More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_4142 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_4142  lysine exporter protein LysE/YggA  100 
 
 
211 aa  419  1e-116  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000225003  hitchhiker  0.0000840644 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1550  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  56.85 
 
 
225 aa  212  2.9999999999999995e-54  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2912  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  54.82 
 
 
215 aa  205  4e-52  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4855  transporter, LysE family  51.24 
 
 
213 aa  176  3e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4781  transporter LysE family  51.24 
 
 
213 aa  175  4e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.917767  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2400  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  52 
 
 
214 aa  165  4e-40  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.954989  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1841  lysine exporter protein LysE/YggA  39.6 
 
 
216 aa  142  4e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000006365 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0493  lysine exporter protein LysE/YggA  32.52 
 
 
219 aa  125  5e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1905  lysine exporter protein LysE/YggA  37.75 
 
 
215 aa  125  6e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2724  lysine exporter protein LysE/YggA  40 
 
 
204 aa  123  2e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.138868 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1664  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  37.86 
 
 
209 aa  120  9.999999999999999e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0862458  normal  0.0704615 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3142  amino acid transporter LysE  33.66 
 
 
218 aa  119  3.9999999999999996e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.142315  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2800  lysine exporter protein LysE/YggA  39.36 
 
 
204 aa  118  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.208295  normal  0.25716 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3021  amino acid transporter LysE  37.89 
 
 
204 aa  115  5e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.196294  normal  0.164035 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2658  lysine exporter protein LysE/YggA  38.34 
 
 
204 aa  115  6e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.53678  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70510  hypothetical protein  32.32 
 
 
206 aa  90.1  2e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6117  hypothetical protein  32.83 
 
 
206 aa  89.7  3e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3404  lysine exporter protein LysE/YggA  30.24 
 
 
211 aa  89.7  3e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.325379  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0042  lysine exporter protein LysE/YggA  37.57 
 
 
216 aa  87.8  1e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1641  lysine exporter protein LysE/YggA  29.76 
 
 
212 aa  86.7  2e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.950543  normal  0.4347 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1219  hypothetical protein  29.17 
 
 
219 aa  86.7  3e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2482  lysine exporter protein LysE/YggA  28.29 
 
 
224 aa  85.9  4e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3976  lysine exporter protein LysE/YggA  30.48 
 
 
205 aa  84.3  0.000000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0215233 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1800  threonine efflux protein, putative  25.37 
 
 
212 aa  84  0.000000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0618  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  27.14 
 
 
211 aa  84  0.000000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4153  threonine efflux system  31.19 
 
 
207 aa  84  0.000000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000179823  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1213  hypothetical protein  28.95 
 
 
219 aa  84  0.000000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0989  lysine exporter protein LysE/YggA  28.86 
 
 
210 aa  83.6  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3963  threonine efflux system  31.19 
 
 
207 aa  83.2  0.000000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.245678  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1147  transporter, LysE family  29.41 
 
 
210 aa  81.6  0.000000000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4710  lysine exporter protein LysE/YggA  27.86 
 
 
209 aa  80.9  0.00000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.142665 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7469  lysine exporter protein LysE/YggA  30.65 
 
 
205 aa  80.9  0.00000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3142  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  30.65 
 
 
208 aa  80.9  0.00000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0269907  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3663  lysine exporter protein LysE/YggA  27.59 
 
 
209 aa  80.9  0.00000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3488  lysine exporter protein LysE/YggA  26.6 
 
 
223 aa  81.3  0.00000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4189  lysine exporter protein LysE/YggA  30.58 
 
 
212 aa  79.3  0.00000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0194  threonine efflux system  30.1 
 
 
207 aa  79  0.00000000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0335584  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0476  lysine exporter protein LysE/YggA  28.21 
 
 
209 aa  78.2  0.00000000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26160  hypothetical protein  28.57 
 
 
204 aa  78.2  0.00000000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.519724  normal  0.19854 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1435  amino acid transporter LysE  29.03 
 
 
210 aa  77.4  0.0000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.410501  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0243  threonine efflux system  28.28 
 
 
206 aa  77.8  0.0000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.569169  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2771  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  29.89 
 
 
203 aa  77.8  0.0000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2977  amino acid transporter LysE  27.09 
 
 
228 aa  76.3  0.0000000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007323  GBAA_pXO2_0078  amino acid efflux protein  28.04 
 
 
205 aa  75.9  0.0000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00283  neutral amino-acid efflux system  29.1 
 
 
223 aa  74.3  0.000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03702  threonine efflux system  26.13 
 
 
206 aa  74.3  0.000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03651  hypothetical protein  26.13 
 
 
206 aa  74.3  0.000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3278  homoserine/threonine efflux pump  29.1 
 
 
223 aa  74.3  0.000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0396  putative transport protein  28.19 
 
 
210 aa  74.3  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.979225  hitchhiker  0.00000000000454708 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0405  putative transport protein  28.19 
 
 
210 aa  74.3  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000145475 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0394  putative homoserine/threonine efflux protein  29.1 
 
 
222 aa  74.3  0.000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0556  threonine efflux system  28 
 
 
206 aa  74.3  0.000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0399  putative transport protein  28.57 
 
 
210 aa  74.3  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4190  threonine efflux system  26.13 
 
 
206 aa  74.3  0.000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00587316 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3296  homoserine/threonine efflux pump  29.1 
 
 
223 aa  74.3  0.000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0459  putative transport protein  28.19 
 
 
210 aa  74.3  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000321828 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0417  putative transport protein  28.19 
 
 
210 aa  74.3  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.322077  normal  0.0110609 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2059  lysine exporter protein LysE/YggA  26.46 
 
 
211 aa  74.3  0.000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0219  threonine efflux system  28 
 
 
206 aa  74.3  0.000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00287  hypothetical protein  29.1 
 
 
223 aa  74.3  0.000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0352  putative homoserine/threonine efflux protein  29.1 
 
 
215 aa  74.7  0.000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4239  threonine efflux system  26.13 
 
 
206 aa  73.6  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.588967  normal  0.890135 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0399  putative homoserine/threonine efflux protein  27.81 
 
 
223 aa  73.6  0.000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4344  threonine efflux system  25.63 
 
 
204 aa  73.2  0.000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0556  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  27.81 
 
 
204 aa  73.9  0.000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5694  lysine exporter protein LysE/YggA  29.03 
 
 
205 aa  73.6  0.000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.666323 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0359  putative homoserine/threonine efflux protein  27.27 
 
 
210 aa  73.6  0.000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.672304  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3973  threonine efflux system  25.63 
 
 
206 aa  73.6  0.000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.137764  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4286  threonine efflux system  26.13 
 
 
206 aa  72.8  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.492935 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5264  threonine efflux system  26.13 
 
 
204 aa  72.8  0.000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.613043 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4167  threonine efflux system  26.13 
 
 
206 aa  72.8  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3997  threonine efflux system  27.5 
 
 
206 aa  73.2  0.000000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6528  lysine exporter protein LysE/YggA  27.96 
 
 
205 aa  73.2  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.28884 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4188  threonine efflux system  26.13 
 
 
206 aa  72.8  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4346  threonine efflux system  26.13 
 
 
206 aa  72.8  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.459932  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4156  homoserine/threonine efflux pump  26.13 
 
 
206 aa  72.8  0.000000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0765  threonine efflux protein, putative  24.67 
 
 
234 aa  72.8  0.000000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2796  lysine exporter protein LysE/YggA  27.36 
 
 
214 aa  72.8  0.000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0921  putative threonine efflux protein  27.62 
 
 
205 aa  72.8  0.000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4047  threonine efflux system  26.13 
 
 
204 aa  72.4  0.000000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3536  lysine exporter protein LysE/YggA  26.22 
 
 
234 aa  72.8  0.000000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4290  threonine efflux system  26.13 
 
 
206 aa  72.4  0.000000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5352  lysine exporter protein LysE/YggA  30.69 
 
 
204 aa  72.4  0.000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.128052 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4185  threonine efflux system  26.13 
 
 
206 aa  72.4  0.000000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.485697 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29100  hypothetical protein  32.89 
 
 
204 aa  72.4  0.000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00136638 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2230  hypothetical protein  27.96 
 
 
204 aa  72  0.000000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1757  lysine exporter protein LysE/YggA  26.67 
 
 
214 aa  72  0.000000000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.290271  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0194  threonine efflux system  25.37 
 
 
208 aa  72  0.000000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.331917  normal  0.247253 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4118  RhtB family transporter  23.68 
 
 
213 aa  70.9  0.00000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06605  putative threonine efflux protein  26.94 
 
 
203 aa  70.5  0.00000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5915  LysE family transporter  26.53 
 
 
204 aa  70.1  0.00000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.723016 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5674  lysine exporter protein LysE/YggA  27.42 
 
 
205 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6038  lysine exporter protein LysE/YggA  27.42 
 
 
205 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.133303 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3581  lysine exporter protein LysE/YggA  34.68 
 
 
222 aa  69.7  0.00000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0689  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  27.95 
 
 
235 aa  69.7  0.00000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0668  lysine exporter protein LysE/YggA  27.95 
 
 
235 aa  69.7  0.00000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0596  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  27.81 
 
 
230 aa  69.7  0.00000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.400455  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4393  lysine exporter protein LysE/YggA  32.26 
 
 
205 aa  69.3  0.00000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.140673 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0111  hypothetical protein  27.5 
 
 
215 aa  69.3  0.00000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0717  lysine exporter protein LysE/YggA  29.84 
 
 
204 aa  68.9  0.00000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.392476 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>