More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_2800 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_2800  lysine exporter protein LysE/YggA  100 
 
 		 204 aa  396  1e-109  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.208295  normal  0.25716 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2658  lysine exporter protein LysE/YggA  89.71 
 
 		 204 aa  338  5e-92  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.53678  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3021  amino acid transporter LysE  88.73 
 
 		 204 aa  334  5.999999999999999e-91  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.196294  normal  0.164035 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2724  lysine exporter protein LysE/YggA  72.06 
 
 		 204 aa  292  2e-78  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.138868 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1664  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  61.31 
 
 		 209 aa  233  2.0000000000000002e-60  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0862458  normal  0.0704615 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1905  lysine exporter protein LysE/YggA  55.77 
 
 		 215 aa  221  4.9999999999999996e-57  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1841  lysine exporter protein LysE/YggA  47.14 
 
 		 216 aa  171  6.999999999999999e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000006365 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0042  lysine exporter protein LysE/YggA  48.17 
 
 		 216 aa  140  9.999999999999999e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2912  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  41.58 
 
 		 215 aa  135  3.0000000000000003e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1550  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  40.74 
 
 		 225 aa  132  5e-30  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3142  amino acid transporter LysE  36.22 
 
 		 218 aa  124  9e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.142315  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0493  lysine exporter protein LysE/YggA  33.85 
 
 		 219 aa  120  9.999999999999999e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4142  lysine exporter protein LysE/YggA  38.8 
 
 		 211 aa  115  3e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000225003  hitchhiker  0.0000840644 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2400  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  41.95 
 
 		 214 aa  107  2e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.954989  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4393  lysine exporter protein LysE/YggA  40.11 
 
 		 205 aa  99.8  2e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.140673 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4189  lysine exporter protein LysE/YggA  30.92 
 
 		 212 aa  99.8  3e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1147  transporter, LysE family  34.93 
 
 		 210 aa  94.7  8e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4855  transporter, LysE family  38.22 
 
 		 213 aa  94.7  8e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3488  lysine exporter protein LysE/YggA  35.11 
 
 		 223 aa  94  1e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0989  lysine exporter protein LysE/YggA  33.97 
 
 		 210 aa  92.8  3e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4781  transporter LysE family  37.7 
 
 		 213 aa  91.3  9e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.917767  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4710  lysine exporter protein LysE/YggA  32.32 
 
 		 209 aa  87.8  9e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.142665 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1757  lysine exporter protein LysE/YggA  31.47 
 
 		 214 aa  85.5  4e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.290271  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1641  lysine exporter protein LysE/YggA  30.35 
 
 		 212 aa  85.5  5e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.950543  normal  0.4347 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6117  hypothetical protein  35.18 
 
 		 206 aa  85.1  7e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3663  lysine exporter protein LysE/YggA  31.66 
 
 		 209 aa  84.3  0.000000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02071  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  37.07 
 
 		 208 aa  84.3  0.000000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0424528  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0476  lysine exporter protein LysE/YggA  28.5 
 
 		 209 aa  84  0.000000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007323  GBAA_pXO2_0078  amino acid efflux protein  28.8 
 
 		 205 aa  82.8  0.000000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70510  hypothetical protein  35.92 
 
 		 206 aa  82.4  0.000000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3404  lysine exporter protein LysE/YggA  29.41 
 
 		 211 aa  82  0.000000000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.325379  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0618  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  31.07 
 
 		 211 aa  81.6  0.000000000000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0936  lysine exporter protein LysE/YggA  31.02 
 
 		 212 aa  80.1  0.00000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.950459  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2939  lysine exporter protein LysE/YggA  31.22 
 
 		 214 aa  79.7  0.00000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.419308  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4118  RhtB family transporter  30.48 
 
 		 213 aa  79.3  0.00000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0556  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  28.57 
 
 		 204 aa  79  0.00000000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1031  hypothetical protein  31.73 
 
 		 212 aa  79  0.00000000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.332162  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1800  threonine efflux protein, putative  27 
 
 		 212 aa  78.2  0.00000000000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1849  amino acid transporter LysE  30.48 
 
 		 212 aa  77.4  0.0000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.402974  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1920  amino acid transporter LysE  30.48 
 
 		 212 aa  77.4  0.0000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1219  hypothetical protein  32.98 
 
 		 219 aa  77.4  0.0000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43570  hypothetical protein  32.56 
 
 		 213 aa  77.4  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.443465  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2796  lysine exporter protein LysE/YggA  28.71 
 
 		 214 aa  77.8  0.0000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1213  hypothetical protein  32.98 
 
 		 219 aa  77  0.0000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1256  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  32 
 
 		 205 aa  77  0.0000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02476  hypothetical protein  32.31 
 
 		 211 aa  76.6  0.0000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06605  putative threonine efflux protein  32.66 
 
 		 203 aa  76.3  0.0000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29100  hypothetical protein  33.15 
 
 		 204 aa  75.5  0.0000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00136638 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0765  threonine efflux protein, putative  28.7 
 
 		 234 aa  74.7  0.0000000000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1814  lysine exporter protein LysE/YggA  32.85 
 
 		 205 aa  74.7  0.000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000397951  hitchhiker  0.0000354309 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1060  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  32.43 
 
 		 209 aa  73.2  0.000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.741251  normal  0.078929 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0194  threonine efflux system  31.66 
 
 		 207 aa  73.6  0.000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0335584  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0596  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  32.34 
 
 		 230 aa  73.6  0.000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.400455  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6693  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  31.12 
 
 		 190 aa  72.8  0.000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2572  hypothetical protein  32.02 
 
 		 222 aa  72.4  0.000000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3653  hypothetical protein  31.16 
 
 		 213 aa  72.8  0.000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.345331  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0009  lysine exporter protein LysE/YggA  27.54 
 
 		 245 aa  72.4  0.000000000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0108149 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3987  hypothetical protein  32.04 
 
 		 204 aa  72.4  0.000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.178555  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0921  putative threonine efflux protein  26.97 
 
 		 205 aa  72.4  0.000000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0194  threonine efflux system  28.5 
 
 		 208 aa  72  0.000000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.331917  normal  0.247253 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5352  lysine exporter protein LysE/YggA  30.88 
 
 		 204 aa  72  0.000000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.128052 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0243  threonine efflux system  31.47 
 
 		 206 aa  71.6  0.000000000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.569169  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3976  lysine exporter protein LysE/YggA  30.5 
 
 		 205 aa  71.6  0.000000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0215233 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5915  LysE family transporter  32.97 
 
 		 204 aa  71.6  0.000000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.723016 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1462  lysine exporter protein LysE/YggA  30.58 
 
 		 216 aa  71.6  0.000000000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2059  lysine exporter protein LysE/YggA  28.8 
 
 		 211 aa  70.9  0.00000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2482  lysine exporter protein LysE/YggA  27.59 
 
 		 224 aa  70.9  0.00000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0699  amino acid transporter LysE  30.93 
 
 		 204 aa  70.1  0.00000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0691811  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0051  amino acid transporter LysE  29.53 
 
 		 210 aa  70.5  0.00000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3839  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  27.04 
 
 		 204 aa  70.1  0.00000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4153  threonine efflux system  30.65 
 
 		 207 aa  70.1  0.00000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000179823  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0100  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  27.44 
 
 		 234 aa  70.5  0.00000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0732  lysine exporter protein LysE/YggA  33.33 
 
 		 204 aa  69.7  0.00000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.831174 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5694  lysine exporter protein LysE/YggA  30.37 
 
 		 205 aa  69.7  0.00000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.666323 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3644  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  27.04 
 
 		 204 aa  68.6  0.00000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3963  threonine efflux system  30.61 
 
 		 207 aa  68.6  0.00000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.245678  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3675  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  28.57 
 
 		 212 aa  68.6  0.00000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.663978 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1730  amino acid transporter LysE  29.44 
 
 		 208 aa  68.2  0.00000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000126843  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03702  threonine efflux system  26.94 
 
 		 206 aa  67.4  0.0000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4156  homoserine/threonine efflux pump  27.46 
 
 		 206 aa  67.8  0.0000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4290  threonine efflux system  27.46 
 
 		 206 aa  67.4  0.0000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4185  threonine efflux system  27.46 
 
 		 206 aa  67.4  0.0000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.485697 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03651  hypothetical protein  26.94 
 
 		 206 aa  67.4  0.0000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5264  threonine efflux system  27.32 
 
 		 204 aa  67.8  0.0000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.613043 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3973  threonine efflux system  27.23 
 
 		 206 aa  67.4  0.0000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.137764  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4190  threonine efflux system  26.94 
 
 		 206 aa  67.4  0.0000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00587316 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4047  threonine efflux system  27.46 
 
 		 204 aa  67.4  0.0000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0587  lysine exporter protein LysE/YggA  28.09 
 
 		 236 aa  67.4  0.0000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1435  amino acid transporter LysE  28.35 
 
 		 210 aa  67.4  0.0000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.410501  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1744  lysine exporter protein LysE/YggA  31.85 
 
 		 208 aa  66.6  0.0000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0257251  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4344  threonine efflux system  26.94 
 
 		 204 aa  67  0.0000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2431  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  32.64 
 
 		 209 aa  66.6  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.61042  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1483  lysine exporter protein LysE/YggA  32.82 
 
 		 215 aa  67.4  0.0000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003627  putative threonine efflux protein  28.35 
 
 		 231 aa  67  0.0000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3743  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  29.86 
 
 		 205 aa  67  0.0000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4188  threonine efflux system  27.78 
 
 		 206 aa  66.2  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05339  putative threonine efflux protein  29.55 
 
 		 187 aa  66.2  0.0000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3536  lysine exporter protein LysE/YggA  27.68 
 
 		 234 aa  65.9  0.0000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4247  putative homoserine/threonine efflux protein  31.11 
 
 		 208 aa  65.5  0.0000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000239469 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3366  lysine exporter protein LysE/YggA  27.31 
 
 		 234 aa  65.1  0.0000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>