136 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnec_0681 on replicon NC_010531
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010531  Pnec_0681  amino acid permease-associated region  100 
 
 		 195 aa  379  1e-104  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1272  amino acid permease-associated region  76.92 
 
 		 431 aa  271  5.000000000000001e-72  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0069  amino acid transporter  34.24 
 
 		 433 aa  107  1e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.266806  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0278  amino acid permease-associated region  30.37 
 
 		 434 aa  94.4  1e-18  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1136  amino acid permease-associated region  29.95 
 
 		 447 aa  87.8  9e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.304278 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1315  amino acid permease-associated region  30.21 
 
 		 441 aa  85.9  3e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.172576  normal  0.0920117 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1932  amino acid transporter  28.21 
 
 		 437 aa  73.9  0.000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.392371  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2693  amino acid permease-associated region  29.56 
 
 		 786 aa  73.6  0.000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00403  Amino acid permease-associated region  30.61 
 
 		 441 aa  73.6  0.000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.613152  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0803  amino acid transporter  26.84 
 
 		 429 aa  70.9  0.00000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0717  amino acid permease-associated region  26.94 
 
 		 434 aa  71.2  0.00000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  decreased coverage  0.00000167398  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2084  amino acid permease-associated region  28.43 
 
 		 770 aa  66.2  0.0000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2108  amino acid permease-associated region  26.7 
 
 		 445 aa  66.2  0.0000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1735  amino acid permease-associated region  25.6 
 
 		 452 aa  64.3  0.000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.51734  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0525  amino acid permease family protein  28.5 
 
 		 430 aa  62.8  0.000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0566  amino acid permease-associated region  24.27 
 
 		 764 aa  62.4  0.000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0529  amino acid permease family protein  28.5 
 
 		 430 aa  62.4  0.000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00437  predicted transporter  28.5 
 
 		 430 aa  62  0.000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.936072  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3124  amino acid permease-associated region  28.5 
 
 		 430 aa  62  0.000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.554048  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1908  amino acid permease-associated region  27.18 
 
 		 440 aa  62.4  0.000000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.00117224  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00442  hypothetical protein  28.5 
 
 		 430 aa  62  0.000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0565  amino acid permease family protein  28.5 
 
 		 430 aa  62  0.000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3130  amino acid permease-associated region  28.5 
 
 		 430 aa  62  0.000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0286434  hitchhiker  0.000108674 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0579  amino acid permease family protein  28.5 
 
 		 430 aa  62  0.000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0129  amino acid permease-associated region  27.69 
 
 		 451 aa  61.2  0.00000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0421  amino acid permease family protein  27.98 
 
 		 430 aa  58.5  0.00000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0116  amino acid transporter  29.65 
 
 		 443 aa  58.5  0.00000006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2678  amino acid permease-associated region  29.15 
 
 		 420 aa  58.2  0.00000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0723531  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0195  amino acid permease-associated region  27.14 
 
 		 745 aa  57.8  0.00000009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0441  amino acid permease-associated region  23.32 
 
 		 740 aa  55.8  0.0000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.238325  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2649  amino acid permease-associated region  28.64 
 
 		 450 aa  55.8  0.0000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2694  amino acid permease-associated region  28.64 
 
 		 450 aa  55.8  0.0000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.11519  normal  0.0425419 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0543  amino acid permease-associated region  28.85 
 
 		 456 aa  54.7  0.0000008  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00639269  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0333  hypothetical protein  25.89 
 
 		 394 aa  53.9  0.000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0018  amino acid permease-associated region  28.76 
 
 		 510 aa  53.9  0.000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.190747 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3620  amino acid permease-associated region  26.11 
 
 		 494 aa  52.8  0.000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0181  amino acid permease-associated region  26.5 
 
 		 443 aa  53.1  0.000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3650  putative amino acid permease  25.71 
 
 		 413 aa  52.8  0.000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.171718  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0357  hypothetical protein  24.87 
 
 		 394 aa  51.2  0.000008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2625  amino acid permease-associated region  28.96 
 
 		 482 aa  51.6  0.000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0475967  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2679  amino acid permease-associated region  28.96 
 
 		 482 aa  51.6  0.000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1416  amino acid permease-associated region  24.04 
 
 		 486 aa  51.2  0.000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0737  amino acid permease-associated region  23.15 
 
 		 506 aa  50.4  0.00002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000351708  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1150  amino acid permease-associated region  26.85 
 
 		 476 aa  50.1  0.00002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000287534  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1720  amino acid permease-associated region  24.76 
 
 		 471 aa  50.1  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0692  amino acid permease-associated region  25 
 
 		 820 aa  50.1  0.00002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.145008  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3353  amino acid permease-associated region  23.5 
 
 		 486 aa  49.3  0.00003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.262265  normal  0.87626 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1920  amino acid permease-associated region  25.37 
 
 		 466 aa  48.9  0.00004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000169214  normal  0.866406 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3685  amino acid permease  24.4 
 
 		 460 aa  48.9  0.00004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1741  amino acid permease-associated region  23.38 
 
 		 467 aa  48.5  0.00005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.908164  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0831  amino acid permease-associated region  25.24 
 
 		 476 aa  48.5  0.00005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3604  amino acid permease-associated region  26.11 
 
 		 445 aa  48.5  0.00005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.466276 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3942  amino acid permease-associated region  26.11 
 
 		 445 aa  48.5  0.00005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1840  amino acid transporter  28.64 
 
 		 466 aa  48.5  0.00006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2516  amino acid permease-associated region  23.58 
 
 		 477 aa  48.1  0.00007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2522  amino acid permease-associated region  23.68 
 
 		 461 aa  48.1  0.00007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1215  amino acid permease-associated region  22.22 
 
 		 792 aa  48.1  0.00007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1815  amino acid permease-associated region  21.24 
 
 		 491 aa  48.1  0.00008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.275696 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3053  amino acid permease-associated region  24.15 
 
 		 466 aa  47.8  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2011  putative cationic amino acid transporter  21.83 
 
 		 500 aa  47  0.0002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6404  amino acid tranporter  23.67 
 
 		 468 aa  46.6  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.307303 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3101  amino acid permease-associated region  23.19 
 
 		 466 aa  47  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.29025  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0262  amino acid transporter  27.07 
 
 		 491 aa  47  0.0002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2967  amino acid permease-associated region  24.15 
 
 		 466 aa  46.6  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.799342  normal  0.23719 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3790  amino acid permease-associated region  23.11 
 
 		 491 aa  46.2  0.0003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.198748  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0321  amino acid permease family protein  30.39 
 
 		 460 aa  46.2  0.0003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0838341  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1769  amino acid permease-associated region  28.22 
 
 		 439 aa  46.2  0.0003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0907  amino acid transporter  24.54 
 
 		 486 aa  46.6  0.0003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.555245  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00849  cationic amino acid transporter  25.47 
 
 		 476 aa  45.8  0.0004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000255765  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06078  cationic amino acid transporter  25.47 
 
 		 476 aa  45.8  0.0004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0210338  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3500  inner membrane protein YjeH  26.87 
 
 		 422 aa  45.4  0.0005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000277884  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1820  amino acid transport protein  23.01 
 
 		 542 aa  45.4  0.0005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0544653 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1274  amino acid permease-associated region  27.8 
 
 		 458 aa  45.4  0.0006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1634  amino acid permease-associated region  21.8 
 
 		 476 aa  45.1  0.0007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.131349  normal  0.325388 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0650  amino acid permease family protein  26.13 
 
 		 471 aa  43.9  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000109071 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0660  amino acid permease family protein  26.13 
 
 		 471 aa  43.9  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0562  amino acid permease family protein  26.13 
 
 		 471 aa  43.9  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0504  amino acid permease (amino acid transporter)  26.13 
 
 		 471 aa  43.9  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.140308  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0506  amino acid permease (amino acid transporter)  26.13 
 
 		 471 aa  43.9  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0250  amino acid permease-associated region  23.7 
 
 		 465 aa  44.3  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0593  amino acid permease family protein  26.13 
 
 		 471 aa  43.9  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1191  amino acid permease-associated region  34.02 
 
 		 499 aa  44.3  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2158  amino acid permease family protein  36.08 
 
 		 483 aa  43.5  0.002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2442  amino acid permease-associated region  22.71 
 
 		 468 aa  43.5  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1623  amino acid transporter  22.68 
 
 		 427 aa  43.1  0.002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000133426  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3056  amino acid permease-associated region  22.71 
 
 		 468 aa  43.5  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.738455  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5065  amino acid permease-associated region  30.65 
 
 		 457 aa  43.1  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0442814  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3470  amino acid permease-associated region  31.46 
 
 		 561 aa  43.1  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0308593  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3075  amino acid permease-associated region  22.71 
 
 		 468 aa  43.5  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00850  cationic amino acid transporter  23.39 
 
 		 486 aa  43.5  0.002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  decreased coverage  0.0000549978  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06077  cationic amino acid transporter  23.39 
 
 		 486 aa  43.5  0.002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00275694  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4510  amino acid permease-associated region  37.08 
 
 		 505 aa  43.5  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.338934 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0721  amino acid permease family protein  25.13 
 
 		 471 aa  43.1  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2164  amino acid permease-associated region  19.9 
 
 		 455 aa  43.1  0.003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0909  amino acid permease family protein  21.6 
 
 		 467 aa  42.7  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1042  amino acid permease-associated region  22.44 
 
 		 773 aa  42.7  0.003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.534613  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0914  amino acid permease family protein  30.23 
 
 		 467 aa  42.7  0.003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.43784e-41 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1066  amino acid permease-associated region  25.91 
 
 		 425 aa  42.7  0.003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0746  amino acid permease-associated region  23.94 
 
 		 716 aa  43.1  0.003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.200674  normal  0.311948 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0818  amino acid permease family protein  30.23 
 
 		 467 aa  42.7  0.004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>