More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_5641 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_5641  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 309 aa  627  1e-179  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64910  LysR family transcriptional regulator  96.09 
 
 		 312 aa  598  1e-170  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4920  transcriptional regulator, LysR family  71.91 
 
 		 301 aa  445  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0596  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  72.43 
 
 		 301 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.327486 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0549  LysR family transcriptional regulator  75 
 
 		 301 aa  431  1e-120  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0725196  normal  0.266185 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0212  LysR family transcriptional regulator  65.31 
 
 		 296 aa  399  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.0028482  normal  0.250883 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3680  LysR family transcriptional regulator  63.73 
 
 		 298 aa  398  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.301341  hitchhiker  0.00043388 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5311  LysR family transcriptional regulator  65.31 
 
 		 296 aa  398  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.256019  normal  0.0494064 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4107  LysR family transcriptional regulator  63.39 
 
 		 298 aa  397  1e-109  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.41444 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3381  LysR family transcriptional regulator  64.07 
 
 		 298 aa  395  1e-109  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1757  LysR family transcriptional regulator  63.39 
 
 		 298 aa  397  1e-109  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0074148 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5169  LysR family transcriptional regulator  63.95 
 
 		 296 aa  389  1e-107  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.569755  normal  0.0670669 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5259  LysR family transcriptional regulator  63.95 
 
 		 296 aa  387  1e-106  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0665  LysR family transcriptional regulator  54.36 
 
 		 304 aa  305  6e-82  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0688297  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0892  LysR family transcriptional regulator  46.74 
 
 		 325 aa  260  2e-68  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5069  LysR family transcriptional regulator  43.4 
 
 		 302 aa  233  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00568872  normal  0.0350365 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1341  transcriptional regulator, LysR family  45.95 
 
 		 305 aa  231  9e-60  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.281725  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2519  LysR family transcriptional regulator  45.61 
 
 		 305 aa  229  3e-59  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.543102  hitchhiker  0.00756718 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0174  LysR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 305 aa  227  2e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.117248  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3156  LysR family transcriptional regulator  42.91 
 
 		 297 aa  227  2e-58  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.636908  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0157  LysR family transcriptional regulator  40.85 
 
 		 305 aa  224  2e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000802537 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1019  LysR family transcriptional regulator  43.79 
 
 		 297 aa  223  2e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0116  LysR family transcriptional regulator  42.76 
 
 		 299 aa  223  2e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.734759  normal  0.979022 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0176  LysR family transcriptional regulator  40.33 
 
 		 305 aa  223  3e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.175853  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0879  LysR family transcriptional regulator  43.88 
 
 		 314 aa  222  4.9999999999999996e-57  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8482  transcriptional regulator, LysR family  42.56 
 
 		 311 aa  218  1e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.736171  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0983  LysR family transcriptional regulator  41.64 
 
 		 300 aa  217  2e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.288934  normal  0.0876373 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1461  LysR family transcriptional regulator  40.34 
 
 		 310 aa  214  1.9999999999999998e-54  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5462  transcriptional regulator, LysR family  41.38 
 
 		 306 aa  213  4.9999999999999996e-54  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.278821  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0906  LysR family transcriptional regulator  39.66 
 
 		 310 aa  210  2e-53  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24960  LysR family transcriptional regulator protein  38.97 
 
 		 304 aa  210  3e-53  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05850  LysR family transcriptional regulator  41.03 
 
 		 302 aa  206  4e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5015  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  40.2 
 
 		 328 aa  206  5e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.46519  normal  0.168867 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0550  putative transcriptional regulator  41.03 
 
 		 302 aa  206  5e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.540128  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1635  LysR family transcriptional regulator  42.61 
 
 		 302 aa  205  6e-52  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1983  LysR family transcriptional regulator  42.03 
 
 		 299 aa  205  6e-52  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.360577  hitchhiker  0.00420822 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0776  LysR family transcriptional regulator  42.61 
 
 		 302 aa  205  6e-52  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.861314  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1987  LysR family transcriptional regulator  42.61 
 
 		 302 aa  205  6e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.58662  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0499  LysR family transcriptional regulator  42.61 
 
 		 302 aa  205  6e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0570  LysR family transcriptional regulator  42.61 
 
 		 302 aa  205  6e-52  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.546598  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2084  LysR family transcriptional regulator  42.61 
 
 		 302 aa  205  6e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0681  LysR family transcriptional regulator  42.61 
 
 		 302 aa  205  6e-52  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0894  LysR family transcriptional regulator  42.61 
 
 		 302 aa  204  2e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3949  LysR family transcriptional regulator  39.04 
 
 		 296 aa  204  2e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.211824  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4000  LysR family transcriptional regulator  41.02 
 
 		 294 aa  203  3e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000117315 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3783  LysR family transcriptional regulator  41.22 
 
 		 294 aa  202  6e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.557524  hitchhiker  0.00000939543 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4430  LysR family transcriptional regulator  40.75 
 
 		 298 aa  199  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.3079  normal  0.432703 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4494  LysR family transcriptional regulator  40.34 
 
 		 294 aa  198  7.999999999999999e-50  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1418  LysR family transcriptional regulator  40.34 
 
 		 294 aa  198  7.999999999999999e-50  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.380241  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4071  LysR family transcriptional regulator  40.48 
 
 		 310 aa  198  7.999999999999999e-50  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0418  transcriptional regulator, LysR family  41.72 
 
 		 298 aa  197  2.0000000000000003e-49  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4524  LysR family transcriptional regulator  38.7 
 
 		 308 aa  197  2.0000000000000003e-49  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2171  LysR family transcriptional regulator  38.97 
 
 		 304 aa  196  6e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6038  LysR family transcriptional regulator  38.44 
 
 		 330 aa  195  7e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.904291  normal  0.627469 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0117  transcriptional regulator, LysR family  36.64 
 
 		 302 aa  194  1e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.476103  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1048  LysR family transcriptional regulator  39.66 
 
 		 310 aa  194  1e-48  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.540636  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5808  LysR family transcriptional regulator  38.57 
 
 		 296 aa  194  1e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2208  LysR family transcriptional regulator  39.09 
 
 		 315 aa  193  2e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.860838  normal  0.101243 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5664  LysR family transcriptional regulator  42.42 
 
 		 306 aa  193  2e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0318296 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4608  LysR family transcriptional regulator  39.46 
 
 		 332 aa  193  4e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.960011  normal  0.108983 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6082  LysR family transcriptional regulator  38.57 
 
 		 329 aa  192  4e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0031  LysR family transcriptional regulator  42.49 
 
 		 299 aa  193  4e-48  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.213809  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1038  transcriptional regulator, LysR family  36.55 
 
 		 302 aa  193  4e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.143731 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3787  transcriptional regulator, LysR family  41.24 
 
 		 300 aa  193  4e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1086  LysR family transcriptional regulator  39.31 
 
 		 310 aa  192  7e-48  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.404999  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3282  LysR family transcriptional regulator  37.97 
 
 		 294 aa  191  1e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.355799  normal  0.889807 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6151  LysR family transcriptional regulator  39.12 
 
 		 330 aa  191  1e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.410647  normal  0.467276 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5786  LysR family transcriptional regulator  39.12 
 
 		 330 aa  191  1e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6631  LysR family transcriptional regulator  38.44 
 
 		 343 aa  190  2e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5573  LysR family transcriptional regulator  36.52 
 
 		 301 aa  191  2e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0669  transcriptional regulator LysR family  39.66 
 
 		 299 aa  189  2.9999999999999997e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7705  LysR family transcriptional regulator  38.18 
 
 		 317 aa  188  8e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.728095  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2995  transcriptional regulator, LysR family  41.03 
 
 		 297 aa  188  8e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02150  transcription regulator transcription regulator protein  38.97 
 
 		 296 aa  188  1e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2532  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  38.91 
 
 		 301 aa  187  1e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.949132 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2406  transcriptional regulator, LysR family  39.03 
 
 		 317 aa  188  1e-46  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4116  transcriptional regulator, LysR family  41.5 
 
 		 300 aa  188  1e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2978  LysR family transcriptional regulator  39.03 
 
 		 317 aa  187  2e-46  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2804  transcriptional regulator, LysR family  39.25 
 
 		 301 aa  186  5e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.860406  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1725  LysR family transcriptional regulator  40.41 
 
 		 326 aa  186  5e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4413  LysR family transcriptional regulator  37.37 
 
 		 300 aa  185  8e-46  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.163519  normal  0.82352 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3409  LysR family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 317 aa  185  9e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.690541  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5716  transcriptional regulator LysR family  40.75 
 
 		 299 aa  184  1.0000000000000001e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0340323  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2764  DNA-binding transcriptional activator GcvA  37.15 
 
 		 303 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.872031  normal  0.426445 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0743  LysR family transcriptional regulator  34.8 
 
 		 301 aa  184  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.876946 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3471  DNA-binding transcriptional activator GcvA  36.46 
 
 		 303 aa  183  3e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000267837  hitchhiker  0.000102426 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5533  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  40.07 
 
 		 302 aa  183  3e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5241  LysR family transcriptional regulator  37.54 
 
 		 317 aa  182  4.0000000000000006e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.11151  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4055  LysR family transcriptional regulator  38.23 
 
 		 315 aa  183  4.0000000000000006e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3466  LysR family transcriptional regulator  38.23 
 
 		 315 aa  183  4.0000000000000006e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2690  LysR family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 316 aa  182  5.0000000000000004e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2984  DNA-binding transcriptional activator GcvA  37.85 
 
 		 303 aa  182  6e-45  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0851103  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0823  transcriptional regulator, LysR family  34.46 
 
 		 301 aa  182  7e-45  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3270  LysR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 318 aa  182  7e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.321515  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3322  DNA-binding transcriptional activator GcvA  37.15 
 
 		 303 aa  182  9.000000000000001e-45  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00000222387  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1990  LysR family transcriptional regulator  38.28 
 
 		 298 aa  182  9.000000000000001e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.288797  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1052  DNA-binding transcriptional activator GcvA  36.08 
 
 		 305 aa  181  1e-44  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3221  DNA-binding transcriptional activator GcvA  36.08 
 
 		 305 aa  181  1e-44  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.0000086091  normal  0.146962 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0999  DNA-binding transcriptional activator GcvA  36.08 
 
 		 305 aa  181  1e-44  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000272283  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2967  LysR family transcriptional regulator  39.56 
 
 		 292 aa  181  2e-44  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.991326 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>