transcriptional regulator  40.2 
 
 		 298 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4782  LysR family transcriptional regulator  40.07 
 
 		 298 aa  179  5.999999999999999e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.319472  normal  0.896768 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1783  LysR family transcriptional regulator  40.4 
 
 		 298 aa  179  7e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0444  LysR family transcriptional regulator  39.87 
 
 		 298 aa  177  2e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.641872  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5489  LysR family transcriptional regulator  39.74 
 
 		 298 aa  176  5e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.407046  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5371  LysR family transcriptional regulator  39.74 
 
 		 298 aa  176  5e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2443  DNA-binding transcriptional activator GcvA  36.91 
 
 		 300 aa  175  9.999999999999999e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.586469  normal  0.671238 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3485  transcriptional regulator, LysR family  36.18 
 
 		 305 aa  167  2e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1341  transcriptional regulator, LysR family  37.5 
 
 		 305 aa  166  4e-40  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.281725  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5716  transcriptional regulator LysR family  36.61 
 
 		 299 aa  166  6.9999999999999995e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0340323  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2171  LysR family transcriptional regulator  35.12 
 
 		 304 aa  164  1.0000000000000001e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5015  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  35.79 
 
 		 328 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.46519  normal  0.168867 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2519  LysR family transcriptional regulator  36.93 
 
 		 305 aa  164  2.0000000000000002e-39  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.543102  hitchhiker  0.00756718 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24960  LysR family transcriptional regulator protein  35.45 
 
 		 304 aa  163  3e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5808  LysR family transcriptional regulator  36.18 
 
 		 296 aa  162  4.0000000000000004e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0906  LysR family transcriptional regulator  32.87 
 
 		 310 aa  160  2e-38  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0418  transcriptional regulator, LysR family  38.41 
 
 		 298 aa  160  3e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3737  DNA-binding transcriptional activator GcvA  36 
 
 		 314 aa  160  3e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.42879  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1725  LysR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 326 aa  160  3e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2208  LysR family transcriptional regulator  36.51 
 
 		 315 aa  159  4e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.860838  normal  0.101243 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6038  LysR family transcriptional regulator  35.84 
 
 		 330 aa  159  5e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.904291  normal  0.627469 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1048  LysR family transcriptional regulator  32.53 
 
 		 310 aa  159  6e-38  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.540636  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3156  LysR family transcriptional regulator  34.36 
 
 		 297 aa  159  7e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.636908  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1461  LysR family transcriptional regulator  32.53 
 
 		 310 aa  159  7e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5069  LysR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 302 aa  159  7e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00568872  normal  0.0350365 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05850  LysR family transcriptional regulator  34.11 
 
 		 302 aa  158  9e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0550  putative transcriptional regulator  33.78 
 
 		 302 aa  158  1e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.540128  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5907  transcriptional regulator LysR family  33.45 
 
 		 305 aa  158  1e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2978  LysR family transcriptional regulator  37.06 
 
 		 317 aa  157  2e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3282  LysR family transcriptional regulator  34.12 
 
 		 294 aa  157  2e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.355799  normal  0.889807 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5573  LysR family transcriptional regulator  35.39 
 
 		 301 aa  157  2e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1256  LysR family transcriptional regulator  32.88 
 
 		 310 aa  157  2e-37  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.196796  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3604  LysR family transcriptional regulator  33.9 
 
 		 323 aa  156  3e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1086  LysR family transcriptional regulator  32.18 
 
 		 310 aa  157  3e-37  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.404999  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5462  transcriptional regulator, LysR family  34.01 
 
 		 306 aa  157  3e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.278821  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0116  LysR family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 299 aa  156  4e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.734759  normal  0.979022 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4635  LysR family transcriptional regulator  35.41 
 
 		 307 aa  156  4e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.258134  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4415  LysR family transcriptional regulator  36.24 
 
 		 295 aa  155  5.0000000000000005e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1672  LysR family transcriptional regulator  35.28 
 
 		 331 aa  155  7e-37  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.324341  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0083  DNA-binding transcriptional activator GcvA  35.74 
 
 		 309 aa  155  8e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.363159  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7137  DNA-binding transcriptional activator GcvA  35.81 
 
 		 306 aa  155  9e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.126779  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0157  LysR family transcriptional regulator  33.01 
 
 		 305 aa  155  1e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000802537 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3787  transcriptional regulator, LysR family  35.99 
 
 		 300 aa  154  1e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5325  LysR family transcriptional regulator  35.23 
 
 		 301 aa  154  1e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.972364  normal  0.036575 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2406  transcriptional regulator, LysR family  36.74 
 
 		 317 aa  154  1e-36  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0176  LysR family transcriptional regulator  33 
 
 		 305 aa  154  1e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.175853  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4049  LysR family transcriptional regulator  34.69 
 
 		 290 aa  154  1e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.769313  normal  0.721068 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3250  transcriptional regulator, LysR family  36.86 
 
 		 314 aa  154  1e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.228941  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4988  LysR family transcriptional regulator  33.78 
 
 		 399 aa  154  2e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.225998  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1449  LysR family transcriptional regulator  35.52 
 
 		 305 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.828927  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7705  LysR family transcriptional regulator  34.13 
 
 		 317 aa  153  4e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.728095  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5786  LysR family transcriptional regulator  35.15 
 
 		 330 aa  152  5e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6151  LysR family transcriptional regulator  35.15 
 
 		 330 aa  152  5e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.410647  normal  0.467276 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6674  LysR family transcriptional regulator  35.49 
 
 		 296 aa  152  5.9999999999999996e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.143364 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2531  transcriptional regulator, LysR family  35.29 
 
 		 295 aa  152  8.999999999999999e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0325  DNA-binding transcriptional activator GcvA  37.16 
 
 		 320 aa  151  1e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4116  transcriptional regulator, LysR family  36.03 
 
 		 300 aa  151  1e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0174  LysR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 305 aa  151  1e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.117248  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4920  transcriptional regulator, LysR family  33.22 
 
 		 301 aa  150  2e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4080  LysR family transcriptional regulator  31.33 
 
 		 304 aa  150  2e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2866  transcriptional regulator, LysR family  34.59 
 
 		 298 aa  150  3e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.490862  normal  0.457382 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0743  LysR family transcriptional regulator  32.21 
 
 		 301 aa  150  3e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.876946 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2690  LysR family transcriptional regulator  34.23 
 
 		 316 aa  150  3e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4071  LysR family transcriptional regulator  36.45 
 
 		 310 aa  150  3e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6631  LysR family transcriptional regulator  34.47 
 
 		 343 aa  150  3e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5664  LysR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 306 aa  150  3e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0318296 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6082  LysR family transcriptional regulator  34.59 
 
 		 329 aa  149  4e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1251  LysR family transcriptional regulator  34.68 
 
 		 300 aa  149  4e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.255094 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6198  LysR family transcriptional regulator  35.4 
 
 		 296 aa  149  5e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0533844 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5831  LysR family transcriptional regulator  35.4 
 
 		 296 aa  149  5e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3409  LysR family transcriptional regulator  34.23 
 
 		 317 aa  149  6e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.690541  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0117  transcriptional regulator, LysR family  33.89 
 
 		 302 aa  149  7e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.476103  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0669  transcriptional regulator LysR family  34.9 
 
 		 299 aa  149  7e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1035  LysR family transcriptional regulator  30.45 
 
 		 317 aa  148  9e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.919804 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0596  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  32.89 
 
 		 301 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.327486 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5160  LysR family transcriptional regulator  34.23 
 
 		 317 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.709796 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6525  LysR family transcriptional regulator  35.05 
 
 		 301 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0823  transcriptional regulator, LysR family  31.89 
 
 		 301 aa  148  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3138  transcriptional regulator, LysR family  34.25 
 
 		 298 aa  148  1.0000000000000001e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.224221  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5241  LysR family transcriptional regulator  33.89 
 
 		 317 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.11151  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5998  LysR family transcriptional regulator  35.27 
 
 		 300 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.123891  normal  0.186417 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>