More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_3466 on replicon NC_008543
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010515  Bcenmc03_4055  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 315 aa  646    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3466  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 315 aa  646    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3409  LysR family transcriptional regulator  97.68 
 
 		 317 aa  587  1e-167  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.690541  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5160  LysR family transcriptional regulator  94.01 
 
 		 317 aa  584  1e-166  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.709796 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5241  LysR family transcriptional regulator  97.67 
 
 		 317 aa  584  1e-166  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.11151  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2690  LysR family transcriptional regulator  97.99 
 
 		 316 aa  582  1.0000000000000001e-165  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2772  LysR family transcriptional regulator  77.18 
 
 		 310 aa  464  1e-129  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.500434  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6757  transcriptional regulator, LysR family  76.85 
 
 		 310 aa  457  1e-127  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.914679 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24960  LysR family transcriptional regulator protein  48 
 
 		 304 aa  280  2e-74  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0550  putative transcriptional regulator  48.82 
 
 		 302 aa  278  8e-74  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.540128  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5573  LysR family transcriptional regulator  48.48 
 
 		 301 aa  278  9e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05850  LysR family transcriptional regulator  48.48 
 
 		 302 aa  278  1e-73  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0157  LysR family transcriptional regulator  49.16 
 
 		 305 aa  275  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000802537 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5069  LysR family transcriptional regulator  50.17 
 
 		 302 aa  274  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00568872  normal  0.0350365 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0176  LysR family transcriptional regulator  49.16 
 
 		 305 aa  274  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.175853  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1038  transcriptional regulator, LysR family  47.64 
 
 		 302 aa  273  2.0000000000000002e-72  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.143731 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0174  LysR family transcriptional regulator  48.68 
 
 		 305 aa  273  4.0000000000000004e-72  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.117248  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5015  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  47.85 
 
 		 328 aa  270  2e-71  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.46519  normal  0.168867 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0894  LysR family transcriptional regulator  51.54 
 
 		 302 aa  267  2e-70  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1341  transcriptional regulator, LysR family  49.15 
 
 		 305 aa  265  5.999999999999999e-70  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.281725  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4430  LysR family transcriptional regulator  47.47 
 
 		 298 aa  265  5.999999999999999e-70  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.3079  normal  0.432703 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1635  LysR family transcriptional regulator  51.54 
 
 		 302 aa  265  7e-70  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2084  LysR family transcriptional regulator  51.54 
 
 		 302 aa  265  7e-70  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0776  LysR family transcriptional regulator  51.54 
 
 		 302 aa  265  7e-70  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.861314  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0570  LysR family transcriptional regulator  51.54 
 
 		 302 aa  265  7e-70  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.546598  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0499  LysR family transcriptional regulator  51.54 
 
 		 302 aa  265  7e-70  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1987  LysR family transcriptional regulator  51.54 
 
 		 302 aa  265  7e-70  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.58662  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0681  LysR family transcriptional regulator  51.54 
 
 		 302 aa  265  7e-70  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0116  LysR family transcriptional regulator  46.84 
 
 		 299 aa  265  1e-69  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.734759  normal  0.979022 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5462  transcriptional regulator, LysR family  46.23 
 
 		 306 aa  264  2e-69  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.278821  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2519  LysR family transcriptional regulator  48.81 
 
 		 305 aa  264  2e-69  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.543102  hitchhiker  0.00756718 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0117  transcriptional regulator, LysR family  46.98 
 
 		 302 aa  254  1.0000000000000001e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.476103  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3949  LysR family transcriptional regulator  45.61 
 
 		 296 aa  253  2.0000000000000002e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.211824  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0418  transcriptional regulator, LysR family  48.65 
 
 		 298 aa  253  3e-66  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02150  transcription regulator transcription regulator protein  46.28 
 
 		 296 aa  251  1e-65  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2406  transcriptional regulator, LysR family  44.76 
 
 		 317 aa  250  2e-65  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2978  LysR family transcriptional regulator  44.76 
 
 		 317 aa  250  3e-65  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1983  LysR family transcriptional regulator  47.67 
 
 		 299 aa  249  6e-65  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.360577  hitchhiker  0.00420822 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2208  LysR family transcriptional regulator  45.16 
 
 		 315 aa  248  6e-65  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.860838  normal  0.101243 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0983  LysR family transcriptional regulator  42.37 
 
 		 300 aa  246  3e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.288934  normal  0.0876373 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3156  LysR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 297 aa  241  1e-62  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.636908  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7231  LysR family transcriptional regulator  44.9 
 
 		 301 aa  239  5e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.112256 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5533  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  48.44 
 
 		 302 aa  238  6.999999999999999e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6539  LysR family transcriptional regulator  45.24 
 
 		 297 aa  237  2e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.189801 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1019  LysR family transcriptional regulator  41.72 
 
 		 297 aa  236  3e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6055  LysR family transcriptional regulator  45.79 
 
 		 297 aa  236  3e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0813453  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5691  LysR family transcriptional regulator  45.79 
 
 		 297 aa  236  3e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0669  transcriptional regulator LysR family  44.37 
 
 		 299 aa  235  7e-61  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1990  LysR family transcriptional regulator  44.07 
 
 		 298 aa  235  9e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.288797  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3604  LysR family transcriptional regulator  40.47 
 
 		 323 aa  234  1.0000000000000001e-60  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0906  LysR family transcriptional regulator  43.79 
 
 		 310 aa  234  1.0000000000000001e-60  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2171  LysR family transcriptional regulator  43.4 
 
 		 304 aa  234  1.0000000000000001e-60  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1461  LysR family transcriptional regulator  43.6 
 
 		 310 aa  234  2.0000000000000002e-60  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0879  LysR family transcriptional regulator  45.24 
 
 		 314 aa  233  3e-60  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0031  LysR family transcriptional regulator  43.58 
 
 		 299 aa  231  1e-59  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.213809  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1882  LysR family transcriptional regulator  42.47 
 
 		 302 aa  231  1e-59  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1725  LysR family transcriptional regulator  45.05 
 
 		 326 aa  228  1e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4116  transcriptional regulator, LysR family  43.39 
 
 		 300 aa  226  3e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2967  LysR family transcriptional regulator  41.98 
 
 		 292 aa  226  5.0000000000000005e-58  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.991326 
 
 
-
 
NC_004310  BR1086  LysR family transcriptional regulator  40.28 
 
 		 310 aa  223  4.9999999999999996e-57  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.404999  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1048  LysR family transcriptional regulator  40.28 
 
 		 310 aa  222  6e-57  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.540636  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3787  transcriptional regulator, LysR family  42.86 
 
 		 300 aa  221  9e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5664  LysR family transcriptional regulator  43.62 
 
 		 306 aa  221  9.999999999999999e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0318296 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2995  transcriptional regulator, LysR family  45.48 
 
 		 297 aa  221  1.9999999999999999e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1476  LysR family transcriptional regulator  44.59 
 
 		 299 aa  218  7.999999999999999e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.955554  normal  0.680105 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5716  transcriptional regulator LysR family  42.03 
 
 		 299 aa  216  2.9999999999999998e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0340323  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1251  LysR family transcriptional regulator  42.19 
 
 		 300 aa  213  1.9999999999999998e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.255094 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0743  LysR family transcriptional regulator  39.73 
 
 		 301 aa  213  4.9999999999999996e-54  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.876946 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4071  LysR family transcriptional regulator  42.63 
 
 		 310 aa  212  7e-54  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5169  LysR family transcriptional regulator  38.85 
 
 		 296 aa  210  2e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.569755  normal  0.0670669 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2377  LysR family transcriptional regulator  43.39 
 
 		 298 aa  211  2e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.120288  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1256  LysR family transcriptional regulator  42.09 
 
 		 310 aa  211  2e-53  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.196796  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0823  transcriptional regulator, LysR family  39.38 
 
 		 301 aa  210  2e-53  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5311  LysR family transcriptional regulator  38.51 
 
 		 296 aa  209  4e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.256019  normal  0.0494064 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0212  LysR family transcriptional regulator  38.51 
 
 		 296 aa  209  4e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.0028482  normal  0.250883 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3282  LysR family transcriptional regulator  40.35 
 
 		 294 aa  209  6e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.355799  normal  0.889807 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3680  LysR family transcriptional regulator  37.29 
 
 		 298 aa  209  6e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.301341  hitchhiker  0.00043388 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5259  LysR family transcriptional regulator  38.91 
 
 		 296 aa  209  7e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5907  transcriptional regulator LysR family  39.04 
 
 		 305 aa  208  1e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4107  LysR family transcriptional regulator  36.95 
 
 		 298 aa  207  2e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.41444 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1757  LysR family transcriptional regulator  36.95 
 
 		 298 aa  207  2e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0074148 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4494  LysR family transcriptional regulator  41.92 
 
 		 294 aa  206  5e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1418  LysR family transcriptional regulator  41.92 
 
 		 294 aa  206  5e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.380241  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4413  LysR family transcriptional regulator  39.04 
 
 		 300 aa  204  1e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.163519  normal  0.82352 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4000  LysR family transcriptional regulator  41.72 
 
 		 294 aa  204  1e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000117315 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3381  LysR family transcriptional regulator  36.61 
 
 		 298 aa  204  1e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2532  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  43.94 
 
 		 301 aa  204  2e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.949132 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3783  LysR family transcriptional regulator  41.81 
 
 		 294 aa  203  2e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.557524  hitchhiker  0.00000939543 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4397  LysR family transcriptional regulator  42.42 
 
 		 295 aa  202  9e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.544326  normal  0.0963466 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2804  transcriptional regulator, LysR family  43.6 
 
 		 301 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.860406  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1035  LysR family transcriptional regulator  36.3 
 
 		 317 aa  200  1.9999999999999998e-50  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.919804 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2729  LysR family transcriptional regulator  42.66 
 
 		 323 aa  200  1.9999999999999998e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.270725  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5641  LysR family transcriptional regulator  38.23 
 
 		 309 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1297  LysR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 304 aa  199  3.9999999999999996e-50  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.496743  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0596  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  38.1 
 
 		 301 aa  199  6e-50  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.327486 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2482  LysR family transcriptional regulator  38.41 
 
 		 303 aa  199  6e-50  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.134269  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4920  transcriptional regulator, LysR family  38.44 
 
 		 301 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64910  LysR family transcriptional regulator  37.05 
 
 		 312 aa  196  3e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6082  LysR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 329 aa  197  3e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6038  LysR family transcriptional regulator  41.24 
 
 		 330 aa  197  3e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.904291  normal  0.627469 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>