More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmul_5325 on replicon NC_010087
Organism: Burkholderia multivorans ATCC 17616



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010087  Bmul_5325  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 
301 aa  609  1e-173  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.972364  normal  0.036575 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5998  LysR family transcriptional regulator  88.78 
 
 
300 aa  524  1e-148  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.123891  normal  0.186417 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6525  LysR family transcriptional regulator  87.76 
 
 
301 aa  520  1e-147  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5754  LysR family transcriptional regulator  88.1 
 
 
300 aa  519  1e-146  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6674  LysR family transcriptional regulator  87.41 
 
 
296 aa  517  1.0000000000000001e-145  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.143364 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5831  LysR family transcriptional regulator  87.76 
 
 
296 aa  515  1.0000000000000001e-145  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6198  LysR family transcriptional regulator  87.76 
 
 
296 aa  515  1.0000000000000001e-145  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0533844 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4415  LysR family transcriptional regulator  65.97 
 
 
295 aa  372  1e-102  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3473  LysR family transcriptional regulator  57.68 
 
 
302 aa  337  9.999999999999999e-92  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.878224 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4194  transcriptional regulator, LysR family  57.24 
 
 
302 aa  334  1e-90  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0402435 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5893  LysR family transcriptional regulator  57.29 
 
 
295 aa  333  2e-90  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0010  LysR family transcriptional regulator  55.93 
 
 
301 aa  332  5e-90  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2271  transcriptional regulator, LysR family  57.69 
 
 
311 aa  328  9e-89  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1948  transcriptional regulator, LysR family  57.34 
 
 
311 aa  327  1.0000000000000001e-88  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.244059  normal  0.065003 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3031  DNA-binding transcriptional activator GcvA  49.48 
 
 
294 aa  264  1e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6358  DNA-binding transcriptional activator GcvA  49.83 
 
 
294 aa  265  1e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.478035  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3012  DNA-binding transcriptional activator GcvA  49.48 
 
 
294 aa  264  2e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2398  DNA-binding transcriptional activator GcvA  49.48 
 
 
294 aa  264  2e-69  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.273893  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3007  DNA-binding transcriptional activator GcvA  49.48 
 
 
294 aa  262  4e-69  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3057  DNA-binding transcriptional activator GcvA  49.83 
 
 
294 aa  262  4.999999999999999e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0253  DNA-binding transcriptional activator GcvA  50 
 
 
293 aa  261  6.999999999999999e-69  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.208187  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2922  DNA-binding transcriptional activator GcvA  49.48 
 
 
294 aa  261  1e-68  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.554203 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0281  DNA-binding transcriptional activator GcvA  50 
 
 
293 aa  261  1e-68  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0477  DNA-binding transcriptional activator GcvA  50 
 
 
293 aa  261  1e-68  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0293  DNA-binding transcriptional activator GcvA  50 
 
 
293 aa  261  1e-68  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6790  DNA-binding transcriptional activator GcvA  47.95 
 
 
305 aa  255  6e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0668323  hitchhiker  0.00000431754 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4417  DNA-binding transcriptional activator GcvA  47.06 
 
 
307 aa  249  4e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.838235  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2479  LysR family transcriptional regulator  46.9 
 
 
316 aa  244  1.9999999999999999e-63  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.102884  hitchhiker  0.0063597 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2674  LysR family transcriptional regulator  41.14 
 
 
310 aa  223  4e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.910839 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5947  LysR family transcriptional regulator  40.13 
 
 
321 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.287273 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5583  LysR family transcriptional regulator  40.13 
 
 
321 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6448  LysR family transcriptional regulator  40.62 
 
 
318 aa  219  3e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6131  LysR family transcriptional regulator  39.8 
 
 
310 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2086  glycine cleavage system transcriptional activator  51.32 
 
 
335 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.606063  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6419  LysR family transcriptional regulator  38.98 
 
 
297 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3007  transcriptional regulator  51.32 
 
 
335 aa  212  7e-54  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7137  DNA-binding transcriptional activator GcvA  45.05 
 
 
306 aa  209  6e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.126779  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2531  transcriptional regulator, LysR family  42.56 
 
 
295 aa  204  1e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2422  transcriptional regulator, LysR family  43.34 
 
 
300 aa  203  2e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0409685 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3737  DNA-binding transcriptional activator GcvA  41.92 
 
 
314 aa  202  4e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.42879  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2145  LysR substrate-binding  43.34 
 
 
300 aa  202  6e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.46623  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0906  LysR family transcriptional regulator  38.6 
 
 
299 aa  202  7e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.306914  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2169  LysR family regulatory protein  38.25 
 
 
299 aa  199  3e-50  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.225103  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0814  LysR family transcriptional regulator  38.25 
 
 
299 aa  199  3e-50  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.959289  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2105  transcriptional regulator, LysR family  43.49 
 
 
300 aa  199  5e-50  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.289933 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3485  transcriptional regulator, LysR family  41.26 
 
 
305 aa  197  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1341  transcriptional regulator, LysR family  40.21 
 
 
305 aa  194  2e-48  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.281725  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2519  LysR family transcriptional regulator  39.86 
 
 
305 aa  193  3e-48  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.543102  hitchhiker  0.00756718 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2214  LysR family transcriptional regulator  42.47 
 
 
308 aa  191  1e-47  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0248  LysR family transcriptional regulator  39.18 
 
 
302 aa  189  5e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.319703  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2151  LysR family transcriptional regulator  38.19 
 
 
312 aa  188  8e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.349903  normal  0.92042 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3471  DNA-binding transcriptional activator GcvA  37.72 
 
 
303 aa  187  2e-46  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000267837  hitchhiker  0.000102426 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3322  DNA-binding transcriptional activator GcvA  37.72 
 
 
303 aa  186  4e-46  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00000222387  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3150  transcriptional regulator, LysR family  37.88 
 
 
297 aa  185  6e-46  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2984  DNA-binding transcriptional activator GcvA  37.72 
 
 
303 aa  183  2.0000000000000003e-45  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0851103  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2429  DNA-binding transcriptional activator GcvA  37.02 
 
 
303 aa  183  3e-45  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0671136  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3254  DNA-binding transcriptional activator GcvA  35.79 
 
 
304 aa  183  3e-45  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.655611  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0734  LysR family transcriptional regulator  41.03 
 
 
314 aa  183  4.0000000000000006e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0171  LysR family transcriptional regulator  39.12 
 
 
326 aa  183  4.0000000000000006e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.231188 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3207  DNA-binding transcriptional activator GcvA  35.43 
 
 
305 aa  182  5.0000000000000004e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.00274599  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3127  DNA-binding transcriptional activator GcvA  35.43 
 
 
305 aa  182  5.0000000000000004e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.000000208594  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2443  DNA-binding transcriptional activator GcvA  39.04 
 
 
300 aa  182  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.586469  normal  0.671238 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3192  DNA-binding transcriptional activator GcvA  35.43 
 
 
305 aa  182  5.0000000000000004e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.00535836  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4215  DNA-binding transcriptional activator GcvA  39.72 
 
 
322 aa  182  5.0000000000000004e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3307  DNA-binding transcriptional activator GcvA  35.43 
 
 
305 aa  182  5.0000000000000004e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00899018  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3144  DNA-binding transcriptional activator GcvA  35.43 
 
 
305 aa  182  5.0000000000000004e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.0000119726  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1052  DNA-binding transcriptional activator GcvA  35.76 
 
 
305 aa  181  9.000000000000001e-45  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3221  DNA-binding transcriptional activator GcvA  35.76 
 
 
305 aa  181  9.000000000000001e-45  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.0000086091  normal  0.146962 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0999  DNA-binding transcriptional activator GcvA  35.76 
 
 
305 aa  181  9.000000000000001e-45  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000272283  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0418  DNA-binding transcriptional activator GcvA  35.29 
 
 
306 aa  180  2e-44  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000171121  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8482  transcriptional regulator, LysR family  38.26 
 
 
311 aa  180  2e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.736171  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2764  DNA-binding transcriptional activator GcvA  36.68 
 
 
303 aa  181  2e-44  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.872031  normal  0.426445 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02659  DNA-binding transcriptional dual regulator  35.12 
 
 
305 aa  179  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0880  transcriptional regulator, LysR family  35.12 
 
 
305 aa  179  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.630361  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3114  DNA-binding transcriptional activator GcvA  35.12 
 
 
305 aa  179  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000698481  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1533  DNA-binding transcriptional activator GcvA  37.37 
 
 
303 aa  180  2.9999999999999997e-44  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2952  DNA-binding transcriptional activator GcvA  35.12 
 
 
305 aa  179  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  2.32585e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0904  DNA-binding transcriptional activator GcvA  35.12 
 
 
305 aa  179  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4072  DNA-binding transcriptional activator GcvA  35.12 
 
 
305 aa  179  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.0000000156513  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2949  DNA-binding transcriptional activator GcvA  35.12 
 
 
305 aa  179  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.000000000549414  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2331  LysR family transcriptional regulator  39.59 
 
 
305 aa  180  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0724376  normal  0.145615 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02620  hypothetical protein  35.12 
 
 
305 aa  179  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3062  DNA-binding transcriptional activator GcvA  35.12 
 
 
305 aa  179  2.9999999999999997e-44  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  0.00000000000000830878  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3368  LysR family transcriptional regulator  37.59 
 
 
307 aa  179  4e-44  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2795  DNA-binding transcriptional activator GcvA  37.37 
 
 
303 aa  179  4e-44  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.119571  normal  0.0711239 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3544  DNA-binding transcriptional activator GcvA  35.37 
 
 
310 aa  179  4.999999999999999e-44  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  hitchhiker  0.00470366  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2894  DNA-binding transcriptional activator GcvA  37.37 
 
 
303 aa  179  4.999999999999999e-44  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00417784  hitchhiker  0.00000518904 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2724  DNA-binding transcriptional activator GcvA  37.37 
 
 
303 aa  179  4.999999999999999e-44  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000916948  normal  0.0913399 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2783  DNA-binding transcriptional activator GcvA  36.68 
 
 
303 aa  179  4.999999999999999e-44  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.029199  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1584  LysR family transcriptional regulator  34.95 
 
 
295 aa  178  8e-44  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.534905  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2565  DNA-binding transcriptional activator GcvA  35.99 
 
 
303 aa  177  1e-43  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2522  LysR family transcriptional regulator  36.09 
 
 
320 aa  177  1e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00304048  unclonable  0.0000288017 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1282  DNA-binding transcriptional activator GcvA  37.02 
 
 
303 aa  177  1e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.433323  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1350  DNA-binding transcriptional activator GcvA  37.02 
 
 
303 aa  177  2e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.960187  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1364  DNA-binding transcriptional activator GcvA  37.02 
 
 
303 aa  177  2e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0933505  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3066  LysR family transcriptional regulator  33.91 
 
 
296 aa  177  2e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.249094  hitchhiker  0.00377983 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4712  LysR family transcriptional regulator  39.37 
 
 
297 aa  177  2e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0181499  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2996  DNA-binding transcriptional activator GcvA  37.02 
 
 
303 aa  177  2e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.174451  hitchhiker  0.00000205749 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1389  DNA-binding transcriptional activator GcvA  37.02 
 
 
303 aa  177  2e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.13608 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2452  LysR family transcriptional regulator  36.33 
 
 
320 aa  177  2e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000000228881 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>