More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_0665 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007963  Csal_0665  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 304 aa  625  1e-178  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0688297  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4107  LysR family transcriptional regulator  54.01 
 
 		 298 aa  310  1e-83  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.41444 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1757  LysR family transcriptional regulator  54.01 
 
 		 298 aa  310  1e-83  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0074148 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3381  LysR family transcriptional regulator  53.31 
 
 		 298 aa  310  2e-83  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3680  LysR family transcriptional regulator  53.31 
 
 		 298 aa  310  2.9999999999999997e-83  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.301341  hitchhiker  0.00043388 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5641  LysR family transcriptional regulator  54.36 
 
 		 309 aa  305  5.0000000000000004e-82  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64910  LysR family transcriptional regulator  51.32 
 
 		 312 aa  303  3.0000000000000004e-81  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4920  transcriptional regulator, LysR family  51.5 
 
 		 301 aa  292  6e-78  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5169  LysR family transcriptional regulator  49.48 
 
 		 296 aa  292  6e-78  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.569755  normal  0.0670669 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5259  LysR family transcriptional regulator  49.48 
 
 		 296 aa  291  1e-77  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0212  LysR family transcriptional regulator  49.48 
 
 		 296 aa  291  1e-77  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.0028482  normal  0.250883 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5311  LysR family transcriptional regulator  49.83 
 
 		 296 aa  290  1e-77  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.256019  normal  0.0494064 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0596  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  51 
 
 		 301 aa  289  4e-77  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.327486 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0549  LysR family transcriptional regulator  52.51 
 
 		 301 aa  272  6e-72  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0725196  normal  0.266185 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0892  LysR family transcriptional regulator  45.68 
 
 		 325 aa  234  1.0000000000000001e-60  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1341  transcriptional regulator, LysR family  43.06 
 
 		 305 aa  218  1e-55  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.281725  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3156  LysR family transcriptional regulator  38.91 
 
 		 297 aa  216  4e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.636908  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2519  LysR family transcriptional regulator  43.87 
 
 		 305 aa  216  5e-55  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.543102  hitchhiker  0.00756718 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1048  LysR family transcriptional regulator  41.45 
 
 		 310 aa  214  9.999999999999999e-55  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.540636  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0906  LysR family transcriptional regulator  39.27 
 
 		 310 aa  213  2.9999999999999995e-54  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1086  LysR family transcriptional regulator  41.09 
 
 		 310 aa  211  9e-54  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.404999  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0174  LysR family transcriptional regulator  39.04 
 
 		 305 aa  211  1e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.117248  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0176  LysR family transcriptional regulator  38.7 
 
 		 305 aa  209  4e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.175853  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0157  LysR family transcriptional regulator  38.7 
 
 		 305 aa  209  5e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000802537 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8482  transcriptional regulator, LysR family  41.64 
 
 		 311 aa  209  7e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.736171  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2208  LysR family transcriptional regulator  40.85 
 
 		 315 aa  208  1e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.860838  normal  0.101243 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24960  LysR family transcriptional regulator protein  38.97 
 
 		 304 aa  208  1e-52  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0983  LysR family transcriptional regulator  38.26 
 
 		 300 aa  206  3e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.288934  normal  0.0876373 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0116  LysR family transcriptional regulator  38.87 
 
 		 299 aa  206  5e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.734759  normal  0.979022 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1461  LysR family transcriptional regulator  37.82 
 
 		 310 aa  205  8e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5069  LysR family transcriptional regulator  38.01 
 
 		 302 aa  204  2e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00568872  normal  0.0350365 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05850  LysR family transcriptional regulator  40.44 
 
 		 302 aa  203  4e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0550  putative transcriptional regulator  40.44 
 
 		 302 aa  202  5e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.540128  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2171  LysR family transcriptional regulator  39.27 
 
 		 304 aa  199  3.9999999999999996e-50  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3787  transcriptional regulator, LysR family  42.8 
 
 		 300 aa  199  6e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0669  transcriptional regulator LysR family  38.97 
 
 		 299 aa  198  7e-50  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5015  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  39.05 
 
 		 328 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.46519  normal  0.168867 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1019  LysR family transcriptional regulator  38.73 
 
 		 297 aa  197  2.0000000000000003e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0879  LysR family transcriptional regulator  40 
 
 		 314 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7231  LysR family transcriptional regulator  37.29 
 
 		 301 aa  196  3e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.112256 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0031  LysR family transcriptional regulator  39.27 
 
 		 299 aa  196  3e-49  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.213809  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4430  LysR family transcriptional regulator  38.73 
 
 		 298 aa  195  9e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.3079  normal  0.432703 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5462  transcriptional regulator, LysR family  38.6 
 
 		 306 aa  194  1e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.278821  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1983  LysR family transcriptional regulator  39.86 
 
 		 299 aa  195  1e-48  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.360577  hitchhiker  0.00420822 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4116  transcriptional regulator, LysR family  41.7 
 
 		 300 aa  193  3e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3949  LysR family transcriptional regulator  38.69 
 
 		 296 aa  192  4e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.211824  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2967  LysR family transcriptional regulator  37.87 
 
 		 292 aa  191  1e-47  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.991326 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0117  transcriptional regulator, LysR family  37.46 
 
 		 302 aa  191  2e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.476103  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1990  LysR family transcriptional regulator  37.82 
 
 		 298 aa  190  2e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.288797  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4413  LysR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 300 aa  190  2.9999999999999997e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.163519  normal  0.82352 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0418  transcriptional regulator, LysR family  40.58 
 
 		 298 aa  189  5e-47  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5691  LysR family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 297 aa  189  5e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6055  LysR family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 297 aa  189  5e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0813453  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1725  LysR family transcriptional regulator  41.7 
 
 		 326 aa  189  5.999999999999999e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0894  LysR family transcriptional regulator  41.82 
 
 		 302 aa  188  8e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5664  LysR family transcriptional regulator  39.5 
 
 		 306 aa  188  9e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0318296 
 
 
-
 
NC_003296  RS02150  transcription regulator transcription regulator protein  38.41 
 
 		 296 aa  188  1e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2406  transcriptional regulator, LysR family  37.59 
 
 		 317 aa  186  4e-46  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2084  LysR family transcriptional regulator  41.52 
 
 		 302 aa  186  5e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0776  LysR family transcriptional regulator  41.52 
 
 		 302 aa  186  5e-46  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.861314  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0499  LysR family transcriptional regulator  41.52 
 
 		 302 aa  186  5e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0681  LysR family transcriptional regulator  41.52 
 
 		 302 aa  186  5e-46  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0570  LysR family transcriptional regulator  41.52 
 
 		 302 aa  186  5e-46  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.546598  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1987  LysR family transcriptional regulator  41.52 
 
 		 302 aa  186  5e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.58662  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1635  LysR family transcriptional regulator  41.52 
 
 		 302 aa  186  5e-46  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2978  LysR family transcriptional regulator  37.59 
 
 		 317 aa  185  7e-46  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4071  LysR family transcriptional regulator  39.24 
 
 		 310 aa  185  9e-46  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5907  transcriptional regulator LysR family  38.32 
 
 		 305 aa  185  1.0000000000000001e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5573  LysR family transcriptional regulator  35.66 
 
 		 301 aa  184  1.0000000000000001e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4524  LysR family transcriptional regulator  38.18 
 
 		 308 aa  184  2.0000000000000003e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4397  LysR family transcriptional regulator  38.99 
 
 		 295 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.544326  normal  0.0963466 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1251  LysR family transcriptional regulator  37.76 
 
 		 300 aa  183  3e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.255094 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4080  LysR family transcriptional regulator  35.49 
 
 		 304 aa  183  3e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2151  LysR family transcriptional regulator  38.75 
 
 		 312 aa  182  7e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.349903  normal  0.92042 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6539  LysR family transcriptional regulator  36.76 
 
 		 297 aa  181  1e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.189801 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5716  transcriptional regulator LysR family  39.64 
 
 		 299 aa  181  1e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0340323  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2377  LysR family transcriptional regulator  40.22 
 
 		 298 aa  180  2e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.120288  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2772  LysR family transcriptional regulator  38.99 
 
 		 310 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.500434  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1882  LysR family transcriptional regulator  36.73 
 
 		 302 aa  179  5.999999999999999e-44  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5533  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  39.71 
 
 		 302 aa  179  7e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4000  LysR family transcriptional regulator  38.57 
 
 		 294 aa  178  9e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000117315 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2690  LysR family transcriptional regulator  36.42 
 
 		 316 aa  177  1e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2764  DNA-binding transcriptional activator GcvA  36.36 
 
 		 303 aa  178  1e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.872031  normal  0.426445 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4494  LysR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 294 aa  177  2e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1418  LysR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 294 aa  177  2e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.380241  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3409  LysR family transcriptional regulator  36.75 
 
 		 317 aa  177  2e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.690541  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6038  LysR family transcriptional regulator  37.91 
 
 		 330 aa  177  3e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.904291  normal  0.627469 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3282  LysR family transcriptional regulator  36.43 
 
 		 294 aa  176  3e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.355799  normal  0.889807 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5241  LysR family transcriptional regulator  36.42 
 
 		 317 aa  176  5e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.11151  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3604  LysR family transcriptional regulator  33.22 
 
 		 323 aa  176  5e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2565  DNA-binding transcriptional activator GcvA  35.44 
 
 		 303 aa  176  6e-43  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01183  DNA-binding transcriptional activator GcvA  34.68 
 
 		 306 aa  175  7e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6757  transcriptional regulator, LysR family  37.67 
 
 		 310 aa  175  8e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.914679 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0418  DNA-binding transcriptional activator GcvA  34.01 
 
 		 306 aa  174  9.999999999999999e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000171121  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3254  DNA-binding transcriptional activator GcvA  35.49 
 
 		 304 aa  175  9.999999999999999e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.655611  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6358  DNA-binding transcriptional activator GcvA  37.21 
 
 		 294 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.478035  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5808  LysR family transcriptional regulator  38.13 
 
 		 296 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2783  DNA-binding transcriptional activator GcvA  35.99 
 
 		 303 aa  174  9.999999999999999e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.029199  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3466  LysR family transcriptional regulator  38.18 
 
 		 315 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4055  LysR family transcriptional regulator  38.18 
 
 		 315 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>