83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_1017 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008609  Ppro_1017  phage integrase family protein  100 
 
 		 418 aa  867    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0440345  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0420  hypothetical protein  56.79 
 
 		 128 aa  91.7  2e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000335832  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0712  integrase family protein  29.11 
 
 		 285 aa  69.3  0.0000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00227312  n/a   
 
 
-
 
NC_013386  Adeg_2179  integrase family protein  27 
 
 		 288 aa  63.5  0.000000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.353401  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0519  phage integrase family protein  30 
 
 		 300 aa  62.4  0.00000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.24612  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0078  phage integrase family protein  27.17 
 
 		 319 aa  62.4  0.00000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4219  phage integrase family protein  25.88 
 
 		 463 aa  61.6  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0795  phage integrase family protein  25.11 
 
 		 283 aa  61.2  0.00000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0775  phage integrase family protein  27.66 
 
 		 286 aa  60.5  0.00000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0341069  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3561  Phage integrase  26.92 
 
 		 275 aa  53.9  0.000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3995  phage integrase family protein  23.18 
 
 		 415 aa  53.1  0.000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.0000158235  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2844  integrase family protein  23.43 
 
 		 329 aa  52.4  0.00001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2967  phage integrase family protein  27.51 
 
 		 379 aa  51.6  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.132884  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2923  phage integrase  27.51 
 
 		 379 aa  51.6  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5334  integrase family protein  21.09 
 
 		 354 aa  51.2  0.00003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0272  phage integrase family site specific recombinase  25.3 
 
 		 319 aa  51.6  0.00003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5317  integrase family protein  21.09 
 
 		 354 aa  51.2  0.00003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0905  phage integrase family site specific recombinase  25.3 
 
 		 319 aa  51.6  0.00003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0295  phage integrase family site specific recombinase  25.3 
 
 		 319 aa  51.6  0.00003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1456  integrase family protein  24.69 
 
 		 337 aa  50.8  0.00004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.699839  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2705  phage integrase family protein  24.24 
 
 		 386 aa  50.4  0.00005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.248695  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0399  phage integrase family protein  22.92 
 
 		 337 aa  50.1  0.00007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0287  site-specific recombinase, phage integrase family  28.66 
 
 		 412 aa  50.1  0.00007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1326  phage integrase family protein  26.07 
 
 		 457 aa  49.7  0.00009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.558955  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0845  phage integrase  26.07 
 
 		 457 aa  49.7  0.00009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7637  integrase family protein  27.74 
 
 		 425 aa  49.7  0.00009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0989  integrase family protein  26.07 
 
 		 355 aa  49.3  0.0001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000138199  hitchhiker  0.00000000000000368709 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0722  phage integrase family protein  29.6 
 
 		 306 aa  49.7  0.0001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0599364 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1133  phage integrase  28.45 
 
 		 454 aa  49.7  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00289406  hitchhiker  0.000832848 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0370  phage integrase family protein  24.77 
 
 		 304 aa  48.5  0.0002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0924  phage integrase family protein  26.17 
 
 		 294 aa  48.5  0.0002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.852644  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1126  phage integrase family protein  25.93 
 
 		 367 aa  48.5  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.665365  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3565  phage integrase family protein  24.37 
 
 		 402 aa  48.9  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000473566  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2020  LigA  24.15 
 
 		 397 aa  48.5  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.389387  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2649  phage integrase family protein  24.91 
 
 		 381 aa  48.5  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.833719 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0860  integrase family protein  26.79 
 
 		 370 aa  48.5  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2307  integrase family protein  26.83 
 
 		 335 aa  47.8  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.109793  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2770  integrase family protein  25.94 
 
 		 434 aa  48.1  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.00484712  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1934  phage integrase family protein  27.27 
 
 		 297 aa  47.8  0.0004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1994  integrase family protein  25.54 
 
 		 315 aa  47.4  0.0005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000000947418  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2649  integrase family protein  25.49 
 
 		 333 aa  46.6  0.0008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.413706  hitchhiker  0.000000656425 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1985  phage integrase family protein  21.83 
 
 		 469 aa  46.6  0.0009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.630467  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3066  phage integrase  26.5 
 
 		 341 aa  45.8  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2499  phage integrase family protein  23.66 
 
 		 381 aa  46.2  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.005662  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0037  integrase-recombinase protein  29.59 
 
 		 285 aa  45.8  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.491877  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2834  integrase family protein  29.71 
 
 		 314 aa  45.8  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.061361  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0787  formylmethanofuran dehydrogenase subunit E-like protein  22.76 
 
 		 320 aa  46.6  0.001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  decreased coverage  0.00453269  unclonable  0.000000000000100471 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0758  phage integrase family protein  22.55 
 
 		 304 aa  46.2  0.001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.000222973  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1932  tyrosine recombinase XerD  27.23 
 
 		 310 aa  46.2  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1185  integrase family protein  20.49 
 
 		 311 aa  45.8  0.001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0419  integrase family protein  27.9 
 
 		 414 aa  45.1  0.002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000230336  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1846  integrase family protein  28.57 
 
 		 370 aa  45.4  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.00000018136  normal  0.604263 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2882  phage integrase  26.5 
 
 		 341 aa  45.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.948794  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0209  phage integrase family protein  26.61 
 
 		 379 aa  45.4  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1615  phage integrase family protein  25 
 
 		 368 aa  45.1  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0481425  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2489  tyrosine recombinase XerD  28.09 
 
 		 318 aa  45.8  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.189208  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5285  phage integrase family protein  24.49 
 
 		 388 aa  45.4  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1337  integrase family protein  24.48 
 
 		 392 aa  44.7  0.003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0155558  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3152  integrase family protein  24.14 
 
 		 352 aa  44.7  0.003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1297  phage integrase family protein  30.72 
 
 		 295 aa  45.1  0.003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3924  integrase family protein  26.17 
 
 		 321 aa  44.7  0.003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.733894 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0574  integrase family protein  30.72 
 
 		 295 aa  44.7  0.003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1574  integrase family protein  30.17 
 
 		 385 aa  44.3  0.004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.00294023  normal  0.46427 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1556  integrase family protein  24.53 
 
 		 307 aa  44.3  0.004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.36987  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0840  integrase family protein  28.82 
 
 		 294 aa  44.3  0.004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.774041 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2622  integrase family protein  25.49 
 
 		 335 aa  44.3  0.004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.647869  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2124  phage integrase family protein  23.08 
 
 		 301 aa  44.3  0.004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.308322  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1082  integrase family protein  26.28 
 
 		 290 aa  44.3  0.004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2414  phage integrase family protein  20.92 
 
 		 358 aa  44.3  0.004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10430  site-specific recombinase XerD  26.04 
 
 		 313 aa  43.9  0.005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00129547  unclonable  0.000000000966981 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2110  phage integrase family protein  23.48 
 
 		 335 aa  44.3  0.005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.717737  hitchhiker  0.00928356 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2246  integrase family protein  24.52 
 
 		 382 aa  44.3  0.005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0989454  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1288  integrase family protein  24.52 
 
 		 382 aa  43.9  0.005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00250501  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1368  phage integrase  39.66 
 
 		 526 aa  43.9  0.005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.509686 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0105  hydrogenase expression/formation protein  25 
 
 		 354 aa  43.5  0.006  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1689  integrase family protein  24.47 
 
 		 292 aa  43.5  0.006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0836065  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0548  hypothetical protein  23.2 
 
 		 334 aa  43.5  0.006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.271041 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2090  transport protein  25 
 
 		 353 aa  43.5  0.007  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0326537  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5143  phage integrase family site specific recombinase  27.27 
 
 		 404 aa  43.5  0.007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0463539  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1585  phage integrase  29.27 
 
 		 286 aa  43.5  0.007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.791115  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1268  integrase family protein  25.17 
 
 		 353 aa  43.5  0.008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3658  putative bacteriophage integrase  27.74 
 
 		 444 aa  43.1  0.008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.626735 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3848  integrase family protein  23.49 
 
 		 327 aa  43.1  0.009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.250043  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>