More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_3679 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008752  Aave_3679  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 310 aa  632  1e-180  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5220  LysR family transcriptional regulator  59.16 
 
 		 308 aa  366  1e-100  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.329091 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3360  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  41.31 
 
 		 303 aa  219  5e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0854  LysR family transcriptional regulator  41.95 
 
 		 300 aa  207  1e-52  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0783  transcriptional regulator, LysR family  41.95 
 
 		 300 aa  208  1e-52  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.530493  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5473  LysR family transcriptional regulator  39.73 
 
 		 307 aa  202  5e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3509  LysR family transcriptional regulator  39.6 
 
 		 300 aa  199  7e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.138319 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1019  LysR family transcriptional regulator  37.37 
 
 		 297 aa  171  2e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0983  LysR family transcriptional regulator  36.58 
 
 		 300 aa  162  5.0000000000000005e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.288934  normal  0.0876373 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4712  LysR family transcriptional regulator  35.02 
 
 		 297 aa  151  1e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0181499  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4008  transcriptional regulator, LysR family  33.57 
 
 		 292 aa  149  7e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1165  LysR family transcriptional regulator  34.27 
 
 		 300 aa  149  8e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.711876  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2443  DNA-binding transcriptional activator GcvA  33.11 
 
 		 300 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.586469  normal  0.671238 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3544  DNA-binding transcriptional activator GcvA  33.54 
 
 		 310 aa  147  2.0000000000000003e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  hitchhiker  0.00470366  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7137  DNA-binding transcriptional activator GcvA  33.54 
 
 		 306 aa  147  3e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.126779  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0481  LysR family transcriptional regulator  33.1 
 
 		 292 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3737  DNA-binding transcriptional activator GcvA  35.29 
 
 		 314 aa  145  1e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.42879  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3949  LysR family transcriptional regulator  33.11 
 
 		 296 aa  144  2e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.211824  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2208  LysR family transcriptional regulator  33.12 
 
 		 315 aa  143  3e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.860838  normal  0.101243 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0444  LysR family transcriptional regulator  34.66 
 
 		 298 aa  144  3e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.641872  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2694  transcriptional regulator, LysR family  33.33 
 
 		 294 aa  143  3e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.484374  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4301  transcriptional regulator, LysR family  35.5 
 
 		 290 aa  143  4e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4494  LysR family transcriptional regulator  33.9 
 
 		 294 aa  142  9e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1418  LysR family transcriptional regulator  33.9 
 
 		 294 aa  142  9e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.380241  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1113  LysR family transcriptional regulator  34.3 
 
 		 298 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.379059  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1824  LysR family transcriptional regulator  34.3 
 
 		 298 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.381841  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2086  LysR family transcriptional regulator  34.3 
 
 		 298 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4000  LysR family transcriptional regulator  33.9 
 
 		 294 aa  141  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000117315 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1983  LysR family transcriptional regulator  36.27 
 
 		 299 aa  141  9.999999999999999e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.360577  hitchhiker  0.00420822 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0350  LysR family transcriptional regulator  34.3 
 
 		 298 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0822  LysR family transcriptional regulator  34.3 
 
 		 298 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1725  LysR family transcriptional regulator  35.91 
 
 		 326 aa  140  1.9999999999999998e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1783  LysR family transcriptional regulator  34.3 
 
 		 298 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2329  LysR family transcriptional regulator  35.03 
 
 		 288 aa  140  1.9999999999999998e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0998  LysR family transcriptional regulator  35.27 
 
 		 290 aa  140  1.9999999999999998e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.927457 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1341  transcriptional regulator, LysR family  35.45 
 
 		 305 aa  140  3e-32  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.281725  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4611  LysR family transcriptional regulator  33 
 
 		 299 aa  140  3e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8482  transcriptional regulator, LysR family  36.45 
 
 		 311 aa  139  3.9999999999999997e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.736171  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4988  LysR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 399 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.225998  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2465  LysR family transcriptional regulator  31.31 
 
 		 309 aa  139  6e-32  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000370846 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2519  LysR family transcriptional regulator  35.45 
 
 		 305 aa  139  7e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.543102  hitchhiker  0.00756718 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3783  LysR family transcriptional regulator  33.56 
 
 		 294 aa  139  7.999999999999999e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.557524  hitchhiker  0.00000939543 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1528  transcriptional regulator, LysR family  35.03 
 
 		 288 aa  139  7.999999999999999e-32  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5015  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  32.55 
 
 		 328 aa  138  1e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.46519  normal  0.168867 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2946  transcriptional regulator, LysR family  33.22 
 
 		 292 aa  138  1e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.601984 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3282  LysR family transcriptional regulator  33.22 
 
 		 294 aa  138  1e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.355799  normal  0.889807 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2804  transcriptional regulator, LysR family  33.22 
 
 		 301 aa  137  2e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.860406  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0174  LysR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 305 aa  137  2e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.117248  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3688  LysR family transcriptional regulator  34.51 
 
 		 300 aa  137  2e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.0000000292486  normal  0.608026 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4145  LysR family transcriptional regulator  32.77 
 
 		 299 aa  137  2e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.323905 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2978  LysR family transcriptional regulator  32.38 
 
 		 317 aa  137  3.0000000000000003e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4524  LysR family transcriptional regulator  33.45 
 
 		 308 aa  137  3.0000000000000003e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3137  transcriptional regulator, LysR family  33.56 
 
 		 287 aa  137  3.0000000000000003e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.076596  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5069  LysR family transcriptional regulator  31.35 
 
 		 302 aa  136  4e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00568872  normal  0.0350365 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4575  LysR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 285 aa  136  4e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0546566  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2783  DNA-binding transcriptional activator GcvA  32.2 
 
 		 303 aa  136  4e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.029199  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6631  LysR family transcriptional regulator  34.36 
 
 		 343 aa  136  5e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2565  DNA-binding transcriptional activator GcvA  32.35 
 
 		 303 aa  136  5e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5786  LysR family transcriptional regulator  34.36 
 
 		 330 aa  136  5e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6151  LysR family transcriptional regulator  34.36 
 
 		 330 aa  136  5e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.410647  normal  0.467276 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3000  LysR family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 298 aa  136  6.0000000000000005e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4878  LysR family transcriptional regulator  35.17 
 
 		 296 aa  135  7.000000000000001e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000628995  hitchhiker  0.000000000242081 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2203  DNA-binding transcriptional activator GcvA  33.11 
 
 		 303 aa  135  7.000000000000001e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0223993  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2429  DNA-binding transcriptional activator GcvA  33.01 
 
 		 303 aa  135  7.000000000000001e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0671136  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0999  DNA-binding transcriptional activator GcvA  34.78 
 
 		 305 aa  135  8e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000272283  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5204  transcriptional regulator, LysR family  34.1 
 
 		 309 aa  135  8e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.647866  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4472  LysR family transcriptional regulator  33.89 
 
 		 292 aa  135  8e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.368186 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0418  DNA-binding transcriptional activator GcvA  32.55 
 
 		 306 aa  135  8e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000171121  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3221  DNA-binding transcriptional activator GcvA  34.78 
 
 		 305 aa  135  8e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.0000086091  normal  0.146962 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3485  transcriptional regulator, LysR family  33.56 
 
 		 305 aa  135  8e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1052  DNA-binding transcriptional activator GcvA  34.78 
 
 		 305 aa  135  8e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6038  LysR family transcriptional regulator  33.89 
 
 		 330 aa  135  8e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.904291  normal  0.627469 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5716  transcriptional regulator LysR family  35.03 
 
 		 299 aa  135  9e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0340323  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5808  LysR family transcriptional regulator  33.89 
 
 		 296 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7705  LysR family transcriptional regulator  33.79 
 
 		 317 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.728095  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3471  DNA-binding transcriptional activator GcvA  33.01 
 
 		 303 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000267837  hitchhiker  0.000102426 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0550  putative transcriptional regulator  30.41 
 
 		 302 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.540128  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3322  DNA-binding transcriptional activator GcvA  32.68 
 
 		 303 aa  134  9.999999999999999e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00000222387  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2406  transcriptional regulator, LysR family  32.06 
 
 		 317 aa  134  1.9999999999999998e-30  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2456  LysR family transcriptional regulator  33.89 
 
 		 318 aa  134  1.9999999999999998e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1350  DNA-binding transcriptional activator GcvA  33.01 
 
 		 303 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.960187  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3254  DNA-binding transcriptional activator GcvA  34.06 
 
 		 304 aa  134  1.9999999999999998e-30  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.655611  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6525  LysR family transcriptional regulator  37.18 
 
 		 301 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1389  DNA-binding transcriptional activator GcvA  33.01 
 
 		 303 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.13608 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6358  DNA-binding transcriptional activator GcvA  33.67 
 
 		 294 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.478035  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1364  DNA-binding transcriptional activator GcvA  33.01 
 
 		 303 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0933505  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0669  transcriptional regulator LysR family  34.31 
 
 		 299 aa  134  1.9999999999999998e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2996  DNA-binding transcriptional activator GcvA  33.01 
 
 		 303 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.174451  hitchhiker  0.00000205749 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05850  LysR family transcriptional regulator  30.41 
 
 		 302 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2764  DNA-binding transcriptional activator GcvA  33.01 
 
 		 303 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.872031  normal  0.426445 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0761  LysR family transcriptional regulator  33.45 
 
 		 296 aa  134  3e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.309741  hitchhiker  0.0000750011 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5641  LysR family transcriptional regulator  32.79 
 
 		 309 aa  134  3e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2922  DNA-binding transcriptional activator GcvA  33.67 
 
 		 294 aa  134  3e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.554203 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3057  DNA-binding transcriptional activator GcvA  33.67 
 
 		 294 aa  134  3e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4361  LysR family transcriptional regulator  34.83 
 
 		 296 aa  133  3e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0000122892  hitchhiker  0.0000705341 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3066  LysR family transcriptional regulator  31.19 
 
 		 296 aa  133  3e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.249094  hitchhiker  0.00377983 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5664  LysR family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 306 aa  133  3.9999999999999996e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0318296 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2532  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  32.53 
 
 		 301 aa  133  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.949132 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3031  DNA-binding transcriptional activator GcvA  33.9 
 
 		 294 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3012  DNA-binding transcriptional activator GcvA  33.9 
 
 		 294 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>